Random Amplified Polymorphic DNA (R

Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) assay was performed to estimate genetic polymorphism in six different
rice (Oryza sativa L.) cultivars viz. Basmati 370, DM 25, IRATOM 24, Binadhan 6, TNDB 100 and Y 1281. Three out of
the 15 decamer random primers showed amplification of genomic DNA in 24 individuals. The primers produced a total of
26 bands of which 14 were polymorphic. Proportion of polymorphic bands and gene diversity estimates were 26.92% and
0.09 for Basmati 370, 11.54% and 0.04 for DM 25, 11.54% and 0.05 for IRATOM 24, 7.69% and 0.02 for Binadhan 6 and
23.08% and 0.11 for TNDB 100 whereas Y 1281 cultivar was monomorphic indicating the existence of high level of intra
cultivar genetic variation in Basmati 370 and TNDB, respectively 100. High levels of population differentiation (GST = 0.75)
and low levels of gene flow (Nm = 0.16) estimates across all the loci indicate sufficient existence of genetic variation among
these six cultivars. Low intra cultivar variation and significant differentiation in different cultivar pairs was observed at a
number of loci. Nei’s genetic distances estimated among the different pairs of cultivars were correlated with geographical
distances. The UPGMA dendrogram based on Nei’s genetic distance clubbed the cultivars into three clusters. RAPD
analysis showed promise as an effective tool in estimating genetic polymorphism in different rice cultivars.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทำการสุ่มทดสอบขยาย Polymorphic ดีเอ็นเอ (อาร์เอพีดี) ประเมินโพลิมอร์ฟิซึมพันธุกรรมใน 6 แตกต่างกันข้าว (Oryza ซา L.) พันธุ์ viz. 370 ติก 25 DM, IRATOM 24, Binadhan 6, TNDB 100 และ Y 1281 สามของไพรเมอร์แบบสุ่ม decamer 15 พบขยายของ genomic DNA ในบุคคล 24 ไพรเมอร์ที่ผลิตทั้งหมดวง 26 ที่มี polymorphic ที่ 14 ประเมินสัดส่วน polymorphic วงและความหลากหลายของยีนได้ 26.92% และสำหรับติก 370, 11.54% และสำหรับ DM 25, 11.54% และ 0.05 สำหรับ IRATOM 24, 7.69% และสำหรับ Binadhan 6 0.02 0.04 0.09 และ23.08% และ 0.11 TNDB 100 ในขณะที่ Y 1281 cultivar เป็น monomorphic บ่งชี้อยู่ในระดับสูงภายในความผันแปรทางพันธุกรรม cultivar ใน 370 บาสมาติกและ TNDB, 100 ตามลำดับ ระดับสูงของการสร้างความแตกต่างของประชากร (GST = 0.75)และระดับต่ำสุดของการไหลของยีน (Nm = 0.16) ประเมินข้าม loci ทั้งหมดระบุว่า มีเพียงพอของความผันแปรทางพันธุกรรมระหว่างพันธุ์เหล่านี้หก เปลี่ยนแปลง cultivar อินทราต่ำและสร้างความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในคู่ cultivar ต่าง ๆ ถูกตรวจสอบที่มีจำนวน loci มีระยะห่างทางพันธุกรรมของ Nei ประเมินระหว่างคู่แตกต่างกันของพันธุ์ถูก correlated กับภูมิศาสตร์ระยะทาง Dendrogram UPGMA โดยใช้ระยะห่างทางพันธุกรรมของ Nei รวมพันธุ์ที่เป็นคลัสเตอร์ที่สาม อาร์เอพีดีวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าสัญญาเป็นเครื่องมือมีประสิทธิภาพในการประมาณโพลิมอร์ฟิซึมพันธุกรรมในพันธุ์ข้าวที่แตกต่างกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สุ่มขยาย Polymorphic DNA (RAPD)
