The uptake of benzoateand derivativ

The uptake of benzoate
and derivatives thereof into the cell is facilitated by transport
systems (Chaudhry et al., 2007; Clark et al., 2002; Ledger et al., 2009;
Nichols and Harwood, 1997; Nishikawa et al., 2008). In the cell, benzoate
can be converted to catechol via cis-1,2-dihydroxybenzoate
or via protocatechuate. Catechol is the key intermediate in the catechol
branch and it is converted into cis, cis-muconic acid by catechol
1,2-dioxygenases (Fig. 3) which have been extensively studied in
various bacteria (Patel et al., 1976; Harayama et al., 1992; Mason
and Cammack, 1992; Nakai et al., 1988; Strachan et al., 1998).
Muconate cycloisomerase then converts cis, cis-muconic acid to
muconolactone which is degraded to succinyl-CoA and acetyl-CoA
downstream in the -ketoadipate pathway (Fig. 3).
With respect to genetic regulation, the transcriptional regulators
BenR and CatR, as well as BenM and CatM were found in
Pseudomonas sp. and Acinetobacter sp., respectively (Collier et al.,
1998; Jeffrey et al., 1992; McFall et al., 1998). In the presence of
benzoate, BenR from Pseudomonas putida activates transcription
of the benABCD operon for the conversion of benzoate to catechol
(Jeffrey et al., 1992), and CatR from P. putida activates transcription
of the catBCA operon in response to cis, cis-muconic acid for
further degradation of catechol via cis, cis-muconic acid (McFall
et al., 1998). In Acinetobacter sp. strain ADP1, the regulator BenM
activates transcription of the benABCDE operon and cat genes for
degradation of catechol in response to both benzoate and cis, cismuconic
acid (Collier et al., 1998). CatM, to which BenM is 75%
similar, additionally activates transcription of cat genes in response
to cis, cis-muconic acid for degradation of catechol (Collier et al.,
1998). The unusual features of this system are the abilities of both
BenM and CatM to recognize the same inducer, cis, cis-muconate,
and to regulate some of the same genes, such as catA and catB.
The ability to produce cis, cis-muconic acid from benzoate by
fermentation has been reported for some microorganisms. It was
found that Pseudomonas sp. B13 grown in 1 l succinate (60 mM)
mineral medium in a controlled bioreactor converted benzoate,
which was added successively to concentrations of 5–10 mM to the
growth medium, to cis, cis-muconic acid with 91% yield (Schmidt
and Knackmuss, 1984). In this strain, no muconate cycloisomerase
activity was induced and the cis, cis-muconic acid titer reached
about 52 mM. Enhanced accumulation of cis, cis-muconic acid
obtained by biocatalytic conversion from benzoate was observed
in a high cell density culture of a mutant P. putida strain BM014
in a cell-recycle bioreactor carried out in a fed-batch mode (Choi
et al., 1997). In this study a productivity of 38.7 mM/(l h) and a cis,
cis-muconic acid titer of 95 mM in the culture broth were obtained
(Choi et al., 1997). Phosphate limitation, cobalt supplementation
and dissolved oxygen concentrations above 20% saturation were
found to be positive for optimum rates of cell growth and product
formation. A higher cis, cis-muconic acid titer of more than 225 mM
was reached in a fed-batch process with computer-controlled
dissolved oxygen-stat feeding, a strategy to obtain high cell densities
by the control of oxygen supply (Bang and Choi, 1995). An
ultraviolet-irradiated mutant of a microorganism belonging to the
genus Arthrobacter devoid of muconate cycloisomerase activity
showed the capacity to produce about 310 mM cis, cis-muconic
acid over 48 h in a 30 l jar fermenter by successive feeding of small
amounts of benzoate (Mizuno et al., 1988).
Recently, the strain P. putida KT2440-JD1 was described, which
was derived from P. putida KT2440 by random mutagenesis
with N-methyl-N-nitro-N-nitrosoguanidine and exposure to 3-
fluorobenzoate. The strain was no longer able to grow with
benzoate as sole carbon source, but co-metabolized benzoate to
cis, cis-muconic acid, which accumulated in the medium with
89% yield (molcis, cis-muconate/molbenzoate) during growth on glucose
(van Duuren et al., 2011c). During cultivation in continuous culture
at a growth rate of 0.2 h−1, the specific cis, cis-muconic acid
production rate was about 1.3 mM/gdry cell weight/h and increased
to 10 mM/(g h) during wash-out cultivation at a dilution rate of
1.3 h−1 (max = 0.6 h−1), indicating that the productivity of P. putida
KT2440-JD1 is much higher under max conditions. This production
rate is at least eight times higher than those reported for other cis,
cis-muconic acid-producing strains (van Duuren et al., 2011c).
