The genome size of melon (12 chromo

The genome size of melon (12 chromosome pairs) is estimated to be 454 Mb, and cucumber (7 chromosome pairs) has a genome size of 367 Mbp [13]. The evolutionary
relationship between melon and cucumber can be investigated through chromosome analysis. In Kirkbride’s taxonomic assessment of Cucumis [2], subgenus Cucumis is considered primitive and subgenus Melo was hypothesized to have been derived from it through chromosomal fragmentation [14-16]. In contrast, cytological investigations have also suggested that ancestral species of subgenus Melo gave rise to subgenus Cucumis species
via chromosome fusion or non-homologous translocation[17,18]. However, Ramachandran and Seshadri [19]argued that the two subgenera are not closely related given differences in geographical distribution and chromosome number, size, organization, and behavior.
More recent molecular-based phylogenetic analyses of Cucumis support the hypothesis that the base chromosome number of x = 7 was achieved by chromosome reduction from x = 12 progenitor species [8,10,12].Despite their distinct phylogenetic relationships
[20,21], the genomes of melon and cucumber seem to be highly conserved. Cross-species similarities based on molecular marker transferability among cucurbit crops
are well documented. Neuhausen [20] first reported affinities among cucurbit species by identifying molecular cross-hybridizations (i.e., signals) using RFLP probes.
More recently, Katzir et al. [21] and Danin-Poleg et al.[22] defined specific genomic regions using SSR primer products to reveal considerable sequence homologies
between cucumber and melon. Danin-Poleg et al. [23]identified nine SSR markers shared between melon and cucumber and proposed that their cucumber Linkage Group B and melon Linkage Groups E and 2 were syntenic. Since 2000, molecular markers (primarily SSRs)
developed from melon have been used routinely in cucumber genetic mapping studies or vice versa [24-37].The high degree of synteny and conservation between
the melon and cucumber genomes has also been demonstrated at the DNA sequence level (micro-synteny).Park et al. [38] and Meyer et al. [39] compared genomic DNA flanking the zucchini yellow mosaic virus resistance locus (zym) in melon and cucumber and
detected considerable marker colinearity between those species. Alignment of melon BAC-end and BAC clone(6.7 Mbp) sequences of melon against a cucumber draft
genome assembly (line Gy 14) revealed 90% homology between the compared sequences [40,41]. Although transposition activity was found to be low in cucumber,
it is comparatively high in melon [41]. Thus, it has been postulated that the genomic size differences between
melon and cucumber is due mainly to the expansion of
inter-genic regions and proliferation of transposable elements
