Fig. 6. Contrast of the relative anthocyanin and flavone contents among the different capitulum developmental stages in the four shading treatments. (A) Seedlings treated with a
fluorescent lamp. B, C and D indicate the shading of the capitulum, all leaves and the whole plant, respectively. The measurement for relative pigments content was based on Lin and
Harnly (2010). The results are presented as the mean ± SD of three replicates. Different letters represent significant differences at P < 0.01 between the capitulum developmental
stages.
steadily decreased. In contrast, for CmPHYA, it decreased first and
then increased in all treatments during capitulum development.
Moreover, the expression levels of CmPHYB and CmCRY2 steadily
increased, and the remaining two photoreceptor genes (CmCRY1a
and CmCRY1b) expressed irregularly during capitulum
development.
We classified the relativity between gene transcript level and
anthocyanin content into three degrees, namely weak (R2 < 0.33),
moderately significant (0.33 R2 0.66), and significant
(R2 > 0.66). As shown in Fig. 8 and Table S2, the transcript levels of
11 genes, CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6,
CmMYB7-1, CmbHLH24, CmCRY1a, CmCOP1 and CmHY5, were
significantly or moderate significantly correlated with anthocyanin
content; except for the inferred repressor CmMYB7-1, these correlations
were positive. There was a weak correlation between the
transcript levels of the remaining six genes and anthocyanin
content.
Finally, the tissue specificity of gene expression was analyzed.
According to the relative expression levels of each gene in the ray
florets and leaves (Fig. 7 and Table S2), we concluded that nine
genes were specifically expressed in the ray florets, including
CmCHS, CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6,
CmMYB7-1 and CmbHLH24, because under FL, their relative
expression levels were much higher in the ray florets than in the
leaves.
Based on the above results, we deduced four main conclusions
(1) all of the six structural genes in the anthocyanin pathway are
key genes that respond to shading; (2) CmHY5 is an important
enhancer for light-induced anthocyanin biosynthesis; (3) almost all
of the structural and regulatory genes in the anthocyanin pathway,
except for CmF30H, are of flower-specific-expression characteristic;
and (4) all of the five photoreceptor genes, CmPHYA, CmPHYB,
CmCRY1a, CmCRY1b and CmCRY2, are non-essential genes for lightinduced
anthocyanin biosynthesis.
3.4. Hierarchical clustering analyses of gene expression
The four clustering analyses reveal two common points. First,
CmCOP1 and CmHY5 always showed a closer relationship, regardless
of shading treatment. Second, a total of seven genes in the
anthocyanin biosynthesis pathway, including four structural genes
(CmF3H, CmANS, CmDFR and Cm3GT) and three TFs (CmMYB5-1,
CmMYB6 and CmbHLH24), were also more closely related to each
other (Fig. 9). These common points were consistent with the results
obtained from the gene expression analyses.
4. Discussion
4.1. Anthocyanins accumulation in the ray florets
Various works have shown that anthocyanin accumulation and
petal growth are regulated by the same environmental and internal
