s shown in Table 1, the foreign ele

s shown in Table 1, the foreign elements in GMO sample 1 were two human insertions (ACTA1 promoter and TPM3 cDNA) as well as the Simian Virus small tAg (SV40). The sequence for the entire Human ACTA1 gene was used as the reference genome to align the unmapped reads (see Section 2). Fig. 4A illustrates the detected peaks for a single wild-type sample and the three GMO samples. As shown, GMO sample 1 contains a strong peak difference when compared to the other samples for all three antibodies tested for the ACTA1 gene. This peak mapped to one of the known ACTA1 regulatory elements (light blue vertical lines) confirming the insertion of an ACTA1 promoter into GMO sample 1. For the wild-type controls and the two GMO samples not containing these insertions (i.e. GMO samples 2 and 3), only minor peaks (

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แสดงในตารางที่ 1 องค์ประกอบต่างในตัวอย่างจีเอ็มโอ 1 s ถูกสองมนุษย์แทรก (ACTA1 โปรโมเตอร์และ TPM3 cDNA) รวมทั้งป้ายเล็กไวรัสสิมิลัน (SV40) ลำดับสำหรับยีนมนุษย์ ACTA1 ทั้งหมดถูกใช้เป็นกลุ่มอ้างอิงการจัดตำแหน่งการอ่านที่ไม่ได้แม็ป (ดูส่วนที่ 2) รูปที่ 4A แสดงยอดตรวจพบสำหรับตัวอย่างป่าชนิดเดียวและตัวอย่างจีเอ็มโอที่สาม ดังที่ระบุไว้ ตัวอย่างจีเอ็มโอ 1 ประกอบด้วยความแตกต่างสูงสุดแข็งแกร่งเมื่อเทียบกับตัวอย่างสำหรับแอนติบอดีสามทั้งหมดผ่านทดสอบยีน ACTA1 ยอดนี้แมปหนึ่งรู้จัก ACTA1 กำกับดูแลองค์ประกอบ (เส้นแสงแนวตั้งสีฟ้าได้) เพื่อยืนยันการแทรกของโปรโมเตอร์ที่ ACTA1 ลงในตัวอย่างจีเอ็มโอ 1 ตัวควบคุมแบบธรรมชาติและตัวอย่างจีเอ็มโอที่สอง ไม่ประกอบด้วยแทรกเหล่านี้ (เช่นจีเอ็มโอตัวอย่าง 2 และ 3), เพียงเล็กน้อยยอด (< 50 อ่าน) ถูกตั้งข้อสังเกต ตรวจสอบเพิ่มเติมเปิดเผยว่า ยอดเขาเหล่านี้สอดคล้องกับภูมิภาคเซทจะมียีน ACTA1 (เช่นภูมิภาคเหล่านั้นของความคล้ายคลึงกันของลำดับสูงระหว่างเมาส์และมนุษย์ genomes) ซึ่งจะเขียนแทน ด้วยแถบสีเทาในรูปที่ 4ลำดับสำหรับยีน TPM3 มนุษย์ทั้งยังถูกใช้เป็นแม่แบบอ้างอิงสำหรับการแม็ปการอ่านที่ไม่ได้แม็ป ตัวอย่างจีเอ็มโอ 1 อยู่สูงสุดขนาดใหญ่ตั้งอยู่ที่ปลาย 5 ′ของยีน TPM3 ซึ่งขาดที่อื่น ๆ (รูปที่ 4B) เล็กน้อยคล้ายกับผลการการยีน ACTA1 มนุษย์ พื้นหลังยอด (< 50 อ่าน) สำหรับทั้งสามทดสอบแอนติบอดีถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับตัวอย่างอื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

s แสดงในตารางที่ 1 องค์ประกอบที่ต่างประเทศในจีเอ็มโอตัวอย่าง 1 สองแทรกมนุษย์ (โปรโมเตอร์ ACTA1 และ TPM3 cDNA) เช่นเดียวกับลิงไวรัสแท็กขนาดเล็ก (SV40) ลำดับสำหรับทั้งยีน ACTA1 มนุษย์ที่ใช้เป็นจีโนมการอ้างอิงถึงการจัด unmapped อ่าน (ดูมาตรา 2) มะเดื่อ. 4A แสดงให้เห็นถึงยอดเขาตรวจพบตัวอย่างป่าชนิดเดียวและสามตัวอย่างจีเอ็มโอ ดังแสดงจีเอ็มโอตัวอย่าง 1 มีความแตกต่างสูงสุดที่แข็งแกร่งเมื่อเทียบกับตัวอย่างอื่น ๆ สำหรับทั้งสามแอนติบอดีทดสอบยีน ACTA1 ยอดเขานี้จับคู่กับหนึ่งขององค์ประกอบการกำกับดูแลที่รู้จักกัน ACTA1 ข้อมูล (ไฟเส้นแนวตั้งสีฟ้า) ยืนยันการแทรกของโปรโมเตอร์ ACTA1 ลงตัวอย่างจีเอ็มโอ 1. สำหรับการควบคุมชนิดป่าและสองตัวอย่างจีเอ็มโอไม่ได้มีการแทรกเหล่านี้ (ตัวอย่างเช่นจีเอ็มโอที่ 2 และ 3) เพียงยอดเขาเล็ก ๆ น้อย ๆ (<50 อ่าน) ถูกตั้งข้อสังเกต การตรวจสอบเพิ่มเติมพบว่ายอดเหล่านี้สอดคล้องกับภูมิภาคที่คล้ายคลึงกันของยีน ACTA1 (เช่นพื้นที่เหล่านั้นมีความคล้ายคลึงกันระหว่างลำดับสูงเมาส์และจีโนมของมนุษย์) ซึ่งจะแสดงโดยวงดนตรีสีเทาในรูป 4.

ลำดับสำหรับทั้งยีน TPM3 มนุษย์นอกจากนี้ยังใช้เป็นแม่แบบสำหรับการทำแผนที่อ้างอิงอ่านแม็ป ตัวอย่างจีเอ็มโอ 1 ที่มียอดขนาดใหญ่ตั้งอยู่ที่ปลาย 5 'ของยีนซึ่งเป็น TPM3 ขาดสำหรับตัวอย่างอื่น ๆ ทั้งหมด (รูป. 4B) คล้ายกับผลของยีน ACTA1 มนุษย์ยอดพื้นหลังเล็ก ๆ น้อย ๆ (<50 อ่าน) สามแอนติบอดีทดสอบทั้งหมดถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับตัวอย่างอื่น ๆ ทั้งหมด