1. PSEUDOMONAS SYRINGAE PATHOVARS
It seems a little unfair that a team of pathovars has been voted for an award,
a bit like a relay team winning the 400-m individual Olympic gold medal. It
may of course be argued that the pathovar designation is really unjustified
and that we are dealing with one remarkably versatile single species, Pseudomonas
syringae. This debate is now being resurrected by the emerging
detail from genomic sequencing. The criteria for this award were importance
to basic science and impact on food production and/or the environment—
P. syringae scores heavily on all counts.
The economic impact of P. syringae is increasing, with a resurgence of old
diseases, including bacterial speck of tomato (pv. tomato; Shenge et al.,
2007), and the emergence of new infections of importance worldwide, such
as bleeding canker of horse-chestnut (pv. aesculi; Green et al., 2010). The
European Handbook of Plant Diseases (Smith et al., 1988) describes 28
pathovars, each attacking a different host species. We can now add pv.
aesculi to this list. Several pathovars cause long-term problems in trees, often
through the production of distortions and cankers (e.g. pathovars savastanoi
and morsprunorum). Infections of annual crops are more sporadic, and
outbreaks are often caused by sowing contaminated seed. Many reports
highlight the seed-borne nature of P. syringae, but it is a remarkably adaptive
pathogen, emerging in some apparently bizarre sites, such as snow melt
waters (Morris et al., 2007). Once new infections have established, given
favourable conditions of rainfall and temperatures, disease outbreaks are
often devastating, as observed with bean halo blight caused by pv. phaseolicola
(Murillo et al., 2010).
Research into the molecular biology of virulence and plant defence
against P. syringae has opened up new insights into microbial pathogenicity,
not only with regard to plants but also with more general significance to
human diseases. Pathovars phaseolicola and tomato have emerged as excellent
models for fundamental studies on bacterial attack and plant defence
(Arnold et al., 2011; Preston, 2000). Notable examples are discoveries
concerning the hypersensitive response and pathogenicity (hrp) gene cluster
encoding the type III secretion system (see Fig. 1), effector trafficking and
host targets for defence suppression (Huynh et al., 1989; Jovanovic et al.,
2011; Kvitko et al., 2009; Li et al., 2002; Zhang et al., 2010).
Pseudomonas syringae leads the field in the impact of high-throughput
sequencing technologies on our understanding of pathogenicity. Remarkably,
the prediction by O’Brien et al. (2011) that, ‘. . . at least two dozen new
P. syringae genomes will be released this year’, has been proven to be
correct with the publication of the landmark study by Baltrus et al. (2011). So
far, a perhaps unexpected feature is that pathovars colonizing strongly
unrelated plants are being closely grouped together, for example pv. savastanoi
(olive) and pv. phaseolicola (bean) both lie within the same clade.
Genomic analysis, initiated by Joardar et al. (2005) and Lindeberg et al.
(2008), has perhaps the most potential for unravelling the determinants of
host specificity. As more genomic sequences are completed, further insight
should be gained into the still puzzling role of effector proteins and toxins in
defining host range within the species.
Pseudomonas syringae pathovars represent not only the premier plant
pathogenic bacterial grouping, but would also probably top the all time
pathogen charts including fungi and oomycetes. Research on the effector
biology of the filamentous pathogens is very much following in the wake
of advances made with P. syringae (Cunnac et al., 2009; Hann et al., 2010;
Oliva et al., 2010).
Fig.
