Infectious bursal disease is a high

Infectious bursal disease is a highly contagious disease of young chickens caused by Infectious bursal disease virus (IBDV). Genome segment A encodes the capsid protein (VP2), while segment B encodes the RNA-dependent RNA polymerase (VP1). In the present study, we trace the molecular epidemiology of IBDV in Brazil by analyzing 29 isolates collected in the major regions of poultry production. To genetically characterize the isolates, phylogenetic and population dynamic analyses were conducted using 68 VP1 (2634 nt) and 102 VP2 (1356 nt) coding sequences from IBDV isolates from different regions of the world. Furthermore, the evolution of IBDV was analyzed by characterizing the selective forces that operated during the diversification of viral isolates. We show that IBDV isolates were introduced into Brazil mainly from the Netherlands and the USA. These introductions were associated with all Brazilian poultry production regions analyzed in this work. In addition, we show that the evolution of IBDV has been shaped by a combination of very low recombination rates and relatively high rates of nucleotide substitution (2.988×10(-4) for VP1 and 3.2937×10(-4) for VP2), which themselves are a function of purifying selection operating on VP1 and VP2. Furthermore, our extended Bayesian skyline plot suggests that the increase in the effective population size of isolates of IBDV is consistent with its epidemiological history, with a large increase during the emergence of acute outbreaks of IBD in the 1980s.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อักเสบเป็นโรคติดต่ออย่างของไก่สาวที่เกิดจากไวรัสอักเสบ (IBDV) ส่วนกลุ่ม A จแมปโปรตีน capsid (VP2), ในขณะที่เซ็กเมนต์บีจแมปขึ้นอยู่กับอาร์เอ็นเออาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส (VP1) ในการศึกษาปัจจุบัน เราติดตามระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ IBDV ในบราซิล โดยการวิเคราะห์แยก 29 ในภูมิภาคสำคัญของการผลิตสัตว์ปีก การแปลงพันธุกรรมลักษณะแยก phylogenetic และประชากรวิเคราะห์แบบไดนามิกได้ดำเนินการใช้ 68 VP1 (2634 nt) และ 102 VP2 (1356 nt) รหัสลำดับจาก IBDV ที่แยกได้จากภูมิภาคต่าง ๆ ของโลก นอกจากนี้ มีวิเคราะห์วิวัฒนาการของ IBDV ลเห็นกองงานที่ดำเนินการในวิสาหกิจของไวรัสที่แยกได้ เราแสดงว่า IBDV ที่แยกได้ถูกนำเข้าสู่ประเทศบราซิลส่วนใหญ่จากเนเธอร์แลนด์และสหรัฐอเมริกา บทนำของเหล่านี้ถูกเชื่อมโยงกับภูมิภาคผลิตสัตว์ปีกบราซิลทั้งหมดวิเคราะห์ในงานนี้ นอกจากนี้ เราแสดงว่า วิวัฒนาการของ IBDV รูปทรง โดยรวมราคา recombination ที่ต่ำมากและราคาค่อนข้างสูงของแทนนิวคลีโอไทด์ (2.988×10(-4) สำหรับ VP1) และ 3.2937×10(-4) สำหรับ VP2 ซึ่งตัวเองเป็นไปเลือกทำงานบน VP1 และ VP2 บริสุทธิ์ นอกจากนี้ เราขยายทฤษฎีสกายไลน์แปลงแนะนำว่า การเพิ่มขึ้นของขนาดประชากรมีประสิทธิภาพการแยกของ IBDV สอดคล้องกับประวัติความ มีเพิ่มขึ้นมากในระหว่างการเกิดขึ้นของการระบาดเฉียบพลันของ IBD ในทศวรรษ 1980