Transcriptomics and proteomics revealed that the catBCA
operon in P. putida KT2440-JD1 is no longer induced in the presence
of 5 mM benzoate. DNA sequencing of the catBCA-catR region
revealed one single point mutation in the conserved DNA-binding
domain of the transcriptional regulator CatR. Apparently, the mutation
in catR inhibited the expression of all genes of the catBCA
operon. The ben operon was highly expressed in the mutant
and in its parental strain in the presence of benzoate. Since this
operon contains the gene catA2 (PP 3166), which was shown to
encode a second catechol 1,2-dioxygenase besides catA, the strain
was still able to convert catechol to cis, cis-muconic acid. In a
follow-up work, a fed-batch process was developed for P. putida
KT2440-JD1 in which the addition of benzoate was coupled to the
acidification of the medium. The medium is acidified when benzoate
is converted to cis, cis-muconate, and therefore coupling the
addition of benzoate to the pH-regulation prevented undesired
accumulation of benzoate by optimized feeding. Under these conditions
up to 130 mM cis, cis-muconic acid was accumulated in
the culture medium with a molar product yield (molcis, cis-muconic
acid/molbenzoate) of close to 100% when P. putida KT2440-JD1 was
grown on glucose (van Duuren et al., 2011b).
Toxic benzoate is used as ingredient for various industrial and
medical applications including pH adjustment and preservation
(Nair, 2001). In the fermentation studies higher concentrations of
benzoate seriously inhibited growth and therefore benzoate was
supplemented to the medium only in the low millimolar range.
P. putida KT2440-JD1 was unable to grow in glucose medium in
the presence of 50 mM benzoate (van Duuren et al., 2011b). To

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ต่อการเจริญของ benzoateและอนุพันธ์ดังกล่าวลงในเซลล์จะอำนวยความสะดวก โดยการขนส่งระบบ (Chaudhry et al., 2007 คลาร์กและ al., 2002 บัญชีแยกประเภทและ al., 2009นิโคลและ Harwood, 1997 Nishikawa et al., 2008) ในเซลล์ benzoateสามารถแปลง catechol ผ่าน cis-1, 2-dihydroxybenzoateหรือผ่าน ทาง protocatechuate Catechol จะคีย์ใน catechol กลางสาขาและจะถูกแปลงเป็น cis กรด cis muconic โดย catechol1, 2-dioxygenases (Fig. 3) ซึ่งได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางในแบคทีเรียต่าง ๆ (Patel et al., 1976 Harayama et al., 1992 Masonและ Cammack, 1992 มาซาฮิโระ et al., 1988 Strachan และ al., 1998)Muconate cycloisomerase cis กรด cis muconic เพื่อที่แปลงแล้วmuconolactone ที่เสื่อมโทรม succinyl CoA และ acetyl-CoAปลายน้ำในทางเดิน - ketoadipate (Fig. 3)เกี่ยวกับการควบคุมทางพันธุกรรม เคร่งครัด transcriptionalBenR และ CatR รวมทั้ง BenM และ CatM พบในAcinetobacter sp. และ pseudomonas sp.ตามลำดับ (กำลังขุดถ่านหิน et al.,ปี 1998 เจฟฟรีย์ et al., 1992 McFall และ al., 1998) หน้าtranscription benzoate เรียกใช้ BenR จาก Pseudomonas putidaของ operon benABCD สำหรับการแปลง benzoate catechol(เจฟฟรีย์ et al., 1992) และ CatR จาก P. putida เรียกใช้ transcriptionของ operon catBCA ใน cis, cis muconic กรดสำหรับต่อการย่อยสลายของ catechol ผ่าน cis, cis muconic กรด (McFallและ al., 1998) ใน Acinetobacter sp.