1. ลี SYRINGAE PATHOVARSเหมือนธรรมเล็กน้อยที่ทีมงาน pathovars มีการโหวตสำหรับรางวัลบิตเช่นทีมรีเลย์ชนะ 400 m แต่ละโอลิมปิคเหรียญทอง มันอาจแน่นอนได้โต้เถียงว่า กำหนด pathovar unjustified จริง ๆและที่เรากำลังเผชิญกับหนึ่งทแบบหลากหลายชนิด Pseudomonas เดี่ยวsyringae อภิปรายนี้ตอนนี้กำลังฟื้น โดยเกิดขึ้นรายละเอียดจาก genomic ลำดับ เงื่อนไขสำหรับรางวัลนี้มีความสำคัญวิทยาศาสตร์พื้นฐานและผลกระทบต่อการผลิตอาหารและ/หรือสิ่งแวดล้อมเช่นคะแนน P. syringae หนักบนนับทั้งหมดผลกระทบทางเศรษฐกิจของ P. syringae มีเพิ่ม รีเซอร์เจนซ์เป็นของเก่าโรค รวม speck แบคทีเรียของมะเขือเทศ (มะเขือ pv. Shenge et al.,2007), และเกิดการติดเชื้อใหม่สำคัญทั่วโลก เช่นเป็น canker มีเลือดออกของม้าเกาลัด (pv. aesculi สีเขียว et al., 2010) ที่ยุโรปคู่มือของพืชโรค (Smith et al., 1988) อธิบายถึง 28pathovars แต่ละโจมตีชนิดโฮสต์ เราสามารถเพิ่ม pvaesculi รายการนี้ Pathovars หลายปัญหาระยะยาวในต้นไม้ มักจะผ่านการผลิตที่บิดเบือนและ cankers (เช่น pathovars savastanoiก morsprunorum) ติดเชื้อของพืชประจำปีจะมีมากขึ้น และเมล็ด sowing ปนเปื้อนมักเกิดการระบาด รายงานจำนวนมากเน้นธรรมชาติเชื่อว่าเมล็ดของ P. syringae แต่ก็เหมาะสมเป็นอย่างยิ่งการศึกษา การเกิดใหม่ในบางเว็บไซต์เห็นได้ชัดว่าแปลกประหลาด เช่นหิมะละลายน้ำ (มอร์ริส et al., 2007) เมื่อติดเชื้อใหม่ได้สำเร็จ ให้เงื่อนไขดีปริมาณน้ำฝน และอุณหภูมิ การแพร่ระบาดของโรคมักทำลายล้าง เท่าที่สังเกต ด้วยโรค halo ถั่วที่เกิดจากแสงอาทิตย์ phaseolicola(Murillo et al., 2010)วิจัยเป็นอณูชีววิทยาของกลาโหม virulence และโรงงานจาก P. syringae มีเปิดขึ้นใหม่เจาะลึก pathogenicity จุลินทรีย์ไม่เพียงแต่เกี่ยวกับพืชแต่ยังมีความสำคัญทั่วไปเพื่อโรคในมนุษย์ ได้เกิดเป็นดี Pathovars phaseolicola และมะเขือเทศแบบจำลองสำหรับแบคทีเรียป้องกันการโจมตีและโรงงานการศึกษาขั้นพื้นฐาน(อาร์โนลด์เอ็ด al., 2011 เพรสตัน 2000) ตัวอย่างค้นพบเกี่ยวกับการตอบสนอง hypersensitive และคลัสเตอร์ยีน pathogenicity (hrp)ชนิด III หลั่งระบบการเข้ารหัส (ดู Fig. 1), effector ค้า และโฮสต์เป้าหมายการป้องกันปราบปราม (ฮอยอันและ al., 1989 Jovanovic et al.,2011 Kvitko et al., 2009 Li et al., 2002 เตียว et al., 2010)Syringae ลีนำฟิลด์ในผลกระทบของอัตราความเร็วสูงเทคโนโลยีลำดับบนเราเข้าใจ pathogenicity อย่างยิ่งทำนายโดยโอไบรอันเอส al. (2011) ที่, ' . ... ใหม่น้อยสองโหลP. syringae genomes จะออกปีนี้ ', ได้รับการพิสูจน์ให้แก้ไข ด้วยการเผยแพร่การศึกษาโรงแรมแลนด์มาร์คโดย Baltrus et al. (2011) ดังนั้นห่างไกล คุณลักษณะไม่คาดคิดอาจจะเป็น pathovars ที่ colonizing อย่างยิ่งพืชที่ใกล้ชิดเกี่ยวข้องด้วยกันกลุ่ม เช่นแสงอาทิตย์ savastanoi(มะกอก) และ pv phaseolicola (ถั่ว) ทั้งสองนอนใน clade เดียวกันGenomic วิเคราะห์ เริ่มต้น โดย Joardar et al. (2005) และ Lindeberg et al(2008), มีบางทีสุดอาจน้อยดีเทอร์มิแนนต์ของspecificity โฮสต์ ตามลำดับมาก genomic เสร็จ เพิ่มเติมความเข้าใจควรได้รับถาม effector โปรตีนและสารพิษในบทบาทยังทำให้งงกำหนดช่วงโฮสต์ภายในสายพันธุ์ลี syringae pathovars แสดงไม่เพียงแต่โรงงานพรีเมียร์จัดกลุ่ม แบคทีเรียอุบัติแต่จะยังคงด้านบนตลอดเวลาแผนภูมิการศึกษารวมทั้งเชื้อราและ oomycetes วิจัย effector ที่ชีววิทยาของโรค filamentous เป็นอย่างมากต่อไปนี้ในการปลุกความก้าวหน้าในการทำ ด้วย (Cunnac et al., 2009; P. syringae Al. ร้อยเอ็ด Hann, 2010โอลิวาชุน et al., 2010)ฟิก
การแปล กรุณารอสักครู่..

