These data could be interpreted to
mean that one ancestral gene gave rise to four paralogs after 2R, but
one gene has been lost after the second duplication.
As discussed above, SS1, SS2 and SS5 probably originated during
2R. However, it is quite difficult to differentiate clearly which paralog
pair (SS1/SS2 or SS1/SS5) was created by the first round of duplication
(1R), because the two rounds of duplications happened more than
500 Mya over a short period of time (Dehal and Boore 2005; Simone
and Axel 2005). Although the precise timing of 2R is still unclear
(Venkatesh et al., 2007; Kuraku et al., 2009), it has been demonstrated
that 2R happened after the divergence of tunicates and lancelets
(Putnam et al., 2008) but before the radiation of jawed vertebrates
(Venkatesh et al., 2007; Ravi et al., 2009). Given that two SS2-related
sequences have been preserved in cartilaginous fish, we speculate
that SS2 might have originated in 1R and then, SS2 was duplicated in
2R to give rise to two SS2-related sequences in cartilaginous fish. It is
likely that the cartilaginous fish SS-like counterpart has been
subsequently lost in bony fish.
Based on the above data, we propose an updated hypothesis for
the evolution of SS genes in vertebrates. As shown in Fig. 6A, a single
ancestral SS gene might have existed before the 1R. After two
successive rounds of genome duplication, four SS genes could exist,
but only three genes (SS1, SS2 and SS5) have been retained in bony
fish. The generation of SS4 (by SS1) in teleost fish occurred during 3R.
Local duplications produced SS3 (by SS1) in most teleost fish and SS6
(by SS2) in zebrafish. During these processes, many SS genes might
have been lost after duplications due to functional redundancy of the
duplicates. A brief comparison of our hypothesis on the evolutionary
origins of the vertebrate SS gene with that of a previous study
(Tostivint et al., 2008) is shown in Fig. 6, and there are several
differences between these two hypotheses.
ข้อมูลเหล่านี้อาจจะตีความ
หมายความว่ายีนของบรรพบุรุษให้สูงขึ้นถึงสี่ paralogs หลังจาก 2R แต่
ยีนได้รับหายไปหลังจากการทำสำเนาที่สอง.
ตามที่กล่าวไว้ข้างต้น SS1, SS2 และ SS5 อาจจะเกิดขึ้นในช่วง
2R แต่ก็ค่อนข้างยากที่จะแยกความแตกต่างได้อย่างชัดเจนซึ่ง paralog
คู่ (SS1 / SS2 หรือ SS1 / SS5) ถูกสร้างขึ้นโดยรอบแรกของการทำสำเนา
(1R) เพราะทั้งสองรอบของการซ้ำซ้อนกันที่เกิดขึ้นมากกว่า
500 มในช่วงระยะเวลาสั้น ๆ ของเวลา (Dehal และ Boore 2005 Simone
และแอ็กเซิล 2005) แม้ว่าเวลาที่แม่นยำของ 2R ยังไม่ชัดเจน
(Venkatesh et al, 2007;.. Kuraku et al, 2009) จะได้รับการแสดงให้เห็น
ว่า 2R เกิดขึ้นหลังจากที่ความแตกต่างของเพรียงหัวหอมและ lancelets
แต่ก่อน (พัท et al, 2008). รังสีของกรามกระดูกสันหลัง
(Venkatesh et al, 2007;. ราวี et al, 2009). ระบุว่าสอง SS2 ที่เกี่ยวข้องกับ
ลำดับได้รับการเก็บรักษาไว้ในกระดูกอ่อนปลาเราคาดการณ์
ว่า SS2 อาจจะเกิดขึ้นใน 1R แล้ว SS2 ถูกทำซ้ำใน
2R ที่จะก่อให้เกิดสองลำดับ SS2 ที่เกี่ยวข้องกับกระดูกอ่อนปลา มันเป็น
โอกาสที่กระดูกอ่อนปลาคู่เอสเอสเหมือนได้รับ
หายไปในกระดูกปลา.
บนพื้นฐานของข้อมูลดังกล่าวข้างต้นเราเสนอสมมติฐานปรับปรุงสำหรับ
วิวัฒนาการของยีนเอสเอสในสัตว์มีกระดูกสันหลัง ดังแสดงในรูป 6A เดียว
ยีน SS บรรพบุรุษอาจมีอยู่ก่อนที่จะ 1R หลังจากที่ทั้งสอง
รอบต่อเนื่องของการทำสำเนาจีโนมสี่ยีนเอสเอสจะมีอยู่
แต่เพียงสามยีน (SS1, SS2 และ SS5) ได้รับการเก็บรักษาไว้ในกระดูก
ปลา รุ่นของ SS4 (โดย SS1) ในปลา teleost เกิดขึ้นในช่วง 3R.