สายพันธุ์ ADP1, BenM เครื่องปรับลมเรียกใช้ transcription benABCDE operon และแมวยีนของ catechol ตอบ benzoate และ cis, cismuconicกรด (กำลังขุดถ่านหินและ al., 1998) CatM ที่ BenM เป็น 75%คล้าย นอกจากนี้เรียกใช้ transcription ของยีนแมวตอบการ cis, cis muconic กรดสำหรับย่อยสลายของ catechol (กำลังขุดถ่านหิน et al.,ปี 1998) . ลักษณะการทำงานผิดปกติของระบบนี้มีความสามารถทั้งสองอย่างBenM และ CatM รู้จัก inducer เดียว cis, cis-muconateและ การควบคุมของยีนเดียวกัน catA และ catBความสามารถในการผลิต cis, cis muconic กรดจาก benzoate โดยมีการรายงานการหมักสำหรับจุลินทรีย์บาง มันเป็นพบว่า Pseudomonas sp. B13 ปลูก succinate 1 l (60 mM)แร่ปานกลางใน bioreactor ควบคุมแปลง benzoateซึ่งมีเพิ่มติด ๆ กันเพื่อความเข้มข้น 5 – 10 มม.เพื่อการเชื้อ การ cis, cis muconic กรดกับ 91% ผลตอบแทน (Schmidtก Knackmuss, 1984) ในการนี้ต้องใช้ ไม่ cycloisomerase muconateกิจกรรมทำให้เกิด และ cis, cis muconic titer กรดถึงประมาณ 52 มม. สะสมเพิ่มของ cis กรด cis muconicรับโดย biocatalytic แปลงจาก benzoate ถูกสังเกตในวัฒนธรรมความหนาแน่นสูงเซลล์ของ putida P. กลายพันธุ์เป็นสายพันธุ์ BM014ใน bioreactor เซลล์-ไซที่ทำในโหมดชุดงานเลี้ยง (Choiและ al., 1997) ในการศึกษาประสิทธิภาพของ /(l h) มม. 38.7 และแบบ ciscis muconic กรด titer ของ 95 มม.ในซุปวัฒนธรรมได้รับ(Choi et al., 1997) ข้อจำกัดฟอสเฟต โคบอลต์แห้งเสริมและความเข้มข้นของออกซิเจนที่ละลายอยู่เหนือ 20% ความเข้มและต้องเป็นค่าบวกสำหรับราคาที่เหมาะสมของการเจริญเติบโตของเซลล์และผลิตภัณฑ์การก่อ Cis สูง cis muconic titer กรดมากกว่า 225 มม.ถึงในกระบวนการชุดงานเลี้ยงที่มีคอมพิวเตอร์ควบคุมอาหาร กลยุทธ์เพื่อให้ได้ความหนาแน่นของเซลล์สูงสถิติออกซิเจนส่วนยุบโดยการควบคุมของออกซิเจน (บางและ Choi, 1995) มีรังสีอัลตราไวโอเลต irradiated mutant ของจุลินทรีย์ที่อยู่ในพืชสกุล Arthrobacter ไร้ muconate cycloisomerase กิจกรรมแสดงให้เห็นว่ากำลังการผลิตประมาณ 310 มม. cis, cis muconicกรดใน fermenter ขวดมี 30 ลิตรโดยอาหารเล็กต่อเนื่องกว่า 48 hจำนวน benzoate (คุมิซุโนะ et al., 1988)ล่าสุด putida ต้องใช้ P. KT2440-JD1 ถูกอธิบาย ที่มาจาก P. putida KT2440 โดย mutagenesis สุ่มN-methyl-เอ็น - ไนโตร-N-nitrosoguanidine และสัมผัสกับ 3-fluorobenzoate สายพันธุ์ก็ไม่สามารถเติบโตด้วยbenzoate เป็นแหล่งคาร์บอนแต่เพียงผู้เดียว แต่ benzoate metabolized ร่วมกับcis กรด cis muconic ซึ่งสะสมในสื่อด้วย89% ผลตอบแทน (molcis, cis-muconate/molbenzoate) ในระหว่างการเจริญเติบโตในกลูโคส(van Duuren et al., 2011c) ในระหว่างการเพาะปลูกในวัฒนธรรมอย่างต่อเนื่องที่อัตราการเติบโตของ 0.2 h−1 เฉพาะ cis กรด cis muconicอัตราการผลิตได้ประมาณ 1.3 มม./gdry น้ำหนัก/h ของเซลล์ และเพิ่มขึ้นการ /(g h) 10 มม.