Taxonomy relies greatly on morpholo

Taxonomy relies greatly on morphology to discriminate groups. Computerized geometric morphometric methods for quantitative shape analysis measure, test and visualize differences in form in a highly effective, reproducible, accurate and statistically powerful way. Plant leaves are commonly used in taxonomic analyses and are particularly suitable to landmark based geometric morphometrics. However, botanists do not yet seem to have taken advantage of this set of methods in their studies as much as zoologists have done. Using free software and an example dataset from two geographical populations of sessile oak leaves, we describe in detailed but simple terms how to: a) compute size and shape variables using Procrustes methods; b) test measurement error and the main levels of variation (population and trees) using a hierachical design; c) estimate the accuracy of group discrimination; d) repeat this estimate after controlling for the effect of size differences on shape (i.e., allometry). Measurement error was completely negligible; individual variation in leaf morphology was large and differences between trees were generally bigger than within trees; differences between the two geographic populations were small in both size and shape; despite a weak allometric trend, controlling for the effect of size on shape slighly increased discrimination accuracy. Procrustes based methods for the analysis of landmarks were highly efficient in measuring the hierarchical structure of differences in leaves and in revealing very small-scale variation. In taxonomy and many other fields of botany and biology, the application of geometric morphometrics contributes to increase scientific rigour in the description of important aspects of the phenotypic dimension of biodiversity. Easy to follow but detailed step by step example studies can promote a more extensive use of these numerical methods, as they provide an introduction to the discipline which, for many biologists, is less intimidating than the often inaccessible specialistic literature.