The microbial populations in no-til

The microbial populations in no-till agricultural soil and casts of the earthworm Lumbricus rubellus were examined by culturing and molecular methods. Clone libraries of the 16S rRNA genes were prepared from DNA isolated directly from the soil and earthworm casts. Although no single phylum dominated the soil library of 95 clones, the largest numbers of clones were from Acidobacteria (14%), Cytophagales (13%), Chloroflexi (8%), and γ-Proteobacteria (8%). While the cast clone library of 102 clones was similar to the soil library, the abundances of several taxa were different. Representatives of the Pseudomonas genus as well as the Actinobacteria and Firmicutes increased in number, and one group of unclassified organisms found in the soil library was absent in the cast library. Likewise, soil and cast archaeal 16S rRNA gene libraries were similar, although the abundances of some groups were different. Two hundred and thirty aerobic bacteria were also isolated on general heterotrophic media from casts, burrows, and soil. The cast isolates were both phenotypically and genotypically different from the soil isolates. The cast isolates were more likely to reduce nitrate, grow on acetate and Casamino Acids, and utilize fewer sugars than the soil isolates. On the basis of their ribotypes, the cast isolates were dominated by Aeromonas spp. (28%), which were not found in the soil isolates, and other γ-Proteobacteria (49%). In contrast, the soil isolates were mostly Actinobacteria (53%), Firmicutes (16%), and γ-Proteobacteria (19%). Isolates obtained from the sides of earthworm burrows were not different from the soil isolates. Diversity indices for the collections of isolates as well as rRNA gene libraries indicated that the species richness and evenness were decreased in the casts from their levels in the soil. These results were consistent with a model where a large portion of the microbial population in soil passes through the gastrointestinal tract of the earthworm unchanged while representatives of some phyla increase in abundance.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ประชากรจุลินทรีย์ในดินเกษตรไม่มีลิ้นชักเก็บเงินและบรรยากาศของไส้เดือน Lumbricus rubellus ถูก examined โดยวิธีเลี้ยง และโมเลกุล ไลบรารีโคลนของยีน 16S rRNA วจัดจากดีเอ็นเอที่แยกได้โดยตรงจากมองบวกดินและไส้เดือน แม้ไม่มีไฟลัมเดียวครอบงำห้องสมุดดินของโคลน 95 เลขที่ใหญ่ที่สุดของโคลนก็จาก Acidobacteria (14%), Cytophagales (13%), Chloroflexi (8%), และγ-Proteobacteria (8%) ในขณะที่ไลบรารีโคลนหล่อของ 102 โคลนคล้ายกับไลบรารีดิน ร้านของหลายแตกต่างกัน ตัวแทนของ Pseudomonas เช่นเดียวกับ Actinobacteria และ Firmicutes เพิ่มหมายเลข และหนึ่งกลุ่มของสิ่งมีชีวิตไม่ได้แยกประเภทที่ลงดินหายไปในไลบรารีหล่อ ทำนองเดียวกัน ดินหล่อ archaeal 16S rRNA ยีนไลบรารีและคล้ายกัน แม้ว่าร้านของกลุ่มบางอย่างแตกต่างกัน เชื้อแบคทีเรียแอโรบิกสองร้อยสามสิบได้ยังหน้าสื่อทั่วไป heterotrophic มองบวก โพรง และดิน หล่อที่แยกได้ทั้ง phenotypically และ genotypically แตกต่างจากดินแยก หล่อแยกมีแนวโน้ม การลดไนเตรท อะซิเตทและกรด Casamino ใช้น้ำตาลน้อยกว่าดินแยก บนพื้นฐานของพวกเขา ribotypes หล่อแยกถูกครอบงำ โดย Aeromonas ออกซิเจน (28%), ซึ่งไม่พบในดินแยก และอื่น ๆ γ-Proteobacteria (49%) ตรงกันข้าม ดินแยกได้เป็นส่วนใหญ่ (53%) Actinobacteria, Firmicutes (16%), และγ-Proteobacteria (19%) แยกออกได้จากด้านข้างของโพรงไส้เดือนไม่ได้แตกต่างจากดินแยก ดัชนีความหลากหลายสำหรับคอลเลกชันที่แยกเป็นห้องสมุดยีนของ rRNA ระบุสายพันธุ์ความอุดมสมบูรณ์และ evenness ถูกลดลงในบรรยากาศจากระดับในดิน