รูป 6 ความคมชัดของเนื้อหาโฟเลทสูงและ flavone สัมพัทธ์ระหว่างขั้นตอนพัฒนาการของแคปปิทูลัมที่แตกต่างกันในการรักษาแรเงาสี่ (ก) ต้นกล้ารักษาด้วยการหลอดฟลูออเรสเซนต์ B, C และ D แสดงการแรเงาการแคปปิทูลัม ใบทั้งหมด และโรง งานทั้งหมด ตามลำดับ การวัดสีสัมพันธ์เนื้อหาอิงหลิน และHarnly (2010) ผลลัพธ์ได้แสดงเป็นค่าเฉลี่ย± SD ของเหมือนกับสาม ตัวอักษรที่แตกต่างกันแสดงถึงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญที่ P < 0.01 ระหว่างแคปปิทูลัมพัฒนาการขั้นตอนการลดลงอย่างต่อเนื่อง ตรงกันข้าม CmPHYA มันลดก่อน และแล้ว เพิ่มขึ้นในการรักษาทั้งหมดในระหว่างการพัฒนาแคปปิทูลัมนอกจากนี้ ระดับนิพจน์ของ CmPHYB และ CmCRY2 อย่างต่อเนื่องเพิ่มขึ้น และที่เหลือสองรับแสงยีน (CmCRY1aและ CmCRY1b) แสดงไม่สม่ำเสมอระหว่างแคปปิทูลัมการพัฒนาเราจัดความสัมพันธ์ระหว่างยีนระดับเสียงบรรยาย และเนื้อหานั้นลงในสามองศา อ่อนแอคือ (R2 < 0.33),สำคัญปานกลาง (0.33 R2 0.66), และมีความสำคัญ(R2 > 0.66) ดังแสดงในรูป 8 และตาราง S2 ระดับเสียงบรรยายของยีนที่ 11, CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6CmMYB7-1, CmbHLH24, CmCRY1a, CmCOP1 และ CmHY5 ถูกอย่างมีนัยสำคัญ หรือปานกลางมีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญกับโฟเลทสูงเนื้อหา ยกเว้น repressor สรุป CmMYB7-1 ความสัมพันธ์เหล่านี้ดีมาก มีความสัมพันธ์ที่อ่อนระหว่างการบันทึกระดับของยีนที่เหลือหกและโฟเลทสูงเนื้อหาในที่สุด ความจำเพาะของเนื้อเยื่อของยีนถูกวิเคราะห์ตามระดับนิพจน์สัมพัทธ์ของแต่ละยีนใน rayflorets และใบ (รูปที่ 7 และตาราง S2), เราได้ข้อสรุปว่า เก้ายีนที่ถูกแสดงโดยเฉพาะเป็น florets เรย์ รวมทั้งCmCHS, CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6CmMYB7-1 และ CmbHLH24 เนื่องจากภายใต้ FL ญาติของพวกเขาระดับนิพจน์ถูกมากมากกว่าใน florets เรย์ในการใบไม้ตามผลลัพธ์ข้างต้น เราซึ่งสามารถกล่าวได้ข้อสรุปหลักสี่(1) ทั้งหมดของยีนโครงสร้างหกในทางเดินนั้นคีย์ยีนที่ตอบสนองการแรเงา (2) CmHY5 เป็นสำคัญเพิ่มการสังเคราะห์แสงที่เกิดนั้น (3) เกือบทั้งหมดโครงสร้างและ regulatory ยีนในทางเดินนั้นยกเว้น CmF30H มีลักษณะดอกไม้เฉพาะนิพจน์และทั้งหมด (4) ของยีนรับแสงห้า CmPHYA, CmPHYBมียีนไม่จำเป็นสำหรับ lightinduced CmCRY1a, CmCRY1b และ CmCRY2โฟเลทสูงสังเคราะห์3.4 แบบลำดับชั้นระบบคลัสเตอร์วิเคราะห์แสดงออกของยีนการวิเคราะห์ระบบคลัสเตอร์สี่เปิดเผยทั่วไปสองจุด ครั้งแรกCmCOP1 และ CmHY5 มักจะแสดงให้เห็นว่าความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิด โดยไม่คำนึงถึงการแรเงารักษา วินาที จำนวนเจ็ดยีนในการโฟเลทสูงสังเคราะห์เดิน รวมสี่โครงสร้างยีน(CmF3H, CmANS, CmDFR และ Cm3GT) และสาม TFs (CmMYB5-1CmMYB6 และ CmbHLH24), ก็ยังเพิ่มเติมสัมพันธ์กับแต่ละอื่น ๆ (9 รูป) จุดเหล่านี้พบได้สอดคล้องกับผลการจากการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนได้4. สนทนา4.1. anthocyanins สะสมใน florets เรย์ผลงานต่าง ๆ ที่ได้แสดงที่สะสมนั้น และเจริญเติบโตกลีบดอกถูกควบคุม โดยตรงภายใน และสิ่งแวดล้อม
การแปล กรุณารอสักครู่..

มะเดื่อ. 6. ความคมชัดของญาติและ anthocyanin flavone เนื้อหาในหมู่ดอกระยะการพัฒนาที่แตกต่างกันในการรักษาสี่แรเงา (A) ต้นกล้ารับการรักษาด้วย
หลอดไฟนีออน B, C และ D บ่งบอกถึงการแรเงาของดอกใบและพืชทั้งตามลำดับ การวัดสำหรับเนื้อหาเม็ดสีญาติอยู่บนพื้นฐานของหลินและ
Harnly (2010) ผลที่จะได้นำเสนอเป็นค่าเฉลี่ย± SD สามซ้ำ ตัวอักษรที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญเป็นตัวแทนของความแตกต่าง p <0.01 ระหว่างพัฒนาการดอก
ขั้นตอน.
ลดลงอย่างต่อเนื่อง ในทางตรงกันข้ามสำหรับ CmPHYA ก็ลดลงเป็นครั้งแรกและ
จากนั้นที่เพิ่มขึ้นในการรักษาทั้งหมดในระหว่างการพัฒนาดอก.
นอกจากนี้ยังมีระดับการแสดงออกของ CmPHYB และ CmCRY2 อย่างต่อเนื่อง
เพิ่มขึ้นและส่วนที่เหลืออีกสองยีนแสง (CmCRY1a
และ CmCRY1b) แสดงความไม่สม่ำเสมอในช่วงดอก
พัฒนา.
