Cadmium (Cd) is a nonessential meta

Cadmium (Cd) is a nonessential metallic trace element that poses potential chronic toxicity to living organisms. To date, little is known about the Cd-responsive regulatory network in root vegetable crops including radish. In this study, 31,015 unigenes representing 66,552 assembled unique transcripts were isolated from radish root under Cd stress based on de novo transcriptome assembly. In all, 1496 differentially expressed genes (DEGs) consisted of 3579 transcripts were identified from Cd-free (CK) and Cd-treated (Cd200) libraries. Gene Ontology and pathway enrichment analysis indicated that the up- and down-regulated DEGs were predominately involved in glucosinolate biosynthesis as well as cysteine and methionine-related pathways, respectively. RT-qPCR showed that the expression profiles of DEGs were in consistent with results from RNA-Seq analysis. Several candidate genes encoding phytochelatin synthase (PCS), metallothioneins (MTs), glutathione (GSH), zinc iron permease (ZIPs) and ABC transporter were responsible for Cd uptake, accumulation, translocation and detoxification in radish. The schematic model of DEGs and microRNAs-involved in Cd-responsive regulatory network was proposed. This study represents a first comprehensive transcriptome-based characterization of Cd-responsive DEGs in radish. These results could provide fundamental insight into complex Cd-responsive regulatory networks and facilitate further genetic manipulation of Cd accumulation in root vegetable crops.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แคดเมียม (Cd) จะยังไม่จำเป็นโลหะติดตามองค์ประกอบที่ก่อให้เกิดความเป็นพิษเรื้อรังเพื่อชีวิต วันที่ น้อยมีชื่อเสียงเกี่ยวกับเครือข่ายซีดีตอบสนองต่อข้อบังคับในรากพืชผักได้แก่หัวผักกาด ในการศึกษานี้ unigenes 31,015 66,552 ประกอบเฉพาะใบแสดงผลการแสดงถูกแยกต่างหากจากหัวผักกาดรากภายใต้ความเครียดซีดีตาม de novo transcriptome แอสเซมบลี ทั้งหมด ค.ศ. 1496 differentially แสดงยีน (DEGs) ประกอบด้วย 3579 ระบุซีดีฟรี (CK) และไลบรารีรับซีดี (Cd200) ใบแสดงผลการ วิเคราะห์ขอยีนภววิทยาและทางเดินที่ระบุว่า การขึ้น และลงระเบียบ DEGs ได้เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ glucosinolate เป็น cysteine และ methionine เกี่ยวข้อง มนต์ predominately ตามลำดับ RT-qPCR แสดงให้เห็นว่า โพรไฟล์ของ DEGs นิพจน์ที่อยู่ในสอดคล้องกับผลจากการวิเคราะห์ลำดับอาร์เอ็นเอ ยีนผู้สมัครหลายรหัส phytochelatin synthase (PCS), metallothioneins (MTs) กลูตาไธโอน (GSH), สังกะสีเหล็ก permease (ZIPs) และขนส่ง ABC ได้ชอบซีดูดซับ สะสม การสับเปลี่ยน และล้างพิษในหัวผักกาด มันแบบความ DEGs และ microRNAs-เกี่ยวข้องกับเครือข่ายกำกับดูแลซีตอบสนองได้นำเสนอ การศึกษานี้แสดงถึงการแรกครอบคลุม transcriptome ตามคุณสมบัติของ DEGs ซีดีตอบสนองในหัวผักกาด ผลลัพธ์เหล่านี้สามารถให้ความเข้าใจพื้นฐานในเครือข่ายกำกับดูแลซีดีตอบสนองที่ซับซ้อน และช่วยจัดการทางพันธุกรรมของซีดีสะสมในรากพืชผักต่อไป

