2.1. In silico analysis of the huma

2.1. In silico analysis of the human ABCB10 gene promoter
In order to identify the basic transcriptional regulatory mechanisms
of the ABCB10 gene, we performed a bioinformatic search of the genomic
sequence immediately preceding the start of the protein coding region
for potential promoter elements and regulatory sites. Within the
potential ABCB10 promoter, we were unable to identify any canonical
TATA box sequences. Since it is well documented that most of the
human TATA-less promoters are associated with CpG islands [18,19],
we analysed the 5′-flanking region of ABCB10 using CpG Island Searcher
software, identifying a classical CpG island (at−845/+906 bp), within
the expected location of the ABCB10 core promoter with GC content
above 68%. Analysis of the resources of the Database of Transcriptional
Start Sites (DBTSS) showed that there is no single major TSS (Transcriptional
Start Site), with TSSs identified by large-scale sequencing experiments
dispersed between nucleotides −306 and −53 relative to the
ATG translation initiation codon (Fig. 1). The most prominent concentration
of transcriptional start sites, suggesting the location of core regulatory
sequences, is located within a 100 bp stretch of genomic
sequence between nucleotides −320 and −220.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.1 การในวิเคราะห์ silico โปรโมเตอร์ยีน ABCB10 มนุษย์การระบุกลไกการกำกับดูแลพื้นฐาน transcriptionalของยีน ABCB10 เราทำการค้นหาผลเชิงวิวัฒนาการของ genomic ที่ลำดับก่อนจุดเริ่มต้นของโปรตีนรหัสภูมิภาคสำหรับองค์ประกอบเป็นโปรโมเตอร์และไซต์บังคับ ภายในเป็นโปรโมเตอร์ ABCB10 เราไม่สามารถระบุมาตรฐานได้เดินกล่องลำดับนั้น เนื่องจากดี ที่สุดของเอกสารคนเดินน้อยก่อจะเกี่ยวข้องกับเกาะประเภทวัสดุสิ้นเปลือง [18,19],เรา analysed 5′ flanking ภูมิภาคของ ABCB10 ใช้ผู้ค้นหาเกาะประเภทวัสดุสิ้นเปลืองซอฟต์แวร์ ระบุเกาะประเภทวัสดุสิ้นเปลืองคลาสสิก (at−845 / +906 bp), ภายในตำแหน่งที่คาดไว้ของโปรโมเตอร์หลัก ABCB10 กับ GC เนื้อหาเหนือ 68% วิเคราะห์ทรัพยากรของการฐานข้อมูลของ Transcriptionalเริ่มต้นเว็บไซต์ (DBTSS) พบว่า มีไม่ TSS หลักเดียว (Transcriptionalเริ่มไซต์), กับ TSSs ที่ระบุการทดลองขนาดใหญ่ลำดับกระจายระหว่างนิวคลีโอไทด์ −306 และ −53 กับการATG แปลเริ่มต้นรหัสพันธุกรรม (Fig. 1) ความเข้มข้นโดดเด่นมากที่สุดของเว็บไซต์เริ่มต้น transcriptional แนะนำสถานที่หลักที่กำกับดูแลลำดับ ตั้งอยู่ภายในยืด bp 100 ของ genomicลำดับนิวคลีโอไทด์ −320 และ −220

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.1 ในการวิเคราะห์ silico ของ ABCB10 โปรโมเตอร์ของยีนของมนุษย์
เพื่อที่จะระบุกลไกการกำกับดูแลขั้นพื้นฐานการถอดรหัส
ยีน ABCB10 เราดำเนินการค้นหาทางชีววิทยาของจีโนม
ลำดับทันทีก่อนเริ่มต้นของภูมิภาคโปรตีนเข้ารหัส
สำหรับองค์ประกอบโปรโมเตอร์ที่มีศักยภาพและการกำกับดูแลเว็บไซต์ ภายใน
ก่อการ ABCB10 ที่อาจเกิดขึ้นเราไม่สามารถที่จะระบุใด ๆ ที่ยอมรับ
กล่องทาทาลำดับ เพราะมันเป็นเอกสารที่ดีที่สุดของ
มนุษย์ก่อการทาทาน้อยที่เกี่ยวข้องกับเกาะ CpG [18,19],
เราวิเคราะห์ภูมิภาค 5'-ขนาบข้างของ ABCB10 ใช้ CpG เกาะ Searcher
ซอฟต์แวร์ระบุเกาะ CpG คลาสสิก (ที่-845 / + 906 bp) ภายใน
สถานที่ที่คาดหวังของผู้ก่อการหลัก ABCB10 ที่มีเนื้อหา GC
ด้านบน 68% การวิเคราะห์ของทรัพยากรของฐานข้อมูลของการถอดรหัสพันธุกรรม
เริ่มไซต์ (DBTSS) แสดงให้เห็นว่าไม่มีเมเจอร์เดียวที่ TSS (การถอดรหัสพันธุกรรม
เริ่ม Site) กับ TSSs ระบุลำดับการทดลองขนาดใหญ่
แยกย้ายกันระหว่างนิวคลีโอ -306 และ -53 เทียบกับ
การแปล ATG codon เริ่มต้น (รูปที่ 1). ความเข้มข้นที่โดดเด่นที่สุด
ของเว็บไซต์เริ่มต้นการถอดรหัสบอกสถานที่ตั้งของกฎระเบียบหลัก
ลำดับที่ตั้งอยู่ภายในยืด 100 bp ของจีโนม
ลำดับนิวคลีโอระหว่าง -320 และ -220

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.1 . ในการวิเคราะห์โครงข่ายของมนุษย์ abcb10 ยีนส่งเสริม
เพื่อระบุพื้นฐานลองกลไกการควบคุม
ของ abcb10 ยีนที่เราทำการค้นหาไบโอ นฟ ์เมติกของจีโนม
ดับทันทีก่อนการเริ่มต้นของโปรตีนองค์ประกอบเขต
โปรโมเตอร์ที่มีศักยภาพและเว็บไซต์ที่มีการเข้ารหัส ภายใน abcb10
ส่งเสริมศักยภาพเราไม่สามารถที่จะหาใด ๆเกี่ยวกับ
ทาทากล่องดังนี้ ในเมื่อมันเป็นเอกสารที่ดีมากที่สุดของ
ทาทามนุษย์โปรโมเตอร์น้อยเกี่ยวข้องกับ CPG เกาะ [ 18,19 ]
เราวิเคราะห์ 5 ’ - flanking region ของ abcb10 ใช้ CPG ซอฟต์แวร์ค้นหา
เกาะระบุเกาะ CPG คลาสสิก ( − 845 / 906 BP ) ภายใน
คาดว่าตำแหน่งของ abcb10 แกน ส่งเสริมการขายด้วย GC เนื้อหา
ข้างบน 68 %การวิเคราะห์ทรัพยากรของฐานข้อมูลของเว็บไซต์เริ่มต้น particle
( dbtss ) พบว่ามีที่เดียวไม่มีสาขา TSS ( เว็บไซต์เริ่มต้น particle
) กับ tsss ระบุการทดลองการกระจายขนาดใหญ่
ระหว่างนิวคลีโอไทด์ 306 และ−− 53 เทียบกับ
ATG แปลเริ่มต้น codon ( รูปที่ 1 ) ที่โดดเด่นที่สุดของเว็บไซต์เริ่มลองความเข้มข้น
,แนะนำสถานที่หลักกฎระเบียบ
ลำดับ ตั้งอยู่ภายใน 100 BP ยืดลำดับจีโนม
ระหว่างนิวคลีโอไทด์และ−− 220 .