AbstractBackgroundGrowth-related tr

Abstract
Background

Growth-related traits have been mapped on bovine chromosome 6 (BTA 6) in various bovine breed populations. We previously mapped a significant quantitative trait locus (QTL) for carcass and body weight (CW-2) between 38 and 55 cM on BTA 6 using a Japanese Black half-sib family. Additional QTL mapping studies detected four QTL for body or carcass weight that overlapped with CW-2 in Japanese Black and Japanese Brown half-sib families. To map the region in greater detail, we applied cross-breed comparisons of haplotypes that have been shown to be powerful in canine.

Results

We used 38 microsatellite markers to search for a shared Q (increasing carcass and/or body weight) haplotype within the 17-cM CW-2 region among five sires. Linkage disequilibrium mapping using maternal alleles of the offspring showed that an 815-kb shared Q haplotype was associated with body or carcass weight in both breeds. The addition of 43 single nucleotide polymorphism (SNP) markers narrowed the region to 591 kb containing 4 genes. The SNP changing Ile-442 to Met in NCAPG (chromosome condensation protein G) was significantly associated with carcass weight (p < 1.2 × 10-11) in a large Japanese Black population as well as in the five families. The Q allele of the SNP was also associated with a larger longissimus muscle area and thinner subcutaneous fat thickness in steers of all five families, indicating that the CW-2 locus is pleiotropic and favorable for marker-assisted selection of beef cattle.

Conclusion

A 591-kb critical region for CW-2 was identified. The SNP changing Ile-442 to Met in NCAPG (chromosome condensation protein G) can be used as a positional candidate of CW-2 for marker-assisted selection.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อพื้นหลังลักษณะที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตมีการแมปในโครโมโซมวัว 6 (BTA 6) ในประชากรวัวสายพันธุ์ต่าง ๆ เราก่อนหน้านี้แมปสำคัญเชิงปริมาณคัส (QTL) สำหรับน้ำหนักซากและร่างกาย (ตามน้ำหนักจริง-2) ระหว่าง 38 และ 55 ซม.บน 6 BTA ใช้ครอบครัวสิบครึ่งญี่ปุ่นสีดำ ศึกษาการแม็ป QTL เพิ่มเติมพบ QTL สี่สำหรับน้ำหนักร่างกายหรือซากที่ซ้อนกัน 2 ตามน้ำหนักจริงในญี่ปุ่นสีดำและสีน้ำตาลญี่ปุ่นครึ่งสิบครอบครัว แผนที่ภูมิภาคในรายละเอียดมากขึ้น เราใช้การเปรียบเทียบข้ามสายพันธุ์ haplotypes ที่ได้รับการแสดงจะมีประสิทธิภาพในสุนัขผลลัพธ์เราใช้เครื่องหมายชนิด microsatellite 38 หา haplotype Q (เพิ่มน้ำหนักซากหรือร่างกาย) ใช้ร่วมกันในภูมิภาคตามน้ำหนักจริง 2 17 ซม.ระหว่างพ่อพันธุ์โคที่ห้า เชื่อมโยงการแม็ป disequilibrium ใช้ alleles แม่ของลูกหลานแสดงให้เห็นว่า เป็น 815 kb ร่วม Q haplotype ที่สัมพันธ์กับน้ำหนักของร่างกายหรือซากทั้งสองสายพันธุ์ การเพิ่มเครื่องหมาย 43 เดียวนิวคลีโอไทด์โพลีมอร์ฟิซึม (SNP) จำกัด 591 kb ประกอบด้วยยีน 4 ภูมิภาค SNP เปลี่ยนเมา-442 เม็ทใน NCAPG (โครโมโซมมีหยดน้ำเกาะโปรตีน G) ถูกเชื่อมโยงอย่างมากกับน้ำหนักซาก (p < 1.2 × 10-11) ในขนาดใหญ่สีดำที่ญี่ปุ่นประชากรเช่นในครอบครัว 5 นอกจากนี้ยังเกี่ยวข้องกับบริเวณกล้ามเนื้อ longissimus ใหญ่และทินเนอร์ใต้ไขมันหนาสำเร็จของครอบครัวห้าทั้งหมด แสดงว่า โลกัสโพลตามน้ำหนักจริง 2 pleiotropic และมงคลช่วยทำเครื่องหมายเลือกเนื้อวัว allele Q ของ SNP ได้บทสรุประบุพื้นที่สำคัญ 591 kb ตามน้ำหนักจริง 2 SNP เปลี่ยนเมา-442 เม็ทใน NCAPG (โครโมโซมมีหยดน้ำเกาะโปรตีน G) สามารถใช้เป็นผู้สมัครตำแหน่ง 2 ตามน้ำหนักจริงสำหรับการเลือกเครื่องช่วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ
พื้นหลังลักษณะการเจริญเติบโตที่เกี่ยวข้องกับการได้รับการแมปบนโครโมโซมวัว 6 (BTA 6) ในประชากรวัวสายพันธุ์ต่างๆ ก่อนหน้านี้เราแมปสถานที่ลักษณะเชิงปริมาณที่มีนัยสำคัญ (QTL) สำหรับซากและน้ำหนักตัว (CW-2) ระหว่าง 38 และ 55 เซนติเมตร BTA 6 โดยใช้สีดำญี่ปุ่นครึ่ง SIB ครอบครัว การศึกษาการทำแผนที่ QTL ตรวจพบเพิ่มเติมสี่ QTL สำหรับร่างกายหรือน้ำหนักซากที่ซ้อนทับกับ CW-2 สีดำญี่ปุ่นและญี่ปุ่นสีน้ำตาลครอบครัวครึ่ง SIB ต้องการแมภูมิภาคในรายละเอียดมากขึ้นเรานำมาใช้เปรียบเทียบข้ามสายพันธุ์ของ haplotypes ที่ได้รับการแสดงที่จะมีประสิทธิภาพในการสุนัข. ผลการค้นหา38 เราใช้เครื่องหมายไมโครเพื่อค้นหาที่ใช้ร่วมกัน Q (เพิ่มขึ้นซากและ / หรือน้ำหนักตัว) haplotype ภายใน 17 ซม CW-2 ภูมิภาคในหมู่ห้าตระกูล การทำแผนที่สมดุลเชื่อมโยงโดยใช้อัลลีลมารดาของลูกหลานแสดงให้เห็นว่า 815 กิโลไบต์ที่ใช้ร่วมกัน-Q haplotype มีความสัมพันธ์กับร่างกายหรือน้ำหนักซากในสายพันธุ์ทั้งสอง นอกเหนือจาก 43 ความแตกต่างเบื่อหน่ายเดียว (SNP) เครื่องหมายแคบภูมิภาคเพื่อ 591 กิโลไบต์ 4 ที่มียีน SNP เปลี่ยน Ile-442 จะพบใน NCAPG (โครโมโซมควบแน่นโปรตีน G) มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญที่มีน้ำหนักซาก (p <1.2 × 10-11) ในประชากรสีดำขนาดใหญ่ของญี่ปุ่นเช่นเดียวกับในห้าครอบครัว Q อัลลีลของ SNP ยังเกี่ยวข้องกับพื้นที่ของกล้ามเนื้อ longissimus ขนาดใหญ่และความหนาของไขมันใต้ผิวหนังทินเนอร์ในการนำพาของทุกห้าครอบครัวแสดงให้เห็นว่าสถานที่ CW-2 เป็น pleiotropic และดีสำหรับการเลือกเครื่องหมายช่วยของโคเนื้อ. สรุป591 -kb ภูมิภาคที่สำคัญสำหรับ CW-2 ถูกระบุว่า SNP เปลี่ยน Ile-442 จะพบใน NCAPG (โครโมโซมควบแน่นโปรตีน G) สามารถนำมาใช้ในฐานะผู้สมัครตำแหน่งของ CW-2 สำหรับการเลือกเครื่องหมายช่วย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลังนามธรรม

