Denaturing gradient gel electrophor

Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis and
phospholipid fatty acid (PLFA) analysis are popular methods to
investigate the changes in microbial communities that result from
different fertilization regimes. For instance, the abundance and
composition of native soil bacterial communities under different
fertilization practices using DGGE were examined by Shen et al.
(2010), while PLFA analysis was employed by Zhang et al. (2012).
They found opposite patterns of microbial community structure
after chemical fertilizer and organic manure inputs. However, their
results may introduce an incomplete estimate of phylogenetic
diversity, particularly in environmental samples containing
diverse microorganisms, because only the predominant and
specific microbial types can be identified by DGGE and PLFA,
respectively (Zelles, 1997; Crecchio et al., 2007). Conversely,
pyrosequencing can provide a large number of sequences and
even reveal small changes in microbial populations for obtaining
massive sequences in parallel (Poulsen et al., 2013).
Previous studies have demonstrated that high mineral nitrogen
inputs and low crop recoveries may lead to the reduction of
bacterial diversity and increase fungal biomass (Geisseler and Kate,
2014). However, the overuse of manure-based compost in China is
also popular, especially during the transition period from
conventional to organic farming systems. Farmers consider
consecutive and heavy application of compost to always be
conducive to improved soil fertility and crop yield (Ju et al., 2007),
but the changes resulting from its administration are not yet fully
understood. We hypothesized that high input level of manurebased
compost over a long period of time might change soil
microbial activity, abundance and community more significantly
than using the same amount of inorganic nitrogen. For this reason,
a three-year
field experiment was conducted to accurately: (1)
analyze the shifts in soil physicochemical and biological properties
under heavy application of organic compost and inorganic
nitrogen; (2) compare the degrees of influence on soil microbial
activity, abundance, and community by different fertilization
regimes; and (3) examine the relationship between soil physico-
chemical characteristics and microbial community composition.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Denaturing เจลไล่ระดับวิเคราะห์ electrophoresis (DGGE) และการวิเคราะห์กรดไขมัน (PLFA) ฟอสโฟลิพิดเป็นวิธียอดนิยมตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในชุมชนจุลินทรีย์ที่ได้จากระบอบปัจจุบันแตกต่างกัน อุดมสมบูรณ์เช่น และองค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียดินดั้งเดิมภายใต้แตกต่างกันปฏิบัติการปฏิสนธิใช้ DGGE ถูกตรวจสอบโดย Shen et al(2010), ในขณะที่ PLFA วิเคราะห์ถูกว่าจ้างโดย Zhang et