Correlations between gene expressio

Correlations between gene expression and metabolite/phytohormone levels under abiotic stress conditions have been reported for Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). However, little is known about these correlations in rice (Oryza sativa‘Nipponbare’), despite its importance as a model monocot. We performed an integrated analysis to clarify the relationships among cold- and dehydrationresponsive metabolites, phytohormones, and gene transcription in rice. An integrated analysis of metabolites and gene expression indicated that several genes encoding enzymes involved in starch degradation, sucrose metabolism, and the glyoxylate cycle are upregulated in rice plants exposed to cold or dehydration and that these changes are correlated with the accumulation of glucose (Glc), fructose, and sucrose. In particular, high expression levels of genes encoding isocitrate lyase and malate synthase in the glyoxylate cycle correlate with increased Glc levels in rice, but not in Arabidopsis, under dehydration conditions, indicating that the regulation
of the glyoxylate cycle may be involved in Glc accumulation under dehydration conditions in rice but not Arabidopsis. An integrated analysis of phytohormones and gene transcripts revealed an inverse relationship between abscisic acid (ABA) signaling and cytokinin (CK) signaling under cold and dehydration stresses; these stresses increase ABA signaling and decrease CK signaling. High levels ofOryza sativa 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts correlate with ABA accumulation, and low levels of Cytochrome P450 (CYP) 735Atranscripts correlate with decreased levels of a CK precursor in rice. This reduced expression of CYP735Asoccurs in rice but not Arabidopsis. Therefore, transcriptional regulation ofCYP735Asmight be involved in regulating CK levels under cold and dehydration conditions in rice but not Arabidopsis

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความสัมพันธ์ระหว่างยีนนิพจน์และ metabolite/phytohormone ระดับสภาวะเครียด abiotic ถูกรายงานใน Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) อย่างไรก็ตาม น้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับความสัมพันธ์เหล่านี้ข้าว (Oryza sativa'Nipponbare') แม้ มีความสำคัญเป็น monocot รุ่น เราทำการวิเคราะห์วงจรเพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่างเย็น และ dehydrationresponsive metabolites, phytohormones และ transcription ของยีนในข้าว การวิเคราะห์วงจรของ metabolites และยีนบ่งชี้หลายยีนเอนไซม์ย่อยสลายแป้ง เผาผลาญซูโครส และวัฏจักรเกี่ยวข้องกับการเข้ารหัสใช้ upregulated ในพืชข้าวสัมผัสเย็นการคายน้ำ และการที่ เปลี่ยนแปลงเหล่านี้มี correlated กับสะสมกลูโคส (Glc), ฟรักโทส และซูโครส โดยเฉพาะ นิพจน์สูงระดับของยีนเข้า isocitrate lyase และมาลา synthase ในวัฏจักรการเชื่อมโยงมีระดับเพิ่มขึ้น Glc ในข้าว แต่ไม่ใช่ ใน Arabidopsis สภาวะ คายน้ำเพื่อระบุว่า ข้อบังคับของ glyoxylate ใน วงจรอาจจะเกี่ยวข้องใน Glc สะสมภายใต้เงื่อนไขการคายน้ำในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis การวิเคราะห์วงจร phytohormones และใบแสดงผลของยีนเปิดเผยความสัมพันธ์ผกผันระหว่างกรดแอบไซซิก (ABA) สัญญาณและสัญญาณ cytokinin (CK) ภายใต้ความเครียดเย็นและคายน้ำ ความเครียดเหล่านี้เพิ่ม ABA ตามปกติและลดสัญญาณ CK ความสัมพันธ์ระดับสูง ofOryza ซา 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts สะสม ABA และความสัมพันธ์ระดับต่ำของ Cytochrome P450 (CYP) 735Atranscripts ระดับการลดลงของสารตั้งต้น CK ในข้าว นี้ลดค่าของ CYP735Asoccurs ในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis ดังนั้น ofCYP735Asmight transcriptional ระเบียบเกี่ยวข้องในการควบคุมระดับ CK สภาวะเย็นและการคายน้ำในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความสัมพันธ์ระหว่างการแสดงออกของยีนและระดับสาร / phytohormone ภายใต้เงื่อนไขความเครียด abiotic ได้รับรายงานสำหรับ Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) แต่ไม่ค่อยมีใครรู้เกี่ยวกับความสัมพันธ์เหล่านี้ในข้าว (Oryza sativa'Nipponbare) แม้จะมีความสำคัญในฐานะที่เป็นใบเลี้ยงเดี่ยวรูปแบบ เราดำเนินการวิเคราะห์แบบบูรณาการเพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่างสาร cold- และ dehydrationresponsive, phytohormones และการถอดรหัสยีนในข้าว การวิเคราะห์แบบบูรณาการของสารและการแสดงออกของยีนที่ชี้ให้เห็นว่ายีนหลายเข้ารหัสเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายแป้งเผาผลาญน้ำตาลซูโครสและวงจร glyoxylate จะ upregulated ในพืชข้าวสัมผัสกับความหนาวเย็นหรือการคายน้ำและว่าการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้จะมีความสัมพันธ์กับการสะสมของน้ำตาลกลูโคส (Glc) ฟรุกโตสและซูโครส โดยเฉพาะอย่างยิ่งระดับการแสดงออกสูงของยีนที่ควบคุมการไอเลส isocitrate และเทส malate ในรอบ glyoxylate มีความสัมพันธ์กับระดับ Glc ที่เพิ่มขึ้นในข้าว แต่ไม่ได้อยู่ใน Arabidopsis
ภายใต้เงื่อนไขการคายน้ำแสดงให้เห็นว่าการควบคุมของวงจรglyoxylate อาจจะเกี่ยวข้องกับการสะสม Glc ภายใต้ เงื่อนไขการคายน้ำในข้าว แต่ไม่ Arabidopsis การวิเคราะห์แบบบูรณาการของ phytohormones และจิตบำบัดยีนเปิดเผยความสัมพันธ์แบบผกผันระหว่างกรดแอบไซซิก (ABA) ส่งสัญญาณและไซโตไคนิ (CK) ส่งสัญญาณภายใต้ความเครียดและการคายน้ำเย็น; ความเครียดเหล่านี้จะเพิ่มการส่งสัญญาณสดและลดการส่งสัญญาณ CK ระดับสูง ofOryza sativa 9 ถูกต้อง-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts มีความสัมพันธ์กับการสะสม ABA และระดับต่ำของ Cytochrome P450 (CYP) 735Atranscripts ลดลงมีความสัมพันธ์กับระดับของสารตั้งต้น CK ข้าว นี้การแสดงออกที่ลดลงของ CYP735Asoccurs ข้าว แต่ไม่ Arabidopsis ดังนั้นการควบคุมการถอดรหัส ofCYP735Asmight มีส่วนร่วมในการควบคุมระดับ CK ภายใต้สภาพอากาศหนาวเย็นและการคายน้ำในข้าว แต่ไม่ Arabidopsis

