Article outlineShow full outlineAbs

Article outlineShow full outline
Abstract
Keywords
Direct link to deposited data
Materials and methods
Discussion
Conflict of interest
Acknowledgments
References
Figures and tables




ADVERTISEMENT

Genomics Data
Volume 2, December 2014, Pages 135–138

Cover image
Open Access
Data in Brief
Transcriptome profiling for discovery of genes involved in shoot apical meristem and flower development
Vikash K. Singh, Mukesh Jain,
Show more
DOI: 10.1016/j.gdata.2014.06.004
Get rights and content
Under a Creative Commons license
Abstract
Flower development is one of the major developmental processes that governs seed setting in angiosperms. However, little is known about the molecular mechanisms underlying flower development in legumes. Employing RNA-seq for various stages of flower development and few vegetative tissues in chickpea, we identified differentially expressed genes in flower tissues/stages in comparison to vegetative tissues, which are related to various biological processes and molecular functions during flower development. Here, we provide details of experimental methods, RNA-seq data (available at Gene Expression Omnibus database under GSE42679) and analysis pipeline published by Singh and colleagues in the Plant Biotechnology Journal (Singh et al., 2013), along with additional analysis for discovery of genes involved in shoot apical meristem (SAM) development. Our data provide a resource for exploring the complex molecular mechanisms underlying SAM and flower development and identification of gene targets for functional and applied genomics in legumes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทความเค้าเต็ม outlineShowบทคัดย่อคำสำคัญเชื่อมโยงโดยตรงการฝากข้อมูลวัสดุและวิธีการสนทนาความขัดแย้งทางผลประโยชน์ตอบการอ้างอิงตัวเลขและตารางโฆษณา ข้อมูล Genomicsฉบับที่ 2, 2557 ธันวาคม หน้า 135-138 ภาพปกเปิดเข้าข้อมูลอย่างย่อTranscriptome สร้างโพรไฟล์สำหรับการค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องกับยิง apical meristem และพัฒนาดอกไม้Vikash คุณสิงห์ Mukesh เจน ดูเพิ่มเติมดอย: 10.1016/j.gdata.2014.06.004ได้รับสิทธิและเนื้อหาภายใต้ใบอนุญาตครีเอทีฟคอมมอนส์บทคัดย่อดอกไม้พัฒนาเป็นหนึ่งในกระบวนการพัฒนาหลักที่ควบคุมการตั้งค่าเมล็ดใน angiosperms อย่างไรก็ตาม น้อยเป็นที่รู้จักกันเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลที่ต้นแบบพัฒนาดอกไม้กิน เราระบุยีน differentially แสดงเนื้อเยื่อ/ระยะโดยเนื้อเยื่อผักเรื้อรัง ซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพและฟังก์ชันระดับโมเลกุลต่าง ๆ ในระหว่างการพัฒนาดอกไม้ ดอกไม้ใช้อาร์เอ็นเอลำดับขั้นตอนต่าง ๆ ของการพัฒนาดอกและเนื้อเยื่อผักเรื้อรังน้อยในแกงถั่วเขียว ที่นี่ เราสามารถให้รายละเอียดของวิธีการทดลอง อาร์เอ็นเอลำดับข้อมูล (มียีนนิพจน์ Omnibus ฐานข้อมูลฐานข้อมูล GSE42679) และวิเคราะห์ขั้นตอนการเผยแพร่ โดยสิงห์และเพื่อนร่วมงานในสมุดรายวันเทคโนโลยีชีวภาพพืช (สิงห์ร้อยเอ็ด al., 2013), พร้อมกับวิเคราะห์เพิ่มเติมสำหรับการค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องในการยิง apical meristem พัฒนา (SAM) ข้อมูลของเราให้ทรัพยากรในกลไกระดับโมเลกุลซับซ้อนต้นพัฒนา SAM และดอกไม้และรหัสของยีนเป้าหมายการทำงาน และใช้ genomics ในกิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บทความ outlineshow เต็มร่าง


เป็นคำหลักลิงค์โดยตรงไปที่ฝากข้อมูล

ความขัดแย้งวัสดุและวิธีการสนทนา
สนใจ


ขอบคุณอ้างอิงตัวเลขและตารางข้อมูลใน




โฆษณา


เล่ม 2 ธันวาคม 2014 , หน้า 135 - 138

ภาพปก


เปิดการเข้าถึงข้อมูลสั้นๆทราน ริปโตมโปรไฟล์สำหรับ การค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องกับเนื้อเยื่อเจริญบริเวณปลายยอด และการพัฒนา
ดอกไม้vikash เค. ซิงห์ , Mukesh Jain แสดงเพิ่มเติม

ดอย : 10.1016 / j.gdata . 2014.06.004

รับสิทธิและเนื้อหาอยู่ภายใต้สัญญาอนุญาตครีเอทีฟคอมมอนส์

ดอกไม้บทคัดย่อการพัฒนาเป็นหนึ่งในสาขาการพัฒนากระบวนการที่ควบคุมเมล็ดการตั้งค่าในพืชดอก . อย่างไรก็ตาม เป็นที่รู้จักกันเพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับกลไกระดับโมเลกุลดอกไม้ต้นแบบการพัฒนาในพืชตระกูลถั่วใช้ RNA seq ในขั้นตอนต่างๆของการพัฒนาดอกและไม่กี่เนื้อเยื่อพืชถั่วเขียว เราระบุยีนที่แสดงออกแตกต่างกันในเนื้อเยื่อดอกไม้ / ขั้นตอนในการเปรียบเทียบกับเนื้อเยื่อพืชซึ่งเกี่ยวข้องกับกระบวนการทางชีวภาพและหน้าที่ของโมเลกุลต่างๆในระหว่างการพัฒนาดอกไม้ ที่นี่ เราให้รายละเอียดของวิธีการทดลองซึ่งใช้ seq ข้อมูลการแสดงออกของยีนแบบฐานข้อมูลภายใต้ gse42679 ) และการวิเคราะห์ท่อ จัดพิมพ์โดย ซิงห์ และเพื่อนร่วมงานในพืชเทคโนโลยีชีวภาพวารสาร ( Singh et al . , 2013 ) พร้อมกับการวิเคราะห์เพิ่มเติมของการค้นพบยีนที่เกี่ยวข้องกับเนื้อเยื่อเจริญบริเวณปลายยอด ( แซม ) การพัฒนาข้อมูลที่เราให้บริการทรัพยากรสำหรับการเรียนรู้ซับซ้อนของกลไกระดับโมเลกุลและการพัฒนาต้นแบบแซมดอกไม้และการจำแนกยีนเป้าหมายสำหรับการทำงานและหน่วยพันธุกรรมประยุกต์
พืชตระกูลถั่ว