In order to determine whether the t

In order to determine whether the tryptic peptides isolated from
environmental samples matched those of M. luteus, the aconitate
hydratase protein sequence was downloaded from the genomic
sequence of M. luteus ATCC 4698 and SK58 (www.ncbi.nlm.nih.gov/
bioproject), and a virtual digest of the sequence was performed
with Protein Prospector software (prospector.ucsf.edu/prospector).
This software takes a known protein sequence and virtually cuts the protein with trypsin. Selecting the type of instrument used in the
software, in this case MALDI TOF MS, generates a list of all possible
m/z values, which could be present in the mass spectra. Mass
spectral peak lists (virtual spectra) obtained with the aid of Protein
Prospector were empirically compared with experimental spectra
of two M. luteus ATCC strains, S. hominis ATCC 27844, and 9 environmental
samples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เพื่อกำหนดว่า เปปไทด์ tryptic แยกต่างหากจากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมตรงของ M. luteus ที่ aconitateดาวน์โหลดจากที่ genomic hydratase ลำดับโปรตีนลำดับของ M. luteus ATCC 4698 และ SK58 (www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject), และทำการย่อยเสมือนของลำดับกับโปรตีน Prospector ซอฟต์แวร์ (prospector.ucsf.edu/prospector)ซอฟต์แวร์นี้จะลำดับโปรตีนที่รู้จักกัน และแทบตัดโปรตีนกับทริปซิน เลือกชนิดของเครื่องมือที่ใช้ในการซอฟต์แวร์ ใน MS, TOF MALDI นี้กรณีสร้างรายการได้ทั้งหมดค่า m/z ซึ่งอาจจะอยู่ในแรมสเป็คตรามวล มวลรายการช่วงสเปกตรัม (เสมือนแรมสเป็คตรา) ได้ ด้วยความช่วยเหลือของโปรตีนProspector ถูกเปรียบเทียบกับแรมสเป็คตราทดลอง empiricallyสายพันธุ์ ATCC luteus M. 2, S. hominis ATCC 27844 และสิ่งแวดล้อม 9ตัวอย่างการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อที่จะตรวจสอบว่าเปปไทด์ tryptic แยกได้จาก
ตัวอย่างจากสิ่งแวดล้อมที่ตรงกับผู้ M. luteus, aconitate
ลำดับโปรตีน hydratase ดาวน์โหลดจากจีโนม
ลำดับของ M. luteus ATCC 4698 และ SK58 (www.ncbi.nlm.nih.gov/
bioproject ) และย่อยเสมือนของลำดับได้ดำเนินการ
กับโปรตีนซอฟต์แวร์ Prospector (prospector.ucsf.edu/prospector).
ซอฟแวร์นี้จะใช้เวลาลำดับโปรตีนที่รู้จักและแทบตัดโปรตีนที่มี trypsin เลือกประเภทของเครื่องมือที่ใช้ในการ
ซอฟแวร์ในกรณีนี้ MALDI TOF MS สร้างรายการเป็นไปได้ทั้งหมด
เมตร / ค่า Z ซึ่งอาจจะอยู่ในสเปกตรัมมวล มวล
รายการยอดสเปกตรัม (สเปกตรัมเสมือน) ได้ด้วยความช่วยเหลือของโปรตีน
Prospector ถูกนำมาเปรียบเทียบกับการสังเกตุสเปกตรัมการทดลอง
ของทั้งสองสายพันธุ์ M. luteus ATCC, S. hominis ATCC 27844 และสิ่งแวดล้อม 9
ตัวอย่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อตรวจสอบว่า สารอาหารที่แยกได้จากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมเข้ากับบรรดาเมตร

hydratase luteus , อะโคนิเตตโปรตีนลำดับถูกดาวน์โหลดจากลำดับจีโนมของเชื้อ M .
luteus 4698 และ sk58 ( www.ncbi . nlm . NIH . gov /
bioproject ) และย่อยเสมือนของลำดับการ
กับซอฟต์แวร์ แร่ โปรตีน ( แร่ UCSF . edu /
แร่ )ซอฟต์แวร์นี้จะเรียกว่าลำดับโปรตีนและโปรตีนด้วยเอนไซม์ตัดจริง . เลือกชนิดของเครื่องมือที่ใช้ใน
ซอฟต์แวร์ ในกรณีนี้ มา ดิ tof MS , สร้างรายการของค่าที่เป็นไปได้ทั้งหมด
M / Z ซึ่งอาจจะอยู่ในมวลสเปกตรัม . สเปกตรัมมวล
ยอดรายการ ( Spectra เสมือน ) ได้ด้วยความช่วยเหลือของโปรตีน
แร่ถูกใช้เปรียบเทียบกับการทดลองนี้
2 เมตร luteus ATCC สายพันธุ์ , S . hominis ATCC 27844 และ 9 ตัวอย่างสิ่งแวดล้อม