เลียนท้องถิ่นผลิต SS3 (โดย SS1) ในปลา teleost มากที่สุดและ SS6
(โดย SS2) ใน zebrafish ในระหว่างกระบวนการเหล่านี้ยีนเอสเอสหลายคนอาจจะ
ได้รับหายไปหลังจากที่ซ้ำซ้อนกันเนื่องจากความผิดพลาดของการทำงานของ
รายการที่ซ้ำกัน เปรียบเทียบสั้นสมมติฐานของเราเกี่ยวกับวิวัฒนาการ
ต้นกำเนิดของยีนเลี้ยงลูกด้วยนมเอสเอสกับที่ของการศึกษาก่อนหน้า
(Tostivint et al., 2008) แสดงในรูป 6 และมีหลาย
ความแตกต่างระหว่างทั้งสองสมมติฐาน
การแปล กรุณารอสักครู่..

ข้อมูลเหล่านี้อาจจะตีความหมายความว่าหนึ่งในบรรพบุรุษยีนให้สูงขึ้นถึงสี่ paralogs หลังจาก 2R , แต่ยีนได้สูญหายไปหลังจากที่การทำซ้ำครั้งที่สองตามที่กล่าวไว้ข้างต้น ss1 ss2 ss5 อาจเกิดขึ้นในระหว่าง , และยกสอง อย่างไรก็ตาม มันค่อนข้างยากที่จะแยกความแตกต่างอย่างชัดเจน ซึ่ง paralogคู่ ( ss1 / ss2 หรือ ss1 / ss5 ) ถูกสร้างขึ้นโดยรอบแรกของการทำซ้ำ( คลิป ) เพราะสองรอบของการเกิดมากกว่า500 Mya ช่วงเวลาสั้น ๆของเวลา ( และ dehal บูรี่ 2005 ; ซิโมเน่และ Axel 2005 ) แม้ว่าเวลาที่แม่นยำของ 2R ยังไม่มีความชัดเจน( Venkatesh et al . , 2007 ; kuraku et al . , 2009 ) , มันได้ถูกแสดงที่ 2R เกิดขึ้นหลังจากความแตกต่างของ lancelets ทูนิเขทและ( พัท et al . , 2008 ) แต่ก่อนรังสีของจาเว็ด มีกระดูกสันหลัง( Venkatesh et al . , 2007 ; ราวี et al . , 2009 ) ระบุว่าสอง ss2 ที่เกี่ยวข้องลำดับได้ถูกเก็บรักษาไว้ในปลากระดูกอ่อน เราคาดการณ์ที่ ss2 อาจมีถิ่นกําเนิดในคลิปแล้ว ss2 ถูกคัดลอกใน2R จะก่อให้เกิด ss2 ลำดับสองที่เกี่ยวข้องในปลากระดูกอ่อน . มันคือมีแนวโน้มว่า พรางชมพู กะเทยประจัญบาน SS ชอบคู่ได้ต่อมาหายไปในกระดูกปลาจากข้อมูลข้างต้น เราเสนอให้มีการปรับปรุงสมมติฐานวิวัฒนาการของยีน SS ในกระดูกสันหลัง ดังแสดงในรูปที่ 6 , เดี่ยวบรรพบุรุษของ SS ยีนอาจมีอยู่ก่อน 1R หลังสองรอบต่อเนื่องของจีโนมการทำซ้ำ , สี่ยีน SS อาจมีอยู่แต่แค่ 3 ยีน ( ss1 ss2 , และ ss5 ) ได้ถูกเก็บไว้ในกระดูกปลา รุ่นของ ss4 ( โดย ss1 ) ใน teleost ปลาที่เกิดขึ้นยก 3 .การผลิตในประเทศ SS3 ( ss1 ) ในส่วน teleost ปลาและ ss6( โดย ss2 ) ในปลาม้าลาย . ในระหว่างกระบวนการเหล่านี้ยีนอาจมาก SSหายไปหลังจากการเนื่องจากความซ้ำซ้อนการทำงานของซ้ำกัน สรุปการเปรียบเทียบของสมมติฐานของเราในการวิวัฒนาการต้นกำเนิดของยีน SS สัตว์มีกระดูกสันหลังกับการศึกษาก่อนหน้า( tostivint et al . , 2008 ) ที่แสดงในรูปที่ 6 และมีหลายความแตกต่างระหว่างทั้งสองสมมติฐาน
การแปล กรุณารอสักครู่..
