Virulent lactococcal phages of the

Virulent lactococcal phages of the Siphoviridae family are responsible for the industrial milk fermentation failures worldwide. Lactococcus lactis, a Gram-positive bacterium widely used for the manufacture of fermented dairy products, is subjected to infections by virulent phages, predominantly those of the 936 group, including phage p2. Among the proteins coded by lactococcal phage genomes, of special interest are those expressed early, which are crucial to efficiently carry out the phage lytic cycle. We previously identified and solved the 3D structure of lactococcal phage p2 ORF34, a single stranded DNA binding protein (SSBp2). Here we investigated the molecular basis of ORF34 binding mechanism to DNA. DNA docking on SSBp2 and Molecular Dynamics simulations of the resulting complex identified R15 as a crucial residue for ssDNA binding. Electrophoretic Mobility Shift Assays (EMSA) and Atomic Force Microscopy (AFM) imaging revealed the inability of the Arg15Ala mutant to bind ssDNA, as compared to the native protein. Since R15 is highly conserved among lactococcal SSBs, we propose that its role in the SSBp2/DNA complex stabilization might be extended to all the members of this protein family.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Phages virulent lactococcal ตระกูล Siphoviridae จะชอบนมอุตสาหกรรมหมักดองความล้มเหลวทั่วโลก Lactococcus lactis แบคทีเรียแบคทีเรียแกรมบวกที่ใช้สำหรับการผลิตผลิตภัณฑ์นมหมัก จะอยู่ภายใต้การติดเชื้อ โดย virulent phages เป็นผู้ของกลุ่ม 936, p phage รวม 2 ระหว่างโปรตีนโดย lactococcal phage genomes ความสนใจเป็นพิเศษ คือผู้แสดงก่อน ซึ่งมีความสำคัญอย่างมีประสิทธิภาพดำเนินวงจร lytic phage เราก่อนหน้านี้ระบุ และแก้ไขโครงสร้าง 3D ของ lactococcal phage p 2 ORF34 เดียวควั่นราคาดีเอ็นเอโปรตีนรวม (SSBp2) ที่นี่เราตรวจสอบข้อมูลพื้นฐานระดับโมเลกุลของ ORF34 ผูกกลไกดีเอ็นเอ ดีเอ็นเอเทียบกับจำลอง SSBp2 และ Dynamics โมเลกุลของอาคารได้ระบุ R15 เป็นสารตกค้างที่สำคัญสำหรับผูก ssDNA ภาพเคลื่อนไหวกะ Assays (EMSA) และ Microscopy แรงอะตอม (AFM) ด้วยเปิดเผยไม่สามารถของ Arg15Ala mutant ผูก ssDNA เมื่อเทียบกับโปรตีนเป็น ตั้งแต่ R15 สูงคืออยู่ระหว่าง lactococcal SSBs เราเสนอว่า บทบาทของมันในเสถียรภาพซับซ้อน SSBp2/ดี เอ็นเออาจขยายให้สมาชิกทั้งหมดของตระกูลโปรตีนนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

phages lactococcal รุนแรงของครอบครัว Siphoviridae มีความรับผิดชอบในความล้มเหลวของการหมักนมอุตสาหกรรมทั่วโลก lactis Lactococcus, แบคทีเรียแกรมบวกใช้กันอย่างแพร่หลายในการผลิตผลิตภัณฑ์นมหมักที่อยู่ภายใต้การติดเชื้อโดย phages รุนแรงส่วนใหญ่เป็นผู้ที่อยู่ในกลุ่ม 936 รวมทั้งทำลายจุลินทรีย์ p2 หมู่โปรตีนเขียนโดยจีโนม phage lactococcal, น่าสนใจเป็นพิเศษคือผู้แสดงต้นที่มีความสำคัญที่จะดำเนินการได้อย่างมีประสิทธิภาพวงจร lytic phage เราระบุก่อนหน้านี้และการแก้ไขโครงสร้าง 3 มิติของ lactococcal ORF34 ทำลายจุลินทรีย์ p2, ดีเอ็นเอเกลียวผูกพันโปรตีนเดียว (SSBp2) ที่นี่เราตรวจสอบพื้นฐานระดับโมเลกุลของ ORF34 ผูกพันกลไกในการตรวจดีเอ็นเอ เทียบดีเอ็นเอ SSBp2 และอณู Dynamics จำลองที่ซับซ้อนส่งผลให้ระบุ R15 เป็นสารตกค้างที่สำคัญสำหรับ ssDNA ผูกพัน Electrophoretic การตรวจกะ Mobility (Emsa) และกองทัพปรมาณู Microscopy (AFM) การถ่ายภาพเผยให้เห็นการไร้ความสามารถของมนุษย์กลายพันธุ์ Arg15Ala ผูก ssDNA เมื่อเทียบกับโปรตีนพื้นเมือง ตั้งแต่ R15 เป็นป่าสงวนอย่างมากในหมู่ SSBs lactococcal เราเสนอว่าบทบาทในการรักษาเสถียรภาพซับซ้อน SSBp2/DNA อาจจะมีการขยายไปยังสมาชิกทุกคนในครอบครัวของโปรตีนนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รุนแรง lactococcal จของครอบครัว siphoviridae รับผิดชอบนมหมักของอุตสาหกรรมทั่วโลก แลคโตค คัส lactis , กรัมบวกแบคทีเรียใช้ในการผลิตผลิตภัณฑ์นมหมัก คือต้องติดเชื้อรุนแรงจ เด่นของกลุ่มผู้รัก รวมทั้งฟา P2 . ของโปรตีนเข้ารหัสโดย lactococcal หาฟา ,ที่น่าสนใจเป็นพิเศษคือแสดงก่อน ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญที่สามารถดำเนินการว่าเชื้อกลุ่มรอบ เราระบุก่อนหน้านี้และการแก้ไขโครงสร้าง 3 มิติของ lactococcal เฟจ P2 orf34 โสด ควั่นดีเอ็นเอโปรตีน ( ssbp2 ) ที่นี่เราตรวจสอบพื้นฐานระดับโมเลกุลของ orf34 ผูกพันกลไกดีเอ็นเอดีเอ็นเอเชื่อมต่อบน ssbp2 พลศาสตร์เชิงโมเลกุลและเป็นผลที่ซับซ้อนระบุ R15 เป็นกากที่สําคัญสําหรับ ssdna เข้าเล่ม ยูไนเต็ดเปลี่ยนยีน ( emsa ) และกล้องจุลทรรศน์แรงอะตอม ( AFM ) ภาพแสดงการไร้ความสามารถของ arg15ala กลายพันธุ์ไปผูก ssdna , เมื่อเทียบกับโปรตีนพื้นเมือง ตั้งแต่ R15 เป็นอย่างสูงในหมู่ lactococcal ssbs อนุรักษ์ ,เราเสนอว่า บทบาทใน ssbp2 / ดีเอ็นเอซับซ้อนเสถียรภาพอาจจะขยายไปยังสมาชิกทั้งหมดของครอบครัว
โปรตีน .