In order to identify transcription

In order to identify transcription factorsmost likely to bind and regulate
the activity of the ABCB10 promoter, we performed a detailed in
silico analysis of ABCB10 promoter with MatInspector software which
revealed presence of numerous putative binding sites. Among them,
two types of potential binding sites/response element stood out by
their number and conserved character: those for the Sp and E2F families
of transcription factors (data not shown and Fig. 1). Already in our recent
publication [20],wherewe analysed promoters of ABC transporters
that were identified as potential factors for melanoma multidrug resistance,
we found that GC-boxes binding Sp factors are overrepresented
within ABCB10 promoter. Moreover, using mithramycin A, an inhibitor
of Sp factor binding, we were able to decrease the expression of
ABCB10 (and other ABC genes) in a melanoma cell line [20]. However,
since Sp1 is mostly associated with constitutive maintenance of basal
expression level of CpG-rich promoter-containing genes, in the present
work we focused on the other prominent group of potential regulatory
factors we identified – the E2F family – since they are more likely to be
relevant to physiological modulation of ABCB10 expression.We identified
six high-probability E2F binding motifs within the location of the
putative proximal ABCB10 promoter, labelling them sites 1 through 6
(Fig. 1), corresponding to three different types of consensus E2F response
element sequences (Fig. 1) reported in literature [21,22].

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เพื่อระบุแนวโน้มที่จะผูก และควบคุม transcription factorsmostกิจกรรมของโปรโมเตอร์ ABCB10 เราดำเนินการเป็นรายละเอียดในวิเคราะห์ silico โปรโมเตอร์ ABCB10 กับซอฟต์แวร์ MatInspector ซึ่งเปิดเผยสถานะของไซต์รวม putative จำนวนมาก ในหมู่พวกเขายืนสองชนิดขององค์ประกอบศักยภาพรวมไซต์/ตอบโดยตัวเลขและอักขระนำ: ที่สำหรับครอบครัว Sp และ E2Fปัจจัยในการ transcription (ข้อมูลที่ไม่แสดงและ Fig. 1) แล้วในของเราล่าสุดพิมพ์ [20], ก่อ wherewe analysed ของ ABC ผู้ที่ระบุเป็นปัจจัยศักยภาพสำหรับต้านทาน multidrug เมลาโนมาเราพบ GC-กล่องผูกปัจจัย Sp overrepresentedภายใน ABCB10 โปรโมเตอร์ นอกจากนี้ ใช้ mithramycin A ผลการของ Sp ตัวผูก เราไม่สามารถลดการABCB10 (และยีนอื่น ๆ ABC) ในบรรทัดเซลล์เมลาโนมา [20] อย่างไรก็ตามตั้งแต่ Sp1 เป็นส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับการบำรุงรักษาขึ้นของโรคระดับนิพจน์ของริชประเภทวัสดุสิ้นเปลืองที่ประกอบด้วยโปรโมเตอร์ยีน ในปัจจุบันงานเราเน้นเด่นอีกกลุ่มศักยภาพกำกับดูแลปัจจัยที่เราระบุ –ครอบครัว E2F – เนื่องจากพวกเขามีแนวโน้มที่จะเอ็มที่เกี่ยวข้องกับสรีรวิทยาของนิพจน์ ABCB10เราระบุหกความผูก E2F สูงความน่าเป็นภายในสถานที่putative proximal ABCB10 โปรโมเตอร์ ฉลากออกไซต์ 1 ถึง 6กิน 1), ที่สอดคล้องกับมติ E2F ตอบรับสามประเภทรายงานลำดับองค์ประกอบ (Fig. 1) ในวรรณคดี [21,22]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อที่จะระบุแนวโน้มการถอดความ factorsmost การผูกและควบคุม
การทำงานของโปรโมเตอร์ ABCB10 เราดำเนินการรายละเอียดใน
การวิเคราะห์ silico ของโปรโมเตอร์ ABCB10 กับซอฟต์แวร์ MatInspector ซึ่ง
เผยให้เห็นการปรากฏตัวของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันมากมายสมมุติ ในหมู่พวกเขา
ทั้งสองประเภทของเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันที่มีศักยภาพ / องค์ประกอบการตอบสนองออกมายืนโดย
จำนวนของพวกเขาและตัวอักษรอนุรักษ์: ผู้ Sp และครอบครัว E2F
(. ไม่ได้แสดงข้อมูลและรูปที่ 1) ของปัจจัยการถอดความ แล้วในล่าสุดของเรา
ที่ตีพิมพ์ [20], wherewe วิเคราะห์โปรโมเตอร์ของเอบีซี transporters
ที่ถูกระบุว่าเป็นปัจจัยที่มีศักยภาพสำหรับความต้านทานเนื้องอก multidrug,
เราพบว่า GC-กล่องผูกพันปัจจัย Sp จะ overrepresented
ภายในก่อการ ABCB10 นอกจากนี้การใช้ mithramycin ยับยั้ง
ปัจจัย Sp ผูกพันเราสามารถที่จะลดการแสดงออกของ
ABCB10 (และยีน ABC อื่น ๆ ) ในเซลล์เนื้องอก [20] อย่างไรก็ตาม
ตั้งแต่ SP1 จะเกี่ยวข้องกับการบำรุงรักษาส่วนใหญ่ที่เป็นส่วนประกอบของฐาน
ระดับการแสดงออกของโปรโมเตอร์ที่มี CpG ที่อุดมไปด้วยยีนในปัจจุบัน
การทำงานของเรามุ่งเน้นไปที่กลุ่มที่โดดเด่นอื่น ๆ ของการกำกับดูแลที่มีศักยภาพ
ปัจจัยที่เราระบุ - ครอบครัว E2F - เนื่องจากพวกเขาจะมีโอกาสมากขึ้น จะเป็น
ที่เกี่ยวข้องกับการปรับทางสรีรวิทยาของ ABCB10 expression.We ระบุ
หกความน่าจะเป็นสูง E2F ผูกพันลวดลายภายในสถานที่ตั้งของ
ผู้ก่อการ ABCB10 ใกล้เคียงสมมุติแปะพวกเขาเว็บไซต์ที่ 1 ถึง 6
(รูปที่ 1). สอดคล้องกับสามประเภทที่แตกต่างกันของฉันทามติการตอบสนอง E2F
ลำดับองค์ประกอบ (รูปที่ 1). รายงานในวรรณคดี [21,22]