เราจัด ความสัมพันธ์ระหว่างระดับยีนหลักฐานและ
เนื้อหา anthocyanin เป็นสามองศาคืออ่อนแอ (R2 <0.33)
อย่างมีนัยสำคัญในระดับปานกลาง (0.33? R2? 0.66) และอย่างมีนัยสำคัญ
(R2> 0.66) ดังแสดงในรูป 8 และตาราง S2 ระดับบันทึกของ
11 ยีน CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6,
CmMYB7-1, CmbHLH24, CmCRY1a, CmCOP1 และ CmHY5 ได้
อย่างมีนัยสำคัญหรือปานกลางมีความสัมพันธ์กับ anthocyanin
เนื้อหา ยกเว้นอนุมานอดกลั้น CmMYB7-1 ความสัมพันธ์เหล่านี้
เป็นบวก มีความสัมพันธ์ที่อ่อนแอระหว่าง
ระดับบันทึกของที่เหลืออีกหกยีนและ anthocyanin
เนื้อหา.
สุดท้ายจำเพาะเนื้อเยื่อการแสดงออกของยีนได้รับการวิเคราะห์.
ตามที่ระดับการแสดงออกของญาติของแต่ละยีนในเรย์
ดอกและใบ (รูปที่. 7 และตาราง S2) เราได้ข้อสรุปว่าเก้า
ยีนมีการแสดงออกเฉพาะในดอกย่อย ray รวมทั้ง
CmCHS, CmF3H, CmANS, CmDFR, Cm3GT, CmMYB5-1, CmMYB6,
CmMYB7-1 และ CmbHLH24 เพราะภายใต้ FL, ญาติของพวกเขา
ระดับการแสดงออกสูงมาก ในดอกย่อย ray กว่าใน
. ใบ
บนพื้นฐานของผลข้างต้นเราอนุมานสี่ข้อสรุปหลัก
(1) ทั้งหมดของหกยีนโครงสร้างในทางเดิน anthocyanin ที่มี
ยีนที่สำคัญที่ตอบสนองต่อการแรเงา; (2) CmHY5 มีความสำคัญ
เพิ่มแสงเหนี่ยวนำให้เกิดการสังเคราะห์ anthocyanin; (3) เกือบทั้งหมด
ของยีนโครงสร้างและกฎระเบียบในทางเดิน anthocyanin ที่
ยกเว้น CmF30H เป็นดอกไม้เฉพาะการแสดงออกลักษณะ;
และ (4) ทั้งห้ายีนแสง, CmPHYA, CmPHYB,
CmCRY1a, CmCRY1b และ CmCRY2, มียีนที่ไม่จำเป็นสำหรับ lightinduced
สังเคราะห์ anthocyanin.
3.4 การวิเคราะห์การจัดกลุ่มตามลำดับชั้นของการแสดงออกของยีน
ทั้งสี่การจัดกลุ่มวิเคราะห์เปิดเผยสองจุดที่พบบ่อย แรก
CmCOP1 และ CmHY5 เสมอมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดโดยไม่คำนึงถึง
การรักษาแรเงา ประการที่สองรวมเป็นเจ็ดยีนใน
ทางเดินสังเคราะห์ anthocyanin รวมทั้งสี่ยีนโครงสร้าง
(CmF3H, CmANS, CmDFR และ Cm3GT) และสาม TFS (CmMYB5-1,
CmMYB6 และ CmbHLH24) ก็ยังเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับแต่ละ
อื่น ๆ (รูปที่ 9) จุดร่วมกันเหล่านี้มีความสอดคล้องกับผล
ที่ได้รับจากการแสดงออกของยีนวิเคราะห์.
4 การอภิปราย
4.1 anthocyanins สะสมในเรย์ florets
งานต่าง ๆ ได้แสดงให้เห็นว่าการสะสม anthocyanin และ
การเจริญเติบโตของกลีบดอกถูกควบคุมโดยเดียวกันด้านสิ่งแวดล้อมและภายใน
การแปล กรุณารอสักครู่..