al. (2012)พวกเขาพบตรงกันข้ามกับรูปแบบของโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์หลังจากที่ปุ๋ยเคมีและอินทรีย์มูลอินพุต อย่างไรก็ตาม พวกเขาผลลัพธ์อาจแนะนำการประเมินที่ไม่สมบูรณ์ของ phylogeneticความหลากหลาย โดยเฉพาะอย่างยิ่งในตัวอย่างสิ่งแวดล้อมที่ประกอบด้วยจุลินทรีย์มีความหลากหลาย เพราะเท่ากัน และสามารถระบุชนิดจุลินทรีย์ที่ระบุ โดย DGGE และ PLFAตามลำดับ (Zelles, 1997 Crecchio et al., 2007) ในทางกลับกันpyrosequencing จัดลำดับเป็นจำนวนมาก และแม้แต่เปิดเผยเปลี่ยนแปลงประชากรจุลินทรีย์ขนาดเล็กสำหรับการได้รับลำดับใหญ่ขนาน (Poulsen et al., 2013)การศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงว่าไนโตรเจนแร่สูงอินพุตและ recoveries พืชต่ำอาจนำไปสู่การลดลงของความหลากหลายของแบคทีเรียและเพิ่มชีวมวลเชื้อรา (Geisseler และเคท2014) อย่างไร overuse ของปุ๋ยจากมูลในประเทศจีนเป็นนอกจากนี้ยังนิยม โดยเฉพาะอย่างยิ่งช่วงเปลี่ยนจากธรรมดากับระบบเกษตรอินทรีย์ เกษตรกรพิจารณาต่อเนื่อง และหนักใช้ปุ๋ยให้เสมอเอื้อต่อการปรับปรุงดินพืชและความอุดมสมบูรณ์ผลผลิต (จู et al., 2007),แต่การเปลี่ยนแปลงที่เกิดจากการดูแลไม่ ได้เต็มเข้าใจ เราตั้งสมมติฐานว่าระดับสัญญาณขาเข้าที่สูงของ manurebasedปุ๋ยเป็นระยะเวลานานอาจเปลี่ยนดินกิจกรรมจุลินทรีย์ อุดมสมบูรณ์ และชุมชนมากขึ้นใช้จำนวนอนินทรีย์ไนโตรเจนเหมือนกัน ด้วยเหตุนี้สามปีฟิลด์ทดลองถูกดำเนินการอย่างถูกต้อง: (1)วิเคราะห์กะในคุณสมบัติ physicochemical และชีวภาพของดินภายใต้โปรแกรมประยุกต์หนัก ของปุ๋ยอินทรีย์ และอนินทรีย์ไนโตรเจน (2) เปรียบเทียบองศามีอิทธิพลในดินจุลินทรีย์กิจกรรม อุดมสมบูรณ์ และชุมชน โดยในปัจจุบันแตกต่างกันระบอบ และ (3) ตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างดินและฟิสิกส์ -ลักษณะทางเคมีและองค์ประกอบชุมชนจุลินทรีย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

denaturing ข่าวคราวการไล่ระดับสี (DGGE)
การวิเคราะห์และฟอสโฟกรดไขมัน(PLFA)
การวิเคราะห์เป็นวิธีที่นิยมในการตรวจสอบการเปลี่ยนแปลงในกลุ่มจุลินทรีย์ที่เกิดจากระบอบการปกครองที่แตกต่างกันการปฏิสนธิ
ยกตัวอย่างเช่นความอุดมสมบูรณ์และองค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียในดินที่แตกต่างกันภายใต้พื้นเมืองปฏิบัติที่ปฏิสนธิใช้DGGE ถูกตรวจสอบโดย Shen et al. (2010) ในขณะที่การวิเคราะห์ PLFA ถูกจ้างโดย Zhang et al, (2012). พวกเขาพบว่ารูปแบบตรงข้ามของโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์หลังจากปุ๋ยเคมีและปัจจัยการผลิตปุ๋ยอินทรีย์ แต่พวกเขาผลอาจแนะนำการประเมินที่ไม่สมบูรณ์ของสายวิวัฒนาการความหลากหลายโดยเฉพาะอย่างยิ่งในตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อมที่มีจุลินทรีย์ที่มีความหลากหลายเพราะเพียงเด่นและชนิดของจุลินทรีย์ที่เฉพาะเจาะจงสามารถระบุได้โดยDGGE และ PLFA, ตามลำดับ (Zelles 1997. Crecchio et al, 2007) . ตรงกันข้ามpyrosequencing สามารถให้บริการเป็นจำนวนมากของลำดับและแม้กระทั่งเผยให้เห็นการเปลี่ยนแปลงเล็กๆ ในประชากรจุลินทรีย์สำหรับการได้รับลำดับขนาดใหญ่ในแบบคู่ขนาน(โพลเซ่น et al., 2013). การศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่าไนโตรเจนแร่สูงปัจจัยการผลิตและการกลับคืนพืชต่ำอาจนำไปสู่​​ การลดลงของความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรียและเชื้อราเพิ่มชีวมวล (Geisseler และเคท, 2014) อย่างไรก็ตามการใช้มากเกินไปของปุ๋ยหมักปุ๋ยที่ใช้ในประเทศจีนยังเป็นที่นิยมโดยเฉพาะอย่างยิ่งในช่วงระยะเวลาการเปลี่ยนแปลงจากเดิมไปยังระบบการทำเกษตรอินทรีย์ เกษตรกรพิจารณาประยุกต์ใช้ติดต่อกันและหนักของปุ๋ยหมักที่จะเสมอในการที่จะอุดมสมบูรณ์ของดินที่ดีขึ้นและผลผลิตพืช(จู et al., 2007) แต่การเปลี่ยนแปลงที่เกิดจากการบริหารงานของตนยังไม่ได้อย่างเต็มที่เข้าใจ เราตั้งสมมติฐานว่าระดับสูงของการป้อนข้อมูล manurebased ปุ๋ยหมักในระยะเวลานานของเวลาอาจมีการเปลี่ยนแปลงดินกิจกรรมของจุลินทรีย์ความอุดมสมบูรณ์และชุมชนมากขึ้นอย่างมีนัยสำคัญกว่าการใช้จำนวนเงินเดียวกันของไนโตรเจนนินทรีย์ ด้วยเหตุนี้สามปีทดลองได้ดำเนินการอย่างถูกต้อง(1) วิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงในทางเคมีกายภาพของดินและคุณสมบัติทางชีวภาพภายใต้การประยุกต์ใช้งานหนักของปุ๋ยหมักอินทรีย์และอนินทรีไนโตรเจน; (2) เปรียบเทียบระดับอิทธิพลของจุลินทรีย์ดินในกิจกรรมความอุดมสมบูรณ์และชุมชนที่แตกต่างกันโดยการปฏิสนธิระบอบ; และ (3) ศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างดิน physico- ลักษณะทางเคมีและองค์ประกอบชุมชนของจุลินทรีย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ี่ลาด gel electrophoresis ( การทดลอง ) วิเคราะห์กรดไขมันฟอสโฟลิพิดและ
( plfa ) การวิเคราะห์เป็นวิธีที่นิยมเพื่อ
ศึกษาการเปลี่ยนแปลงในชุมชนจุลินทรีย์ที่เกิดจากการปฏิสนธิ
ระบอบการปกครองที่แตกต่างกัน ตัวอย่าง ความอุดมสมบูรณ์และองค์ประกอบของดินแบคทีเรีย
พื้นเมืองชุมชนภายใต้การปฏิบัติการต่าง ๆที่ใช้ทดสอบโดยการทดลอง
Shen et al .
( 2010 )ในขณะที่การวิเคราะห์ plfa ถูกว่าจ้างโดย Zhang et al . ( 2012 ) .
พวกเขาพบตรงข้ามกับรูปแบบโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์
หลังจากปุ๋ยเคมีและปุ๋ยคอกปัจจัยการผลิต อย่างไรก็ตาม ผลของพวกเขา
อาจแนะนำการประเมินที่ไม่สมบูรณ์ของความหลากหลายโดยเฉพาะอย่างยิ่งในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม

หลากหลายประกอบด้วยจุลินทรีย์ เพราะเพียงโดด และ
เฉพาะจุลินทรีย์ชนิดที่สามารถระบุได้โดยการทดลอง และ plfa
ตามลำดับ ( zelles , 1997 ; crecchio et al . , 2007 ) โดย
ไพโรซีเควนซิงสามารถให้ตัวเลขขนาดใหญ่ของลำดับและ
แม้แต่เปิดเผยการเปลี่ยนแปลงขนาดเล็กในประชากรของจุลินทรีย์เพื่อขอรับ
ขนาดใหญ่ลำดับแบบขนาน ( โพลเซ่น et al . , 2013 ) .
การศึกษาก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่า
ไนโตรเจนแร่สูงปัจจัยการผลิตและผลผลิตขั้นต่ำอาจนำไปสู่การลดลงของความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรียและเชื้อรา
เพิ่มมวลชีวภาพ ( geisseler และเคท
2014 ) อย่างไรก็ตาม การใช้ปุ๋ยคอก ปุ๋ยหมัก ใช้ในประเทศจีนเป็น
ยังเป็นที่นิยมโดยเฉพาะในช่วงเปลี่ยนผ่านจากระบบเกษตรอินทรีย์
ธรรมดา . เกษตรกรพิจารณา
ติดต่อกันและโปรแกรมหนักของปุ๋ยหมักเป็น
เสมอเอื้อต่อการปรับปรุงความอุดมสมบูรณ์ของดิน และผลผลิต ( จู et al . , 2007 ) ,
แต่การเปลี่ยนแปลงที่เกิดจากการบริหารไม่ได้เต็มที่
เข้าใจ เราตั้งสมมุติฐานว่า สูงระดับ manurebased
ใส่ปุ๋ยหมักในช่วงระยะเวลาที่ยาวนานของเวลาอาจเปลี่ยนกิจกรรมของจุลินทรีย์ดิน

อีกอย่าง อุดมสมบูรณ์ และชุมชนมากกว่าการใช้จำนวนเงินเดียวกันของไนโตรเจนอนินทรีย์ ด้วยเหตุนี้