A Single Nucleotide Polymorphism (SNP, pronounced snip; plural snips) is a DNA sequence variation occurring commonly within a population (e.g. 1%) in which a single nucleotide — A, T, C or G — in the genome (or other shared sequence) differs between members of a biological species or paired chromosomes. For example, two sequenced DNA fragments from different individuals, AAGCCTA to AAGCTTA, contain a difference in a single nucleotide. In this case we say that there are two alleles. Almost all common SNPs have only two alleles. The genomic distribution of SNPs is not homogenous; SNPs occur in non-coding regions more frequently than in coding regions or, in general, where natural selection is acting and 'fixing' the allele (eliminating other variants) of the SNP that constitutes the most favorable genetic adaptation.[1] Other factors, like genetic recombination and mutation rate, can also determine SNP density.[2]
SNP density can be predicted by the presence of microsatellites: AT microsatellites in particular are potent predictors of SNP density, with long (AT)(n) repeat tracts tending to be found in regions of significantly reduced SNP density and low GC content.[3]
เดี่ยวเบส Polymorphism (SNP, บุคคลที่ไม่สำคัญเด่นชัด; Snips พหูพจน์) เป็นรูปแบบลำดับดีเอ็นเอที่เกิดขึ้นโดยทั่วไปภายในประชากร (เช่น 1%) ซึ่งเบื่อหน่ายเดียว -, T, C หรือ G - ในจีโนม (หรือลำดับที่ใช้ร่วมกันอื่น ๆ ) ความแตกต่างระหว่างสมาชิกของสปีชีส์ชีวภาพหรือโครโมโซมคู่ ตัวอย่างเช่นสองดีเอ็นเอติดใจจากบุคคลที่แตกต่างกัน, AAGCCTA เพื่อ AAGCTTA, มีความแตกต่างในเดี่ยวเบื่อหน่าย ในกรณีนี้เราบอกว่ามีสองอัลลีล เกือบ SNPs ทั่วไปมีเพียงสองอัลลีล มีการกระจายของจีโนมของ SNPs ไม่ได้เป็นเนื้อเดียวกัน; SNPs เกิดขึ้นในภูมิภาคที่ไม่ได้เข้ารหัสบ่อยกว่าในภูมิภาคการเข้ารหัสหรือโดยทั่วไปที่คัดเลือกโดยธรรมชาติจะทำหน้าที่และ 'แก้ไข' อัลลีล (กำจัดสายพันธุ์อื่น ๆ ) ของ SNP ที่ถือว่าการปรับตัวทางพันธุกรรมที่ดีที่สุด. [1] ปัจจัยอื่น ๆ . เช่นเดียวกับการรวมตัวกันทางพันธุกรรมและอัตราการกลายพันธุ์นอกจากนี้ยังสามารถตรวจสอบความหนาแน่นของ SNP [2] ความหนาแน่น SNP สามารถทำนายได้จากการปรากฏตัวของไมโคร: AT ไมโครโดยเฉพาะมีการพยากรณ์ที่มีศักยภาพของความหนาแน่นของ SNP, มีความยาว (AT) (n) สถานที่ซ้ำพุ่ง ที่จะพบในภูมิภาคของความหนาแน่นของ SNP ลดลงอย่างมากและเนื้อหา GC ต่ำ. [3]
การแปล กรุณารอสักครู่..