in the melon genome [41].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขนาดจีโนมของแตงโม (12 โครโมโซมคู่) คือประมาณ 454 Mb และแตงกวา (7 โครโมโซมคู่) มีขนาดจีโนมของ Mbp 367 [13] การวิวัฒนาการความสัมพันธ์ระหว่างแตงโมและแตงกวาสามารถถูกตรวจสอบ โดยการวิเคราะห์โครโมโซม ใน Kirkbride ของอนุกรมวิธานวัด Cucumis [2], subgenus Cucumis ถือว่าดั้งเดิมและ subgenus Melo ถูกตั้งสมมติฐานว่าการได้รับมาจากนั้นผ่านการกระจายตัวของโครโมโซม [14-16] ในทางตรงกันข้าม cytological สืบสวนได้ยังแนะนำว่า พันธุ์โบราณ subgenus Melo ให้ subgenus Cucumis พันธุ์ฟิวชั่นโครโมโซมหรือการสับเปลี่ยนไม่ใช่ homologous [17,18] อย่างไรก็ตาม Seshadri [19] และ Ramachandran โต้เถียงว่า subgenera สองไม่ใกล้ชิดเกี่ยวข้องที่ให้ความแตกต่างของจำนวนโครโมโซมและการกระจายทางภูมิศาสตร์ ขนาด องค์กร และลักษณะการทำงานล่าสุดตามโมเลกุล phylogenetic วิเคราะห์ของ Cucumis สนับสนุนทฤษฏีที่จำนวนโครโมโซมพื้นฐาน x = 7 สำเร็จ โดยโครโมโซมลดจาก x = 12 progenitor พันธุ์ [8,10,12]แม้ มีความสัมพันธ์ phylogenetic หมด[20,21], genomes ของแตงโมและแตงกวาที่ดูเหมือนจะมีอยู่สูง ความคล้ายคลึงระหว่างสปีชีส์ตาม transferability เครื่องหมายโมเลกุลในพืช cucurbitมีทั้งจัดทำเอกสาร Neuhausen [20] รายงาน affinities ระหว่างพันธุ์ cucurbit โดยระบุโมเลกุลขน-hybridizations (เช่น สัญญาณ) โดยใช้ RFLP คลิปปากตะเข้ก่อนเมื่อเร็ว ๆ นี้ Katzir et al. [21] และ al. et Danin-Poleg [22] กำหนดเฉพาะภูมิภาค genomic ใช้ผลิตภัณฑ์รองพื้น SSR สำแดงลำดับจำนวนมาก homologiesแตงกวาและแตงโม Danin Poleg et al. [23] ระบุเครื่องหมาย SSR 9 ร่วมกันระหว่างแตงโมและแตงกวา และเสนอให้ เชื่อมโยงกลุ่ม B ของแตงกวา และแตงโม E กลุ่มเชื่อมโยง และ 2 ได้ syntenic ตั้งแต่ 2000 เครื่องหมายโมเลกุล (หลัก SSRs)พัฒนาจากแตงโมถูกนำมาใช้อยู่เสมอ ในการศึกษาแผนที่ทางพันธุกรรมของแตงกวา หรือในทางกลับกัน [24-37]ระดับสูงของ synteny และอนุรักษ์ระหว่างนอกจากนี้ยังได้ถูกสาธิต genomes แตงโมและแตงกวาที่ระดับลำดับดีเอ็นเอ (ไมโคร-synteny)สวนร้อยเอ็ด al. [38] และ Meyer et al. [39] เปรียบเทียบ genomic DNA flanking ซูกินีโมเสกสีเหลืองไวรัสต้านทานโลกัสโพล (zym) แตงโมและแตงกวา และพบเครื่องหมายมาก colinearity ระหว่างพันธุ์ดังกล่าว จัดตำแหน่งของแตงโมส่วนบัคและบัคโคลน (6.7 Mbp) ลำดับของแตงโมกับร่างแตงกวาแอสเซมบลีจีโนม (บรรทัด Gy 14) เปิดเผย homology 90% ระหว่างลำดับเปรียบเทียบ [40,41] แม้ว่ากิจกรรม transposition พบจะต่ำในแตงกวาก็ดีอย่างหนึ่งสูงแตงโม [41] ดังนั้น มันมีได้ postulated ว่า ขนาด genomic ส่วนต่างระหว่างแตงโมและแตงกวาเป็นเนื่องจากส่วนใหญ่การขยายตัวของgenic ระหว่างภูมิภาคและขยายตัวขององค์ประกอบ transposableในกลุ่มแตง [41]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขนาดจีโนมของแตงโม (12 คู่โครโมโซม) ประมาณ 454 Mb และแตงกวา (7 คู่โครโมโซม) มีขนาดจีโนมของ 367 Mbp [13] วิวัฒนาการ
ความสัมพันธ์ระหว่างแตงโมและแตงกวาสามารถตรวจสอบผ่านการวิเคราะห์โครโมโซม ใน Kirkbride ของการประเมินการจัดหมวดหมู่ของ [2] Cucumis, subgenus Cucumis ถือว่าดั้งเดิมและ subgenus Melo ถูกตั้งสมมติฐานว่าจะได้รับมาจากมันผ่านการกระจายตัวของโครโมโซม [14-16] ในทางตรงกันข้ามการตรวจสอบเซลล์วิทยายังได้ชี้ให้เห็นว่าสปีชีส์ของบรรพบุรุษของ subgenus Melo ก่อให้เกิดสายพันธุ์ subgenus Cucumis ให้
