RNA extractionAt the end of the 5 w

RNA extraction
At the end of the 5 weeks, mice were sacrificed by decapitation under anesthesia, and the liver was dissected and storage in RNA later. Total RNA was extracted using Trizol reagent and checked for a RIN number to inspect RNA integration. The samples with an RNA integrity number (RIN) > 7.0 and 28S/18S > 0.7 were used for microarray analysis.
DNA microarray
Gene expression profiling (n = 3/group) analyzed by Agilent mouse whole-genome 4 × 44 K chip (design ID: 014868), were performed in Shanghai Biotechnology Corporation (http://www.ebioservice.com/). Total RNA was amplified and labeled by Low Input Quick Amp Labeling Kit, One-Color. Labeled cRNA were purified by RNeasy mini kit. Each slide was hybridized with Cy3-labeled cRNA in Hybridization Oven. Slides were scanned by Agilent Microarray Scanner (Agilent technologies, Santa Clara, CA, USA). Data were extracted with Feature Extraction software 10.7 (Agilent technologies, Santa Clara, CA, USA). Raw data were normalized by Quantile algorithm, Gene Spring Software 11.0 (Agilent technologies, Santa Clara, CA, USA).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สกัด RNAปลาย 5 สัปดาห์ เมาส์ได้เสีย decapitation ภายใต้ยาชา และตับถูก dissected และเก็บในอาร์เอ็นเอในภายหลัง อาร์เอ็นเอทั้งหมดถูกแยกใช้ Trizol เอเจนต์ และการตรวจสอบหมายเลขริ้นเพื่อตรวจ RNA รวม ตัวอย่าง ด้วยหมายเลขความสมบูรณ์ของ RNA (ริ้น) > 7.0 และ 28S/18 ปี > 0.7 ใช้สำหรับวิเคราะห์ microarrayDNA microarrayรวบรวมสถานะแสดงออกของยีน (n = 3/กลุ่ม) วิเคราะห์ โดยชิโนมทั้ง 4 × 44 K เมาส์ Agilent (ออกแบบ ID: 014868), ดำเนินการใน บริษัทเทคโนโลยีชีวภาพเซี่ยงไฮ้ (http://www.ebioservice.com/) อาร์เอ็นเอทั้งหมดถูกขยาย และป้าย โดยต่ำอินพุตด่วนแอมป์ติดฉลากชุด สีหนึ่ง CRNA ป้ายถูกทำ โดยชุดมินิ RNeasy แต่ละภาพนิ่งเป็นไฮบริด ด้วยป้าย Cy3 cRNA ในเตา Hybridization ภาพนิ่งถูกสแกน ด้วยสแกนเนอร์ Microarray Agilent (Agilent เทคโนโลยี ซานตาคลารา CA, USA) ข้อมูลที่ถูกสกัด ด้วยการสกัดคุณลักษณะซอฟต์แวร์ 10.7 (Agilent เทคโนโลยี ซานตาคลารา CA, USA) ข้อมูลดิบได้ตามปกติ โดยอัลกอริทึม Quantile ยีนสปริงซอฟต์แวร์ 11.0 (Agilent เทคโนโลยี ซานตาคลารา CA, USA)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สกัด RNA
ในตอนท้ายของ 5 สัปดาห์ที่ผ่านมาหนูได้รับการเสียสละโดยการตัดศีรษะภายใต้การดมยาสลบและตับถูกชำแหละและการเก็บรักษาในภายหลังอาร์เอ็นเอ อาร์เอ็นเอทั้งหมดถูกสกัดโดยใช้ Trizol สารและการตรวจสอบสำหรับจำนวน RIN ในการตรวจสอบการรวมอาร์เอ็นเอ กลุ่มตัวอย่างที่มีจำนวนสมบูรณ์อาร์เอ็นเอ (ริน)> 7.0 และ 28S / 18S> 0.7 ถูกนำมาใช้สำหรับการวิเคราะห์ microarray.
ดีเอ็นเอ microarray
การแสดงออกของยีน profiling (n = 3 / กลุ่ม) วิเคราะห์โดย Agilent เมาส์จีโนมทั้งหมด 4 × 44 K ชิป (การออกแบบ ID: 014868) ได้ดำเนินการในเซี่ยงไฮ้เทคโนโลยีชีวภาพคอร์ปอเรชั่น (http://www.ebioservice.com/) RNA รวมถูกขยายและติดป้ายตามขาเข้าต่ำด่วน Amp ฉลากชุดสีหนึ่ง ที่มีข้อความสีดำถูกทำให้บริสุทธิ์ด้วยชุดมินิ RNeasy แต่ละภาพนิ่งถูกไฮบริดกับสีดำ Cy3 ติดฉลากในเตาอบผสมพันธุ์ สไลด์ถูกสแกนโดย Agilent Microarray สแกนเนอร์ (เทคโนโลยี Agilent, ซานตาคลารา, แคลิฟอร์เนีย, สหรัฐอเมริกา) ข้อมูลที่ถูกสกัดด้วยซอฟแวร์การดึง 10.7 (เทคโนโลยี Agilent, ซานตาคลารา, แคลิฟอร์เนีย, สหรัฐอเมริกา) ข้อมูลดิบถูกปกติโดยวิธี Quantile ยีนฤดูใบไม้ผลิซอฟท์แว 11.0 (เทคโนโลยี Agilent, ซานตาคลารา, แคลิฟอร์เนีย, สหรัฐอเมริกา)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การสกัดอาร์เอ็นเอที่ส่วนท้ายของสัปดาห์ที่ 5 , หนูเสียสละโดยการตัดหัวภายใต้ยาชา และ ตับ และกระเป๋าใน RNA คือ ผ่าหลัง อาร์เอ็นเอทั้งหมดถูกสกัดโดยใช้ trizol รีเอเจนต์และตรวจสอบสำหรับริน หมายเลขตรวจสอบบูรณาการ RNA ตัวอย่างมีความสมบูรณ์จำนวน RNA ( ริน ) > 7.0 และ 28s / 18S > 0.7 ใช้สำหรับการวิเคราะห์ .ดีเอ็นเอไมโครแอเรย์แบบแผนการแสดงออกของจีน ( n = 3 / กลุ่ม ) โดยใช้เมาส์ Agilent ทั้งจีโนม 4 × 44 k ชิป ( id : การออกแบบ 014868 ) แสดงในเซี่ยงไฮ้ บริษัท เทคโนโลยีชีวภาพ ( http : / / www.ebioservice . com / ) อาร์เอ็นเอทั้งหมดถูกขยาย และป้ายฉลากชุดแอมป์ต่ำใส่โดยด่วน สีเดียว ป้าย crna มีความบริสุทธิ์โดยมินิชุด rneasy . แต่ละสไลด์ด้วยดีเอ็นเอ cy3 ป้าย crna ในเตาอบลูกผสม ภาพนิ่งที่ถูกสแกนโดย Agilent microarray สแกนเนอร์ ( Agilent Technologies , ซานตาคลารา แคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกา ) ข้อมูลสกัดคุณลักษณะการสกัดซอฟต์แวร์ 10.7 ( Agilent Technologies , ซานตาคลารา แคลิฟอร์เนีย สหรัฐอเมริกา ) ข้อมูลดิบเป็นปกติโดยขั้นตอนวิธีควอนไทล์ , ยีนฤดูใบไม้ผลิซอฟต์แวร์ 11.0 ( Agilent เทคโนโลยี ซานตา คลาร่า , แคลิฟอร์เนีย , สหรัฐอเมริกา