ระหว่างล้างออกปลูกในอัตราเจือจาง1.3 h−1 (max = 0.6 h−1), indicating that the productivity of P. putidaKT2440-JD1 is much higher under max conditions. This productionrate is at least eight times higher than those reported for other cis,cis-muconic acid-producing strains (van Duuren et al., 2011c).Transcriptomics and proteomics revealed that the catBCAoperon in P. putida KT2440-JD1 is no longer induced in the presenceof 5 mM benzoate. DNA sequencing of the catBCA-catR regionrevealed one single point mutation in the conserved DNA-bindingdomain of the transcriptional regulator CatR. Apparently, the mutationin catR inhibited the expression of all genes of the catBCAoperon. The ben operon was highly expressed in the mutantand in its parental strain in the presence of benzoate. Since thisoperon contains the gene catA2 (PP 3166), which was shown toencode a second catechol 1,2-dioxygenase besides catA, the strainwas still able to convert catechol to cis, cis-muconic acid. In afollow-up work, a fed-batch process was developed for P. putidaKT2440-JD1 in which the addition of benzoate was coupled to theacidification of the medium. The medium is acidified when benzoateis converted to cis, cis-muconate, and therefore coupling theaddition of benzoate to the pH-regulation prevented undesiredaccumulation of benzoate by optimized feeding. Under these conditionsup to 130 mM cis, cis-muconic acid was accumulated inthe culture medium with a molar product yield (molcis, cis-muconicacid/molbenzoate) of close to 100% when P. putida KT2440-JD1 wasgrown on glucose (van Duuren et al., 2011b).Toxic benzoate is used as ingredient for various industrial andmedical applications including pH adjustment and preservation(Nair, 2001). In the fermentation studies higher concentrations ofbenzoate seriously inhibited growth and therefore benzoate wassupplemented to the medium only in the low millimolar range.P. putida KT2440-JD1 was unable to grow in glucose medium inthe presence of 50 mM benzoate (van Duuren et al., 2011b). To

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การดูดซึมของเบนโซเอและอนุพันธ์ดังกล่าวเข้าไปในเซลล์จะอำนวยความสะดวกโดยการขนส่งระบบ(ชอม et al, 2007;. คลาร์ก, et al., 2002; บัญชีแยกประเภท et al, 2009;. นิโคลส์และฮาร์วู้ด, 1997;. Nishikawa et al, 2008) . ในเซลล์เบนโซเอสามารถแปลงเป็น catechol ผ่านถูกต้อง-1,2-dihydroxybenzoate หรือผ่านทาง protocatechuate catechol เป็นกุญแจสำคัญสื่อกลางในการ catechol สาขาและมันจะถูกแปลงเป็นถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic โดย catechol 1,2-dioxygenases (รูปที่ 3.) ซึ่งได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางในแบคทีเรียต่างๆ(เทล et al, 1976;. Harayama et อัล, 1992. เมสันและCammack 1992; Nakai et al, 1988;... Strachan, et al, 1998) Muconate cycloisomerase แล้วแปลงถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic เพื่อmuconolactone ซึ่งเป็นที่เสื่อมโทรมเพื่อเป็น Succinyl CoA และ acetyl-CoA ปลายน้ำ ใน? เดิน -ketoadipate (รูปที่. 