The DNA from an M. goodii strain SB

The DNA from an M. goodii strain SB 314/96 isolate
was extracted by lysis with cetyltrimethylammonium
bromide (CTAB), according to Sambrook & Russell
(2001). Molecular diagnosis was performed by analysis
of the partial sequencing of triplicate DNA product of
approximately 1500 bp amplified from the 16S rRNA
gene using universal primers (Fredricks & Relman, 1998).
The PCR product was sequenced with ACT Gene Ana´ lises
Moleculares LTDA (Centro de Biotecnologia) using an
automatic sequencer ABI-PRISM 3100 Genetic Analyzer
(Applied Biosystems). The sequences were submitted to a
consensus analysis based on chromatogram reliability
obtained with the Staden Package Gap 4 program
(Staden et al., 2000) and alignment by National
Center for Biotechnology Information BLAST with DNASIS
software (v.2.5; Hitachi Software Engineering Co.). In
order to confirm the identification of the isolate as M.
goodii, we performed a phylogenetic analysis based on the
16S rRNA gene using the neighbour-joining method. In
order to calculate the evolutionary distances and the
pairwise deletion of gaps, the p-distance was implemented
with MEGA v.5.2.2 software.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แยกดีเอ็นเอจากม. goodii ต้องใช้ SB 314/96ถูกสกัด โดย lysis ด้วย cetyltrimethylammoniumโบรไมด์ (CTAB), ตาม Sambrook และรัสเซล(2001) ทำการวินิจฉัยระดับโมเลกุล โดยวิเคราะห์ของลำดับบางส่วนของ triplicate ดีเอ็นเอของประมาณ 1500 bp ขยายจาก 16S rRNAยีนใช้ไพรเมอร์สากล (Fredricks & Relman, 1998)มีการเรียงลำดับผลิตภัณฑ์ PCR กับบัญญัติยีน Ana´ lisesLTDA Moleculares (เซ็นโทรเดอ Biotecnologia) โดยใช้การอัตโนมัติ sequencer ABI ปริซึม 3100 วิเคราะห์ทางพันธุกรรม(Biosystems ใช้) ลำดับที่ถูกส่งไปตามความเชื่อถือ chromatogram วิเคราะห์มติได้ ด้วยโปรแกรม Staden แพคเกจช่วง 4(Staden et al., 2000) และการจัดตำแหน่งแห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพระเบิดกับ DNASISซอฟต์แวร์ (v.2.5 ฮิตาชิวิศวกรรมซอฟต์แวร์จำกัด) ในสั่งให้ยืนยันรหัสแยกเป็น Mgoodii เราทำการวิเคราะห์ phylogenetic ตาม16S rRNA ยีนโดยใช้วิธีการรวมเพื่อนบ้าน ในใบสั่งเพื่อคำนวณระยะทางวิวัฒนาการและการลบแพร์ไวส์ได้ดำเนิน p-ระยะห่างของช่องเม v.5.2.2 ซอฟต์แวร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ดีเอ็นเอจากสายพันธุ์เอ็ม goodii SB 314/96
แยกถูกสกัดโดยการสลายcetyltrimethylammonium
กับโบรไมด์(CTAB) ตาม Sambrook และรัสเซล
(2001) การวินิจฉัยระดับโมเลกุลได้ดำเนินการโดยการวิเคราะห์ของลำดับบางส่วนของผลิตภัณฑ์ดีเอ็นเอเพิ่มขึ้นสามเท่าของประมาณ1,500 bp ขยายจาก 16S rRNA ยีนโดยใช้ไพรเมอร์สากล (Fredricks และ Relman, 1998). ผลิตภัณฑ์ PCR ได้ติดใจกับ ACT ยีน Ana' lises Moleculares LTDA (Centro เด Biotecnologia) โดยใช้ซีเควนอัตโนมัติABI PRISM-3100 วิเคราะห์ทางพันธุกรรม(Applied Biosystems) ลำดับที่ถูกส่งไปยังการวิเคราะห์ความสอดคล้องกันขึ้นอยู่กับความน่าเชื่อถือ chromatogram ได้กับแพคเกจ Staden Gap 4 โปรแกรมและการจัดตำแหน่งแห่งชาติ(Staden et al, 2000.) ศูนย์เทคโนโลยีชีวภาพข้อมูลระเบิดกับ DNASIS ซอฟแวร์ (v.2.5; ฮิตาชิ จำกัด วิศวกรรมซอฟต์แวร์ ) ในการสั่งซื้อเพื่อยืนยันบัตรประจำตัวของแยกเป็นเมตรgoodii เราดำเนินการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการอยู่บนพื้นฐานของ16S rRNA ยีนโดยใช้วิธีเพื่อนบ้านเข้า ในการคำนวณระยะทางวิวัฒนาการและที่ลบจากจำนวนของช่องว่างที่พีไกลถูกนำมาใช้กับซอฟต์แวร์v.5.2.2 MEGA