Recent advances in DNA sequencing t

Recent advances in DNA sequencing technologies have allowed scientists to probe increasingly complex biological systems, including the diversity of bacteria in the environment. However, despite a multitude of recent studies incorporating these methods, many questions regarding how environmental samples should be collected and stored still persist. Here, we assess the impact of different soil storage conditions on microbial community composition using Illumina-based 16S rRNA V4 amplicon sequencing. Both storage time and temperature affected bacterial community composition and structure. Frozen samples maintained the highest alpha diversity and differed least in beta diversity, suggesting the utility of cold storage for maintaining consistent communities. Samples stored for intermediate times (three and seven days) had both the highest alpha diversity and the largest differences in overall beta diversity, showing the degree of community change after sample collection. These divergences notwithstanding, differences in neither storage time nor storage temperature substantially altered overall communities relative to more than 500 previously examined soil samples. These results systematically support previous studies and stress the importance of methodological consistency for accurate characterization and comparison of soil microbiological assemblages

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความก้าวหน้าล่าสุดในเทคโนโลยีลำดับดีเอ็นเอได้รับอนุญาตให้นักวิทยาศาสตร์หยั่งระบบชีวภาพซับซ้อนมากขึ้น รวมถึงความหลากหลายของแบคทีเรียในสิ่งแวดล้อม อย่างไรก็ตาม แม้ มีหลากหลายการศึกษาล่าสุดเว็บวิธีการเหล่านี้ หลายคำถามควรรวบรวม และเก็บตัวอย่างสิ่งแวดล้อมอย่างไรเกี่ยวข้องยังคงอยู่ ที่นี่ เราประเมินผลกระทบของสภาพการจัดเก็บดินแตกต่างกันในองค์ประกอบชุมชนจุลินทรีย์ใช้ตาม Illumina 16S rRNA ลำดับ amplicon V4 อุณหภูมิและเวลาที่เก็บผลกระทบโครงสร้างและองค์ประกอบชุมชนเชื้อแบคทีเรีย ตัวอย่างน้ำแข็งเก็บความหลากหลายอักษรสูง และแตกต่างอย่างน้อยในความหลากหลายเบต้า แนะนำโปรแกรมอรรถประโยชน์ของห้องเย็นรักษาชุมชนที่สอดคล้องกัน ตัวอย่างเก็บไว้สำหรับเวลากลาง (วันที่สาม และเจ็ด) มีความหลากหลายสูงสุดอัลฟาและเบต้ารวมหลากหลาย แสดงระดับของชุมชนต่างที่ใหญ่ที่สุดเปลี่ยนหลังจากเก็บตัวอย่าง Divergences เหล่านี้เพียงใด ความแตกต่างไม่มีเวลาเก็บหรืออุณหภูมิในการเก็บมากเปลี่ยนแปลงชุมชนโดยรวมเมื่อเทียบกับตัวอย่างดินที่กล่าวถึงก่อนหน้านี้กว่า 500 ผลลัพธ์เหล่านี้ระบบสนับสนุนการศึกษาก่อนหน้านี้ และย้ำความสำคัญของความสอดคล้อง methodological สำหรับจำแนกถูกต้องและเปรียบเทียบ assemblages ทางจุลชีววิทยาของดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความก้าวหน้าล่​​าสุดในเทคโนโลยีลำดับดีเอ็นเอได้รับอนุญาตให้นักวิทยาศาสตร์สามารถตรวจสอบระบบชีวภาพที่ซับซ้อนมากขึ้นรวมทั้งความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรียในสภาพแวดล้อม อย่างไรก็ตามแม้จะมีความหลากหลายของการศึกษาล่าสุดที่ผสมผสานวิธีการเหล่านี้คำถามมากมายเกี่ยวกับวิธีการตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อมควรจะเก็บและเก็บไว้ยังคงมีอยู่ ที่นี่เราประเมินผลกระทบของสภาพการเก็บรักษาที่แตกต่างกันของดินกับองค์ประกอบชุมชนจุลินทรีย์โดยใช้ Illumina ตาม 16S rRNA V4 amplicon ลำดับ เวลาการเก็บรักษาทั้งสองได้รับผลกระทบและอุณหภูมิองค์ประกอบชุมชนแบคทีเรียและโครงสร้าง ตัวอย่างแช่แข็งรักษาความหลากหลายทางอัลฟาสูงสุดและแตกต่างไปอย่างน้อยก็ในความหลากหลายเบต้าแนะนำยูทิลิตี้ในการเก็บรักษาความเย็นในการรักษาชุมชนที่สอดคล้องกัน ตัวอย่างที่เก็บไว้สำหรับครั้งกลาง (สามและเจ็ดวัน) มีทั้งความหลากหลายของอัลฟาสูงสุดและความแตกต่างที่ใหญ่ที่สุดในหลากหลายรุ่นเบต้าโดยรวมแสดงให้เห็นถึงระดับของการเปลี่ยนแปลงชุมชนหลังจากการเก็บตัวอย่าง ความแตกต่างเหล่านี้แม้จะมีความแตกต่างในการจัดเก็บเวลามิได้อุณหภูมิการเก็บรักษาการเปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญของชุมชนโดยรวมเมื่อเทียบกับกว่า 500 ก่อนหน้านี้การตรวจสอบตัวอย่างดิน ผลลัพธ์เหล่านี้เป็นระบบสนับสนุนการศึกษาก่อนหน้านี้และเน้นความสำคัญของความมั่นคงวิธีการสำหรับตัวละครที่ถูกต้องและการเปรียบเทียบของดิน assemblages จุลชีววิทยา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความก้าวหน้าล่าสุดในเทคโนโลยีการจัดลำดับดีเอ็นเอได้รับอนุญาตให้นักวิทยาศาสตร์เพื่อตรวจสอบระบบชีวภาพที่ซับซ้อนมากขึ้น , รวมทั้งความหลากหลายของแบคทีเรียในสิ่งแวดล้อม อย่างไรก็ตาม แม้จะมีความหลากหลายของการศึกษาล่าสุดที่ผสมผสานวิธีการเหล่านี้ คำถามมากมายเกี่ยวกับวิธีการตัวอย่างสิ่งแวดล้อม ควรเก็บรวบรวมและเก็บไว้ยังคงอยู่ ที่นี่เราประเมินผลกระทบของดินที่แตกต่างกันในองค์ประกอบชุมชนจุลินทรีย์ที่ใช้จัดเก็บภาพและลำดับเบส 16S rRNA Illumina v4 ตาม ทั้งกระเป๋า เวลาและอุณหภูมิที่มีผลต่อองค์ประกอบและโครงสร้างชุมชนแบคทีเรีย แช่แข็งตัวอย่างรักษาความหลากหลายสูงสุดและมีความหลากหลายน้อย อัลฟ่า เบต้าแนะนำโปรแกรมอรรถประโยชน์ของห้องเย็นเพื่อรักษาชุมชนที่สอดคล้องกัน ตัวอย่างที่เก็บไว้กลางครั้ง ( 3 วัน ) มีทั้งความหลากหลายและความแตกต่างที่ใหญ่ที่สุด อัลฟ่า เบต้า ในความหลากหลายโดยรวม , แสดงระดับการเปลี่ยนแปลงของชุมชนหลังจากตัวอย่างคอลเลกชัน เหล่านี้ความแตกต่างถึงกระนั้นความแตกต่างในทั้งเวลาและอุณหภูมิอย่างมากการเปลี่ยนแปลงข้อมูลชุมชนสัมพันธ์มากกว่า 500 ก่อนหน้านี้ตรวจสอบตัวอย่างดินโดยรวม ผลลัพธ์เหล่านี้มีระบบสนับสนุนการศึกษาก่อนหน้านี้และความเครียดความสำคัญของความสอดคล้องในการถูกต้อง และการเปรียบเทียบของดินทะเลของทะเล
จุลชีววิทยา