การคุณลักษณะที่เกี่ยวข้องได้รับการแมปบนโครโมโซม 6 ( BTA ) 6 ) ในประชากรพันธุ์วัว ต่าง ๆ เราเคยกำหนดเหลืองปรีดียาธรอย่างมีนัยสำคัญ ( QTL ) ซากและน้ำหนักตัว ( cw-2 ) ระหว่าง 38 55 ซม. บน BTA 6 โดยใช้ครอบครัวครึ่งงดำญี่ปุ่นการศึกษาเพิ่มเติมพบ QTL 4 QTL แผนที่ร่างกาย หรือน้ำหนักที่ทับซ้อนกับ cw-2 ในญี่ปุ่นสีดำและสีน้ำตาลครึ่งญี่ปุ่นสิบครอบครัว แผนที่เขตในรายละเอียดมากกว่า เราใช้ครอสบรีดการเปรียบเทียบผลที่ได้รับการแสดงที่จะมีประสิทธิภาพในสุนัข ผล



เราใช้ 38 ใช้เครื่องหมายเพื่อค้นหาแบ่งปัน Q ( เพิ่มคุณภาพซากและ / หรือน้ำหนักตัว ) พบภายใน 17 ซม. cw-2 เขตหมู่ 5 พ่อพันธุ์โคนม แผนที่ของการเก็บน้ำ linkage โดยใช้ยีนของลูกหลาน พบว่า มีบางครั้งที่พบ 815 Q มีความสัมพันธ์กับร่างกาย หรือน้ำหนักซากทั้ง 2 สายพันธุ์นอกเหนือจาก 43 polymorphism ( SNP ) ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์เครื่องหมายคอดภูมิภาค 591 KB มี 4 คู่ การเปลี่ยนแปลง ile-442 SNP พบใน ncapg ( โครโมโซมการควบแน่นโปรตีนกรัม ) มีความสัมพันธ์กับน้ำหนักซาก ( P < 1.2 × 10-11 ) ขนาดใหญ่ในญี่ปุ่นสีดำประชากรรวมทั้งใน 5 ครอบครัวQ อัลลีลของ SNP เป็นยังเกี่ยวข้องกับโคเนื้อบริเวณขนาดใหญ่และทินเนอร์ไขมันใต้ผิวหนังหนามีทั้งหมดห้าครอบครัว ระบุว่าตนเป็น pleiotropic cw-2 มงคลสำหรับเครื่องหมายช่วยเลือกของโคเนื้อ .

สรุปแล้ว

บางครั้งวิกฤตภูมิภาค cw-2 ถูกระบุตัวการเปลี่ยนแปลง ile-442 SNP พบใน ncapg ( โครโมโซมโปรตีน / กรัม ) สามารถใช้เป็นตำแหน่งผู้สมัครของ cw-2 สำหรับเครื่องหมายช่วยเลือก