ฟิวชั่นผ่านทางโครโมโซมหรือไม่คล้ายคลึงกันโยกย้าย [17,18] อย่างไรก็ตาม Ramachandran และ Seshadri [19] เป็นที่ถกเถียงกันว่าทั้งสองสกุลย่อยที่ไม่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดให้ความแตกต่างในการกระจายทางภูมิศาสตร์และจำนวนโครโมโซมขนาดองค์กรและพฤติกรรม
การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการที่ผ่านมาเพิ่มเติมโมเลกุลตาม Cucumis สนับสนุนสมมติฐานที่ว่าจำนวนโครโมโซมฐาน ของ x = 7 ก็ประสบความสำเร็จจากการลดลงจากโครโมโซม x = 12 รากเหง้าเผ่าพันธุ์ [8,10,12] แม้จะมีความสัมพันธ์ของพวกเขาที่แตกต่าง phylogenetic
[20,21], จีโนมของแตงโมและแตงกวาดูเหมือนจะได้รับการอนุรักษ์อย่างมาก ความคล้ายคลึงกันข้ามสายพันธุ์ที่ขึ้นอยู่กับการถ่ายโอนเครื่องหมายโมเลกุลในพืชตระกูลแตง
มีเอกสารดี Neuhausen [20] ครั้งแรกที่รายงานความพอใจในหมู่สายพันธุ์แตงโดยการระบุโมเลกุลข้าม hybridizations (เช่นสัญญาณ) โดยใช้ยานสำรวจ RFLP
อีกไม่นาน Katzir และคณะ [21] และ Danin-Poleg et al. [22] กำหนดภูมิภาคจีโนมที่เฉพาะเจาะจงโดยใช้ SSR ผลิตภัณฑ์รองพื้นจะเปิดเผย homologies ลำดับมาก
ระหว่างแตงกวาและแตงโม Danin-Poleg และคณะ [23] ระบุเก้าเครื่องหมาย SSR ร่วมกันระหว่างแตงโมและแตงกวาและเสนอว่าแตงกวาของพวกเขาเชื่อมโยงกลุ่มบีและแตงโมเชื่อมโยงกลุ่มอีและ 2 เป็น syntenic ตั้งแต่ปี 2000 โมเลกุลเครื่องหมาย (ส่วนใหญ่ SSRs)
พัฒนามาจากแตงโมที่ได้รับการใช้เป็นประจำในแตงกวาศึกษาการทำแผนที่ทางพันธุกรรมหรือในทางกลับกัน [24-37] ได้โดยเริ่มต้นระดับสูงของ synteny และการอนุรักษ์ระหว่าง
แตงโมและแตงกวาจีโนมได้รับการแสดงให้เห็นถึงดีเอ็นเอ ระดับลำดับ (ไมโคร synteny) .Park และคณะ [38] และเมเยอร์และคณะ [39] เมื่อเทียบดีเอ็นเอขนาบบวบสีเหลืองกระเบื้องโมเสคต้านทานไวรัสที (ZYM) ในแตงโมและแตงกวาและ
ตรวจพบ colinearity เครื่องหมายมากระหว่างสายพันธุ์เหล่านั้น การจัดตำแหน่งของแตงโม BAC-end และ BAC โคลน (6.7 Mbp) ลำดับของแตงโมกับร่างแตงกวา
ประกอบจีโนม (สาย Gy 14) เปิดเผยว่า 90% ที่คล้ายคลึงกันระหว่างลำดับเมื่อเทียบ [40,41] แม้ว่ากิจกรรมการขนย้ายก็พบว่าอยู่ในระดับต่ำในแตงกวา
มันสูงเมื่อเทียบกับในแตงโม [41] ดังนั้นจึงได้มีการตั้งสมมติฐานว่าความแตกต่างของขนาดจีโนมระหว่าง
แตงโมและแตงกวาเป็นสาเหตุหลักมาจากการขยายตัวของ
ภูมิภาคระหว่าง Genic และการขยายตัวขององค์ประกอบ transposable
ในจีโนมแตงโม [41]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จีโนมขนาดของเมลอน ( 12 โครโมโซมคู่ ) คาดว่าจะอยู่ที่ 454 MB และแตงกวา ( 7 โครโมโซมคู่ ) มีจีโนมขนาด 367 MBP [ 13 ] ความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการระหว่างแตงโมและแตงกวา
สามารถศึกษาผ่านการวิเคราะห์โครโมโซม ในอนุกรมวิธานของเคิร์กไบรด์การประเมิน cucumis [ 2 ]subgenus cucumis ถือว่าเป็นแบบดั้งเดิมและ subgenus เมโลเป็นสมมุติฐานที่จะได้รับมาจากผ่านโครโมโซมกระจายตัว [ ซึ่ง ] ในทางตรงกันข้าม การสอบสวนยังพบว่า บรรพบุรุษสามารถมีชนิดของ subgenus เมโลให้สูงขึ้นเพื่อ subgenus cucumis ชนิด
ผ่านโครโมโซมฟิวชั่นหรือไม่ใช่โฮโมโลกัส โยกย้าย [ 17,18 ] อย่างไรก็ตามRamachandran และ seshadri [ 19 ] โต้เถียงว่า สอง subgenera ไม่ได้เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดให้ความแตกต่างในการกระจายทางภูมิศาสตร์และจำนวนโครโมโซม ขนาดองค์กรและพฤติกรรม .
