Also, locus specific RFLP of katG gene of Mycobacterium tuberculosis is used to index point mutations corresponding to various levels of resistance to the anti-tubercular drug isoniazid (Cockerilli et al., 1995).
Another version of PCR-RFLP is PCR-ribotyping, where the specific locus used for amplification is intergenic spacer region of ribosomal DNA. PCR-ribotyping has been used for the characterization of different serotypes of Salmonella (Lagatolla et al., l996), H. influenzae (Jorden and Leaves, 1997), Pseudomonas cepacia (Kostman et al., 1992) and Yersinia enterocolitica (Lobato et al., 1998). PCR targeted to intergenic spacer region of 16S-23S rDNA of Clostridium difficile was used for construction of reference library (Stubbs et al., 1999). A modification of PCR-ribotyping is ARDRA (amplified ribosomal DNA restriction analysis), in which 16S rRNA gene of rrn operon is amplified and digested with restriction endonuclease. The molecular identification and cluster analysis of thermophilic Lactobacilli has been carried out by comparison of their ARDRA patterns (Andrighetto et al., 1998). Combining several polymorphic genes and analyzing their restriction patterns simultaneously can enhance the discriminatory power of PCR-RFLP. Multiplex PCR-RFLP analysis has a discriminatory power comparable to Pulse field gel electrophoresis (PFGE), which is described in the sections to follow. Such a multiplex PCR was developed for Campylobacter jejuni using polymorphic genes gyrA, pflA and fla (Ragimberbeau et al., 1998).
ยัง โลกัสโพล RFLP เฉพาะของยีน katG ของมัยโคแบคทีเรียวัณโรคใช้ดัชนีการกลายพันธุ์ของจุดที่สอดคล้องกับระดับต่าง ๆ ของความต้านทานต่อ isoniazid tubercular ต่อต้านยาเสพติด (Cockerilli และ al., 1995)รุ่นอื่นของ PCR-RFLP เป็น PCR-ribotyping ภูมิภาคเป็นตัวเว้นวรรค intergenic ribosomal เอ็นโลกัสโพลเฉพาะที่ใช้สำหรับขยาย มีการใช้ PCR ribotyping สำหรับคุณสมบัติของ serotypes ต่าง ๆ ของซัล (Lagatolla et al., l996) H. influenzae (Jorden และใบไม้ 1997), Pseudomonas cepacia (Kostman et al., 1992) และ Yersinia enterocolitica (Lobato et al., 1998) เป้าหมายเป็นตัวเว้นวรรค intergenic แคว้น 16S 23S rDNA ของเชื้อ Clostridium difficile PCR ถูกใช้สำหรับการก่อสร้างของการอ้างอิงไลบรารี (Stubbs et al., 1999) การปรับเปลี่ยนการ PCR ribotyping เป็น ARDRA (เอาต์ ribosomal ดีเอ็นเอจำกัดวิเคราะห์), ในที่ 16S rRNA ยีนของ rrn operon ขยาย และเจ่า ด้วย endonuclease จำกัด ดำเนินการวิเคราะห์โมเลกุลของรหัสและคลัสเตอร์ของ thermophilic Lactobacilli ออก โดยเปรียบเทียบรูปแบบของพวกเขา ARDRA (Andrighetto และ al., 1998) รวมยีนหลาย polymorphic และวิเคราะห์รูปแบบข้อจำกัดของตนพร้อมกันสามารถเพิ่มพลังของ PCR-RFLP โจ่งแจ้ง Multiplex PCR-RFLP วิเคราะห์พลังงานประมงทะเลเทียบได้กับชีพจรฟิลด์เจล electrophoresis (PFGE), ซึ่งอธิบายไว้ในส่วนที่คุณต้องทำตามได้ เช่นการ multiplex PCR ได้รับการพัฒนาสำหรับ Campylobacter jejuni ใช้ polymorphic ยีน gyrA, pflA และสัมภาษณ์ของสมาคม (Ragimberbeau et al., 1998)
การแปล กรุณารอสักครู่..

นอกจากนี้ตนที่ RFLP เฉพาะของยีน katG ของเชื้อวัณโรคจะใช้ในการกลายพันธุ์จุดดัชนีที่สอดคล้องกับระดับต่างๆของความต้านทานกับ isoniazid ยาต้านวัณโรค (Cockerilli et al., 1995).