ผลลัพธ์เหล่านี้ได้สอดคล้องกับแบบจำลองซึ่งส่วนใหญ่ของประชากรจุลินทรีย์ในดินผ่านระบบทางเดินอาหารของไส้เดือนที่ไม่เปลี่ยนแปลงในขณะที่ตัวแทนของอาณาจักรบางเพิ่มมากมาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประชากรของจุลินทรีย์ในไม่ไถพรวนดินเกษตรและบรรยากาศของไส้เดือน Lumbricus rubellus ถูกตรวจสอบโดยการเพาะเลี้ยงและวิธีการในระดับโมเลกุล ห้องสมุดโคลนของยีน 16S rRNA ที่เตรียมจากดีเอ็นเอที่แยกได้โดยตรงจากไส้เดือนดินและปลดเปลื้อง แม้ว่าจะไม่มีประเภทเดียวครอบงำห้องสมุดดิน 95 โคลนตัวเลขที่ใหญ่ที่สุดของโคลนจาก Acidobacteria (14%), Cytophagales (13%) Chloroflexi (8%) และγ-Proteobacteria (8%) ในขณะที่ห้องสมุดโยนโคลนของ 102 โคลนก็คล้ายคลึงกับห้องสมุดดินที่อุดมสมบูรณ์ในหลาย ๆ แท็กซ่าแตกต่างกัน ตัวแทนของประเภท Pseudomonas เช่นเดียวกับ actinobacteria และ Firmicutes เพิ่มขึ้นในจำนวนและเป็นหนึ่งในกลุ่มของสิ่งมีชีวิตไม่เป็นความลับที่พบในห้องสมุดดินก็หายไปในห้องสมุดหล่อ ในทำนองเดียวกันดินและโยน archaeal 16S rRNA ห้องสมุดยีนมีความคล้ายคลึงกันแม้ว่าปริมาณของบางกลุ่มแตกต่างกัน สองร้อยสามสิบแบคทีเรียแอโรบิกยังถูกแยกบนสื่อ heterotrophic ทั่วไปจากบรรยากาศโพรงและพื้นดิน ไอโซเลทหล่อทั้งสองลักษณะภายนอกที่แตกต่างกันและ genotypically จากดินแยก ไอโซเลทหล่อมีแนวโน้มที่จะลดไนเตรตเติบโตในอะซิเตทและกรดซามิและใช้น้ำตาลน้อยกว่าดินแยก บนพื้นฐานของการ ribotypes ของพวกเขา, ไอโซเลทหล่อที่ถูกครอบงำโดยเชื้อ Aeromonas spp (28%) ซึ่งไม่พบในดินแยกและγ-Proteobacteria อื่น ๆ (49%) ในทางตรงกันข้ามไอโซเลทดินส่วนใหญ่เป็น actinobacteria (53%), Firmicutes (16%) และγ-Proteobacteria (19%) ที่แยกได้จากด้านข้างของโพรงไส้เดือนดินที่ไม่ได้แตกต่างจากดินแยก ดัชนีความหลากหลายสำหรับคอลเลกชันของเชื้อเช่นเดียวกับห้องสมุด rRNA ยีนชี้ให้เห็นว่าความร่ำรวยชนิดและความเรียบลดลงในปลดเปลื้องจากระดับของพวกเขาในดิน ผลลัพธ์เหล่านี้มีความสอดคล้องกับรูปแบบที่ส่วนใหญ่ของประชากรของจุลินทรีย์ในดินผ่านระบบทางเดินอาหารของไส้เดือนไม่เปลี่ยนแปลงในขณะที่ตัวแทนของบางอย่างเพิ่มขึ้น phyla ในความอุดมสมบูรณ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จุลินทรีย์ในดินมีไม่จน การเกษตรและปลดเปลื้องของไส้เดือน lumbricus rubellus ถูกตรวจสอบโดยวิธีเพาะเลี้ยง และโมเลกุล การโคลนยีน 16S rRNA ของห้องสมุดที่เตรียมจากดีเอ็นเอที่แยกได้โดยตรงจากไส้เดือนดินและเฝือก แม้ว่าไม่มีไฟลัมครอบงำดินห้องสมุด 95 โคลน , ตัวเลขที่ใหญ่ที่สุดของโคลนจาก acidobacteria ( 14% ) , cytophagales ( 13% ) , chloroflexi ( 8% ) และγ - โพรทีโอแบคทีเรีย ( 8% ) ในขณะที่โยนโคลนห้องสมุด 102 โคลนคล้ายกับห้องสมุดดิน , abundances หลายและแตกต่างกัน ตัวแทนสกุล Pseudomonas เช่นเดียวกับแอคติโนมัยสีท Firmicutes และเพิ่มจำนวน และกลุ่มของสิ่งมีชีวิตที่พบในห้องสมุดแยกประเภทดินขาดในเฝือก ห้องสมุด อนึ่ง ดิน และหล่อ archaeal เบส 16S rRNA ยีนห้องสมุดเหมือนกัน ถึงแม้ว่า abundances ของบางกลุ่มที่แตกต่างกัน สองร้อยสามสิบแบคทีเรียแอโรบิกยังแยกบนสื่อแบบทั่วไปจากแบบหล่อ เบอร์โรว์ และดิน หล่อทั้ง phenotypically ไอโซเลทและแตกต่างกัน genotypically จากดินเชื้อ โยนเชื้อมีแนวโน้มที่จะช่วยลดไนเตรท เติบโตใน casamino กรดอะซิเตต และใช้น้ำตาลน้อยกว่าดินเชื้อ บนพื้นฐานของ ribotypes พวกเขาโยนสายพันธุ์เป็น dominated โดยเชื้อ spp . ( 28% ) ซึ่งไม่พบในดินสายพันธุ์และγ - อื่น ๆ โพรทีโอแบคทีเรีย ( 49% ) ในทางตรงกันข้าม ดินเชื้อแอคติโนมัยสีทส่วนใหญ่ ( ร้อยละ 53 ) Firmicutes ( 16% ) และγ - โพรทีโอแบคทีเรีย ( 19% ) ที่แยกได้จากด้านข้างของไส้เดือน เบอร์โรวส์ ไม่ได้แตกต่างจากดินเชื้อ ค่าดัชนีความหลากหลายสำหรับคอลเลกชันของเชื้อ ตลอดจนห้องสมุดยีนที่สร้างขึ้น พบว่า ชนิดและความสมดุลในการลดลงจากระดับในดิน ผลลัพธ์เหล่านี้มีความสอดคล้องกับรูปแบบที่ส่วนใหญ่ของประชากรจุลินทรีย์ในดินผ่านระบบย่อยอาหารของไส้เดือนดินไม่เปลี่ยนแปลง ในขณะที่ผู้แทนของบางประเภทเพิ่มขึ้นมากมาย