Identifying Lactobacillus species u

Identifying Lactobacillus species using only phenotypic and genotypic (16S rDNA sequence analysis)
techniques yields inaccurate results. The objective of this study was to develop species-specific primers
based on randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprinting to distinguish species within the
closely related Lactobacillus plantarum group. One of these primers, OPD-3, produced a species-specific
band that was found only in the tested Lactobacillus pentosus. This specific fragment was isolated from
agarose gel and ligated into a vector for DNA sequencing. A pair of primers, SpOPD3Lpen-F1/R1, that were
highly specific sequence-characterized-amplified-regions (SCARs) were designed according to the
nucleotide sequences of the specific RAPD marker. These primers were used for PCR analysis of the
template DNA of the Lactobacillus strains, and a single 542 bp species-specific band was found only in L.
pentosus. Using PCR, a novel species-specific primer pair is shown to rapidly, accurately and effectively
distinguish L. pentosus from other species in the L. plantarum group of probiotic bacteria.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระบุแลคโตบาซิลลัสสายพันธุ์ใช้เฉพาะฟีโนไทป์ และจีโนไทป์ (16S rDNA ลำดับวิเคราะห์)เทคนิคการทำให้ผลลัพธ์ไม่ถูกต้อง วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือการ พัฒนาไพรเมอร์ species-specificตามสุ่มเอาต์ polymorphic ดีเอ็นเอ (อาร์เอพีดี) ลายพิมพ์เพื่อแยกชนิดภายในกลุ่ม plantarum แลคโตบาซิลลัสที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด หนึ่งผลิต species-specific ของไพรเมอร์เหล่านี้ ผู้ป่วยนอก-3วงดนตรีที่พบเฉพาะใน pentosus แลคโตบาซิลลัสทดสอบ ส่วนนี้เฉพาะแยกต่างหากจากagarose เจ กควบเป็นเวกเตอร์ในลำดับดีเอ็นเอ เป็นคู่ของไพรเมอร์ SpOPD3Lpen-F1/R1 ที่การลำดับลักษณะขยายภูมิภาค (แผลเป็น) ถูกออกแบบตามลำดับนิวคลีโอไทด์ของเครื่องหมายอาร์เอพีดีเฉพาะ ไพรเมอร์เหล่านี้ใช้สำหรับวิเคราะห์ PCRแม่แบบดีเอ็นเอของสายพันธุ์แลคโตบาซิลลัส เดี่ยว 542 bp species-specific วงพบใน L.pentosus ใช้ PCR คู่รองพื้น species-specific นวนิยายแสดงขึ้นให้รวดเร็ว แม่นยำ และมีประสิทธิภาพแยก L. pentosus จากสปีชีส์อื่นในกลุ่ม L. plantarum แบคทีเรียโปรไบโอติกส์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การระบุสายพันธุ์แลคโตบาซิลลัสใช้ฟีโนไทป์เท่านั้นและทางพันธุกรรม (16S rDNA วิเคราะห์ลำดับ)
เทคนิคการทำให้ผลไม่ถูกต้อง วัตถุประสงค์ของการศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาไพรชนิดที่เฉพาะเจาะจง
ขึ้นอยู่กับดีเอ็นเอขยายสุ่ม polymorphic (RAPD) พิมพ์ลายนิ้วมือที่จะแยกสายพันธุ์ภายใน
แลคโตบาซิลลัสที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกลุ่ม plantarum หนึ่งในไพรเหล่านี้ OPD-3, ผลิตสายพันธุ์เฉพาะ
วงที่พบเฉพาะใน pentosus ทดสอบแลคโตบาซิลลัส ส่วนนี้เฉพาะที่แยกได้จาก
เจล agarose และ ligated เป็นเวกเตอร์สำหรับลำดับดีเอ็นเอ คู่ของไพรเมอร์ SpOPD3Lpen-F1 / R1, ที่มีความ
เฉพาะเจาะจงสูงลำดับลักษณะ-ขยายภูมิภาค (Scars) ได้รับการออกแบบตาม
ลำดับเบสของดีเอ็นเอเครื่องหมายที่เฉพาะเจาะจง ไพรเมอร์เหล่านี้ถูกนำมาใช้สำหรับการวิเคราะห์ PCR ของ
แม่แบบดีเอ็นเอของสายพันธุ์แลคโตบาซิลลัสและเดี่ยว 542 bp วงดนตรีสายพันธุ์เฉพาะที่ถูกพบเฉพาะใน L.
pentosus การใช้วิธี PCR, ไพรเมอร์สายพันธุ์เฉพาะนวนิยายคู่ก็แสดงให้เห็นอย่างรวดเร็วถูกต้องและมีประสิทธิภาพ
แตกต่าง pentosus ลิตรจากสายพันธุ์อื่น ๆ ในกลุ่ม L. plantarum มีแบคทีเรียโปรไบโอติก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การระบุชนิดและคุณสมบัติทางพันธุกรรมโดยใช้เพียงแลคโตบาซิลลัส ( การวิเคราะห์ลำดับเบส 16S rDNA )
เทคนิคที่ให้ผลลัพธ์ที่ไม่ถูกต้อง การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาโดยเฉพาะ - ขยายพันธุ์
ตามสุ่ม amplified polymorphic DNA ( RAPD ) พิมพ์ลายนิ้วมือ เพื่อแยกชนิดภายใน
เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด Lactobacillus plantarum กลุ่ม หนึ่งของไพรเมอร์ opd-3 เหล่านี้ ,ผลิตวงดนตรีเฉพาะ - ขยายพันธุ์
ที่พบเฉพาะในการทดสอบ Lactobacillus pentosus . ส่วนนี้เฉพาะถูกแยกจาก
เจลและผูกเป็นเวกเตอร์สำหรับการจัดลำดับดีเอ็นเอ คู่ของไพรเมอร์ spopd3lpen-f1 / R1 ที่
สูงเฉพาะลำดับลักษณะของภูมิภาค ( แผลเป็น ) ถูกออกแบบตามลำดับของนิวคลีโอไทด์
เครื่องหมาย RAPD ที่เฉพาะเจาะจงไพรเมอร์เหล่านี้ถูกใช้สำหรับการวิเคราะห์ PCR ของ
แม่แบบดีเอ็นเอของสายพันธุ์แลคโตบาซิลลัส และเดียวผม BP เฉพาะ - ขยายพันธุ์วงดนตรีพบ L . pentosus
. การใช้ PCR , คู่ไพรเมอร์เผ่าพันธุ์ - เฉพาะนวนิยายแสดงอย่างรวดเร็ว ถูกต้อง และมีประสิทธิภาพ
L . pentosus แตกต่างจากชนิดอื่น ๆใน L . plantarum กลุ่มโพรไบโอติกแบคทีเรีย