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อระบุการถอดความ factorsmost มีแนวโน้มที่จะผูกและควบคุมกิจกรรมของ abcb10
โปรโมเตอร์เราแสดงรายละเอียดในการวิเคราะห์โครงข่ายของ abcb10 โปรโมเตอร์ด้วย

matinspector ซอฟต์แวร์ที่พบมีหลายเว็บไซต์ซึ่งผูกพัน . ในหมู่พวกเขา
สองชนิดขององค์ประกอบเว็บไซต์ / การตอบสนองรวมศักยภาพยืนออกโดย
หมายเลขของตนเอง และตัวละคร : อนุรักษ์สำหรับ SP และ e2f ครอบครัว
ปัจจัยการถอดความ ( ข้อมูลไม่แสดง และรูปที่ 1 ) แล้วล่าสุดของเรา
สิ่งพิมพ์ [ 20 ] , wherewe วิเคราะห์โปรโมเตอร์ของ ABC transporters
ที่ถูกระบุว่าเป็นปัจจัยสำหรับการ melanoma ความต้านทาน
เราพบว่า กล่อง GC ผูก SP มี overrepresented
ภายในการ abcb10 . นอกจากนี้ การใช้ mithramycin
, ยับยั้งของ SP ปัจจัยผูก เราสามารถลดการแสดงออกของ
abcb10 ( และยีน ABC ) ในเซลล์เนื้องอกเส้น [ 20 ] อย่างไรก็ตาม
ตั้งแต่ SP1 ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับการบำรุงรักษาและระดับการแสดงออกของแรกเริ่ม
ของ CPG รวยโปรโมเตอร์ที่มียีน ในงานปัจจุบัน
เราเน้นกลุ่มที่โดดเด่นอื่น ๆที่มีศักยภาพกฎระเบียบ
ปัจจัยที่เราระบุและ e2f ครอบครัว–เพราะพวกเขามีแนวโน้มที่จะได้รับที่เกี่ยวข้องกับการปรับทางสรีรวิทยา
การแสดงออกของ abcb10 เราระบุ
6 มีความเป็นไปได้สูง e2f ผูกลวดลายภายในตำแหน่งของโปรโมเตอร์
ซึ่ง abcb10 ใกล้เคียงฉลากพวกเขาเว็บไซต์ที่ 1 ถึง 6
( รูปที่ 1 ) ซึ่งสอดคล้องกับสามชนิดที่แตกต่างกันของ e2f เอกฉันท์ การตอบสนอง
องค์ประกอบลำดับ ( ฟิค1 ) รายงานในวรรณคดี [ 21,22 ]