A normalized cDNA library from sple

A normalized cDNA library from spleen of Indian catfish, Clarias batrachus, was constructed with a
redundancy factor of 2.29. A total of 2045 clones from the library were single-pass sequenced, which
generated 1937 high quality ESTs with an average read length of approximately 700 bp. Based on sequence
similarities, 65 ESTs were found to be associated with immune functions, which were mainly associated with
response to stress, response to chemical stimulus, cellular response to stimulus, response to external
stimulus, immune response and regulation of response to stimulus. The immune-relevant gene for CD141,
thrombomodulin, has been identified in Teleosts for the first time. Six EST-SSRs and three SNPs were found
associated with eight immune-relevant genes. These markers associated with important immune genes
would be useful for the identification of trait associated alleles for marker-assisted selection. The
identification of the putative immune-related genes provides a meaningful framework to understand the
Indian catfish immune system and defense mechanisms.
© 20

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไลบรารีมาตรฐาน cDNA จากม้ามของอินเดียปลาดุก ปลาดุกด้าน ถูกสร้างขึ้นด้วยการตัวสำรองของ 2.29 จำนวน 2045 โคลนจากไลบรารีถูกเรียงลำดับ รอบ เดียวซึ่งสร้างปีค.ศ. 1937 ESTs คุณภาพ โดยเฉลี่ยอ่านจำนวนประมาณ 700 bp. ตามในลำดับความคล้ายคลึง พบ 65 ESTs จะเกี่ยวข้องกับฟังก์ชันภูมิคุ้มกัน ซึ่งส่วนใหญ่ถูกเชื่อมโยงกับตอบสนองต่อความเครียด การตอบสนองต่อการกระตุ้นทางเคมี กระตุ้นเซลล์ตอบสนอง ตอบสนองภายนอกกระตุ้นเศรษฐกิจ การตอบสนองภูมิคุ้มกัน และควบคุมการตอบสนองต่อการกระตุ้นเศรษฐกิจ ยีนภูมิคุ้มกันที่เกี่ยวข้องสำหรับ CD141thrombomodulin มีการระบุใน Teleosts เป็นครั้งแรก พบ 6 EST-SSRs และ SNPs 3เกี่ยวข้องกับยีนภูมิคุ้มกันที่เกี่ยวข้อง 8 เครื่องหมายเหล่านี้เกี่ยวข้องกับยีนภูมิคุ้มกันที่สำคัญจะมีประโยชน์สำหรับการระบุของ alleles ติดที่เกี่ยวข้องสำหรับการเลือกเครื่องช่วย ที่รหัสของยีนที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกัน putative ให้กรอบมีความหมายให้เข้าใจในปลาอินเดียระบบภูมิคุ้มกันและกลไกการป้องกัน© 20

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ห้องสมุด cDNA ปกติจากม้ามปลาดุกอินเดีย Clarias batrachus ถูกสร้างขึ้นด้วย
ปัจจัยความซ้ำซ้อน 2.29 รวมของ 2045 โคลนจากห้องสมุดถูกเดียวผ่านติดใจที่
สร้าง 1937 ESTs คุณภาพสูงที่มีระยะเวลาในการอ่านเฉลี่ยประมาณ 700 bp ขึ้นอยู่กับลำดับ
ความคล้ายคลึงกัน 65 ESTs พบว่าจะเกี่ยวข้องกับการทำงานของระบบภูมิคุ้มกันซึ่งส่วนใหญ่ที่เกี่ยวข้องกับ
การตอบสนองต่อความเครียดการตอบสนองต่อการกระตุ้นทางเคมี, การตอบสนองของเซลล์เพื่อกระตุ้นการตอบสนองต่อภายนอก
กระตุ้นการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกันและกฎระเบียบของการตอบสนองต่อสิ่งเร้า ยีนภูมิคุ้มกันที่เกี่ยวข้องสำหรับ CD141,
thrombomodulin ได้รับการระบุไว้ใน teleosts เป็นครั้งแรก หก EST-SSRs สาม SNPs ถูกพบ
ที่เกี่ยวข้องกับแปดยีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกัน เครื่องหมายเหล่านี้เกี่ยวข้องกับยีนภูมิคุ้มกันที่สำคัญ
จะเป็นประโยชน์สำหรับการระบุลักษณะของอัลลีลที่เกี่ยวข้องสำหรับการเลือกเครื่องหมายช่วย
บัตรประจำตัวของยีนที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันสมมุติให้กรอบที่มีความหมายที่จะเข้าใจ
ระบบภูมิคุ้มกันของปลาดุกอินเดียและกลไกการป้องกัน.
© 20

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มาตรฐานห้องสมุด cDNA จากม้ามของอินเดีย ปลาดุก ปลาดุก batrachus ถูกสร้างด้วย
) ปัจจัย 2.29 . ทั้งหมด 2588 โคลนจากห้องสมุดผ่านเดียวนี้ซึ่ง
สร้าง 2480 คุณภาพสูงฐานข้อมูลที่มีความยาวอ่านเฉลี่ยประมาณ 700 BP . ตามความคล้ายคลึงกันของลำดับ
65 ฐานข้อมูลพบว่ามีความสัมพันธ์กับฟังก์ชันภูมิคุ้มกันซึ่งส่วนใหญ่จะเกี่ยวข้องกับ
เพื่อตอบสนองต่อความเครียด การตอบสนองต่อการกระตุ้นทางเคมี , การตอบสนองของเซลล์เพื่อกระตุ้น การตอบสนองต่อสิ่งเร้าภายนอก
, ภูมิคุ้มกัน และระเบียบของการตอบสนองต่อสิ่งเร้า ภูมิคุ้มกันที่เกี่ยวข้องยีนสำหรับ cd141
, thrombomodulin ได้ระบุไว้ใน teleosts ครั้งแรก หก EST ssrs สาม snps พบ
ที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันที่เกี่ยวข้อง 8 ยีนเหล่านี้เครื่องหมายที่เกี่ยวข้องกับยีนภูมิคุ้มกันสำคัญ
จะเป็นประโยชน์สำหรับการกำหนดลักษณะของเครื่องหมายที่เกี่ยวข้องเพื่อช่วยในการเลือก
รหัสของการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันให้กรอบความหมายเข้าใจ
อินเดียปลาดุก ระบบภูมิคุ้มกัน ระบบและกลไกป้องกัน
20 สงวนลิขสิทธิ์