Single nucleotide polymorphisms (SN

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are
the most abundant DNA markers in plant genomes. In this
study, based on 54,465 SNPs between the genomes of two
Indica varieties, Minghui 63 (MH63) and Zhenshan 97
(ZS97) and additional 20,705 SNPs between the MH63 and
Nipponbare genomes, we identified and confirmed 1,633
well-distributed SNPs by PCR and Sanger sequencing.
From these, a set of 372 SNPs were further selected to
analyze the patterns of genetic diversity in 300 representative
rice inbred lines from 22 rice growing countries
worldwide. Using this set of SNPs, we were able to
uncover the well-known Indica–Japonica subspecific differentiation
and geographic differentiations within Indica
and Japonica. Furthermore, our SNP results revealed some
common and contrasting patterns of the haplotype diversity
along different rice chromosomes in the Indica and
Japonica accessions, which suggest different evolutionary
forces possibly acting in specific regions of the rice genome
during domestication and evolution of rice. Our results
demonstrated that this set of SNPs can be used as anchor
SNPs for large scale genotyping in rice molecular breeding
research involving Indica–Japonica and Indica–Indica
crosses.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีนิวคลีโอไทด์เดี่ยว polymorphisms (SNPs)เครื่องหมายดีเอ็นเอมากที่สุดใน genomes พืช ในที่นี้ศึกษา ตาม SNPs 54,465 ระหว่าง genomes ของสองสายพันธุ์ Indica, Minghui 63 (MH63) และ Zhenshan 97(ZS97) และ SNPs 20,705 เพิ่มเติมระหว่างการ MH63 และNipponbare genomes เราระบุ และยืนยัน 1,633SNPs แห่งกระจายตามลำดับ PCR และ Sangerจากนี้ ชุดของ 372 SNPs ได้เพิ่มเติมเลือกวิเคราะห์รูปแบบของความหลากหลายทางพันธุกรรมในตัวแทน 300ข้าว inbred บรรทัดจาก 22 ประเทศเติบโตข้าวทั่วโลก เราใช้ชุดนี้ของ SNPs ถูกต้องเปิดที่รู้จัก Indica – Japonica subspecific สร้างความแตกต่างและ differentiations ทางภูมิศาสตร์ภายใน Indicaและ Japonica นอกจากนี้ เปิดเผยผลลัพธ์ของ SNP บางรูปแบบทั่วไป และแตกต่างกันของความหลากหลายของ haplotypeตาม chromosomes ข้าวแตกต่างกันในการ Indica และJaponica accessions การแนะนำต่าง ๆ วิวัฒนาการกองทัพอาจทำหน้าที่ในภูมิภาคที่เฉพาะเจาะจงของกลุ่มข้าวระหว่าง domestication และวิวัฒนาการของข้าว ผลของเราแสดงว่า SNPs ชุดนี้สามารถใช้เป็นจุดยึดSNPs สำหรับ genotyping ขนาดใหญ่ในข้าวพันธุ์โมเลกุลงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับ Indica – Japonica และ Indica – Indicaข้าม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) จะมี
เครื่องหมายดีเอ็นเอที่มีมากที่สุดในจีโนมของพืช ในการนี้
การศึกษาบนพื้นฐานของ 54465 SNPs ระหว่างจีโนมของทั้งสอง
สายพันธุ์ Indica, Minghui 63 (MH63) และ Zhenshan 97
(ZS97) และเพิ่มเติม 20,705 SNPs ระหว่าง MH63 และ
จีโนมของ Nipponbare เราระบุและได้รับการยืนยัน 1,633
SNPs ดีจัดจำหน่ายโดยวิธี PCR และ ลำดับแซงเจอร์.
จากนี้ซึ่งเป็นชุด 372 SNPs ได้รับการคัดเลือกต่อไปเพื่อ
วิเคราะห์รูปแบบของความหลากหลายทางพันธุกรรมใน 300 ตัวแทน
ข้าวสายพันธุ์จาก 22 ประเทศปลูกข้าว
ทั่วโลก ใช้ชุดของ SNPs นี้เราก็สามารถที่จะ
ค้นพบที่รู้จักกันดี Indica-Japonica subspecific ความแตกต่าง
และความแตกต่างทางภูมิศาสตร์ภายใน Indica
และ Japonica นอกจากนี้ผล SNP ของเราแสดงให้เห็นบาง
รูปแบบที่พบบ่อยและตัดกันของความหลากหลาย haplotype
พร้อมโครโมโซมข้าวที่แตกต่างกันใน Indica และ
สาย Japonica ซึ่งชี้ให้เห็นวิวัฒนาการที่แตกต่างกัน
อาจจะเป็นกองกำลังที่ทำหน้าที่ในภูมิภาคที่เฉพาะเจาะจงของจีโนมข้าว
ในช่วง domestication และวิวัฒนาการของข้าว ผลของเรา
แสดงให้เห็นว่าชุดของ SNPs นี้สามารถใช้เป็นที่ยึดเหนี่ยว
SNPs สำหรับ genotyping ขนาดใหญ่ในการปรับปรุงพันธุ์ข้าวโมเลกุล
ที่เกี่ยวข้องกับการวิจัย Indica-Japonica และ Indica-Indica
ไม้กางเขน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์พอลิเมอร์ฟิซึม ( snps )
เครื่องหมายดีเอ็นเอชุกชุมที่สุดในจีโนมพืช ในการศึกษา
ตาม 54465 snps ระหว่างจีโนมสอง
สายพันธุ์ indica , Minghui 63 ( mh63 ) และ zhenshan 97
( zs97 ) และเพิ่มเติม 20705 snps ระหว่าง mh63 และ
nipponbare จีโนมที่เราระบุ และยืนยัน 1633
กระจายดี snps โดยวิธี PCR และลำดับแซงเจอร์ .
จากเหล่านี้ชุดของพวก snps ได้เลือก
วิเคราะห์รูปแบบของความหลากหลายทางพันธุกรรมในสายพันธุ์แท้สาย 300 ตัวแทน
ข้าวจากประเทศที่ปลูกข้าว 22
ทั่วโลก การใช้ชุดของ snps นี้ , เราสามารถที่จะค้นพบที่รู้จักกันดีจากญี่ปุ่น

) ซึ่งเป็นชนิดย่อยแยกย่อย และ differentiations ภูมิศาสตร์ภายใน 3
และ ญี่ปุ่น . นอกจากนี้ การเปิดเผยบาง
SNP ของเราทั่วไป และด้านรูปแบบของโครโมโซม พบความหลากหลาย
พร้อมข้าวที่แตกต่างกันใน 3
จาปและสายพันธุ์ที่แตกต่างกันจะแสดงพลังให้วิวัฒนาการ
เฉพาะในภูมิภาคของจีโนมข้าว
ในระหว่าง domestication และวิวัฒนาการของข้าว ผลของเราแสดงให้เห็นว่าชุดของ snps

นี้สามารถใช้เป็นสมอsnps สำหรับขนาดใหญ่ในข้าวพันธุ์ส่งเสริมการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับโมเลกุล
3 – 3 – 3
จาป และคู่ผสม