1. Pseudomonas syringae PATHOVARS
ดูเหมือนเล็ก ๆ น้อย ๆ ที่ไม่เป็นธรรมว่าทีมของ pathovars ได้รับการโหวตให้ได้รับรางวัล,
บิตเช่นทีมวิ่งผลัดชนะเลิศเหรียญทองบุคคล 400 ม. โอลิมปิก มัน
อาจแน่นอนจะแย้งว่าการแต่งตั้ง pathovar เป็นจริงที่ไม่ยุติธรรม
และที่เราจะจัดการกับชนิดหนึ่งเดียวที่หลากหลายอย่างน่าทึ่ง Pseudomonas
syringae การอภิปรายครั้งนี้ขณะนี้ถูกฟื้นจากที่เกิดขึ้นใหม่
จากรายละเอียดลำดับจีโนม เกณฑ์สำหรับการได้รับรางวัลครั้งนี้มีความสำคัญ
กับวิทยาศาสตร์พื้นฐานและผลกระทบต่อการผลิตอาหารและ / หรือสิ่งแวดล้อม
พี . คะแนน syringae อย่างหนักในทุกข้อหา
กระทบทางเศรษฐกิจของพี syringae จะเพิ่มขึ้นกับการฟื้นตัวของเก่า
โรครวมทั้งจุดแบคทีเรียของมะเขือเทศ (มะเขือเทศ pv.. Shenge, et al,
2007) และการเกิดขึ้นของการติดเชื้อใหม่ที่มีความสำคัญ ทั่วโลกเช่น
เป็นโรคปากเปื่อยมีเลือดออกของม้าเกาลัด (pv aesculi.. สีเขียว, et al, 2010)
คู่มือยุโรปโรคพืช (สมิ ธ et al., 1988) อธิบายถึง 28
pathovars แต่ละโจมตีชนิดที่แตกต่างกันเป็นเจ้าภาพ ตอนนี้เราสามารถเพิ่ม pv.
aesculi รายการนี้ pathovars หลายก่อให้เกิดปัญหาในระยะยาวต้นไม้มักจะ
ผ่านการผลิตการบิดเบือนและเข้าเฝือก (เช่น pathovars savastanoi
และ morsprunorum) การติดเชื้อของพืชประจำปีที่มีเป็นระยะ ๆ มากขึ้นและ
การระบาดมักจะเกิดจากการหว่านเมล็ดพันธุ์ปนเปื้อน รายงานจำนวนมาก
เน้นธรรมชาติที่เกิดจากเมล็ดของพี syringae แต่มันเป็นอย่างน่าทึ่งปรับตัว
เชื้อโรคที่เกิดขึ้นใหม่ในบางเว็บไซต์ที่แปลกประหลาดที่เห็นได้ชัดเช่นหิมะละลาย
น้ำ (มอร์ริส et al., 2007) เมื่อติดเชื้อใหม่ได้สร้างให้
เงื่อนไขที่ดีของปริมาณน้ำฝนและอุณหภูมิการระบาดของโรคที่มีการ
ทำลายล้างมักจะเป็นข้อสังเกตที่มีรัศมีทำลายถั่วที่เกิดจาก pv phaseolicola
(Murillo et al., 2010).
