Sequence alignments were conduced w

Sequence alignments were conduced with the CLUSTAL W program (43). The alignment was then optimized manually. Nucleotide divergences were estimated using the Kimura's two-parameter method (17), excluding gaps and equivocal sites with the DNADIST program implemented in the PHYLIP package, version 3.5 (8). Phylogenetic inference was performed by the neighbor-joining (NJ) method (34) with the NEIGHBOR program from the PHYLIP package. Relative support for particular clades in the NJ tree was estimated by using 1,000 replications of the bootstrap procedure (7), performed with the SEQBOOT, DNADIST, and NEIGHBOR programs from the PHYLIP package. Fusarium

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จัดลำดับถูก conduced กับโปรแกรม CLUSTAL W (43) การจัดตำแหน่งได้แล้วปรับให้เหมาะสมด้วยตนเอง Divergences นิวคลีโอไทด์ที่ถูกประเมินโดยวิธีสองพารามิเตอร์ของคิมุระ (17), ยกเว้นช่องว่างและไซต์สองแง่สองง่าม ด้วยโปรแกรม DNADIST ที่นำมาใช้ในแพคเกจ PHYLIP รุ่น 3.5 (8) สรุปผลดำเนินการ โดยเข้าร่วมกับเพื่อนบ้าน (NJ) วิธีการ (34) โปรแกรมเพื่อนบ้านจากแพคเกจ PHYLIP สนับสนุนเฉพาะ clades ในต้น NJ ญาติถูกประเมิน โดยใช้ระยะ 1,000 ของกระบวนการเริ่มต้นระบบ (7), ดำเนินการกับโปรแกรม SEQBOOT, DNADIST และเพื่อนบ้านจากแพคเกจ PHYLIP Fusarium

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การจัดแนวลำดับถูก conduced กับโปรแกรม Clustal W (43) การจัดตำแหน่งที่ถูกปรับให้เหมาะสมแล้วด้วยตนเอง ความแตกต่างเบื่อหน่ายอยู่ที่ประมาณโดยใช้วิธีการสองพารามิเตอร์ที่ของคิมูระ (17) ไม่รวมช่องว่างและเว็บไซต์ที่ยังไม่มีข้อยุติกับโปรแกรม DNADIST ดำเนินการในแพคเกจ PHYLIP รุ่น 3.5 (8) อนุมาน phylogenetic ถูกดำเนินการโดยเพื่อนบ้านเข้า (NJ) วิธีการ (34) กับโปรแกรมเพื่อนบ้านจากแพคเกจ PHYLIP การสนับสนุนเชิงสัมพัทธ์สำหรับ clades โดยเฉพาะอย่างยิ่งในต้นไม้นิวเจอร์ซีย์ได้รับการประเมินโดยใช้ 1,000 ซ้ำขั้นตอนการบูต (7) ดำเนินการกับ SEQBOOT, DNADIST และโปรแกรมเพื่อนบ้านจากแพคเกจ PHYLIP เชื้อรา Fusarium

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับสองถูกดำเนินการกับ clustal W โปรแกรม ( 43 ) ตำแหน่งก็ปรับด้วยตนเอง นิวคลีโอไทด์ divergences ประมาณโดยใช้คิมูระสองพารามิเตอร์วิธี ( 17 ) , ไม่รวมช่องว่างและมีเลศนัยเว็บไซต์ที่มีโปรแกรมที่ใช้ใน dnadist phylip แพคเกจ , รุ่น 3.5 ( 8 ) การอนุมาน ซึ่งกระทำโดยเพื่อนบ้านร่วม ( NJ ) ( 34 ) กับเพื่อนบ้านโปรแกรมจาก phylip แพคเกจ ญาติสนับสนุนเฉพาะ clades ในต้นไม้ NJ ถูกประเมินโดยใช้ 1000 ซ้ำของกระบวนการบูตสแตรป ( 7 ) , ดำเนินการกับ seqboot dnadist , เพื่อนบ้าน , โปรแกรมจาก phylip แพคเกจ ฟิวซาเรียม