Phylogenetic AnalysisSequences were

Phylogenetic Analysis
Sequences were aligned visually and using Sequence
Editor software, and were analyzed using the computer
program Phylogenetic Analysis Using Parsimony
4.0b2a (PAUP; Swofford, 2000). A heuristic search option
was used to construct trees for parsimony and
maximum-likelihood for the control region. An exhaustive
search was employed for the shorter cytochrome b
region. Gaps were treated first as uninformative characters
and then reanalyzed as new character states. To
prevent the large repeats in the control region from
biasing the results when insertion/deletions were included
as new character states, the entire repeat sequence
between 306 and 502 bp was removed. Trees
were rooted for the control region using sequence data
from the Odocoileinae subfamily (caribou, moose, and
white-tailed deer) and the Cervinae subfamily (sika
and white-lipped deer). Bootstraps were performed to a
total of 100 replicates, and transversional mutations
were weighted against transitional mutations to a
maximum of 15:1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ผลลำดับสอดคล้องสายตา และใช้ลำดับซอฟต์แวร์แก้ไข และถูกวิเคราะห์โดยใช้คอมพิวเตอร์โปรแกรมวิเคราะห์ผลโดยใช้ Parsimony4.0b2a (PAUP Swofford, 2000) ตัวเลือกการค้นหาพฤติกรรมใช้ในการสร้างต้นไม้ parsimony และโอกาสสูงสุดสำหรับพื้นที่ควบคุม ความครบถ้วนสมบูรณ์ค้นหาถูกจ้างสำหรับ b cytochrome สั้นลงภูมิภาค ช่องว่างได้รับการรักษาครั้งแรกเป็นอักขระ uninformativeแล้ว reanalyzed เป็นรัฐใหม่ที่ตัวละคร ถึงป้องกันการทำซ้ำขนาดใหญ่ในพื้นที่ควบคุมจากการให้น้ำหนักกับผลเมื่อแทรก/ลบรวมเป็นอเมริกาตัวละครใหม่ ลำดับการทำซ้ำทั้งหมดระหว่าง bp 306 และ 502 ถูกเอาออก ต้นไม้มีรากสำหรับภูมิภาคควบคุมโดยใช้ข้อมูลลำดับจากวงศ์ย่อย Odocoileinae (caribou กวางมูส และขาว–หางกวาง) และวงศ์ย่อยในวงศ์ย่อยกวาง (ซิก้าและกวางบ้านขาว) Bootstraps ดำเนินการเพื่อการจำนวน 100 replicates และกลายพันธุ์ transversionalมีการถ่วงน้ำหนักจากการกลายพันธุ์เปลี่ยนแปลงไปเป็นสูงสุด 15:1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

phylogenetic วิเคราะห์
ลำดับถูกจัดชิดสายตาและโดยใช้ลำดับ
ซอฟต์แวร์แก้ไขและได้รับการวิเคราะห์โดยใช้คอมพิวเตอร์
โปรแกรม phylogenetic วิเคราะห์การใช้ตระหนี่
4.0b2a (PAUP; Swofford, 2000) ตัวเลือกการค้นหาแก้ปัญหา
ได้ถูกใช้ในการสร้างต้นไม้ประหยัดและ
โอกาสสูงสุดสำหรับภูมิภาคควบคุม หมดจด
ค้นหาเป็นลูกจ้างสำหรับ cytochrome ขสั้น
ภูมิภาค ช่องว่างที่ได้รับการรักษาครั้งแรกในฐานะตัวละคร uninformative
แล้ว reanalyzed เป็นรัฐตัวละครใหม่ เพื่อ
ป้องกันไม่ให้ซ้ำขนาดใหญ่ในภูมิภาคควบคุมจาก
การให้น้ำหนักผลเมื่อแทรก / ลบถูกรวม
เป็นรัฐตัวละครใหม่ลำดับซ้ำทั้งหมด
ระหว่าง 306 และ 502 bp ถูกลบออก
ต้นไม้ มีรากสำหรับภูมิภาคควบคุมการใช้ข้อมูลลำดับ
จาก Odocoileinae อนุวงศ์ (กวางคาริบูกวางและ
กวางขาวนก) และอนุวงศ์ Cervinae (Sika
และกวางขาวน้อย) วัฏจักรได้ดำเนินการไป
รวม 100 ซ้ำและการกลายพันธุ์ transversional
ถูกถ่วงน้ำหนักกับการกลายพันธุ์ของการเปลี่ยนผ่านไป
สูงสุด 15: 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ phylogeneticลำดับ ชิดที่มองเห็นและการใช้ลำดับซอฟต์แวร์แก้ไขและวิเคราะห์ข้อมูล โดยใช้คอมพิวเตอร์โปรแกรมการวิเคราะห์การใช้ ซึ่งความตระหนี่4.0b2a ( ยาจก ; สวอฟฟอร์ด , 2000 ) ตัวเลือกการค้นหาฮิวริสติกใช้ในการสร้างต้นไม้เพื่อความตระหนี่และอันดับสูงสุดสำหรับเขตควบคุม ครบถ้วนค้นหาสำเร็จรูปสั้น ไซโตโครม บีภูมิภาค ช่องว่างที่ได้รับการรักษาก่อนเป็นอักขระที่ไม่ได้ให้แล้ว reanalyzed เป็นสถานะตัวละครใหม่ เพื่อป้องกันไม่ให้ซ้ำรอยขนาดใหญ่ในเขตควบคุมขยายผลเมื่อการแทรก / ลบได้ ได้แก่เป็นสถานะตัวละครใหม่ ลำดับซ้ำทั้งหมดระหว่าง 306 และ 502 BP จะถูกลบออก ต้นไม้เป็นรากฐานสำหรับเขตข้อมูลควบคุมการใช้ลำดับจาก odocoileinae subfamily ( กวางคาริบู มูส และสีขาวหางกวาง ) และวงศ์ย่อยกวาง subfamily ( ดาวและสีขาว lipped กวาง ) bootstraps มีการปฏิบัติการทั้งหมด 100 นาที และ transversional การกลายพันธุ์มีน้ำหนักต่อการกลายพันธุ์ที่เปลี่ยนไปสูงสุด 15 : 1 .