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบบใช้มากในสัณฐานวิทยาถือพรรคถือพวกกลุ่ม คอมพิวเตอร์วิธี morphometric เรขาคณิตในรูปเชิงปริมาณวิเคราะห์วัด ทดสอบ และแสดงให้เห็นความแตกต่างในแบบฟอร์มในวิธีมีประสิทธิภาพสูง จำลอง แม่นยำ และมีประสิทธิภาพทางสถิติ ใบพืชโดยทั่วไปใช้ในการวิเคราะห์อนุกรมวิธาน และเหมาะอย่างยิ่งกับโรงแรมแลนด์มาร์คโดยใช้เรขาคณิต morphometrics อย่างไรก็ตาม botanists ยังดูเหมือนไม่ ได้ประโยชน์จากชุดของวิธีการนี้ในการศึกษาเท่าที่มีทำ zoologists เราใช้ซอฟต์แวร์ฟรีและมีชุดข้อมูลตัวอย่างจากประชากรภูมิศาสตร์ 2 ใบไม้ sessile โอ๊ค อธิบายในรายละเอียด แต่เรื่องวิธีการ: เป็น) คำนวณตัวแปรขนาดและรูปร่างโดยใช้วิธี Procrustes ขทดสอบประเมินข้อผิดพลาด และระดับหลักของความผันแปร (ประชากรและต้นไม้) ใช้แบบ hierachical c) ประเมินความถูกต้องของกลุ่มแบ่งแยก d) ทำซ้ำนี้ประเมินหลังการควบคุมสำหรับผลของความแตกต่างขนาดรูปร่าง (เช่น allometry) ข้อผิดพลาดในการวัดคือระยะทั้งหมด แต่ละการเปลี่ยนแปลงในสัณฐานวิทยาของใบมีขนาดใหญ่ และความแตกต่างระหว่างต้นไม้ได้โดยทั่วไปจะใหญ่กว่าภายในต้นไม้ ความแตกต่างระหว่างประชากรภูมิศาสตร์สองได้เล็กขนาดและรูปร่าง แม้ มีแนวโน้มอ่อนแอ allometric การควบคุมสำหรับผลของขนาดรูปร่าง slighly เพิ่มความถูกต้องของการเลือกปฏิบัติ Procrustes ใช้วิธีการวิเคราะห์สถานที่มีประสิทธิภาพสูงในการวัดโครงสร้างลำดับชั้นของความแตกต่าง ในใบไม้ และ ในการเปิดเผยการเปลี่ยนแปลงที่ระบุมาก ในระบบและเขตข้อมูลอื่นในพฤกษศาสตร์และชีววิทยา การประยุกต์เรขาคณิต morphometrics จัดสรรไปเพิ่มนิตย์วิทยาศาสตร์ในคำอธิบายของลักษณะสำคัญของมิติไทป์ของความหลากหลายทางชีวภาพ ง่ายตามแต่รายละเอียดตัวอย่างขั้นตอนการศึกษาสามารถส่งเสริมเป็นมากใช้วิธีการเหล่านี้เป็นตัวเลข เป็นพวกเขาให้แนะนำขัดเกลาซึ่ง biologists มาก จะสับสนน้อยกว่าวรรณกรรม specialistic มักจะไม่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อนุกรมวิธานอาศัยอย่างมากในการเปลี่ยนรูปร่างของการแยกแยะกลุ่ม คอมพิวเตอร์วิธีเมตริกเรขาคณิตการวัดการวิเคราะห์เชิงปริมาณรูปร่าง, การทดสอบและการมองเห็นความแตกต่างในรูปแบบที่มีประสิทธิภาพสูง, ทำซ้ำ, วิธีที่ถูกต้องและมีประสิทธิภาพทางสถิติ ใบพืชเป็นที่นิยมใช้ในการวิเคราะห์การจัดหมวดหมู่และมีความเหมาะสมอย่างยิ่งที่จะสถานที่ตามความยาวทางเรขาคณิต อย่างไรก็ตามนักพฤกษศาสตร์ยังไม่ดูเหมือนจะมีความได้เปรียบเอาชุดของวิธีการในการศึกษาของพวกเขามากที่สุดเท่าที่ zoologists ได้ทำ การใช้ซอฟต์แวร์ฟรีและชุดข้อมูลตัวอย่างจากสองประชากรทางภูมิศาสตร์ของใบโอ๊คนั่งเราจะอธิบายในแง่รายละเอียดที่เรียบง่าย แต่วิธีการ:) คำนวณขนาดรูปร่างและตัวแปรโดยใช้วิธีการ Procrustes; ข) ข้อผิดพลาดการทดสอบและการวัดระดับหลักของการเปลี่ยนแปลง (ประชากรและต้น) โดยใช้การออกแบบลำดับชั้น; ค) การประเมินความถูกต้องของการเลือกปฏิบัติกลุ่ม; ง) ทำซ้ำประมาณนี้หลังจากที่การควบคุมผลกระทบของความแตกต่างของขนาดรูปร่าง (เช่น allometry) ข้อผิดพลาดการวัดได้เล็กน้อยสมบูรณ์; การเปลี่ยนแปลงในแต่ละสัณฐานใบมีขนาดใหญ่และความแตกต่างระหว่างต้นไม้โดยทั่วไปมีขนาดใหญ่กว่าที่อยู่ในต้นไม้; ความแตกต่างระหว่างสองประชากรทางภูมิศาสตร์ที่มีขนาดเล็กในขนาดและรูปร่าง; แม้จะมีแนวโน้ม