Identification and phylogenetic ana

Identification and phylogenetic analysis of Xenorhabdus isolates

The 69 Xenorhabdus isolates were identified as X. stockiae (n = 52), closely related to X. stockiae (n = 14), and closely related to X. miraniensis (n = 3). These findings were replicated in a phylogenetic analysis. A maximum likelihood tree reconstructed using the 69 Xenorhabdus sequences together with sequences downloaded from GenBank is shown in Figure 2. The Thai isolates fell into four distinct groups. Group 1 included 52 study isolates and a sequence from the NCBI database derived from X. stockiae. Group 2 included 13 study isolates but no reference sequence, and group 3 included one study isolate that was most closely related to group 2. The fourth cluster contained the remaining 3 Thai isolates, which were most closely related to X. miraniensis. Geographical mapping of the largest phylogenetic group containing the 52 X. stockiae isolates demonstrated that these were recovered from diverse geographical locations including 7 provinces (Table 2), as were the 13 isolates belonging to group 2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การระบุและการวิเคราะห์ทางแยก Xenorhabdusแยก Xenorhabdus 69 ระบุเป็น X. stockiae (n = 52), ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ X. stockiae (n = 14), และที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับ X. miraniensis (n = 3) ค้นพบเหล่านี้ถูกจำลองแบบในการวิเคราะห์ผล ต้นไม้สูงโอกาสที่สร้างขึ้นใหม่โดยใช้ลำดับ Xenorhabdus 69 พร้อมดาวน์โหลดจาก GenBank ลำดับจะแสดงในรูปที่ 2 แยกไทยตกสี่กลุ่มที่แตกต่างกัน กลุ่มที่ 1 รวม 52 ศึกษาแยกและลำดับจากฐานข้อมูล NCBI มาจาก X. stockiae กลุ่ม 2 รวม 13 ศึกษาแยกแต่ไม่มีการอ้างอิงลำดับ และแยกศึกษากลุ่มที่ 3 รวมได้อย่างใกล้ชิดมากที่สุดเกี่ยวข้องกับกลุ่ม 2 คลัสเตอร์สี่อยู่เหลือ 3 ไทยแยก ที่สุดเกี่ยวข้องกับ X. miraniensis การทำแผนที่ทางภูมิศาสตร์ใหญ่ที่สุดทางกลุ่มมีแยก X. stockiae 52 แสดงให้เห็นว่า เหล่านี้ถูกกู้คืนจากตำแหน่งที่ตั้งทางภูมิศาสตร์ที่หลากหลายรวมทั้ง 7 จังหวัด (ตาราง 2), เป็น 13 แยกเป็นสมาชิกของกลุ่ม 2 ได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การกำหนดและวิเคราะห์สายวิวัฒนาการของ Xenorhabdus แยก69 ไอโซเลท Xenorhabdus ถูกระบุว่าเป็นเอ็กซ์ stockiae (n = 52) ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับเอ็กซ์ stockiae (n = 14) และที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับเอ็กซ์ miraniensis (n = 3) การค้นพบนี้ถูกจำลองแบบในการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ ต้นไม้โอกาสสูงสุดสร้างขึ้นใหม่โดยใช้ 69 ลำดับ Xenorhabdus ร่วมกับลำดับที่ดาวน์โหลดมาจาก GenBank แสดงในรูปที่ 2 สายพันธุ์ไทยลดลงเป็นสี่กลุ่มที่แตกต่างกัน กลุ่มที่ 1 รวม 52 สายพันธุ์การศึกษาและลำดับจากฐานข้อมูล NCBI ที่ได้มาจากเอ็กซ์ stockiae กลุ่มที่ 2 รวม 13 แยกการศึกษา แต่ลำดับไม่มีการอ้างอิงและกลุ่มที่ 3 รวมถึงแยกการศึกษาหนึ่งที่มีความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดที่สุดกับกลุ่มที่ 2 กลุ่มที่สี่มีส่วนที่เหลืออีก 3 แยกไทยซึ่งเป็นส่วนที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับเอ็กซ์ miraniensis การทำแผนที่ทางภูมิศาสตร์ของกลุ่มสายวิวัฒนาการที่ใหญ่ที่สุดที่มี stockiae 52 X. แยกแสดงให้เห็นว่าเหล่านี้หายไปจากสถานที่ทางภูมิศาสตร์ที่หลากหลายรวมทั้ง 7 จังหวัด (ตารางที่ 2) ในฐานะที่เป็นสายพันธุ์ 13 ที่อยู่ในกลุ่มที่ 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การจำแนกและวิเคราะห์ชนิดของ xenorhabdus ไอโซเลทxenorhabdus 69 ไอโซเลท ที่ถูกระบุว่าเป็น X stockiae ( N   =   52 ) เกี่ยวข้องกับ X stockiae ( N   =   14 ) และเกี่ยวข้องกับ X miraniensis ( N   =   3 ) การค้นพบเหล่านี้ถูกนำในการวิเคราะห์ phylogenetic . ต้นความน่าจะเป็นสูงสุดที่สร้างโดยใช้ลำดับ 69 xenorhabdus ร่วมกับลำดับดาวน์โหลดได้จากขนาดที่แสดงในรูปที่ 2 สายพันธุ์ประเทศไทยตกอยู่ใน 4 กลุ่ม คือ กลุ่มที่ 1 รวม 52 การศึกษาไอโซเลทและลำดับจาก ncbi ฐานข้อมูลได้มาจาก X stockiae . กลุ่มที่ 2 มี 13 การศึกษาเชื้อแต่ไม่มีการอ้างอิงลำดับ และกลุ่มที่ 3 ประกอบด้วย การศึกษาหนึ่งแยกที่ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับกลุ่มที่ 2 กลุ่มที่สี่ มี เหลือ 3 ในประเทศไทย ซึ่งส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับ X miraniensis . แผนที่ทางภูมิศาสตร์ที่ใหญ่ที่สุดของกลุ่ม ซึ่งประกอบด้วย 52 X stockiae ไอโซเลตพบว่าเหล่านี้หายจากที่ตั้งทางภูมิศาสตร์ที่หลากหลายรวมทั้งใน 7 จังหวัด ( ตารางที่ 2 ) เป็นจำนวน 13 ไอโซเลท เป็นของกลุ่มที่ 2