As the cDNA sequences of green alga

As the cDNA sequences of green algal sulP were used in the multiple alignments, there was no usable conserved region to design either specific primer or degenerate primer. Thus, the strategy was changed to do the protein alignment. Five protein primary sequences of algal sulP were retrieved from NCBI database: Nephroselmis olivacea (Acc No. NP_050928), Chlorella vulgaris (Acc No. NP_045890), Chlamydomonas reinhardtii (Acc No. XP_001692459), Mesostigma viride (Acc No. NP_038441), Chlorokybus atmophyticus (Acc No. YP_001019170). The alignment showed the conserved regions on the middle and the C-terminus. The cDNA sequences correspondinding to the conserved parts were used as templates in degenerate primer design. More than a thousand combinations of degenerate forward primers (SdegF), two combinations of nested forward primers (SnestedF) and over a hundred combinations of degenerate reverse primers (SdegR) were designed.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตามลำดับ cDNA ของ sulP สาหร่ายสีเขียวใช้ในการจัดแนวหลาย ได้ภูมิภาคอนุรักษ์ไม่สามารถใช้ในการออกแบบเฉพาะไพรเมอร์หรือรองพื้น degenerate ดังนั้น มีการเปลี่ยนแปลงกลยุทธ์ที่จะทำการจัดตำแหน่งของโปรตีน ลำดับหลักห้าโปรตีนของสาหร่าย sulP ถูกเรียกใช้จากฐานข้อมูล NCBI: olivacea Nephroselmis (หมายเลข Acc NP_050928), คลอเรลล่าผด (Acc No. NP_045890), Chlamydomonas reinhardtii (หมายเลข Acc XP_001692459), Mesostigma viride (หมายเลข Acc NP_038441), Chlorokybus atmophyticus (หมายเลข Acc YP_001019170) การจัดตำแหน่งที่พบในเขตป่าสงวนอยู่ตรงกลางและ C เทอร์มินัส Correspondinding ลำดับ cDNA ที่ส่วนป่าสงวนถูกใช้เป็นแม่แบบในการออกแบบไพรเมอร์ degenerate ชุดพันของการไพรเมอร์หน้า degenerate (SdegF), สองชุด ของไพรเมอร์หน้าซ้อนกัน (SnestedF) และ มากกว่า 100 ชุดของไพรเมอร์กลับ degenerate (SdegR) ถูกออกแบบมา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในฐานะที่เป็นลำดับยีนของ sulP สาหร่ายสีเขียวถูกนำมาใช้ในการจัดแนวหลายไม่มีเขตป่าสงวนที่ใช้งานได้ทั้งในการออกแบบไพรเมอร์ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงหรือเลว ดังนั้นกลยุทธ์ที่ได้รับการเปลี่ยนแปลงที่จะทำการจัดตำแหน่งโปรตีน ห้าลำดับโปรตีนหลักของสาหร่าย sulP ถูกดึงมาจากฐานข้อมูล NCBI: Nephroselmis olivacea (ACC เลข NP_050928) Chlorella vulgaris (ACC เลข NP_045890) Chlamydomonas reinhardtii (ACC เลข XP_001692459) Mesostigma viride (ACC เลข NP_038441) Chlorokybus atmophyticus (ACC เลข YP_001019170) การจัดตำแหน่งที่แสดงให้เห็นว่าภูมิภาคอนุรักษ์บนกลางและ C-ปลายทาง ลำดับยีน correspondinding ไปยังส่วนป่าสงวนถูกนำมาใช้เป็นแม่แบบในการออกแบบไพรเมอร์เลว มากกว่าหนึ่งพันรวมกันของไพรเมอร์ไปข้างหน้าคนเลว (SdegF) สองการรวมกันของไพรเมอร์ไปข้างหน้าซ้อนกัน (SnestedF) และมากกว่าร้อยรวมกันของไพรเมอร์กลับเลว (SdegR) ได้รับการออกแบบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เป็นลำดับของสายพันธุ์สาหร่ายสีเขียว Sulp ถูกใช้ในการจัดแนวแบบไม่มีงาน เขตอนุรักษ์เพื่อออกแบบให้แนวทางที่เฉพาะเจาะจงหรือการรองพื้น ดังนั้น กลยุทธ์ที่เปลี่ยนไปทำให้โปรตีนที่ตำแหน่ง โปรตีนสาหร่าย 5 หลักลำดับ Sulp ถูกดึงจากฐานข้อมูล ncbi : nephroselmis ดำ ( บัญชีไม่ np_050928 ) , ~ iChlorella vulgaris ( บัญชีไม่ np_045890 ) , คลาไมโดโมแนส reinhardtii ( บัญชีไม่ xp_001692459 ) mesostigma viride ( บัญชีไม่ np_038441 ) chlorokybus atmophyticus ( บัญชีไม่ yp_001019170 ) แนว พบว่าบริเวณอนุรักษ์บนกลางและ c-terminus . วิธีลำดับ correspondinding เพื่ออนุรักษ์ชิ้นส่วนที่ใช้เป็นแม่แบบในการออกแบบไพรเมอร์ ทราม กว่าพันชุดของการส่งต่อรองพื้น ( sdegf ) , สองชุดซ้อนกันชนิดไปข้างหน้า ( snestedf ) และมากกว่าร้อยรวมกันของทรามกลับไพรเมอร์ ( sdegr ) ได้รับการออกแบบ