การวิจัยในทางชีววิทยาระดับโมเลกุลของความรุนแรงและการป้องกันพืช
กับพี syringae ได้เปิดข้อมูลเชิงลึกใหม่ ๆ เข้ามาทำให้เกิดโรคจุลินทรีย์
ไม่เพียง แต่ในเรื่องเกี่ยวกับพืช แต่ยังมีความสำคัญมากขึ้นในการทั่วไป
โรคของมนุษย์ Pathovars phaseolicola มะเขือเทศและได้กลายเป็นที่ยอดเยี่ยม
แบบจำลองสำหรับการศึกษาขั้นพื้นฐานในการโจมตีและการป้องกันแบคทีเรียพืช
(อาร์โนล et al, 2011;. เพรสตัน, 2000) ตัวอย่างที่เด่นมีการค้นพบ
เกี่ยวกับการตอบสนองที่ไวเกินและโรค (HRP) กลุ่มยีน
เข้ารหัสระบบการหลั่งประเภท iii (ดูรูปที่ 1). การค้า effector และ
เป้าหมายที่เป็นเจ้าภาพในการปราบปรามการป้องกัน (Huynh et al, 1989;.. Jovanovic, et al,
2011 ; Kvitko et al, 2009;. Li et al, 2002;... Zhang et al, 2010)
Pseudomonas syringae นำไปสู่สนามในผลกระทบของสูงผ่าน
เทคโนโลยีการจัดลำดับในความเข้าใจของเราทำให้เกิดโรค อย่างน่าทึ่ง
ทำนายโดยโอไบรอัน, et al (2011) ที่ ' . . อย่างน้อยสองโหลใหม่
พี จีโนม syringae จะได้รับการปล่อยตัวในปีนี้ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็น
ที่ถูกต้องด้วยการตีพิมพ์การศึกษาสถานที่สำคัญโดย Baltrus et al, (2011) ดังนั้น
ไกลคุณลักษณะที่ไม่คาดคิดอาจจะเป็นที่ pathovars อาณานิคมอย่างยิ่ง
พืชที่ไม่เกี่ยวข้องจะถูกจัดกลุ่มกันอย่างใกล้ชิดเช่น pv savastanoi
(มะกอก) และ pv phaseolicola (ถั่ว) ทั้งสองอยู่ภายใน clade เดียวกัน.
การวิเคราะห์จีโนมที่ริเริ่มโดย Joardar et al, (2005) และ Lindeberg et al.
(2008) มีอาจจะมีศักยภาพมากที่สุดในการคลี่คลายปัจจัยของ
ความจำเพาะโฮสต์ ในฐานะที่เป็นลำดับจีโนมจะเสร็จสมบูรณ์มากขึ้นความเข้าใจต่อไป
ควรจะได้รับเข้าไปยังงงบทบาทของ effector โปรตีนและสารพิษใน
การกำหนดช่วงโฮสต์ภายในสายพันธุ์.
pathovars Pseudomonas syringae ไม่เพียง แต่เป็นตัวแทนของโรงงานชั้นนำของ
การจัดกลุ่มของเชื้อแบคทีเรียที่ทำให้เกิดโรค แต่อาจจะยังด้านบนทั้งหมด เวลา
ชาร์ตรวมทั้งเชื้อโรคเชื้อราและ oomycetes งานวิจัยเกี่ยวกับ effector
ชีววิทยาของเชื้อโรคใยเป็นอย่างมากต่อไปในการปลุก
ของความก้าวหน้าที่ทำด้วยพี syringae (Cunnac et al, 2009;.. Hann et al, 2010;
. Oliva et al, 2010).
รูป
การแปล กรุณารอสักครู่..

1 . ของ syringae pathovars
ดูเหมือนไม่ยุติธรรมที่ทีม pathovars ได้รับการโหวตสำหรับรางวัล
เหมือนวิ่งผลัดทีมที่ชนะแต่ละ 400-m โอลิมปิกเหรียญทอง ครับผมอาจจะแน่นอนจะแย้งว่าชื่อ pathovar เป็นโคมลอย
และเราจะจัดการกับหนึ่งอย่างน่าทึ่งหลากหลายชนิดเดียว , Pseudomonas
syringae .การอภิปรายนี้ได้ถูกคืนชีพโดยนวย
รายละเอียดจากลำดับจีโนม . เกณฑ์รางวัลนี้มีความสำคัญ
เพื่อวิทยาศาสตร์พื้นฐานและผลกระทบต่อการผลิตอาหารและ / หรือสิ่งแวดล้อม -
P syringae คะแนนอย่างมากในทั้งหมดนับ
ผลกระทบทางเศรษฐกิจของหน้า syringae เพิ่มขึ้นกับการฟื้นตัวของโรคเก่า
รวมทั้งจุดแบคทีเรียของมะเขือเทศ ( PV . มะเขือเทศ ; shenge et al . ,
2007 )และการเกิดขึ้นของการติดเชื้อใหม่ที่สำคัญทั่วโลก เช่น
เป็นเลือดออกเปื่อยของเกาลัดม้า ( PV . aesculi ; สีเขียว et al . , 2010 )
คู่มือยุโรปของโรคพืช ( Smith et al . , 1988 ) ได้อธิบายถึง 28
pathovars แต่ละโจมตีโฮสต์ชนิดที่แตกต่างกัน ตอนนี้เราสามารถเพิ่ม PV .