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โรคติดเชื้อ Bursal เป็นโรคติดต่อสูงของไก่หนุ่มเกิดจากเชื้อไวรัสโรคติดเชื้อ Bursal (IBDV) ส่วนถอดรหัสจีโนมโปรตีน capsid นี้ (VP2) ในขณะที่ส่วน B เข้ารหัส RNA polymerase ชนิดขึ้นอยู่กับอาร์เอ็นเอ (VP1) ในการศึกษาปัจจุบันเราติดตามระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของ IBDV ในบราซิลโดยการวิเคราะห์ 29 สายพันธุ์ที่เก็บรวบรวมในภูมิภาคท​​ี่สำคัญของการผลิตสัตว์ปีก หากต้องการลักษณะทางพันธุกรรมเชื้อวิเคราะห์สายวิวัฒนาการและจำนวนประชากรแบบไดนามิกได้รับการดำเนินการโดยใช้ 68 VP1 (2634 เอ็นที) และ 102 VP2 (เอ็นที 1356) การเข้ารหัสลำดับจาก IBDV แยกจากภูมิภาคต่างๆของโลก นอกจากนี้วิวัฒนาการของ IBDV ถูกวิเคราะห์โดยพัฒนาการกองกำลังเลือกที่ดำเนินการในช่วงการกระจายของเชื้อไวรัส เราแสดงให้เห็นว่าไอโซเลท IBDV ถูกนำเข้ามาในประเทศบราซิลส่วนใหญ่มาจากประเทศเนเธอร์แลนด์และสหรัฐอเมริกา แนะนำเหล่านี้มีความสัมพันธ์กับทุกภูมิภาคการผลิตสัตว์ปีกบราซิลวิเคราะห์ในงานนี้ นอกจากนี้เราแสดงให้เห็นว่าวิวัฒนาการของ IBDV ได้รับรูปโดยการรวมกันของอัตราการรวมตัวกันอีกที่ต่ำมากและอัตราที่ค่อนข้างสูงของการทดแทนเบื่อหน่าย (2.988 × 10 (-4) สำหรับ VP1 และ 3.2937 × 10 (-4) สำหรับ VP2) ซึ่งตัวเองเป็นฟังก์ชั่นของการเลือกบริสุทธิ์การดำเนินงานใน VP1 และ VP2 นอกจากนี้พล็อตเส้นขอบฟ้าของเราขยายเบย์แสดงให้เห็นว่าการเพิ่มขึ้นของจำนวนประชากรที่มีประสิทธิภาพของสายพันธุ์ของ IBDV สอดคล้องกับประวัติศาสตร์ทางระบาดวิทยาของมันที่มีเพิ่มขึ้นมากในช่วงการเกิดขึ้นของการระบาดของโรคเฉียบพลันของ IBD ในปี 1980

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โรค bursal ติดเชื้อเป็นสูงติดต่อโรคของไก่หนุ่มที่เกิดจากการติดเชื้อไวรัสโรค bursal ( ibdv ) ส่วนพันธุกรรมเป็นโปรตีนแคปซิดของ Intel ( vp2 ) ในขณะที่กลุ่ม B encodes RNA อาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส ( ขึ้นอยู่กับ vp1 ) ในการศึกษา เราติดตามอณูระบาดวิทยาของ ibdv ในบราซิล โดยการวิเคราะห์ 29 ไอโซในภูมิภาคหลักของการผลิตสัตว์ปีกเพื่อทางพันธุกรรมลักษณะสายพันธุ์ต่างๆ และประชากร การวิเคราะห์แบบไดนามิกโดยใช้จำนวน 68 vp1 ( 2634 NT ) และ 102 vp2 ( 1273 NT ) รหัสลำดับจาก ibdv ไอโซเลตจากภูมิภาคต่างๆของโลก นอกจากนี้ วิวัฒนาการของ ibdv โดยใช้ลักษณะการบังคับที่ใช้ในความหลากหลายของไวรัสเชื้อเราพบว่าไอโซเลท ibdv แนะนำในบราซิลส่วนใหญ่มาจาก เนเธอร์แลนด์ และสหรัฐอเมริกา การแนะนำเหล่านี้ถูกเชื่อมโยงกับภูมิภาคบราซิลสัตว์ปีกการผลิตที่ใช้ในงานนี้ นอกจากนี้ เราพบว่า วิวัฒนาการของ ibdv ได้รับรูปโดยการรวมกันของอัตราการต่ำมากและราคาค่อนข้างสูงของการแทนที่นิวคลีโอไทด์ ( 2.988 × 10 ( - 4 ) สำหรับ vp1 และ 32287 × 10 ( - 4 ) สำหรับ vp2 ) ซึ่งตัวเองเป็นฟังก์ชันของบริสุทธิ์และการผ่าตัด vp1 vp2 . นอกจากนี้ ระบบของเราขยายเส้นขอบฟ้าพล็อตแนะนำว่าเพิ่มประสิทธิภาพขนาดประชากร พบว่า ibdv สอดคล้องกับประวัติศาสตร์ทางระบาดวิทยา , ด้วยการเพิ่มขนาดใหญ่ในช่วงการระบาดรุนแรงของ IBD ในทศวรรษ 1980