the potential influence of SLE susc

the potential influence of SLE susceptibility variants in our tests of
association with LN. To account for potential population substructure,
principal component analyses were computed using SNPs that
passed quality control.35 All tests of association were computed and
adjusted for five principal components in the set I samples and four
principal components in the set II and set III samples. Within each
GWAS set, autosomal SNPs that passed quality control filters and
exhibited a minor allele frequency .0.01 were used to impute the
approximately 2.5 million SNPs in HapMap2 (Build 35) using IMPUTE.36
The reference set for imputation was the Utah residents with
ancestry from northern and western Europe available via the HapMap.
Within each GWAS set, logistic regression models included the abovestated
principal components and accounted for the imputation uncertainty
via the posterior genotype probabilities.36 Dominant, additive,
and recessive genetic models were computed assuming at least 10 and
20 individuals homozygous for the minor allele were observed. Because
of the modest sample size, this requirement caused many SNPs
to not have a test computed in set III. The evidence of association from
each of the three GWAS sets was weighted by sample size and combined
using the weighted inverse normal method as implemented in
METAL.37 To account for any inflation, the genomic control-adjusted
P value was reported.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

อิทธิพลของ SLE ภูมิไวรับตัวแปรในการทดสอบของเรามีศักยภาพความสัมพันธ์กับ LN. สำหรับโครงสร้างประชากรที่มีศักยภาพการวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักถูกคำนวณโดยใช้ SNPs ที่ผ่านการทดสอบทั้งหมดของสมาคมถูกคำนวณ control.35 คุณภาพ และการปรับปรุงสำหรับคอมโพเนนต์หลักที่ห้าในชุดผมตัวอย่างและสี่ส่วนประกอบหลักในชุดที่สองและชุดสามตัวอย่าง ในแต่ละตั้งค่า GWAS, autosomal SNPs ที่ผ่านฟิลเตอร์ควบคุมคุณภาพ และแสดงความถี่อัลลีรอง.0.01 ใช้ imputeประมาณ 2.5 ล้าน SNPs ใน HapMap2 (สร้าง 35) โดยใช้ IMPUTE.36การอ้างอิงที่ตั้งสำหรับ imputation ถูกชาวยูทาห์ด้วยมีเชื้อสายจากภาคเหนือและยุโรปตะวันตกผ่านทาง HapMap การภายในแต่ละชุด GWAS โมเดลถดถอยโลจิสติกรวมอยู่ abovestatedส่วนประกอบหลักครบถ้วน imputation ความไม่แน่นอนผ่าน probabilities.36 หลังจีโนไทป์ที่โดดเด่น สารเติมแต่งและรุ่นแก่นสานต์พันธุกรรมถูกคำนวณสมมติว่าอายุน้อยกว่า 10 ปี และ20 บุคคล homozygous สำหรับอัลรองถูกสังเกต เนื่องจากขนาดตัวอย่างเจียมเนื้อเจียมตัว ความต้องการนี้เกิดจาก SNPs หลายจะไม่มีการทดสอบคำนวณในชุด III หลักฐานของสมาคมจากแต่ละสาม GWAS ชุดถ่วงน้ำหนัก ด้วยขนาดตัวอย่าง และรวมใช้วิธีเฉลี่ยถ่วงน้ำหนักผกผันเป็นดำเนินการในMETAL.37 บัญชีเงินเฟ้อใด ๆ ที่ออกควบคุมปรับปรุงรายงานค่า P