3). ด้วยความเคารพต่อกฎระเบียบทางพันธุกรรมที่หน่วยงานกำกับดูแลการถอดรหัสBenR และ CatR เช่นเดียวกับ BenM และ CATM ถูกพบอยู่ในPseudomonas SP . และ Acinetobacter SP ตามลำดับ (ถ่านหิน, et al. 1998; et al, เจฟฟรีย์, 1992.. แม็กฟอ et al, 1998) ในการปรากฏตัวของเบนโซเอต, BenR จาก Pseudomonas putida เปิดใช้งานการถอดความของoperon benABCD สำหรับการแปลงของเบนโซเอตเพื่อ catechol (เจฟฟรีย์ et al., 1992) และจาก CatR พี putida เปิดใช้งานการถอดความของoperon catBCA ในการตอบสนองที่ถูกต้อง, ถูกต้อง กรด -muconic สำหรับการย่อยสลายต่อไปของcatechol ผ่านถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic (แม็กฟอet al., 1998) ใน Acinetobacter SP ADP1 ความเครียดควบคุม BenM เปิดใช้งานการถอดความของ operon benABCDE และยีนแมวสำหรับการย่อยสลายของcatechol ในการตอบสนองทั้งเบนโซเอตและ CIS, cismuconic กรด (ถ่านหิน et al., 1998) CATM ซึ่ง BenM เป็น 75% ที่คล้ายกันนอกจากนี้ยังเปิดใช้งานการถอดความของยีนแมวในการตอบสนองต่อการถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic สำหรับการย่อยสลายของ catechol (ถ่านหิน et al., 1998) คุณสมบัติที่ผิดปกติของระบบนี้มีความสามารถของทั้งสองBenM และ CATM ที่จะรับรู้ inducer เดียวกันถูกต้อง, ถูกต้อง-muconate, และในการควบคุมบางส่วนของยีนเดียวกันเช่น CATA และ catB. ความสามารถในการผลิตที่ถูกต้อง, ถูกต้อง-muconic กรดเบนโซเอตจากโดยการหมักได้รับการรายงานสำหรับเชื้อ มันถูกพบว่า Pseudomonas SP B13 ปลูกใน 1 ลิตร succinate (60 มิลลิเมตร) กลางแร่ในเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพควบคุมแปลงเบนโซเอต, ซึ่งถูกเพิ่มเข้ามาอย่างต่อเนื่องเพื่อความเข้มข้น 5-10 มิลลิกับสื่อการเจริญเติบโตเพื่อให้ถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic กับผลผลิต 91% (Schmidt และ Knackmuss , 1984) ในสายพันธุ์นี้ไม่มี cycloisomerase muconate กิจกรรมถูกชักนำและถูกต้อง, ถูกต้อง-muconic titer กรดถึงประมาณ52 มิลลิ การสะสมเพิ่มขึ้นของถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic ที่ได้รับจากการแปลง biocatalytic จากเบนโซเอตเป็นข้อสังเกตในการเพาะเลี้ยงเซลล์ความหนาแน่นสูงของมนุษย์กลายพันธุ์พีputida BM014 สายพันธุ์ในเซลล์รีไซเคิลเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพดำเนินการในโหมดอาหารชุด(Choi et al, , 1997) ในการศึกษานี้ผลผลิตของ 38.7 มิลลิ / (lh) และถูกต้อง, ถูกต้อง-muconic titer กรด 95 มิลลิในน้ำซุปวัฒนธรรมที่ได้รับ(Choi et al., 1997) ข้อ จำกัด ฟอสเฟตเสริมโคบอลต์และความเข้มข้นของออกซิเจนที่ละลายในน้ำข้างต้นอิ่มตัว20% ถูกพบว่าเป็นผลบวกต่ออัตราที่เหมาะสมในการเจริญเติบโตของเซลล์และผลิตภัณฑ์การก่อตัว ถูกต้องสูงขึ้นถูกต้อง-muconic titer กรดมากกว่า 225 มิลลิก็มาถึงในกระบวนการอาหารชุดกับเครื่องคอมพิวเตอร์ที่ควบคุมการละลายให้อาหารออกซิเจนสถิติเป็นกลยุทธ์ที่จะได้รับความหนาแน่นของเซลล์สูงโดยการควบคุมของออกซิเจน(แบงและชอย 1995) กลายพันธุ์อัลตราไวโอเลตฉายรังสีของจุลินทรีย์ที่อยู่ในสกุล Arthrobacter ไร้กิจกรรม cycloisomerase muconate แสดงให้เห็นความสามารถในการผลิตประมาณ 310 มิลลิถูกต้อง, ถูกต้อง-muconic กรดมากกว่า 48 ชั่วโมงในถังหมักขวดลิตร 30 โดยการให้อาหารต่อเนื่องของขนาดเล็กปริมาณของเบนโซเอต( Mizuno et al., 1988). เมื่อเร็ว ๆ นี้สายพันธุ์พี putida KT2440-JD1 ถูกอธิบายไว้ซึ่งได้มาจากพีputida KT2440 โดยฉับสุ่มกับN-methyl-N? -nitro-N-nitrosoguanidine และการสัมผัสกับ 3 fluorobenzoate ความเครียดก็ไม่สามารถที่จะเติบโตไปพร้อมกับเบนโซเอตเป็นแหล่งคาร์บอน แต่เพียงผู้เดียว แต่เบนโซเอร่วมเผาผลาญจะถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic ซึ่งสะสมในสื่อที่มีอัตราผลตอบแทน 89% (molcis, ถูกต้อง-muconate / molbenzoate) ในระหว่างการเจริญเติบโตกลูโคส (รถตู้ Duuren et al., 2011c) ในช่วงการเพาะปลูกในวัฒนธรรมอย่างต่อเนื่องในอัตราการเจริญเติบโตของ 0.2 ชั่วโมง-1 ถูกต้องเฉพาะถูกต้อง-muconic กรดอัตราการผลิตเป็นประมาณ1.3 มิลลิ / gdry น้ำหนักเซลล์ / ชั่วโมงและเพิ่มขึ้นถึง10 มิลลิ / (GH) ในระหว่างการเพาะปลูกล้างออก อัตราการลดสัดส่วนของ1.3 H-1 (? = สูงสุด 0.6 ชั่วโมง-1) ที่ระบุว่าผลผลิตของพี putida KT2440-JD1 สูงภายใต้มาก? เงื่อนไขสูงสุด การผลิตนี้อัตราอย่างน้อยแปดครั้งสูงกว่าที่รายงานถูกต้องอื่น ๆ ถูกต้อง-muconic สายพันธุ์ที่ผลิตกรด (รถตู้ Duuren et al., 2011c). Transcriptomics และโปรตีนเปิดเผยว่า catBCA operon ในพี putida KT2440-JD1 ไม่ เหนี่ยวนำให้เกิดอีกต่อไปในการปรากฏตัวของ5 มิลลิเบนโซเอต ลำดับดีเอ็นเอของ catBCA-catR ภูมิภาคเปิดเผยกลายพันธุ์จุดเดียวในดีเอ็นเอผูกพันอนุรักษ์โดเมนของการควบคุมการถอดรหัสCatR เห็นได้ชัดว่าการกลายพันธุ์ใน catR ยับยั้งการแสดงออกของยีนทั้งหมดของ catBCA operon operon เบนได้แสดงออกอย่างมากในการกลายพันธุ์และสายพันธุ์ของผู้ปกครองในการปรากฏตัวของเบนโซเอ ตั้งแต่นี้operon มี catA2 ยีน (PP 3166) ซึ่งแสดงให้เห็นถึงการเข้ารหัสที่สองcatechol 1,2-dioxygenase นอกจาก CATA, ความเครียดก็ยังสามารถที่จะแปลงcatechol จะถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic ในการทำงานติดตามกระบวนการอาหารชุดได้รับการพัฒนาสำหรับพี putida KT2440-JD1 ซึ่งนอกเหนือจากเบนโซเอตได้รับการควบคู่ไปกับการเป็นกรดของกลาง สื่อที่เป็นกรดเบนโซเอตเมื่อถูกแปลงเป็นถูกต้อง, ถูกต้อง-muconate และดังนั้นจึงมีเพศสัมพันธ์นอกเหนือจากเบนโซเอตกับการควบคุมค่าpH ที่ไม่พึงประสงค์ป้องกันไม่ให้เกิดการสะสมของเบนโซเอตโดยการให้อาหารที่ดีที่สุด ภายใต้เงื่อนไขเหล่านี้ถึง 130 มิลลิถูกต้องกรดถูกต้อง-muconic ถูกสะสมในอาหารเลี้ยงเชื้อที่มีผลผลิตกราม(molcis, ถูกต้อง-muconic กรด / molbenzoate) ของใกล้ถึง 100% เมื่อพี putida KT2440-JD1 ถูกปลูกในกลูโคส(รถตู้ Duuren et al., 2011b). เบนโซเอตเป็นพิษถูกนำมาใช้เป็นส่วนผสมสำหรับอุตสาหกรรมต่างๆและการใช้งานทางการแพทย์รวมทั้งการปรับค่า pH และการเก็บรักษา (แนร์, 2001) ในการศึกษาการหมักความเข้มข้นที่สูงขึ้นของเบนโซเอยับยั้งการเจริญเติบโตอย่างจริงจังและดังนั้นจึงเบนโซเอตได้เสริมไปยังสื่อเฉพาะในช่วงmillimolar ต่ำ. พี putida KT2440-JD1 ก็ไม่สามารถที่จะเติบโตในระดับปานกลางกลูโคสในการปรากฏตัวของเบนโซเอตมิลลิ50 (รถตู้ Duuren et al., 2011b) ไปยัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การดูดซึมของเบนโซเอต
และอนุพันธ์ของมันเข้าไปในเซลล์มีความสะดวก โดยระบบการขนส่ง
( Chaudhry et al . , 2007 ; คลาร์ก et al . , 2002 ; บัญชี et al . , 2009 ;
นิโคล และ Harwood , 1997 ; นิชิคาวา et al . , 2008 ) ในเซลล์ เบนโซเอท
สามารถเปลี่ยนแคติคอลผ่าน cis-1,2-dihydroxybenzoate
หรือผ่านทาง protocatechuate . แคติคอลเป็นคีย์แคติคอล
ในระดับกลางสาขา และเป็นแปลงเป็น CIS , CIS muconic กรดแคติคอล
1,2-dioxygenases ( รูปที่ 3 ) ซึ่งได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางใน
แบคทีเรียต่างๆ ( Patel et al . , 1976 ; harayama et al . , 1992 ; เมสัน
กับแคมเมิ่ก , 1992 ; นากา et al . , 1988 ; Strachan et al . , 1998 ) .
