We used taxonomic classification of

We used taxonomic classification of WoRMS as a proxy to
phylogenetic relatedness between taxa. Phylogenetic beta diversity
(PBD) measures the evolutionary dissimilarity among communities.
A common PBD metric, UniFrac, measures the proportion of
evolutionary history unique to each community (Lozupone et al.,
2011). It is calculated as the total branch length unique to each
community relative to the total branch length linking all species in
both communities. PBD can result from two sources: (1) difference
in taxon richness between the two communities, and (2) true
phylogenetic turnover of taxa. We hereby used an algorithm that
decomposes the total PBD into the two independent components
(Leprieur et al., 2012), and use the turnover component to express
phylogenetic dissimilarity between locations. For PBD the same
stratified community matrix was used as for compositional relatedness.
The resulting dissimilarity matrix was visualized with
NMDS ordination, where communities with common evolutionary
history were grouped together, and phylogenetically distantly
related communities were more separated on a two-dimensional
plot.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราใช้ประเภทอนุกรมวิธานของหนอนเป็นพร็อกซีไปrelatedness phylogenetic ระหว่าง taxa ความหลากหลาย phylogenetic เบต้า(PBD) วัด dissimilarity เชิงวิวัฒนาการระหว่างชุมชนสัดส่วนของมาตรการวัดเป็น PBD ทั่วไป UniFracวิวัฒนาการประวัติเฉพาะของแต่ละชุมชน (Lozupone et al.,2011) มีคำนวณเป็นความยาวรวมสาขาเฉพาะของแต่ละความยาวรวมสาขาเชื่อมโยงสปีชีส์ทั้งหมดในชุมชนชุมชนทั้งนี้ PBD สามารถได้จากแหล่งที่สอง: ความแตกต่าง (1)ใน taxon ร่ำรวยระหว่างชุมชนสอง (2) ทรูการหมุนเวียน taxa phylogenetic เราขอใช้ขั้นตอนวิธีการที่decomposes PBD รวมเป็นสองส่วนประกอบอิสระ(Leprieur et al., 2012), และใช้ส่วนประกอบหมุนเวียนในการแสดงdissimilarity phylogenetic ระหว่างที่ตั้ง สำหรับ PBD เหมือนกันชุมชน stratified เมทริกซ์ถูกใช้สำหรับ compositional relatednessเมตริกซ์ dissimilarity ผลลัพธ์มี visualized ด้วยNMDS บวช ที่ชุมชน มีวิวัฒนาการร่วมกันประวัติศาสตร์ถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกัน และ phylogenetically distantlyชุมชนที่เกี่ยวข้องได้มากขึ้นแยกจากกันในแบบสองมิติแผนการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราใช้การจัดหมวดหมู่การจัดหมวดหมู่ของเวิร์มเป็นผู้รับมอบฉันทะเพื่อความสัมพันธ์ระหว่าง phylogenetic แท็กซ่า
ความหลากหลายเบต้าวิวัฒนาการ
(PBD) วัดความแตกต่างกันระหว่างชุมชนวิวัฒนาการ.
เมตริก PBD ทั่วไป UniFrac
วัดสัดส่วนของประวัติศาสตร์วิวัฒนาการที่ไม่ซ้ำกันแต่ละชุมชน(Lozupone et al.,
2011) จะมีการคำนวณเป็นความยาวรวมสาขาที่ไม่ซ้ำกันในแต่ละญาติชุมชนเพื่อความยาวรวมสาขาการเชื่อมโยงทุกชนิดในชุมชนทั้ง PBD เป็นผลมาจากสองแหล่งที่มา: (1) ความแตกต่างในความร่ำรวยแท็กซอนระหว่างสองชุมชนและ(2) ความจริงการหมุนเวียนของสายวิวัฒนาการของแท็กซ่า ขอใช้อัลกอริทึมที่สลายตัวรวม PBD เป็นสองส่วนประกอบอิสระ (Leprieur et al., 2012) และองค์ประกอบที่ใช้หมุนเวียนในการแสดงความแตกต่างกันระหว่างสถานที่phylogenetic สำหรับ PBD เดียวกันเมทริกซ์ชุมชนแบ่งชั้นถูกนำมาใช้เป็นความสัมพันธ์compositional. เมทริกซ์ความแตกต่างกันส่งผลให้ได้รับการมองเห็นด้วยNMDS บวชที่ชุมชนที่มีวิวัฒนาการที่พบประวัติถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกันและphylogenetically ห่างไกลชุมชนที่เกี่ยวข้องกับการถูกแยกออกมากขึ้นในสองมิติพล็อต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่เราใช้ในการจำแนกหมวดหมู่ของหนอนเป็นพร็อกซี่

และ phylogenetic สัมพันธ์ระหว่าง . เบต้า ซึ่งความหลากหลาย
( น้ำ ) วัดที่มีความแตกต่างระหว่างชุมชน .
ทั่วไปน้ำวัด , unifrac การวัดสัดส่วนของ
ประวัติศาสตร์เฉพาะแต่ละชุมชนวิวัฒนาการ ( lozupone et al . ,
2011 ) ซึ่งคำนวณเป็นสาขาเฉพาะแต่ละ
ความยาวรวมชุมชนสัมพันธ์กับความยาวรวมสาขา การเชื่อมโยงทั้งหมดชนิด
ทั้งชุมชน น้ำเป็นผลมาจากสองแหล่งที่มา : ( 1 ) ความแตกต่างระหว่างสองชนิด
ในความอุดมสมบูรณ์ของชุมชน และ ( 2 ) การหมุนเวียน ซึ่งเป็นจริง
ของซ่า . เราขอใช้อัลกอริทึมที่สลายตัวในน้ำทั้งหมดลง

( อิสระ 2 ส่วนประกอบ leprieur et al . , 2012 ) และใช้หมุนเวียนส่วนประกอบด่วน
ซึ่งความแตกต่างระหว่างสถานที่ สำหรับน้ำเหมือนกัน
แบ่งเมทริกซ์ชุมชนใช้สำหรับเรียงความสัมพันธ์ .
ซึ่งจะมองเห็นด้วย
nmds เมทริกซ์คือการบวช ที่ชุมชนกับประวัติวิวัฒนาการ
ทั่วไปถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกัน และ phylogenetically นำลิ่ว
เกี่ยวข้องกับชุมชนมากกว่าแยกบนพล็อต 2 มิติ