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อิทธิพลศักยภาพของโรค SLE สายพันธุ์อ่อนแอในการทดสอบของเรา
ร่วมกับ LN บัญชีสำหรับประชากรที่มีศักยภาพโครงสร้างพื้นฐาน,
การวิเคราะห์องค์ประกอบหลักถูกคำนวณโดยใช้ SNPs ที่
ผ่านการทดสอบคุณภาพ control.35 ทั้งหมดของสมาคมได้รับการคำนวณและ
ปรับห้าองค์ประกอบหลักในชุดที่ผมตัวอย่างและสี่
องค์ประกอบหลักในชุดที่สองและการตั้งค่าตัวอย่างที่สาม ภายในแต่ละ
ชุด GWAS, SNPs autosomal ที่ผ่านฟิลเตอร์ควบคุมคุณภาพและการ
แสดง allele ความถี่เล็กน้อย .0.01 ถูกนำมาใช้เพื่อใส่ร้าย
ประมาณ 2.5 ล้าน SNPs ใน HapMap2 (Build 35) โดยใช้ IMPUTE.36
อ้างอิงที่กำหนดไว้สำหรับการใส่ร้ายถูกที่อาศัยอยู่ในยูทาห์กับ
วงศ์ตระกูล จากภาคเหนือและตะวันตกยุโรปสามารถใช้ได้ผ่านทาง HapMap ได้.
ภายในแต่ละชุด GWAS รูปแบบการถดถอยโลจิสติกรวม abovestated
องค์ประกอบหลักและคิดเป็นความไม่แน่นอนของการใส่ร้าย
ผ่านจีโนไทป์หลัง probabilities.36 เด่น, สารเติมแต่ง
และรูปแบบทางพันธุกรรมด้อยถูกคำนวณสมมติว่าอย่างน้อย 10 และ
20 บุคคล homozygous สำหรับอัลลีลถูกตั้งข้อสังเกตเล็ก ๆ น้อย ๆ เพราะ
ของขนาดของกลุ่มตัวอย่างเจียมเนื้อเจียมตัวความต้องการนี้เกิดจาก SNPs จำนวนมาก
เพื่อไม่ให้มีการทดสอบการคำนวณในเซตที่สาม หลักฐานของสมาคมจาก
แต่ละสามชุด GWAS ถูกถ่วงน้ำหนักด้วยขนาดของกลุ่มตัวอย่างและรวม
โดยใช้วิธีถ่วงน้ำหนักปกติผกผันเป็นดำเนินการใน
METAL.37 การบัญชีสำหรับอัตราเงินเฟ้อใด ๆ การควบคุมการปรับจีโนม
ค่า P ได้รับการรายงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ศักยภาพของอิทธิพลของตัวแปรในการทดสอบของเรา SLE ไวคบหาสมาคมกับ Ln . บัญชีที่ของประชากรที่อาจเกิดขึ้นการวิเคราะห์องค์ประกอบหลัก 4 ด้าน snps ที่ใช้ผ่านคุณภาพของสมาคม control.35 การทดสอบทั้งหมดถูกคำนวณและปรับได้ 5 หลักส่วนประกอบในชุดตัวอย่าง และสี่ส่วนประกอบหลักในชุดที่ 2 และชุดตัวอย่างที่ 3 . ภายในแต่ละชุด gwas snps , ยีนที่ผ่านตัวกรองการควบคุมคุณภาพมีความถี่ของอัลลีลเล็กน้อย 0.01 ถูกใส่ความโดยประมาณ 2.5 ล้าน snps ใน hapmap2 ( สร้าง impute.36 35 ) โดยใช้ชุดอ้างอิงสำหรับการใส่ความเป็นยูทาห์ที่อยู่อาศัยด้วยเชื้อสายจากภาคเหนือและตะวันตกยุโรปสามารถใช้ได้ผ่านทาง hapmap .ภายในแต่ละ gwas ชุดโมเดลการถดถอยโลจิสติกรวม abovestatedส่วนประกอบหลัก และสัดส่วนสำหรับการใส่ความไม่แน่นอนทางพันธุกรรมของ probabilities.36 เด่น , การบวกและพันธุกรรมแบบลักษณะด้อยได้คำนวณว่าอย่างน้อย 10 และ20 บุคคลยีนกลุ่มน้อย เป็น สังเกต เพราะของตัวอย่างที่เจียมเนื้อเจียมตัวขนาดความต้องการนี้ทำให้หลาย snpsไม่ต้องทดสอบคำนวณในชุด III หลักฐานของสมาคมจากแต่ละสาม gwas ชุดก็หนักตามขนาดตัวอย่างและรวมใช้แบบปกติใช้วิธีการผกผันmetal.37 บัญชีใดอัตราเงินเฟ้อ , จีโนมควบคุมปรับค่า P คือรายงาน