muconate cycloisomerase แล้วแปลง CIS , CIS muconic กรด
muconolactone ซึ่งจะสลายไปและ COA
ยาซัคซินิลทิลล่องใน  - ketoadipate ทางเดิน ( รูปที่ 3 ) .
ด้วยความเคารพระเบียบทางพันธุกรรม , particle และควบคุม
benr catr เช่นเดียวกับ benm catm และพบใน
Pseudomonas sp . และ Acinetobacter sp . ตามลำดับ ( คอล et al . ,
2541 ; เจฟฟรีย์ et al . , 1992 ; เมิกฟอล et al . 1998 ) ในการแสดงตนของ
benzoate , benr จาก Pseudomonas enrichment กระตุ้น transcription
ของ benabcd โอเปอรอนสำหรับการแปลงของเบนโซเอตกับแคติคอล
( เจฟฟรีย์ et al . , 1992 ) และ catr จาก P.putida กระตุ้น transcription
ของ catbca โอเปอรอนในการตอบสนอง CIS , CIS กรด muconic สำหรับ
เปลี่ยนแปลงอีกแคติคอลผ่าน CIS , CIS muconic acid ( เมิกฟอล
et al . , 1998 ) ใน Acinetobacter sp . สายพันธุ์ adp1 , ควบคุม benm
กระตุ้น transcription ของยีนแมว
benabcde โอเปอรอนการย่อยสลายของแคติคอลในการตอบสนองทั้ง benzoate และ CIS cismuconic
, กรด ( คอล et al . , 1998 ) catm ซึ่ง benm 75%
ที่คล้ายกันนอกจากนี้กระตุ้น transcription ของยีนแมวในการตอบสนอง
ให้ CIS , CIS กรด muconic การย่อยสลายของแคติคอล ( คอล et al . ,
1998 ) คุณสมบัติที่ผิดปกติของระบบนี้คือความสามารถของทั้งสองและ
benm catm รู้จักเอนไซม์แบบ CISmuconate CIS
และควบคุมบางส่วนของยีนที่เหมือนกัน เช่น คาต้า และ catb .
ความสามารถในการผลิต CIS , CIS muconic กรดเบนโซเอต โดยมีรายงานบาง
หมักจุลินทรีย์ มันถูกพบว่า Pseudomonas sp .
1 L b13 โตซิ ( 60 มม. )
แร่ขนาดกลางในการควบคุมเครื่องปฏิกรณ์ชีวภาพแปลง benzoate ,
ที่ถูกเพิ่มเข้ามาอย่างต่อเนื่องเพื่อความเข้มข้น 5 – 10 มม.
การเจริญเติบโตปานกลาง , CIS , CIS กรด muconic ที่มีผลผลิต 91% ( และชมิดท์
knackmuss , 1984 ) ในสายพันธุ์นี้ ไม่ muconate cycloisomerase
กิจกรรมการและ CIS , CIS muconic กรด :
มม. ถึงประมาณ 52 การสะสมเพิ่มขึ้นของ CIS , CIS muconic กรดที่ได้จากการแปลงจาก 500 biocatalytic

สังเกตในความหนาแน่นเซลล์สูง วัฒนธรรมของสายพันธุ์กลายพันธุ์ P.putida bm014
ในเซลล์รีไซเคิลเครื่องทำในโหมดแบทช์กิน ( ชอย
et al . , 1997 ) การศึกษาประสิทธิผลของ 38.7 มม. ( L / H ) และ CIS
CIS muconic กรดชนิด 95 มม. ในวัฒนธรรมซุปได้
( Choi et al . , 1997 ) ข้อจำกัดฟอสเฟต , โคบอลต์ และความเข้มข้นของออกซิเจนละลายน้ำ

) สูงกว่า 20% ความอิ่มตัวพบว่าเป็นบวก สำหรับอัตราที่เหมาะสมของการเจริญเติบโตของเซลล์และการพัฒนาผลิตภัณฑ์

เป็น CIS สูง , CIS muconic กรดชนิดมากกว่า 225 มม.
