Jerusalem artichoke (Helianthus tub

Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus L.) is an important tuber crop. However, Jerusalem artichoke seeds contain high levels of starch and lipid, making the extraction of high-quality RNA extremely difficult and the gene expression analysis challenging. This study was aimed to improve existing methods for extracting total RNA from Jerusalem artichoke dry seeds and to assess the applicability of the improved method in other plant species. Five RNA extraction methods were evaluated on Jerusalem artichoke seeds and two were modified. One modified method with the significant improvement was applied to assay seeds of diverse Jerusalem artichoke accessions, sunflower, rice, maize, peanut and marigold. The effectiveness of the improved method to extract total RNA from seeds was assessed using qPCR analysis of four selected genes. The improved method of Ma and Yang (2011) yielded a maximum RNA solubility and removed most interfering substances. The improved protocol generated 29 to 41 µg RNA/30 mg fresh weight. An A260/A280 ratio of 1.79 to 2.22 showed their RNA purity. Extracted RNA was effective for downstream applications such as first-stranded cDNA synthesis, cDNA cloning and qPCR. The improved method was also effective to extract total RNA from seeds of sunflower, rice, maize and peanut that are rich in polyphenols, lipids and polysaccharides.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แก่น (Helianthus tuberosus L.) เป็นพืชมีหัวที่สำคัญ อย่างไรก็ตาม แก่นเมล็ดประกอบด้วยแป้งและไขมัน สกัดอาร์เอ็นเอมีคุณภาพสูงมากยากและยีนนิพจน์วิเคราะห์ความท้าทายระดับสูง การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์ เพื่อปรับปรุงวิธีการที่มีอยู่สำหรับแยกอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดแห้งแก่น และ เพื่อประเมินความเกี่ยวข้องของของวิธีการปรับปรุงในพืชชนิดอื่น ๆ วิธีสกัดอาร์เอ็นเอห้าถูกประเมินในเมล็ดแก่น และสองถูกปรับเปลี่ยน หนึ่งวิธีการแก้ไข ด้วยการปรับปรุงที่สำคัญใช้ assay เมล็ดหลากหลาย accessions แก่น ทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด ถั่วลิสง และดาวเรือง ประสิทธิผลของวิธีการปรับปรุงแยกอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดที่ประเมิน qPCR การวิเคราะห์ยีนสี่เลือกใช้ วิธีการปรับปรุงของ Ma และยาง (2011) ผลละลายเป็นอาร์เอ็นเอสูงสุด และเอาสารรบกวนมากที่สุด โพรโทคอลปรับปรุงสร้าง 29-41 ไมโครกรัมเป็นเครื่องอาร์เอ็น เอ/30 มิลลิกรัมต่อน้ำหนักสด อัตราส่วนของ 1.79-2.22 A260/A280 แสดงให้เห็นว่าความบริสุทธิ์ของอาร์เอ็นเอ แยกอาร์เอ็นเอมีประสิทธิภาพสำหรับการใช้งานปลายน้ำเช่นการสังเคราะห์ cDNA ควั่นแรก cDNA โคลน และ qPCR วิธีการปรับปรุงประสิทธิภาพสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด และถั่วลิสงที่อุดมไปด้วยโพลีฟีน