MicroRNAs (miRNAs) are short, endog

MicroRNAs (miRNAs) are short, endogenous and non-protein coding RNAs that are 18–26 nucleotides (nt) in length. The main function of the miRNAs is to negatively control the protein coding sequences at post-transcriptional level. By nature, majority of the miRNAs are evolutionarily conserved. This conserved nature provides the logic to predict the new miRNAs orthologus in a number of plant species. In plants, miRNAs are involved in almost all biological processes from growth and development to biotic and abiotic stresses with metabolism and cell signaling. In the current research, various computational tools were used for the profiling and characterization of new conserved miRNAs and their targets in chilli (Capsicum annuum L.). Consequently, a total of 88 miRNAs (belonging to 81 miRNA families) were discovered from the mining of 118,572 express sequence tags (ESTs). In this study, two miRNA genes were also found as pre-miRNA clusters (can-mir8019 and can-mir8036). In addition, nine miRNAs are randomly selected and experimentally validated through RT-PCR. Furthermore, a total of 409 protein targets were also predicted for these newly profiled miRNAs. These predicted protein targets were classified as: transcription factor, stress related, disease related, growth and development, hypothetical protein, transporters, signaling pathways, metabolism and structural protein. All of these newly identified miRNAs were reported in chilli for the first time. These results will serve as reference data to improve the regulation, management, and modification of this economically important plant at the molecular level. This will also help us to improve the chilli plant for production and biotic and abiotic stress tolerance in the near future.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

MicroRNAs (miRNAs) คือสั้น ภายนอก และไม่ใช่โปรตีนรหัส RNAs ที่ 18 – 26 นิวคลีโอไทด์ (nt) ในความยาว หน้าที่หลักของ miRNAs จะควบคุมโปรตีนรหัสลำดับที่ระดับ post-transcriptional ลบ โดยธรรมชาติ ส่วนใหญ่ของ miRNAs จะอนุรักษ์ evolutionarily ธรรมชาติอนุรักษ์นี้มีตรรกะการทำนาย orthologus miRNAs ใหม่ในจำนวนของชนิดพืช ในพืช miRNAs มีส่วนร่วมในเกือบทุกกระบวนการทางชีวภาพจากการเจริญเติบโตและพัฒนาการกำเนิดสิ่งมีชีวิต และ abiotic เครียดกับการเผาผลาญอาหารและการส่งสัญญาณของเซลล์ ในการวิจัยในปัจจุบัน เครื่องมือคำนวณต่าง ๆ ใช้ในการรวบรวมสถานะและสมบัติของ miRNAs ภัตใหม่และเป้าหมายของตนในพริก (พริก annuum L.) ดังนั้น ทั้งหมด 88 miRNAs (เป็นของครอบครัวเที่ยว 81) ถูกค้นพบจากการทำเหมืองแร่ของแท็กด่วนลำดับ 118,572 (ESTs) ในการศึกษานี้ เที่ยวสองยีนยังพบเป็นกลุ่มเที่ยวก่อน (สามารถ mir8019 และ mir8036 สามารถ) นอกจากนี้ miRNAs เก้าถูกสุ่มเลือก และทดลองตรวจสอบผ่าน RT-PCR นอกจากนี้ รวม 409 โปรตีนเป้าหมายยังคาดการณ์เหล่านี้ใหม่ประวัติ miRNAs เหล่านี้ทำนายโปรตีนเป้าหมายถูกจัดประเภทเป็น: ถอดปัจจัย ที่เกี่ยวข้องกับความเครียด โรค เจริญเติบโต และพัฒนา โปรตีนสมมุติ ขน ส่ง การส่งสัญญาณทางเดิน เผาผลาญ และโปรตีนโครงสร้าง ทั้งหมดของ miRNAs ระบุใหม่เหล่านี้มีรายงานในพริกเป็นครั้งแรก ผลลัพธ์เหล่านี้จะใช้เป็นข้อมูลอ้างอิงในการปรับปรุงกฎระเบียบ การจัดการ และการปรับเปลี่ยนนี้พืชสำคัญทางเศรษฐกิจในระดับโมเลกุล นี้ยังจะช่วยให้เราปรับปรุงพริกพืชสำหรับการผลิตและความเครียดไบโอติก และ abiotic เผื่อในอนาคต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

microRNAs (miRNAs) สั้นภายนอกและไม่ใช่โปรตีนเข้ารหัส RNAs ที่ 18-26 นิวคลีโอ (NT) ในระยะเวลา ฟังก์ชั่นหลักของ miRNAs คือการควบคุมในเชิงลบโปรตีนเข้ารหัสลำดับที่ระดับการโพสต์การถอดรหัส โดยธรรมชาติส่วนใหญ่ของ miRNAs ที่มีการอนุรักษ์วิวัฒนาการ นี้ธรรมชาติอนุรักษ์ให้ตรรกะที่จะคาดการณ์ miRNAs ใหม่ orthologus ในจำนวนของสายพันธุ์พืช ในพืช miRNAs มีส่วนร่วมในเกือบทุกกระบวนการทางชีวภาพจากการเติบโตและพัฒนาเพื่อสิ่งมีชีวิตและความเครียด abiotic กับการเผาผลาญอาหารและการส่งสัญญาณมือถือ ในการวิจัยในปัจจุบันเครื่องมือการคำนวณต่าง ๆ ที่ใช้ในการทำโปรไฟล์และลักษณะของป่าสงวน miRNAs ใหม่และเป้าหมายของพวกเขาในพริก (Capsicum annuum L. ) ดังนั้นทั้งหมด 88 miRNAs (ที่อยู่ 81 ครอบครัว miRNA) ถูกค้นพบจากการทำเหมืองแร่ของ 118,572 แท็กลำดับด่วน (โคลน) ในการศึกษานี้สองยีน miRNA ยังพบก่อน miRNA กลุ่ม (CAN-mir8019 และ CAN-mir8036) นอกจากนี้เก้า miRNAs แบบสุ่มเลือกและตรวจสอบการทดลองผ่าน RT-PCR นอกจากนี้ทั้งหมด 409 เป้าหมายโปรตีนยังถูกคาดการณ์ไว้สำหรับ miRNAs ประวัติใหม่เหล่านี้ เหล่านี้เป้าหมายที่คาดการณ์โปรตีนถูกจัดให้เป็น: ถอดความปัจจัยความเครียดที่เกี่ยวข้องกับการเกิดโรคที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการพัฒนาโปรตีนสมมุติพาหนะ, เส้นทางการส่งสัญญาณการเผาผลาญอาหารและโปรตีนที่มีโครงสร้าง ทั้งหมดของ miRNAs ระบุใหม่เหล่านี้ได้รับรายงานในพริกเป็นครั้งแรก ผลลัพธ์เหล่านี้จะทำหน้าที่เป็นข้อมูลอ้างอิงในการปรับปรุงการควบคุมการจัดการและการปรับเปลี่ยนของพืชเศรษฐกิจที่สำคัญนี้ในระดับโมเลกุล นอกจากนี้ยังจะช่วยให้เราในการปรับปรุงโรงงานพริกสำหรับการผลิตและสิ่งมีชีวิตและความทนทานต่อความเครียด abiotic ในอนาคตอันใกล้