รูปที่ 6 ความคมชัดของแอนโธไซยานินของญาติและฟลาโวนเนื้อหาแตกต่างกันแคปปิทูลัมพัฒนาขั้นตอนในการรักษา 4 . ( 1 ) ต้นกล้ารักษาด้วยโคมไฟเรืองแสง B , C และ D แสดงแรเงาของอุตสาหกรรมเบา , ใบและทั้งต้น ตามลำดับ การวัดสําหรับสีเทียบเนื้อหาตามรินharnly ( 2010 ) ผลลัพธ์ที่ได้จะแสดงเป็นค่าเฉลี่ย± SD สาม ได้แก่ ตัวอักษรที่แตกต่างกันแสดงความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติระหว่างหัวกระดูก ?ขั้นตอนอย่างต่อเนื่องลดลง ในทางตรงกันข้าม สำหรับ cmphya มันลดลง แรก และและเพิ่มขึ้นในการรักษาทั้งหมดในระหว่างการพัฒนาหัวกระดูก .นอกจากนี้ ระดับการแสดงออกของ cmphyb cmcry2 อย่างต่อเนื่องและเพิ่มขึ้น และที่เหลืออีก 2 ยีน ( cmcry1a โฟโตรีเซปเตอร์แสดงแนวโน้มในอุตสาหกรรมเบา cmcry1b ) และการพัฒนาเราจำแนกความสัมพันธ์ระหว่างยีนและระดับผลการเรียนแอนโธไซยานินเนื้อหาออกเป็นสามระดับ คือ อ่อนแอ ( R2 < 0.33 )อย่างปานกลาง ( 0.33 R2 0.66 ) , ความ( R2 > 0.66 ) ดังแสดงในรูปที่ 8 และตาราง S2 ระดับผลการเรียน11 ยีน cmf3h cmans cmdfr , , cm3gt cmmyb5-1 cmmyb6 , , , ,cmmyb7-1 cmbhlh24 cmcry1a , , , และ cmcop1 cmhy5 ,ปานกลางอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ หรือมีความสัมพันธ์กับแอนโทไซยานินเนื้อหา ยกเว้นมีผู้ควบคุม cmmyb7-1 ความสัมพันธ์เหล่านี้บวก มีความสัมพันธ์ที่อ่อนแอ ระหว่างระดับผลการเรียน ที่เหลืออีก 6 ยีนและแอนโธไซยานินเนื้อหาในที่สุด เนื้อเยื่อต่อการแสดงออกของยีนถูกวิเคราะห์ตามญาติระดับการแสดงออกของยีนในแต่ละที่ เรย์ดอกและใบ ( รูปที่ 7 และตาราง S1 ) เราสรุปได้ว่า เก้าโดยเฉพาะยีนแสดงออกใน ray florets รวมถึงcmchs cmf3h cmans cmdfr , , , cm3gt cmmyb5-1 cmmyb6 , , , ,และ cmmyb7-1 cmbhlh24 เพราะภายใต้ FL , ญาติของพวกเขาระดับการแสดงออกที่สูงมากในเรย์ดอก กว่าในใบจากข้อมูลข้างต้น เราได้ข้อสรุปหลักสี่( 1 ) ทั้งหมดของหกโครงสร้างยีนในวิถี มีแอนโทไซยานินคีย์ยีนที่ตอบสนองต่อแสง ( 2 ) cmhy5 เป็นสำคัญเพิ่มแสงและแอนโธไซยานินใน ( 3 ) เกือบทั้งหมดโครงสร้างและกฎระเบียบของยีนในแอนโธไซยานินทางเดิน ,ยกเว้น cmf30h มีลักษณะการแสดงออกเฉพาะดอกไม้ให้และ ( 4 ) ทั้งหมดของห้าโฟโตรีเซปเตอร์ยีน cmphya cmphyb , , ,cmcry1a cmcry1b cmcry2 , และ , ไม่สําคัญ lightinduced ยีนแอนโธไซยานินใน .3.4 . การจัดกลุ่มลำดับชั้นวิเคราะห์การแสดงออกของยีน4 การวิเคราะห์ข้อมูลเปิดเผยทั่วไป สองจุด ครั้งแรกcmcop1 cmhy5 เสมอและมีความสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดไม่ว่าของโปรแกรมการรักษา วินาทีทั้งหมดเจ็ดยีนในวิถีการสังเคราะห์แอนโทไซยานิน รวมทั้งสี่โครงสร้างยีน( cmf3h cmans cmdfr , และ , cm3gt ) และสาม ( cmmyb5-1 TFS ,cmmyb6 cmbhlh24 ) และยังเพิ่มเติมที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับแต่ละอื่น ๆ ( รูปที่ 9 ) จุดเหล่านี้โดยทั่วไปที่สอดคล้องกับผลลัพธ์ที่ได้จากการวิเคราะห์การแสดงออกของยีน .4 . การอภิปราย4.1 . แอนโทไซยานินสะสมอยู่ เรย์ ดอกผลงานต่างๆได้แสดงให้เห็นว่าการสะสมแอนโทไซยานิน และการเจริญเติบโตของกลีบดอกมีการควบคุมโดยเดียวกัน และสิ่งแวดล้อมภายใน
การแปล กรุณารอสักครู่..