มาถึงในกระบวนการ batch กับเฟดควบคุม
stat การให้ออกซิเจน กลยุทธ์เพื่อให้ได้ความหนาแน่นเซลล์สูง
โดยการควบคุมของออกซิเจน ( บางและชอย , 1995 ) อัลตราไวโอเลตรังสีกลายพันธุ์เป็น

จุลินทรีย์ของสกุลยาไร้ muconate cycloisomerase กิจกรรม
พบความสามารถที่จะผลิตประมาณ 310 มม. CIS , CIS muconic
กรดมากกว่า 48 H ใน 30 ลิตรขวดหมัก โดยให้อาหารต่อเนื่องเล็กน้อย
ของเบนโซเอต ( มิซึโนะ et al . , 1988 ) .
เมื่อเร็ว ๆนี้เมื่อย P.putida kt2440-jd1 อธิบายซึ่ง
ได้มา จากการสุ่มโดย P.putida kt2440
กับ n-methyl-n  - nitro-N-nitrosoguanidine และการสัมผัส 3 -
fluorobenzoate . เมื่อยก็ไม่สามารถที่จะเติบโตกับ
Benzoate เป็นแหล่งคาร์บอน แต่ Co metabolized เบนโซเอท

CIS , CIS muconic กรดที่สะสมในอาหาร
89 เปอร์เซ็นต์ ( molcis CIS muconate / molbenzoate ) ในระหว่างการเจริญเติบโตในกลูโคส
( รถตู้ duuren et al . , 2011c ) ในระหว่างการเพาะปลูกใน
วัฒนธรรมอย่างต่อเนื่องที่อัตราการเจริญเติบโต 0.2 H − 1 , CIS ที่เฉพาะเจาะจง , CIS muconic กรด
อัตราการผลิตประมาณ 1.3 มม. / gdry เซลล์และเพิ่มน้ำหนัก / h
10 มม. / / ( g H ) ในระหว่างการล้างออกในอัตราเจือจาง
3 H − 1 (  max = 0.6 H − 1 ) บ่งชี้ว่า ผลผลิตของ P.putida
kt2440-jd1 สูงขึ้นมาก  สูงสุดภายใต้เงื่อนไข
งานนี้อัตราที่สูงกว่ารายงาน CIS อื่นๆ อย่างน้อย 8 ครั้ง muconic
CIS ผลิตกรดสายพันธุ์ ( รถตู้ duuren et al . , 2011c ) .
ทราน ริปโตมิก Proteomics และพบว่า catbca
โอเปอรอนใน P.putida kt2440-jd1 ไม่ชักนำในการปรากฏตัวของเบนโซเอท
5 มิลลิเมตร ลำดับของ catbca catr ภูมิภาคดีเอ็นเอพบการกลายพันธุ์จุดเดียว

ในป่าสงวนดีเอ็นเอมัดโดเมนของ catr particle ควบคุม . เห็นได้ชัดว่า การกลายพันธุ์
ใน catr ยับยั้งการแสดงออกของยีนทั้งหมดของ catbca
โอเปอรอน . เบน โอเปอรอน ซึ่งแสดงออกในสายพันธุ์และสายพันธุ์ของมัน
ผู้ปกครองในการแสดงตนของเบนโซเ . ตั้งแต่โอเปอรอนนี้
ประกอบด้วยยีน cata2 ( PP 3166 ) ซึ่งเป็น
เข้ารหัสที่สองแคติคอล 1,2-dioxygenase นอกจากนี้ CATA , ความเครียด
ยังสามารถแปลงแคติคอลให้ CIS , CIS muconic กรด ใน
ติดตามงาน , ป้อนกระบวนการชุดพัฒนาสำหรับ P.putida
kt2440-jd1 ที่นอกเหนือจาก Benzoate เป็นคู่กับ
กรดของตัวกลาง สื่อปรับ 500
เมื่อแปลงเป็น CIS , muconate CIS และดังนั้นคัป
นอกจากนี้เบนโซเอตกับระเบียบป้องกัน undesired
อ