allometric อ่อนแอควบคุมผลกระทบของขนาดรูปร่างความถูกต้องเลือกปฏิบัติเพิ่มขึ้น slighly Procrustes วิธีการที่ใช้ในการวิเคราะห์สถานที่มีประสิทธิภาพสูงในการวัดโครงสร้างลำดับชั้นของความแตกต่างในใบและในการเปิดเผยรูปแบบมากขนาดเล็ก ในอนุกรมวิธานและสาขาอื่น ๆ อีกหลายแห่งพฤกษศาสตร์และชีววิทยาประยุกต์ยาวเรขาคณิตก่อให้เกิดการเพิ่มความรุนแรงทางวิทยาศาสตร์ในรายละเอียดของประเด็นที่สำคัญของมิติฟีโนไทป์ของความหลากหลายทางชีวภาพ ง่ายต่อการปฏิบัติตามขั้นตอนรายละเอียด แต่จากการศึกษาตัวอย่างขั้นตอนที่สามารถส่งเสริมการใช้งานที่กว้างขวางมากขึ้นของวิธีการเชิงตัวเลขเหล่านี้ที่พวกเขาให้รู้เบื้องต้นเกี่ยวกับวินัยซึ่งสำหรับนักชีววิทยาหลายเป็นข่มขู่น้อยกว่าวรรณกรรม specialistic มักไม่สามารถเข้าถึงได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อนุกรมวิธานอาศัยอย่างมากในลักษณะแบ่งแยกกลุ่ม คอมพิวเตอร์วิธีการลักษณะรูปร่างเรขาคณิตสำหรับการวัดการวิเคราะห์ ทดสอบ และเห็นความแตกต่างในรูปแบบในที่มีประสิทธิภาพสูง ซึ่ง วิธีที่ถูกต้องและมีประสิทธิภาพทางสถิติ ใบพืชที่มักใช้ในการวิเคราะห์หมวดหมู่และมีความเหมาะสมที่จะใช้หลักเรขาคณิต morphometrics . อย่างไรก็ตามนักพฤกษศาสตร์ยังไม่ได้ดูเหมือนจะได้รับประโยชน์จากชุดของวิธีการในการศึกษานี้เป็นนักสัตววิทยาได้สำเร็จ การใช้ซอฟต์แวร์ฟรีและชุดข้อมูลตัวอย่างจากสองประชากรทางภูมิศาสตร์ของเกาะติดใบโอ๊ก เราได้อธิบายในรายละเอียด แต่ง่ายเงื่อนไขวิธีการ : ) คำนวณตัวแปรขนาดและรูปร่างโดยใช้วิธีการ procrustes ;ข ) ข้อผิดพลาดการทดสอบการวัดและระดับหลักของการเปลี่ยนแปลงประชากรและต้นไม้ ) โดยใช้การออกแบบข้อมูล ; C ) การประเมินความถูกต้องของการแบ่งแยกกลุ่ม ; D ) ซ้ำประมาณนี้ หลังจากควบคุมผลของความแตกต่างของขนาด รูปร่าง เช่น แอลโลเมตรี ) ข้อผิดพลาดการวัดมันกระจอก ;การเปลี่ยนแปลงบุคคลในลักษณะใบและความแตกต่างขนาดใหญ่ระหว่างต้นไม้โดยทั่วไปใหญ่กว่าภายในต้นไม้ ความแตกต่างระหว่างสองภูมิภาคประชากรมีขนาดเล็กในขนาดและรูปร่าง แม้จะอ่อนแอประมาณแนวโน้มการควบคุมสำหรับผลของขนาดรูปร่าง slighly เพิ่มค่าความแม่นยำprocrustes ตามวิธีการในการวิเคราะห์จึงมีประสิทธิภาพสูงในการวัดโครงสร้างลำดับชั้นของความแตกต่างในใบและในการเปิดเผยการเปลี่ยนแปลงมากขนาดเล็ก ในอนุกรมวิธานและด้านอื่น ๆ อีกมากมายของพฤกษศาสตร์และชีววิทยาการประยุกต์ทางเรขาคณิต morphometrics มีส่วนช่วยเพิ่มความเข้มงวดในวิทยาศาสตร์อธิบายลักษณะสําคัญของมิติฟีโนไทป์ของความหลากหลายทางชีวภาพ ง่ายที่จะปฏิบัติตาม แต่รายละเอียดขั้นตอนโดยขั้นตอนตัวอย่างการศึกษาสามารถส่งเสริมการใช้กว้างขวางมากขึ้นของวิธีการเหล่านี้ ตัวเลข มีความรู้เบื้องต้นเกี่ยวกับวินัยซึ่งหลายนักชีววิทยามันน่ากลัวน้อยลงกว่าวรรณกรรม Specialistic มักจะไม่สามารถเข้าถึงได้