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แคดเมียม (Cd) เป็นองค์ประกอบโลหะร่องรอยที่ไม่จำเป็นที่ poses พิษเรื้อรังที่อาจเกิดขึ้นกับสิ่งมีชีวิตอาศัยอยู่ ในวันที่ไม่ค่อยมีใครรู้เกี่ยวกับเครือข่ายการกำกับดูแล Cd ตอบสนองในรากพืชผักรวมทั้งหัวไชเท้า ในการศึกษานี้เป็นตัวแทนของ unigenes 31015 66552 ประกอบใบรับรองผลการเรียนที่ไม่ซ้ำกันที่แยกได้จากรากหัวไชเท้าภายใต้ความเครียด Cd อยู่บนพื้นฐานของการชุมนุมโนโวเดยีน ในทุก 1,496 ยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน (degs) ประกอบด้วย 3,579 ยีนที่ถูกระบุจาก Cd ฟรี (CK) และซีดีที่ได้รับ (CD200) ห้องสมุด ยีนอภิปรัชญาและการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าทางเดินชี้ให้เห็นว่าขึ้นและ degs ควบคุมลงเป็นส่วนใหญ่มีส่วนร่วมในการสังเคราะห์ glucosinolate เช่นเดียวกับ cysteine​​ และทางเดิน methionine ที่เกี่ยวข้องตามลำดับ RT-qPCR แสดงให้เห็นว่ารูปแบบการแสดงออกของ degs อยู่ในสอดคล้องกับผลจากการวิเคราะห์ RNA-Seq ยีนหลายเข้ารหัสเทส phytochelatin (PCS) metallothioneins (MTS), กลูตาไธโอน (GSH) สังกะสีเหล็ก permease (รหัสไปรษณีย์) และขนส่งเอบีซีมีความรับผิดชอบสำหรับการดูดซึมแคดเมียมสะสมโยกย้ายและการล้างพิษในหัวไชเท้า รูปแบบแผนผังของ degs และ microRNAs-มีส่วนร่วมในเครือข่ายการกำกับดูแล Cd ตอบสนองที่ถูกเสนอ การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นถึงครั้งแรกที่ครอบคลุมลักษณะยีนที่ใช้ในการ degs Cd ตอบสนองในหัวไชเท้า ผลลัพธ์เหล่านี้จะให้ความเข้าใจพื้นฐานในเครือข่ายที่ซับซ้อนของกฎระเบียบ Cd-ตอบสนองและอำนวยความสะดวกในการจัดการทางพันธุกรรมต่อไปของการสะสมแคดเมียมในรากพืชผัก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แคดเมียม ( ซีดี ) เป็นโลหะธาตุพิษที่เป็นอันตรายที่ไม่จำเป็นอาจเรื้อรังกับสิ่งมีชีวิต อาจเป็นที่รู้จักกันเพียงเล็กน้อยเกี่ยวกับซีดีอ่อนไหวควบคุมเครือข่ายในผักรากพืช ได้แก่ หัวไชเท้า ในการศึกษานี้ 31015 unigenes แทน 66552 ประกอบเฉพาะใบที่แยกได้จากรากหัวไชเท้าภายใต้ความเครียดซีดีตามอีกครั้งทราน ริปโตมประกอบ ใน ทั้งหมดหรือยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน ( degs ) มี 3579 transcripts ถูกระบุจากซีดีฟรี ซีดี ( CK ) และการปฏิบัติ ( cd200 ) ห้องสมุด อภิปรัชญาจีน และการวิเคราะห์เส้นทาง พบว่า การ ขึ้น - ลง คือ ระเบียบ degs เป็นส่วนใหญ่มีส่วนร่วมในการผลิตกลูโคซิโนเลตรวมทั้งกรดอะมิโนเมทไธโอนีน และแนวทางที่เกี่ยวข้อง ตามลำดับRT qpcr พบว่าสีหน้าโปรไฟล์ของ degs อยู่ในสอดคล้องกับผลจากการวิเคราะห์ seq RNA ผู้สมัครหลายยีนสรีรวิทยา คุณภาพ และการเข้ารหัส ( พีซี ) metallothioneins ( เอ็มทีเอ ) กลูตาไธโอน ( GSH ) สังกะสีเหล็ก permease ( ซิป ) และลำเลียง ABC รับผิดชอบการซีดีสะสมโยกย้ายและล้างพิษในหัวไชเท้าวงจรรูปแบบและมีส่วนร่วมในการ degs micrornas ซีดีควบคุมเครือข่ายฯ การศึกษานี้เป็นครั้งแรกที่ครอบคลุมตามการตอบสนองของซีดีทราน ริปโตม degs ในหัวไชเท้า ผลลัพธ์เหล่านี้สามารถให้ความเข้าใจพื้นฐานในการตอบสนองต่อกฎระเบียบที่ซับซ้อนซีดีเครือข่ายการจัดการทางพันธุกรรมต่อไป การสะสมซีดีในพืชรากพืช