PCR amplification was performed in a total volume
of 25 ll containing 2.5 ll of 10 PCR buffer (500 mM
KCl, 15 mM MgCl2 and 100 mM Tris–HCl, pH 9.0, at
room temperature), 200 lM of each deoxynucleotide
triphosphate, 1.25 U of Taq polymerase (Amersham
Biosciences, NY, USA), 1.0 mM of each primer and 10–
100 ng DNA. In accordance with Braker et al. [9], an
additional 1.0 mM MgCl2, 400 ng ll1 BSA and 0.1%
Triton X-100 were added for amplification with primers
nirK1F, nirK3R, nirK5R, nirS1F, nirS3F, nirS3Fa,
nirS4R and nirS6R. An additional 1.0 mM MgCl2 was
added for the primer pair Cunir3:nirK5R [12]. For
amplification of the environmental samples, BSA was
added in the PCRs with all other primer combinations.
For nirS reactions, 1000 ng ll1 was added, for nirK 400
and for nosZ 600.
ดำเนินการในผลรวมปริมาณกระบือ25 ที่ประกอบด้วย 2.5 ll ll 10 PCR บัฟเฟอร์ (500 มม.KCl, MgCl2 15 มม. และ 100 มม.ทริสเรทติ้ง – HCl, pH 9.0 ที่อุณหภูมิห้อง), 200 lM ของ deoxynucleotide แต่ละซีนไตรฟอสเฟต พอลิเมอเรส U Taq 1.25 (Amershamออก นิวยอร์ก สหรัฐอเมริกา), รองพื้นแต่ละและ 10 – 1.0 มิลลิเมตรดีเอ็นเอฉบับที่ 100 ตาม Braker et al. [9], การเพิ่มเติม 1.0 มิลลิเมตร MgCl2, 400 ฉบับ ll 1 บีเอสเอ และ 0.1%Triton X-100 เพิ่มสำหรับขยายกับไพรเมอร์nirK1F, nirK3R, nirK5R, nirS1F, nirS3F, nirS3FanirS4R และ nirS6R แก้ไขเพิ่มเติม 1.0 มิลลิเมตร MgCl2เพิ่มสำหรับคู่ไพรเมอร์ Cunir3:nirK5R [12] สำหรับขยายตัวอย่างสิ่งแวดล้อม บีเอสเอได้เพิ่มใน PCRs กับชุดรองพื้นอื่น ๆ ทั้งหมดสำหรับผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยา 1000 ฉบับ ll 1 ถูกเพิ่ม สำหรับ nirK 400และ สำหรับ nosZ 600
การแปล กรุณารอสักครู่..

ขยาย PCR ที่ได้ดำเนินการในปริมาณรวม
25 LL มี 2.5 LL 10? PCR บัฟเฟอร์ (500 มิลลิ
KCl, 15 มม MgCl2 และ 100 มิลลิเมตร Tris-HCl ค่า pH 9.0 ที่
อุณหภูมิห้อง) 200 LM ของแต่ละ deoxynucleotide
triphosphate 1.25 U ของ Taq โพลิเมอร์ (Amersham
ชีววิทยาศาสตร์, NY, USA) 1.0 มิลลิเมตรแต่ละ ไพรเมอร์และ 10-
100 NG ดีเอ็นเอ สอดคล้องกับ Braker et al, [9] การ
เพิ่มเติม 1.0 มิลลิ MgCl2 400 NG LL 1 บีเอสเอและ 0.1%
Triton X-100 ถูกเพิ่มสำหรับการขยายด้วยไพรเมอร์
nirK1F, nirK3R, nirK5R, nirS1F, nirS3F, nirS3Fa,
nirS4R และ nirS6R เพิ่มอีก 1.0 มิลลิ MgCl2 ถูก
เพิ่มสำหรับไพรเมอร์คู่ Cunir3: nirK5R [12] สำหรับ
การขยายของตัวอย่างสิ่งแวดล้อม BSA ถูก
เพิ่มเข้ามาใน PCRs ที่มีการผสมรองพื้นอื่น ๆ .
สำหรับปฏิกิริยา nirS 1000 NG LL 1 ถูกเพิ่มเข้ามาสำหรับ nirK 400
และ 600 nosZ
การแปล กรุณารอสักครู่..

PCR ( แสดงในหมวดทั้งหมด25 จะประกอบด้วย 2.5 จะ 10 เทคนิคบัฟเฟอร์ ( 500 มม.โพแทสเซียม , 15 มม. และ 100 มม. หรือชุดและ HCl , pH 9.0 , ที่อุณหภูมิห้อง ) , 200 โดย ขอขมาลาโทษ ของแต่ละคนไตรฟอสเฟต , 1.25 U ของแท็กการ ( ชามชีววิทยาศาสตร์ , NY , USA ) , 1.0 มม. ของแต่ละสีและ 10 –100 ของดีเอ็นเอ ตามทุก et al . [ 9 ] ,เพิ่มเติมชุด 400 มม. , ll1 และ 0.1% ของบีเอสเอTriton X-100 เพิ่มขยายกับไพรเมอร์nirk1f nirk3r nirk5r , , nirs1f nirs3f nirs3fa , , , ,และ nirs4r nirs6r เพิ่มเติมชุดคือ 1.0 มม.เพิ่มสำหรับไพรเมอร์คู่ cunir3 : nirk5r [ 12 ] สำหรับแบบตัวอย่างสิ่งแวดล้อม BSA คือเพิ่มใน pcrs กับทั้งหมดอื่น ๆผสมรองพื้น .สำหรับปฏิกิริยา nirs 1000 ng ll1 ถูกเพิ่มสำหรับเนิร์ก 400และ nosz 600
การแปล กรุณารอสักครู่..
