Genome sequence of Vibrio parahaemo

Genome sequence of Vibrio parahaemolyticus: a pathogenic mechanism distinct from that of V cholerae.

Abstract
BACKGROUND:
Vibrio parahaemolyticus, a gram-negative marine bacterium, is a worldwide cause of food-borne gastroenteritis. V parahaemolyticus strains of a few specific serotypes, probably derived from a common clonal ancestor, have lately caused a pandemic of gastroenteritis. The organism is phylogenetically close to V cholerae, the causative agent of cholera.
METHODS:
The whole genome sequence of a clinical V parahaemolyticus strain RIMD2210633 was established by shotgun sequencing. The coding sequences were identified by use of Gambler and Glimmer programs. Comparative analysis with the V cholerae genome was undertaken with MUMmer.
FINDINGS:
The genome consisted of two circular chromosomes of 3288558 bp and 1877212 bp; it contained 4832 genes. Comparison of the V parahaemolyticus genome with that of V cholerae showed many rearrangements within and between the two chromosomes. Genes for the type III secretion system (TTSS) were identified in the genome of V parahaemolyticus; V cholerae does not have these genes.
INTERPRETATION:
The TTSS is a central virulence factor of diarrhoea-causing bacteria such as shigella, salmonella, and enteropathogenic Escherichia coli, which cause gastroenteritis by invading or intimately interacting with intestinal epithelial cells. Our results suggest that V parahaemolyticus and V cholerae use distinct mechanisms to establish infection. This finding explains clinical features of V parahaemolyticus infections, which commonly include inflammatory diarrhoea and in some cases systemic manifestations such as septicaemia, distinct from those of V cholerae infections, which are generally associated with non-inflammatory diarrhoea.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จีโนมลำดับของผล parahaemolyticus: แตกต่างจากของ V cholerae กลไกอุบัติบทคัดย่อพื้นหลัง:ต่อ parahaemolyticus แบคทีเรียทะเลเป็นแบคทีเรียแกรมลบ เป็นสาเหตุของโรคกระเพาะอักเสบแบกรับอาหารทั่วโลก สายพันธุ์ parahaemolyticus V ของ serotypes เฉพาะกี่ คงสืบทอดมาจากบรรพบุรุษ clonal แบบทั่วไป เมื่อเร็ว ๆ นี้ได้เกิดการระบาดของโรคกระเพาะอักเสบ สิ่งมีชีวิตที่เป็น phylogenetically V cholerae ตัวแทนสาเหตุการของอหิวาตกโรควิธีการ:ลำดับทั้งจีโนมของคลินิก V parahaemolyticus ต้องใช้ RIMD2210633 ก่อตั้งขึ้น โดยลำดับปืนลูกซอง ลำดับที่รหัสที่ระบุ โดยใช้โปรแกรมนักการพนันและน้อยนิด วิเคราะห์เปรียบเทียบกับตัว V cholerae จีโนมดำเนินกับ MUMmerค้นพบ:กลุ่มประกอบด้วยของ chromosomes กลมสองของ 3288558 bp และ 1877212 bp มันประกอบด้วยยีน 4832 จีโนม parahaemolyticus V เปรียบเทียบกับค่าของ V cholerae พบ rearrangements ภายใน และ ระหว่าง chromosomes สอง ยีนสำหรับชนิดของระบบการหลั่ง III (TTSS) ระบุในจีโนมของ V parahaemolyticus V cholerae ไม่มียีนเหล่านี้ตีความ:TTSS เป็นปัจจัย virulence กลางท้องเสียทำให้เกิดแบคทีเรียเช่น shigella ระดับ และ enteropathogenic Escherichia coli ที่ทำให้เกิดโรคกระเพาะอักเสบ โดยการบุกรุก หรือโต้ตอบกับ epithelial เซลล์ลำไส้จึง ผลของเราแนะนำว่า V parahaemolyticus และ V cholerae ใช้กลไกที่แตกต่างเพื่อสร้างเชื้อ ค้นหานี้อธิบายลักษณะทางคลินิก ของ V parahaemolyticus เชื้อ ซึ่งโดยทั่วไปรวมถึงท้องเสียอักเสบ และ ในลักษณะระบบบางกรณีเช่น septicaemia แตกต่างจากของ V cholerae เชื้อ ซึ่งโดยทั่วไปที่เกี่ยวข้องกับไม่อักเสบท้องเสีย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับจีโนมของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus: กลไกที่ทำให้เกิดโรคที่แตกต่างจากที่ V cholerae. บทคัดย่อภูมิหลัง: parahaemolyticus Vibrio, แบคทีเรียทะเลแกรมลบ, เป็นสาเหตุทั่วโลกของกระเพาะและลำไส้อักเสบที่เกิดจากอาหาร สายพันธุ์ V parahaemolyticus ของสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจงไม่กี่อาจจะมาจากบรรพบุรุษ clonal ร่วมกันเมื่อเร็ว ๆ นี้ได้ก่อให้เกิดการแพร่ระบาดของกระเพาะอาหารและลำไส้ ชีวิตเป็น phylogenetically ใกล้กับ cholerae วีสาเหตุของอหิวาตกโรค. วิธีการ: ลำดับจีโนมทั้งหมดของคลินิก V parahaemolyticus RIMD2210633 สายพันธุ์ได้รับการจัดตั้งขึ้นตามลำดับปืนลูกซอง ลำดับการเข้ารหัสถูกระบุโดยการใช้การพนันและโปรแกรม Glimmer การวิเคราะห์เปรียบเทียบกับจีโนม V cholerae ได้รับการดำเนินการที่มีคนเล่นละคร. นักวิจัยจีโนมประกอบด้วยสองโครโมโซมวงกลม 3288558 และ 1877212 bp bp; มันมียีน 4832 เปรียบเทียบจีโนม V parahaemolyticus กับที่ของ cholerae V แสดงให้เห็น rearrangements หลายภายในและระหว่างสองโครโมโซม ยีนสำหรับชนิดของระบบการหลั่ง III (TTSS) ได้รับการระบุไว้ในจีโนมของ V parahaemolyticus; cholerae V ไม่มียีนเหล่านี้. ตีความ: TTSS เป็นปัจจัยรุนแรงกลางของเชื้อแบคทีเรียที่ก่อให้เกิดอาการท้องเสียเช่น Shigella, Salmonella และ Enteropathogenic เชื้อ Escherichia coli ซึ่งก่อให้เกิดโรคทางเดินอาหารโดยการบุกรุกหรืออย่างใกล้ชิดมีปฏิสัมพันธ์กับเซลล์เยื่อบุผิวลำไส้ ผลของเราแสดงให้เห็นว่า parahaemolyticus V และ V cholerae ใช้กลไกที่แตกต่างกันเพื่อสร้างการติดเชื้อ การค้นพบนี้จะอธิบายถึงลักษณะทางคลินิกของการติดเชื้อ V parahaemolyticus ซึ่งโดยทั่วไปอาการท้องร่วงอักเสบและในบางกรณีอาการระบบเช่นโลหิตเป็นพิษแตกต่างจากผู้ติดเชื้อ cholerae V ซึ่งจะเกี่ยวข้องกับอาการท้องเสียที่ไม่อักเสบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับจีโนมของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus : กลไกที่แตกต่างจากที่ของเชื้อ V .



