The high sequence complementary bet

The high sequence complementary between the primersequence and the target viral sequence is of vital importance forthe effective RT-PCR detection of the targeted virus (Kwok et al.,1990; Malinowski, 2005). The high variability of ASPV isolates frompear and apple has been reported (Schwarz and Jelkmann, 1998;Komorowska et al., 2010), which often lead to false negative resultsof ASPV detection (Nemchinov et al., 1998; Komorowska et al.,2010). In this study, four pairs of primers, of which two target-ing to CP gene and two targeting to TGB genes, were designedbased on sequences available in GenBank and over 50 sequencesof ASPV pear isolates obtained in our lab. Using in vitro culturedP. communis plants infected by the targeted viruses as materials,one primer pair ASPV247-F/ASPV247-R, which targeted ASPV CPgene, gave the best results for the detection of ASPV pear iso-lates in both uRT-PCR and mRT-PCR. Other primer pairs oftenfailed in the detection of ASPV in one or more plants, indi-cating different sensitivities of those primer pairs for the ASPVdetection.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับสูงที่เกื้อกูลระหว่าง primersequence และเป้าหมายลำดับไวรัสมีความสำคัญสำคัญการตรวจสอบวง RT-PCR ที่มีประสิทธิภาพของไวรัสเป้าหมาย (kwok et al, 1990;. มาลีเนาสกี้, 2005) ความแปรปรวนสูงของ aspv แยก frompear และแอปเปิ้ลได้รับการรายงาน (Schwarz และ jelkmann, 1998;. Komorowska et al, 2010)ซึ่งมักจะนำไปสู่​​การตรวจสอบ resultsof aspv ลบเท็จ (nemchinov และคณะ, 1998;.. Komorowska et al, 2010) ในการศึกษาครั้งนี้สี่คู่ไพรเมอร์ที่สองเป้าหมายไอเอ็นจีที่จะ cp ยีนและสองการกำหนดเป้​​าหมายที่จะ TGB ยีนถูก designedbased ในลำดับที่มีอยู่ใน genbank และกว่า 50 ลูกแพร์ sequencesof aspv แยกได้ในห้องปฏิบัติการของเรา ใช้ในหลอดทดลอง culturedpcommunis พืชที่ติดเชื้อจากไวรัสที่กำหนดเป้​​าหมายเป็นวัสดุหนึ่ง aspv247-f/aspv247-r คู่ไพรเมอร์ซึ่งมีการกำหนดเป้​​าหมาย aspv cpgene ให้ผลลัพธ์ที่ดีที่สุดสำหรับการตรวจสอบของลูกแพร์ aspv iso ปลากะพงขาวในทั้งสอง urt-PCR และ MRT-PCR คู่ไพรเมอร์อื่น ๆ oftenfailed ในการตรวจสอบของ aspv ในหนึ่งหรือมากกว่าพืชกำกับ cating ความเปราะบางแตกต่างกันของคู่ไพรเมอร์เหล่านั้นสำหรับ aspvdetection

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับสูงเสริมระหว่างการ primersequence และลำดับไวรัสเป้าหมายเป็นหัวใจสำหรับการตรวจหา RT-PCR ผลของไวรัสเป้าหมาย (ซเซสเตอร์ลุคโกวง et al., 1990 Malinowski, 2005) สำหรับความผันผวนที่สูงของ ASPV frompear ที่แยกได้ และแอปเปิ้ลได้รับรายงาน (โรลด์และ Jelkmann, 1998Komorowska et al., 2010), ซึ่งมักจะนำไปสู่การตรวจหา ASPV resultsof ลบเท็จ (Nemchinov et al., 1998 Komorowska et al., 2010) ในการศึกษานี้ สี่คู่ไพรเมอร์ ที่สองเป้าหมายกำลังการยีน CP และสองที่กำหนดเป้าหมายไปที่ยีน TGB, designedbased ในลำดับใน GenBank และ 50 sequencesof ASPV ลูกแพร์ isolates ได้ในห้องปฏิบัติการของเรา ใช้เครื่องมือ culturedP เชื้อไวรัสเป้าหมายเป็นวัสดุ พื้นหนึ่งคู่ ASPV247-F/ASPV247-R ซึ่งเป้าหมาย ASPV CPgene พืช communis ให้ผลลัพธ์ตรวจ ASPV ลูกแพร์ iso-ปลา uRT PCR และ mRT PCR รองพื้นอื่น ๆ จับคู่ oftenfailed ในการตรวจพบ ASPV ในพืชอย่าง น้อยหนึ่ง indi cating รัฐแตกต่างกันของคู่ที่รองพื้นสำหรับ ASPVdetection

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

อภิ นันทนาการที่สูงตามลำดับระหว่างที่ primersequence และที่เป้าหมายเป็นไวรัสตามลำดับมีความสำคัญความสำคัญในกระทรวงของตนอย่างมี ประสิทธิภาพ Rt - pcr การตรวจจับที่มีเป้าหมายสำหรับไวรัส( kwok et al ., 1990 ; malinowski , 2005 ) ตั้งได้สูงของ aspv แยก frompear แอปเปิลและมีรายงานว่า( schwarz และ jelkmann 1998 komorowska et al . 2010 )ซึ่งมักจะนำไปสู่ความผิดพลาดทางลบ resultsof aspv การตรวจจับ( nemchinov et al . 1998 komorowska et al . 2010 ) ในการศึกษาวิจัยนี้สี่คู่ของ primers ของยีนซึ่งทั้งสองกลุ่มเป้าหมาย - ไอเอ็นจีประกันชีวิตเพื่อ CP และสองยีนมีเป้าหมายเพื่อ tgb designedbased ลำดับที่จัดให้บริการในเลี้ยงดูและมากกว่า 50 ลูกแพร์หรือสาลี่ sequencesof aspv แยกได้รับในห้องปฏิบัติการของเรา การใช้ใน culturedp เอง.พันธุ์ไม้ละหุ่งที่ติดไวรัสโดยกลุ่มเป้าหมายที่เป็นวัตถุดิบหลักของคู่หนึ่ง aspv 247 - F / aspv 247 - R ซึ่งเป้าหมาย aspv cpgene ให้ได้ผลดีที่สุดสำหรับการตรวจจับของ aspv สาลี่ ISO - lates ใน URT ทั้ง - pcr และสถานีรถไฟฟ้าใต้ดิน - pcr. คู่อื่นๆเชื้อปะทุ oftenfailed ในการตรวจจับของ aspv ในหนึ่งหรือมากกว่าพันธุ์ไม้ indi - cating ความไวของแตกต่างกันของคู่เชื้อปะทุสำหรับ aspvdetection ที่