In prior work, we surveyed over 300

In prior work, we surveyed over 300 structures for the presence of leucines with Cα atom within 7 Å of a vinyl Cα atom and Cβ atom within 6 Å of the same vinyl Cα atom. These criteria identified L79 in GlbN and L75 in CtrHb as candidates for histidine replacement and heme modification. Many other leucines were found. Examples include L106 in nitrophorin 2 (1PEE), L211 in chlorite dismutase (2VXH), L37 in ascorbate peroxidase (1APX), and L71 in cytochrome b 5 (3NER), chosen to highlight proteins that have architectures different from that of globins. Many isoleucines, filtered by the same distance criteria, also occupy positions where a histidine may react. For in vitro applications, screening of pH conditions and permissive exogenous ligands that seat the heme properly can be systematically explored. Thus, it is reasonable to expect that many natural heme proteins can be modified to undergo the reaction, or artificial proteins can be designed to present a histidine with appropriate geometry to the heme.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการทำงานก่อนหน้านี้ เราสำรวจโครงสร้าง 300 สำหรับสถานะของ leucines กับ Cα อะตอมภายใน 7 Åของอะตอม a ไวนิล Cα Cβ อะตอมภายใน 6 Åของอะตอม Cα ไวนิลเหมือนกัน เหล่านี้เงื่อนไข identified L79 L75 ใน CtrHb และ GlbN เป็นคน modification แทนและ heme histidine พบ leucines อื่น ๆ ตัวอย่างเช่น L106 ใน nitrophorin 2 (1PEE), L211 ใน chlorite dismutase (2VXH), L37 ใน ascorbate peroxidase (1APX), และ L71 ใน cytochrome b 5 (3NER), เลือกที่จะเน้นโปรตีนที่มีสถาปัตยกรรมของ globins ใน isoleucines, filtered โดยใช้เงื่อนไขระยะทางเดียว ยังครองตำแหน่งที่อาจมีต่อ histidine เป็น สำหรับใช้งานเครื่อง ตรวจสภาพ pH และ ligands บ่อย permissive ที่ที่นั่ง heme ถูกต้องสามารถระบบสำรวจ ดังนั้น จึงเหมาะสมคาดว่า โปรตีนธรรมชาติ heme หลายสามารถ modified รับปฏิกิริยา หรือโปรตีน artificial สามารถออกแบบการนำเสนอ histidine เป็นเรขาคณิตที่เหมาะสมกับ heme

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการทำงานก่อนที่เราสำรวจกว่า 300 โครงสร้างสำหรับการปรากฏตัวของ leucines กับอะตอมCαภายใน 7 ของไวนิลCαอะตอมและอะตอมCβภายใน 6 ของไวนิลเดียวกันอะตอมCα เกณฑ์เหล่านี้ระบุสายเอ็ด L79 ใน GlbN และ L75 ใน CtrHb เป็นผู้สมัครเพื่อทดแทนฮิสติดีนและฮีมไอออนบวก Modi ไฟ leucines อื่น ๆ อีกมากมายที่พบ ตัวอย่าง ได้แก่ L106 ใน nitrophorin 2 (1PEE) L211 ใน chlorite dismutase (2VXH) L37 ใน ascorbate peroxidase (1APX) และ L71 ใน cytochrome ข 5 (3NER) เลือกที่จะเน้นโปรตีนที่มีสถาปัตยกรรมที่แตกต่างจากที่ globins isoleucines หลายสาย ltered ตามเกณฑ์ระยะเดียวกันยังครองตำแหน่งที่ฮิสติดีนอาจทำปฏิกิริยา สำหรับการใช้งานในหลอดทดลอง, การคัดกรองจากสภาพความเป็นกรดด่างและแกนด์ภายนอกที่อนุญาตที่นั่ง heme อย่างถูกต้องสามารถสำรวจระบบ ดังนั้นจึงมีเหตุผลที่จะคาดหวังว่าโปรตีนฮีมธรรมชาติหลายสามารถ Modi เอ็ดสายที่จะได้รับการตอบสนองหรือ Arti สายโปรตีนทางการได้รับการออกแบบที่จะนำเสนอฮิสติดีนที่มีความเหมาะสมกับรูปทรงเรขาคณิตของ heme

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในก่อนทำงาน เราสำรวจมากกว่า 300 โครงสร้างสำหรับการปรากฏตัวของ leucines กับ C αอะตอมภายใน 7 กริพเพนของไวนิลαอะตอม C และ C บีตาอะตอมภายใน 6 กริพเพนของเดียวกันαไวนิล C อะตอม โดยมีหลักเกณฑ์และ identi จึงเอ็ด l79 ใน glbn l75 ใน ctrhb ในฐานะผู้สมัครแทนฮีมีนและ Modi จึงไอออนบวก leucines อื่นๆที่พบ ตัวอย่าง ได้แก่ l106 ใน nitrophorin 2 ( 1pee )l211 ในคลอ Dismutase ( 2vxh ) l37 ascorbate peroxidase ( ใน 1apx ) และ l71 ในไซโตโครม บี 5 ( 3ner ) เลือกที่จะเน้นโปรตีนที่มีสถาปัตยกรรมที่แตกต่างจากที่ของ globins . หลาย isoleucines ltered , ถ่ายทอดตามเกณฑ์ระยะทางเดียวกันยังครอบครองตำแหน่งที่ีนอาจตอบสนอง สำหรับใช้ในหลอดทดลอง ,ตรวจสภาพภายนอก และลิแกนด์แบบที่นั่งฮีมอย่างถูกต้องสามารถรับสำรวจ ดังนั้นจึงมีเหตุผลที่จะคาดหวังว่าโปรตีนฮีมธรรมชาติหลายชนิดสามารถโมดิจึงเอ็ดได้รับ ปฏิกิริยา หรือ กิ่โปรตีนจึงสามารถออกแบบให้เหมาะสมกับปัจจุบัน เมื่อเรขาคณิตให้นี่ . . .