โครงการ และ polysaccharides ยังได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เยรูซาเล็มอาติโช๊ค (Helianthus tuberosus L. ) เป็นพืชหัวที่มีความสำคัญ อย่างไรก็ตามเยรูซาเล็มเมล็ดอาติโช๊คมีระดับสูงของแป้งและไขมันทำให้การสกัดอาร์เอ็นเอที่มีคุณภาพสูงที่ยากมากและการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนที่ท้าทายความสามารถ การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อปรับปรุงวิธีการที่มีอยู่สำหรับการสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดมาจากกรุงเยรูซาเล็มอาติโช๊คเมล็ดแห้งและการประยุกต์ใช้ในการประเมินวิธีการที่ดีขึ้นในพืชชนิดอื่น ๆ ห้าวิธีการสกัดอาร์เอ็นเอได้รับการประเมินในกรุงเยรูซาเล็มเมล็ดอาติโช๊คและสองมีการแก้ไข วิธีการแก้ไขที่มีการปรับปรุงที่สำคัญถูกนำมาใช้กับ assay เมล็ดพันธุ์ของความหลากหลายเยรูซาเล็มอาติโช๊คสายทานตะวันข้าวข้าวโพดถั่วลิสงและดอกดาวเรือง ประสิทธิภาพของวิธีการที่ดีขึ้นในการสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดได้รับการประเมินโดยใช้การวิเคราะห์ qPCR ของยีนที่เลือกสี่ วิธีการที่ดีขึ้นของแม่และยาง (2011) ผลการละลาย RNA สูงสุดและลบออกสารรบกวนมากที่สุด โปรโตคอลที่ดีขึ้นสร้าง 29-41 ไมโครกรัม RNA / น้ำหนัก 30 มิลลิกรัมสด อัตราส่วน A260 / A280 ของ 1.79-2.22 แสดงให้เห็นความบริสุทธิ์อาร์เอ็นเอของพวกเขา อาร์เอ็นเอที่สกัดได้มีประสิทธิภาพสำหรับการใช้งานต่อเนื่องเช่นครั้งแรกที่ติดสังเคราะห์ cDNA, cDNA โคลนและ qPCR วิธีการที่ดีขึ้นก็ยังมีประสิทธิภาพในการสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดของดอกทานตะวันข้าวข้าวโพดและถั่วลิสงที่อุดมไปด้วยโพลีฟีน, ไขมันและน้ำตาลมาก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แก่นตะวันต่อความเร็ว L . ) เป็นพืชหัวที่สำคัญ อย่างไรก็ตามเมล็ดอาร์ติโช้คเยรูซาเล็มประกอบด้วยแป้งและไขมัน ทำให้การสกัดอาร์เอ็นเอที่มีคุณภาพสูงมากและการแสดงออกของยีนการวิเคราะห์ความท้าทายการศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาวิธีการสกัด RNA จากที่มีอยู่ทั้งหมดแก่นตะวันแห้ง เมล็ดพืช และเพื่อประเมินการประยุกต์ใช้การปรับปรุงวิธีการในพืชชนิดอื่น ๆ ห้าวิธีการสกัด RNA จำนวนเมล็ดอาร์ติโช้คเยรูซาเล็มและทั้งสองถูกแก้ไขแก้ไขวิธีหนึ่งที่มีการปรับปรุงอย่างมีนัยสำคัญจะใช้วิธีหลากหลาย แก่นตะวันสายพันธุ์เมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด ถั่วลิสง และดาวเรือง ผลของการปรับปรุงวิธีการสกัดอาร์เอ็นเอรวมจากเมล็ดถูกประเมินโดยใช้การวิเคราะห์ qpcr สี่เลือกยีนการปรับปรุงวิธีการของหม่า หยาง ( 2011 ) ให้ค่าการละลายสูงสุดและลบมากที่สุด รบกวน RNA สาร การปรับปรุงโปรโตคอลสร้าง 29 ถึง 41 µ g . / 30 มิลลิกรัมต่อน้ำหนักสด . การ a260 / a280 เท่ากับ 1.79 2.22 ของ RNA มีความบริสุทธิ์ สกัด RNA เป็นที่มีประสิทธิภาพสำหรับการใช้งานต่อเนื่อง เช่น การสังเคราะห์ cDNA cDNA แรกติดโคลน และ qpcr .การปรับปรุงวิธีก็มีประสิทธิภาพเพื่อสกัดอาร์เอ็นเอทั้งหมดจากเมล็ดทานตะวัน ข้าว ข้าวโพด และถั่วที่อุดมไปด้วย โพลีฟีนอล ลิพิด และ พอลิแซ็กคาไรด์ .