พื้นหลังบทคัดย่อ : Vibrio parahaemolyticus , แบคทีเรียแกรมลบ มารีน เป็นสาเหตุของการเกิดโรคกระเพาะอาหารทั่วโลก . V parahaemolyticus สายพันธุ์ของ ( เฉพาะบาง อาจได้มาจากงานทั่วไปที่บรรพบุรุษได้เมื่อเร็ว ๆนี้เกิดระบาดของโรคกระเพาะ .สิ่งมีชีวิตที่เป็น phylogenetically ใกล้ v อตัวแทนที่เป็นสาเหตุของอหิวาตกโรค วิธีการ :

ทั้งจีโนมลำดับของ rimd2210633 V parahaemolyticus สายพันธุ์ทางคลินิก ก่อตั้งขึ้นโดยลำดับ ปืนสั้น รหัสลำดับถูกระบุโดยใช้โปรแกรมนักพนันและแสงสลัว การวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบกับเชื้อพันธุกรรม V มีปัญหากับนักแสดงละครใบ้ .

สรุป :โครโมโซมประกอบด้วยสองโครโมโซมวงกลมของ 3288558 BP และ 1877212 BP ; มันมี 4832 ยีน การเปรียบเทียบจีโนม V parahaemolyticus ด้วยวี อแสดงหลาย rearrangements ภายในและระหว่างสองโครโมโซม ยีนสำหรับสามประเภทของระบบการหลั่ง ( TTSS ) ระบบการเก็บเป็นความลับที่ถูกระบุในจีโนมของ V parahaemolyticus ; v อไม่ได้มียีนเหล่านี้ตีความ

:การ ttss เป็นปัจจัยที่ก่อให้เกิดความรุนแรงของโรคอุจจาระร่วงกลางก่อให้เกิดแบคทีเรีย เช่น เชื้อชิเกลล่า และ enteropathogenic , Escherichia coli ที่ทำให้เกิดโรคกระเพาะ โดยบุกรุกหรือแนบแน่นโต้ตอบกับลำไส้เยื่อบุเซลล์ จากผลการศึกษาที่ V parahaemolyticus และ V อหิวาตกโรคใช้กลไกที่แตกต่างกันเพื่อสร้างการติดเชื้อการค้นพบนี้อธิบายลักษณะทางคลินิกของ V parahaemolyticus เชื้อ ซึ่งมักจะรวมถึงการอักเสบท้องเสียและในบางกรณีระบบลักษณะอาการเช่นภาวะเลือดเป็นพิษ , แตกต่างจากพวก V cholerae เชื้อ ซึ่งโดยทั่วไปจะเกี่ยวข้องกับไม่อักเสบ ท้องเสียด้วย