ได้ดำเนินการทดสอบเพื่อประเมินความแตกต่างทางพันธุกรรมในหกที่แตกต่างกันข้าว(Oryza sativa L. ) พันธุ์ ได้แก่ บาสมาติก 370 DM 25 IRATOM 24 Binadhan 6 TNDB 100 และ y 1281. สามใน
15 decamer ไพรเมอร์แบบสุ่มแสดงให้เห็นว่าการขยายของดีเอ็นเอใน 24 บุคคล ไพรเมอร์ที่ผลิตทั้งหมด
26 วงดนตรีที่ 14 เป็น polymorphic สัดส่วนของวงดนตรีที่ polymorphic และประมาณการเกี่ยวกับความหลากหลายของยีนเป็น 26.92% และ
0.09 สำหรับบาสมาติก 370, 11.54% และ 0.04 สำหรับ DM 25, 11.54% และ 0.05 สำหรับ IRATOM 24, 7.69% และ 0.02 สำหรับ Binadhan 6 และ
23.08% และ 0.11 สำหรับ TNDB 100 ขณะที่ Y 1281 พันธุ์เป็น monomorphic
แสดงให้เห็นการดำรงอยู่ของระดับสูงของภายในพันธุ์การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในบาสมาติก370 และ TNDB ตามลำดับ 100 ระดับสูงของความแตกต่างของประชากร (GST = 0.75)
และระดับต่ำของการไหลของยีน (นิวตันเมตร = 0.16) ประมาณการในทุกตำแหน่ง
บ่งบอกถึงการดำรงอยู่ที่เพียงพอของการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในหมู่เหล่านี้หกสายพันธุ์ รูปแบบพันธุ์ภายในต่ำและความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในคู่ที่แตกต่างกันพันธุ์พบว่าในจำนวนตำแหน่ง
ระยะทางพันธุกรรม Nei
ประมาณในหมู่คู่ที่แตกต่างของสายพันธุ์ที่มีความสัมพันธ์กับทางภูมิศาสตร์ระยะทาง UPGMA dendrogram ขึ้นอยู่กับระยะทางพันธุกรรมของ Nei พานพันธุ์ออกเป็นสามกลุ่ม RAPD
การวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าสัญญาเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการประมาณความแตกต่างทางพันธุกรรมในพันธุ์ข้าวที่แตกต่างกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Amplified Polymorphic DNA ( RAPD ) โดยทำการประเมินพันธุกรรมความหลากหลายในหกที่แตกต่างกัน
ข้าว ( Oryza sativa L . ) พันธุ์ ได้แก่ Basmati 370 , DM 25 , iratom 24 , binadhan 6 , tndb 100 Y 1189 . ทั้งสามออกจาก
15 decamer ไพรเมอร์แบบสุ่มพบว่าดีเอ็นเอใน 24 คน ไพรเมอร์ที่ผลิตทั้งหมดของ
26 วงดนตรีที่ 14 ที่สร้างความแตกต่างสัดส่วนของกลุ่มที่มีความหลากหลายและประมาณการจำนวน 26.92 %
0.09 สำหรับ Basmati 370 11.54 % และปริมาณ DM 25 11.54 % และ 0.05 24 iratom ที่สุดร้อยละ 0.02 , สำหรับ binadhan 6
23.08% และ 0.11 สำหรับ tndb 100 ในขณะที่ Y 1281 พบว่า monomorphic แสดงการดำรงอยู่ของระดับสูงของภายใน
ของความแปรผันทางพันธุกรรมใน Basmati 370 และ tndb ตามลำดับ 100ระดับความแตกต่างของประชากร ( GST = 0.75 ) และระดับต่ำของการไหลของยีน
( nm = 0.16 ) ประมาณการในสถานะทั้งหมดบ่งชี้ตัวตนที่เพียงพอของการแปรผันทางพันธุกรรมระหว่าง
6 พันธุ์ ต่ำและความแตกต่างในการเปลี่ยนแปลงที่สำคัญภายในพันธุ์พันธุ์ที่แตกต่างกันพบว่าคู่ที่
จำนวน loci .เนยเป็นพันธุกรรมระยะทางประมาณระหว่างคู่ที่แตกต่างกันของพันธุ์มีความสัมพันธ์กับระยะทางภูมิศาสตร์

มีความแตกต่างทางพันธุกรรมจากเนยก็จับเป็นระยะทางพันธุกรรมพันธุ์ออกเป็น 3 กลุ่ม การวิเคราะห์ RAPD
มีสัญญาเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในการประเมินทางพันธุกรรมความหลากหลายในสายพันธุ์ข้าวต่างๆ