Abstract
Objectives: Streptococcus pneumoniae, pneumococcus, is an important
human pathogen that causes both serious invasive infections, such
as septicaemia, meningitis and pneumonia, as well as mild upper respiratory
infections. It also belongs to the normal nasopharyngeal microbial
flora. The purpose of this study was to compare bacteriological
phenotypic methods with genetechnological methods in the identification
of pneumococci, especially among suspect pneumococcal isolates
lacking one or more typical characteristics. In addition, we evaluated
the usefulness of an STGG medium for the transport and storage of
nasopharyngeal specimens and nasopharyngeal bacterial isolates.
Methods. α-hemolytic streptococcal isolates identified as pneumococcus
and isolates suspected to be pneumococci were used in the
comparisons of identification methods. S. pneumoniae, Haemophilus
influenzae and Moraxella catarrhalis were used to test the survival
of these bacteria in the STGG medium. Several phenotypic (optochin
sensitivity, bile solubility, capsular quellung reaction) and genetechnological
(a PCR based on virulence genes ply, psaA and lytA; a realtime
ply PCR combined with melting curve analysis; AccuProbe and
ARDRA) methods were used. A bacterial culture was used to detect
bacteria in the STGG medium.
Results. A typical S. pneumoniae isolate is an optochin-sensitive,
capsulated or unencapsulated, bile-soluble α-hemolytic streptococcus.
An optochin sensitivity test is a basic method for identifying pneumococcus,
even from nasopharyngeal specimens. Genetechnological
methods based on several pneumococcal virulence genes provide new
possibilities for identifying S. pneumoniae, but their use may lead to
misidentification of some α-hemolytic streptococci as pneumococcus.
In the present study, a real-time ply PCR confirmed by melting curve
analysis of amplification products could exclude false positive ply PCR
results. The STGG medium was confirmed to be a suitable medium
for deep-freeze storage and transport of nasopharyngeal specimens and
isolates of S. pneumoniae, H. influenzae and M. catarrhalis.
บทคัดย่อวัตถุประสงค์ : Streptococcus pneumoniae ชี้ตัวเป็นสำคัญ ,เชื้อโรคที่ทำให้เกิดการติดเชื้อทั้งมนุษย์ที่ร้ายแรง เช่นเป็นภาวะเลือดเป็นพิษ เยื่อหุ้มสมองอักเสบ และปอดบวม หายใจส่วนบนเป็นไม่รุนแรงเชื้อ มันก็เป็นของธรรมดาลําจุลินทรีย์ฟลอร่า การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อเปรียบเทียบแบคทีเรียวิธีการที่ใกล้เคียงกับวิธี genetechnological ในตัวการรักษาในโรงพยาบาล โดยเฉพาะในหมู่เด็กๆ สงสัยเลทขาดไปหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งลักษณะทั่วไป นอกจากนี้ เราประเมินประโยชน์ของการ stgg ขนาดกลางสำหรับการขนส่งและจัดเก็บตัวอย่างลําลําแบคทีเรียและเชื้อวิธีการ แอลฟา streptococcal hemolytic แยกระบุชี้ตัวและจำนวนที่สงสัยว่าจะถูกใช้ใน ),การเปรียบเทียบวิธีการระบุ S . pneumoniae โฮโมฟิลัส ,่ moraxella catarrhalis และถูกใช้เพื่อทดสอบการอยู่รอดของแบคทีเรียเหล่านี้ใน stgg ปานกลาง ฟีโนไทป์ ( optochin หลายความไวของน้ำดี การละลายปฏิกิริยา quellung ) และ genetechnological แคลเซียม ทองแดง เหล็ก( ซึ่งขึ้นอยู่กับความรุนแรงและยีนชั้น , psaa lyta ; เรียลไทม์เกลียวดีเอ็นเอรวมกับจุดหลอมเหลวการวิเคราะห์และ accuprobe โค้งardra ) วิธีใช้ เป็นแบคทีเรียที่ใช้ตรวจจับแบคทีเรียใน stgg ปานกลางผลลัพธ์ S . pneumoniae โดยทั่วไปแยกเป็น optochin อ่อนไหวunencapsulated capsulated หรือละลายน้ำดีแอลฟา hemolytic Streptococcus .การ optochin การทดสอบความไวเป็นวิธีพื้นฐานสำหรับการระบุชี้ตัว ,แม้จากลําตัวอย่าง genetechnologicalโดยวิธีป้องกันหลายโรคยีนให้ใหม่ความเป็นไปได้สำหรับการระบุ S . pneumoniae , แต่การใช้ของพวกเขาอาจนำไปสู่misidentification ของแอลฟาเป็นเชื้อ hemolytic ชี้ตัว .ในการศึกษาครั้งนี้ เป็นเพียงแบบ PCR ยืนยันโดยละลายโค้งการวิเคราะห์ของผลิตภัณฑ์ ( อาจไม่รวมบวกเท็จเกลียวดีเอ็นเอผลลัพธ์ การ stgg กลางได้รับการยืนยันที่จะเป็นสื่อที่เหมาะสมสำหรับกระเป๋าตรึงลึกและขนส่งลําตัวอย่างและเชื้อ S . pneumoniae , H . ่ . catarrhalis .
การแปล กรุณารอสักครู่..
