Genetic diversity of 28 wild specie

Genetic diversity of 28 wild species of fodder legume Cassia using RAPD,
ISSR and SSR markers: a novel breeding strategy
Suprava Mohanty1, A. B. Das2, *, Nabarun Ghosh3, *
, B. B. Panda4, Don W. Smith5
1
Cytogenetics Laboratory, Regional Plant Resource Centre, Nayapalli, Bhubaneswar 751015, Orissa, India.
2Department of Agricultural Biotechnology, College of Agriculture, Orissa University of Agriculture &
Technology, Bhubaneswar 751003, India.
3Department of Life, Earth and Environmental Sciences, West
Texas A&M University, Canyon, TX 79016, USA. 4Departemnt of Botany, Berhampur University, Orissa,
India.
5 Department of Biological Sciences, University of North Texas, Denton, Texas 76203
RAPD, ISSR and SSR primers were used to assess genetic diversity and phylogenetic relationships among 28
species of Cassia (2n = 16, 26, 28). RAPD, ISSR and SSR primers revealed 36.12, 42.7 and 54.4% polymorphism,
respectively. The Dendograms based on RAPD, ISSR, and SSR data precisely organized 28 species of Cassia into
different clusters. SSR primer could distinguish all species analyzed within the genus. Polymorphic index varied
from 0.1 to 0.5 for both SSR and RAPD markers; primer index values were substantially higher for RAPD primers
(0.35 – 4.65) than for SSR primers (0.35 – 1.73). It was possible to identify accessions with the help of RAPD, ISSR
and SSR markers. Dendograms constructed from RAPD, ISSR and SSR data revealed DNA marker-based genetic
identification in Cassia. Four groups of Cassia that were resolved corresponded to species grouped earlier
taxonomically. Cassia mimosoides with a different genomic set up showed close relation to C. javanica. Cassia
siamea and C. spectabilis; C. grandis and C. nodosa in a core group with close morphological similarities. Cassia
artemisioides and C. covesii, both showing morphologically drought tolerance characters are closely placed,
indicating that they are the wild progenitors of these species. The broad adaptation of some species of Cassia
implies a large probability that nuclear DNA mutations occurred in the past and that resulted in diversification
and genetic polymorphism in growth habit, vigor, and stem, leaf, seed, and pod characteristics and a
physiological polymorphism, the water-use efficiency.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์ป่า 28 legume อาหารขี้เหล็กใช้อาร์เอพีดีเครื่องหมาย SSR และ ISSR: นวนิยายพันธุ์กลยุทธ์Suprava Mohanty1, A. B. Das2, *, Nabarun Ghosh3, *, B. B. Panda4 ดอน W. Smith51เซลล์พันธุศาสตร์ห้องปฏิบัติการ ศูนย์ภูมิภาคพืช Nayapalli, 751015, Orissa อินเดียในภุพเนศวร2Department ของมหาวิทยาลัยเกษตร Orissa เทคโนโลยีชีวภาพเกษตร วิทยาลัยเกษตร &เทคโนโลยี 751003 ภุพเนศวรอินเดีย3Department ชีวิต โลก และสิ่งแวดล้อม วิทยาศาสตร์ ตะวันตกเท็กซัสเอแอนด์เอ็มมหาวิทยาลัย แคนยอน TX 79016 สหรัฐอเมริกา 4Departemnt พฤกษศาสตร์ มหาวิทยาลัย Berhampur, Orissaอินเดีย5 แผนกชีวภาพวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยของนอร์ทเท็กซัส Denton เท็กซัส 76203ใช้ไพรเมอร์ ISSR อาร์เอพีดี และ SSR เพื่อประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ phylogenetic ระหว่าง 28พันธุ์ขี้เหล็ก (2n = 16, 26, 28) ไพรเมอร์ ISSR อาร์เอพีดี และ SSR เปิดเผย 36.12, 42.7 และ 54.4% โพลิมอร์ฟิ ซึมตามลำดับ Dendograms ที่ยึดตามข้อมูลอาร์เอพีดี ISSR และ SSR แม่นยำจัดพันธุ์ขี้เหล็กเป็น 28คลัสเตอร์ที่แตกต่างกัน SSR พื้นสามารถแยกสปีชีส์ทั้งหมดที่วิเคราะห์ภายในตระกูลนี้ ดัชนี polymorphic ที่แตกต่างกันจาก 0.1 ถึง 0.5 สำหรับเครื่องหมาย SSR และอาร์เอพีดี รองพื้นค่าดัชนีสูงมากสำหรับไพรเมอร์อาร์เอพีดี(0.35 – 4.65) กว่าสำหรับไพรเมอร์ SSR (0.35-1.73) สามารถระบุ accessions ช่วยของอาร์เอพีดี ISSRและเครื่องหมาย SSR Dendograms สร้างจากอาร์เอพีดี SSR และ ISSR ข้อมูลเปิดเผยโดยใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอทางพันธุกรรมรหัสในขี้เหล็ก กลุ่มที่สี่ของขี้เหล็กที่แก้ไข corresponded กับสปีชีส์ที่ถูกจัดกลุ่มก่อนหน้านี้taxonomically Cassia mimosoides กับแบบ genomic C. javanica แสดงปิดสัมพันธ์ได้ ขี้เหล็กsiamea และ C. spectabilis C. grandis และเบียร์ C. ในกลุ่มหลักที่มีความคล้ายคลึงของปิด ขี้เหล็กartemisioides และ C. covesii ทั้งสองแสดง morphologically อักขระยอมรับภัยแล้งอย่างใกล้ชิดได้วางไว้ระบุว่า พวกเขาเป็น progenitors ป่าพันธุ์ ปรับกว้างบางพันธุ์ขี้เหล็กหมายถึงความน่าเป็นขนาดใหญ่ ที่เกิดการกลายพันธุ์ของดีเอ็นเอนิวเคลียร์ในอดีตที่ส่งผลให้วิสาหกิจและโพลิมอร์ฟิซึมพันธุ ในเติบโตนิสัย แข็ง และ ก้าน ใบ เมล็ด ฝักลักษณะและสรีรวิทยาโพลิมอร์ฟิซึม ประสิทธิภาพการใช้น้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์ป่า 28 ของพืชตระกูลถั่วอาหารสัตว์ Cassia ใช้ RAPD,
ISSR และเครื่องหมาย SSR: กลยุทธ์การปรับปรุงพันธุ์นวนิยาย
Suprava Mohanty1, AB Das2 *, Nabarun Ghosh3 *
บีบี Panda4 ดอนดับเบิลยู Smith5
1
Cytogenetics ห้องปฏิบัติการศูนย์ทรัพยากรพืชในภูมิภาค , Nayapalli, Bhubaneswar 751015, โอริสสาอินเดีย.
2 ภาควิชาเทคโนโลยีชีวภาพทางการเกษตร, วิทยาลัยเกษตร,
โอริสสามหาวิทยาลัยเกษตรและเทคโนโลยีBhubaneswar 751003 อินเดีย.
3Department ชีวิตโลกและวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม,
เวสต์เท็กซัสA & M University, แคนยอน, TX 79016, สหรัฐอเมริกา. 4Departemnt พฤกษศาสตร์ Berhampur
มหาวิทยาลัยโอริสสาอินเดีย.
5 ภาควิชาวิทยาศาสตร์ชีวภาพ, University of North Texas, Denton, เท็กซัส 76203
RAPD, ISSR และไพรเมอร์ SSR ถูกนำมาใช้ในการประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการหมู่ 28
ชนิด Cassia (2n = 16 , 26, 28) RAPD, ISSR และไพรเมอร์เปิดเผย SSR 36.12, 42.7 และ 54.4% ความแตกต่าง,
ตามลำดับ Dendograms ขึ้นอยู่กับอาร์เอพี, ISSR และข้อมูลที่แม่นยำ SSR จัด 28 ชนิด Cassia
เข้าไปในกลุ่มที่แตกต่างกัน ไพรเมอร์ SSR สามารถแยกแยะวิเคราะห์ทุกชนิดที่อยู่ในประเภท ดัชนี polymorphic แตกต่างกัน
0.1-0.5 ทั้ง SSR และเครื่องหมาย RAPD; ค่าดัชนีไพรเมอร์ได้อย่างมีนัยสำคัญที่สูงขึ้นสำหรับไพรเมอร์อาร์เอพี
(0.35-4.65) กว่า SSR ไพรเมอร์ (0.35-1.73) มันเป็นไปได้ที่จะระบุสายด้วยความช่วยเหลือของอาร์เอพี, ISSR
และเครื่องหมาย SSR Dendograms สร้างจาก RAPD, ISSR และข้อมูล SSR