aesculi รายการนี้ หลาย pathovars ก่อให้เกิดปัญหาระยะยาวมักจะ
ในต้นไม้ผ่านการผลิตจากการบิดเบือนและ cankers ( เช่น pathovars และ savastanoi
morsprunorum ) เชื้อของพืชล้มลุกที่กระจัดกระจายมากขึ้นและ
ระบาดมักจะเกิดจากเมล็ดที่ปนเปื้อนการหว่าน หลายรายงาน
เน้นคลอดธรรมชาติ syringae เมล็ดของพี แต่มันเป็นเพราะการปรับตัว
เชื้อโรคใหม่ที่แปลกประหลาดมาก เห็นได้ชัดว่าเว็บไซต์เช่นน้ำหิมะละลาย
( มอร์ริส et al . , 2007 )เมื่อเชื้อใหม่ได้สร้างให้
สภาพดีของปริมาณฝนและอุณหภูมิ การระบาดของโรคจะ
แรงบ่อยๆ เท่าที่สังเกต มีรัศมีทำลายถั่วที่เกิดจาก PV . phaseolicola
( โย่ et al . , 2010 ) .
วิจัยชีววิทยาระดับโมเลกุลของโรคพืชและการป้องกัน
กับหน้า syringae ได้เปิดมุมมองใหม่ในการ
จุลินทรีย์ไม่เพียง แต่ยังเกี่ยวกับพืชที่มีความสำคัญทั่วไปมากขึ้น
มนุษย์โรค pathovars phaseolicola และมะเขือเทศมีชุมนุมเป็นรุ่นที่ดีสำหรับการศึกษาขั้นพื้นฐานในการโจมตีแบคทีเรีย
และป้องกันพืช ( Arnold et al . , 2011 ; เพรสตัน , 2000 ) ตัวอย่างที่เด่นคือการค้นพบเกี่ยวกับการตอบสนองไวเกิน
( HRP ) กลุ่มยีนประเภทของระบบการหลั่ง 3 การเข้ารหัส ( ดูรูปที่ 1 ) ค้า (
โฮสต์เป้าหมายปราบปรามและป้องกัน ( หวิ่ง et al . , 1989 ; โยวาโนวิซ et al . ,
2011 ; kvitko et al . , 2009 ; Li et al . , 2002 ; Zhang et al . , 2010 ) .
Pseudomonas syringae นำ ด้านผลกระทบของเทคโนโลยีในการช่วย
ความเข้าใจของเราของการ . อย่างน่าทึ่ง ,
ทำนายโดยโอไบอัน et al .( 2011 ) นั้น ' . . . . . . . อย่างน้อยสองโหลใหม่
P syringae จีโนมจะออกในปีนี้ ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าเป็น
ถูกต้องกับสิ่งพิมพ์การศึกษาสถานที่สำคัญโดย baltrus et al . ( 2011 ) ดังนั้น
ไกล , คุณลักษณะที่ไม่คาดคิด บางทีมัน pathovars colonizing ขอ
ไม่เกี่ยวข้องพืชจะถูกจัดกลุ่มเข้าด้วยกันอย่างใกล้ชิด ตัวอย่าง PV . savastanoi
( มะกอก ) และ PV .phaseolicola ( ถั่ว ) ทั้งคู่ใน clade เดียวกัน
การวิเคราะห์จีโนมที่ริเริ่มโดย joardar et al . ( 2005 ) และลินด์เบิร์ก et al .
( 2008 ) มีบางทีที่มีศักยภาพมากที่สุดสำหรับการเปิดเผยออกมาเกี่ยวกับปัจจัยของ
ต่อโฮสต์ เป็นลำดับจีโนม กว่าจะแล้วเสร็จ
ข้อมูลเชิงลึกเพิ่มเติมที่ควรจะได้รับในบทบาทของโปรตีน ( ยังคงงง และสารพิษในการโฮสต์ภายในช่วง
ชนิดของ syringae pathovars แสดงไม่เพียง แต่เชื้อโรคแบคทีเรียพืช
Premier กลุ่ม แต่ก็อาจจะด้านบนทั้งหมดเวลาแผนภูมิรวมทั้งเชื้อโรคเชื้อราและ oomycetes
. งานวิจัยเกี่ยวกับโต้ง
ชีววิทยาของเชื้อโรคที่มีมากดังต่อไปนี้ในการปลุกของความก้าวหน้าให้กับหน้า syringae
( cunnac et al . , 2009 ; Hann et al . , 2010 ;
Oliva et al . , 2010 ) .
ฟิค
การแปล กรุณารอสักครู่..