รุ่นของ PCR-RFLP ก็คือ PCR-ribotyping, ที่สถานที่เฉพาะที่ใช้สำหรับการขยายเป็นพื้นที่ spacer intergenic ดีเอ็นเอไรโบโซม PCR-ribotyping ถูกนำมาใช้สำหรับลักษณะของสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของเชื้อ Salmonella (Lagatolla et al., l996), เอช influenzae (Jorden และใบ 1997) Pseudomonas cepacia (Kostman et al., 1992) และ Yersinia enterocolitica (บาโตเอต al., 1998) PCR กำหนดเป้าหมายไปยัง intergenic ภูมิภาค spacer ของ 16S-23S rDNA ของ Clostridium difficile ถูกนำมาใช้ในการก่อสร้างห้องสมุดอ้างอิง (สตับส์ et al., 1999) การปรับเปลี่ยนของ PCR-ribotyping เป็น ARDRA (ไรโบโซมขยายข้อ จำกัด การวิเคราะห์ดีเอ็นเอ) ซึ่งยีน 16S rRNA ของ operon rrn จะขยายและย่อยด้วยข้อ จำกัด endonuclease บัตรประจำตัวของโมเลกุลและการวิเคราะห์กลุ่มของอุณหภูมิ Lactobacilli ได้รับการดำเนินการโดยการเปรียบเทียบรูปแบบของพวกเขา ARDRA (Andrighetto et al., 1998) รวมยีน polymorphic หลายรูปแบบและการวิเคราะห์ข้อ จำกัด ของพวกเขาพร้อมกันสามารถเพิ่มอำนาจการเลือกปฏิบัติของ PCR-RFLP การวิเคราะห์ Multiplex PCR-RFLP มีอำนาจเลือกปฏิบัติเปรียบได้กับชีพจรข่าวคราวสนาม (PFGE) ซึ่งอธิบายไว้ในส่วนที่จะปฏิบัติตาม ดังกล่าว multiplex PCR ได้รับการพัฒนาสำหรับ Campylobacter jejuni ใช้ยีน polymorphic Gyra, pflA และ fla (Ragimberbeau et al., 1998)
การแปล กรุณารอสักครู่..

นอกจากนี้ ความเชื่อ : katg เฉพาะของยีนของเชื้อวัณโรคที่ใช้จุดดัชนีการกลายพันธุ์ที่สอดคล้องกับระดับต่างๆของความต้านทานต่อยาต้านเกี่ยวกับวัณโรค isoniazid ( cockerilli et al . , 1995 ) .
รุ่นอื่น ribotyping ว่าเทคนิคที่ใช้เฉพาะด้านสำหรับเด็กเป็นเขต spacer ส่าของ ribosomal DNAPCR ribotyping ได้ถูกใช้เพื่อศึกษาคุณสมบัติของเชื้อ ( ที่แตกต่างกัน ( lagatolla et al . , l996 ่ ) , H . ( จอร์เดิ้นและใบ , 1997 ) , Pseudomonas cepacia ( kostman et al . , 1992 ) และ เยอซิเนีย enterocolitica ( โลบาโต et al . , 1998 ) โดยเป้าหมายของ 16s-23s rDNA spacer ส่าเขตของ Clostridium difficile ถูกใช้ในการก่อสร้างห้องสมุดอ้างอิง ( สตับส์ et al . ,1999 ) การเปลี่ยนแปลงของ PCR ribotyping เป็น ardra ( การวิเคราะห์ดีเอ็นเอเบสจำกัด Protein ) ซึ่งในเบส 16S rRNA ยีนของ rrn โอเปอรอนจะขยายและย่อยกับเอนโดนิวคลีเอสจำกัด . การกำหนดและการวิเคราะห์กลุ่มของโมเลกุล และแลคโตบาซิลไล ได้ดำเนินการโดยการเปรียบเทียบรูปแบบ ardra ( andrighetto et al . , 1998 )รวมหลายหลายยีนและการวิเคราะห์รูปแบบการตัดของพวกเขาพร้อมกันสามารถเพิ่มพลังของความว่า . การวิเคราะห์ว่ามัลติมีอำนาจจำแนกเปรียบชีพจรฟิลด์ gel electrophoresis ( PFGE ) ซึ่งจะอธิบายในหัวข้อต่อไป เช่น เทคนิค multoplex PCR ที่พัฒนาขึ้นเพื่อประกวดการใช้ยีน Gyra จำนวน ,pfla และ fla ( ragimberbeau et al . , 1998 ) .
การแปล กรุณารอสักครู่..