เปิดเผยทางพันธุกรรมที่ใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอประจำตัวประชาชนในCassia สี่กลุ่มขี้เหล็กที่ได้รับการแก้ไขตรงกับสายพันธุ์ก่อนหน้านี้มีการจัดกลุ่ม
taxonomically Cassia mimosoides กับชุดจีโนมที่แตกต่างกันขึ้นแสดงให้เห็นว่ามีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับซี javanica Cassia
siamea และ C spectabilis; C. grandis และ C nodosa ในกลุ่มแกนที่มีความคล้ายคลึงกันทางสัณฐานวิทยาใกล้ Cassia
artemisioides และ C covesii
ทั้งแสดงสัณฐานวิทยาตัวอักษรทนแล้งจะถูกวางไว้อย่างใกล้ชิดระบุว่าพวกเขาเป็นบรรพบุรุษป่าชนิดนี้ การปรับตัวในวงกว้างของบางชนิด Cassia
หมายถึงความน่าจะเป็นขนาดใหญ่ที่กลายพันธุ์ดีเอ็นเอนิวเคลียร์ที่เกิดขึ้นในอดีตที่ผ่านมาและส่งผลให้เกิดความหลากหลายและความแตกต่างทางพันธุกรรมในนิสัยการเจริญเติบโตความแข็งแรงและลำต้นใบเมล็ดและลักษณะฝักและความแตกต่างทางสรีรวิทยาที่ประสิทธิภาพการใช้น้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความหลากหลายทางพันธุกรรมของสัตว์ป่าของพืชตระกูลถั่วอาหารสัตว์ 28 ชนิด Cassia โดยใช้เทคนิค RAPD และ SSR markers , issr

: กลยุทธ์ผสมพันธุ์ใหม่ suprava mohanty1 , A . B . das2 , * , nabarun ghosh3 *
, B . B . panda4 ก็ . smith5
1
เซลล์ในห้องปฏิบัติการ ศูนย์ทรัพยากรพืชในภูมิภาค nayapalli ภุพเนศวร , 751015 รัฐโอริสสาอินเดีย
ภาควิชาเทคโนโลยีชีวภาพเกษตร วิทยาลัยเกษตรมหาวิทยาลัยโอริสสาของ&
เกษตรเทคโนโลยี 751003 Bhubaneswar , อินเดีย .
3department ของชีวิต โลกและวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม , เวสต์เท็กซัสเป็น&
M มหาวิทยาลัย , แคนยอน , TX 79016 , สหรัฐอเมริกา 4departemnt พฤกษศาสตร์ berhampur มหาวิทยาลัยรัฐโอริสสาอินเดีย
.
5 ภาควิชาวิทยาศาสตร์ชีวภาพ , University of North Texas , Denton , เท็กซัส โดย 76203
,issr SSR และไพรเมอร์เพื่อใช้ประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ต่างๆระหว่าง 28
ชนิด Cassia ( 2n = 16 , 27 , 28 ) โดย issr SSR , และไพรเมอร์พบ 36.12 สำคัญมากกว่า , และ % จึง
ตามลำดับ การ dendograms ตามด้วย issr และ SSR , ข้อมูลยําจัด 28 ชนิด Cassia เป็น
กลุ่มที่แตกต่างกันSSR primer แยกแยะชนิดวิเคราะห์ภายในสกุล ดัชนีจำนวนแตกต่างกัน
จาก 0.1 ถึง 0.5 ทั้งรองพื้นและได้รับเครื่องหมายอาร์เอพีดี ดัชนีมีค่าสูงขึ้นอย่างมากสำหรับ RAPD primers
( 0.35 ( 4.65 ) กว่า SSR PCR ( 0.35 ( 1.73 ) มันเป็นไปได้เพื่อระบุตัวอย่างด้วยความช่วยเหลือของโดย issr
SSR , และเครื่องหมาย โดย dendograms สร้างจาก ,issr และข้อมูลที่ได้รับจากทางพันธุกรรม พบดีเอ็นเอเครื่องหมาย
ในขี้เหล็ก สี่กลุ่มของขี้เหล็กที่แก้ไขได้ตรงกับชนิดจัดกลุ่มก่อน
taxonomically . mimosoides Cassia มีความแตกต่างอย่างตั้ง มีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับ C . จาวานิกา . Cassia
siamea . singalana ; C . สักและ C โนโดซ่าในกลุ่มหลักที่มีลักษณะปิด เช่น Cassia
artemisioides . covesii ทั้งการแสดงจากความแห้งแล้งความอดทนตัวอักษรอย่างใกล้ชิดอยู่
แสดงว่าพวกเขาจะตั้งต้นของป่าชนิดนี้ การปรับตัวกว้างของบางชนิด Cassia
หมายถึงความเป็นไปได้ขนาดใหญ่ที่นิวเคลียร์ดีเอ็นเอการกลายพันธุ์ที่เกิดขึ้นในอดีต ที่ส่งผลให้วิสาหกิจ
และพันธุกรรม polymorphism ในนิสัยการเจริญเติบโตแข็งแรง ลำต้นและใบเมล็ดพันธุ์และลักษณะฝักและ
) ด้านประสิทธิภาพการใช้น้ำ