ล่าสุดจากการวิเคราะห์โมเลกุล ซึ่งสนับสนุนสมมติฐานที่ว่า ฐานจํานวนโครโมโซม X = 7 พบว่าโครโมโซมลดลงจาก x = 12 ต้นตระกูลสายพันธุ์ [ 8,10,12 ] cucumis .ของพวกเขาที่แตกต่างกัน ซึ่งมีความสัมพันธ์ 20,21
[ ] , จีโนมของแตงโมและแตงกวา ดูเหมือนจะเป็น ที่มีการอนุรักษ์ . ข้ามชนิดกัน ขึ้นอยู่กับกำหนดการเครื่องหมายโมเลกุลของแตงโมพืช
มีเอกสารดี neuhausen [ 20 ] รายงานแรก affinities ในหมู่ตำรวจ โดยระบุ hybridizations ข้ามชนิดโมเลกุล ( เช่นสัญญาณ ) โดยใช้ RFLP probes .
เมื่อเร็วๆ นี้katzir et al . [ 21 ] และ danin นอกจากนี้ et al . [ 22 ] กำหนดเฉพาะจีโนมภูมิภาคใช้ผลิตภัณฑ์รองพื้น SSR เปิดเผย
ลำดับ homologies มากระหว่างแตงกวาและเมลอน danin นอกจากนี้ et al . [ 23 ] ระบุเก้าเครื่องหมาย SSR ร่วมกัน ระหว่าง แตงโม และแตงกวา แตงกวา และเสนอว่าพวกเขาเชื่อมโยงกลุ่ม B และกลุ่ม E แตงเชื่อมโยง 2 มี syntenic . ตั้งแต่ปี 2000 ,โมเลกุลเครื่องหมาย ( หลัก ssrs )
พัฒนาจากแตงโมถูกใช้ตรวจในการทำแผนที่การศึกษาพันธุกรรมแตงกวาหรือในทางกลับกัน [ ใบ ] . ระดับ synteny และอนุรักษ์ระหว่าง
เมล่อนและจีโนมแตงกวายังได้รับแสดงให้เห็นในระดับไมโคร ( ดีเอ็นเอลำดับ synteny ) ปาร์ค et al . [ 38 ] และเมเยอร์ et al .[ 39 ] เทียบดีเอ็นเอจบวบไวรัสโมเสกเหลืองต้านทานโลคัส ( zym ) แตงโมและแตงกวาและตรวจพบเครื่องหมาย
colinearity มากระหว่างชนิดนั้น การแตงบั๊กสิ้นสุดและบัคโคลนขึ้น ( MBP ) ลำดับของจีโนมแตงกวาแตงโมกับร่าง
ประกอบ ( เส้น GY 14 ) เปิดเผย 90% homology ระหว่างเทียบลำดับ [ 40,41 ]แม้ว่ากิจกรรมตำแหน่งอยู่ต่ำในแตงกวา ,
มันเปรียบเทียบสูงในแตงโม [ 41 ] ดังนั้นจึงได้รับการ postulated ว่าจีโนมขนาดความแตกต่างระหว่าง
แตงโมและแตงกวานั้นเนื่องจากการขยายตัวของภูมิภาค และการทำให้เป็นอินเตอร์

องค์ประกอบตรวจแตงโม ) [ 41 ]