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความสัมพันธ์ระหว่างการแสดงออกของยีนและระดับอุณหภูมิ / phytohormone ภายใต้สภาวะความเครียด ไร่ถูกรายงานว่ามี Arabidopsis ( Arabidopsis thaliana ) แต่น้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับความสัมพันธ์เหล่านี้ในข้าว ( Oryza sativa'nipponbare ' ) แม้จะมีความสำคัญเป็นพืชใบเลี้ยงเดี่ยว แบบจำลองเราทำการวิเคราะห์แบบบูรณาการเพื่อชี้แจงความสัมพันธ์ระหว่างเย็นและ dehydrationresponsive metabolites phytohormones และยีนถอดความในข้าว การวิเคราะห์รวมของหลายชนิดและการแสดงออกของยีนหลายยีนเข้ารหัส พบว่าเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญแป้ง โดยการย่อยสลายและวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิดเป็น upregulated ในต้นข้าวสัมผัสกับน้ำเย็นหรือน้ำและการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้มีความสัมพันธ์กับการสะสมกลูโคส ( glc ) , ฟรุคโตสและซูโครส โดยเฉพาะระดับการแสดงออกของยีนเข้ารหัสสูง lyase ไอโซซิเตรตและ malate synthase ในวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิดมีความสัมพันธ์กับการเพิ่มระดับ glc ในข้าว แต่ไม่ใช่ใน Arabidopsis ,ภายใต้สภาวะขาดน้ำ ระบุว่า ระเบียบ
จากวงจรทฤษฎีบทเวียนบังเกิดอาจเกี่ยวข้องกับ glc สะสมภายใต้สภาวะ dehydration ในข้าว แต่ไม่ Arabidopsis . การวิเคราะห์รวมของ phytohormones และยีนยีนเปิดเผยความสัมพันธ์ผกผันระหว่าง abscisic acid ( ABA ) การส่งสัญญาณและไซโทไคนิน ( CK ) ส่งสัญญาณในเย็นและการเน้น ;การเพิ่มและลดความเครียดเหล่านี้ ABA CK ส่งสัญญาณ ระดับ oforyza , 9-cis-epoxycarotenoid dioxygenasetranscripts สัมพันธ์กับการสะสม ABA และระดับต่ำของโครมพี 450 ( CYP ) 735atranscripts มีความสัมพันธ์กับระดับของ CK ลดลง โปรตีนในข้าว ลดการแสดงออกของ cyp735asoccurs ในข้าวแต่ไม่ Arabidopsis . ดังนั้นลอง ofcyp735asmight มีส่วนร่วมในการออกข้อบังคับระเบียบหรือเงื่อนไขในระดับใต้เย็นและแห้งข้าวแต่ไม่ Arabidopsis