The divergences among ompA, csuE an

The divergences among ompA, csuE and blaOXA-51-like allelic
sequences of CC113/79, CC103/15, CC110/25, CC109/1 and CC118/2 isolates were assessed with Clustal V multiple alignment with MegAlign
tool of the Lasergene software package (DNAStar, Inc., Madison, WI).
Primers described in Table 2 were designed to yield different combinations of PCR amplicon sizes and assign isolates of each of the five CC into
a distinct profile group. Expected amplicon sizes were determined by
in silico analysis with the multiple alignment tool of the Lasergene's
SeqMan software.
Primer properties such as Tm, CG content, dimer and hairpin formation were analyzed with Oligocalc and autodimer (Kibbe, 2007; Vallone
and Butler, 2004). In addition, the potential primer target availability
under PCR conditions was assessed with the mfold web server (Zuker,
2003).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Divergences ompA, csuE และ blaOXA 51-เหมือน allelicลำดับของ CC113/79, CC103 15, CC110/25, CC109/1 และ CC118/2 แยกถูกประเมิน ด้วย Clustal V MegAlign หลายแนวเครื่องมือแพคเกจซอฟต์แวร์ Lasergene (DNAStar, Inc. เมดิสัน WI)ออกแบบมาเพื่อให้ผลแตกต่างของขนาด PCR amplicon และกำหนดแยกของแต่ละ CC ห้าเป็นไพรเมอร์ที่อธิบายไว้ในตารางที่ 2กลุ่มโพรไฟล์ที่แตกต่างกัน ขนาด amplicon คาดว่าจะดำเนินการโดยในรูปดอกไม้วิเคราะห์ด้วยเครื่องมือจัดตำแหน่งหลายของของ Lasergeneซอฟต์แวร์ SeqManคุณสมบัติรองพื้นเช่น Tm เนื้อหา CG, dimer และกิ๊บก่อถูกวิเคราะห์ ด้วย Oligocalc และ autodimer (Kibbe, 2007 Valloneและพ่อ บ้าน 2004) นอกจากนี้ ที่รองพื้นเป้าหมายกับที่ว่างภายใต้เงื่อนไข PCR ได้รับการประเมินกับเว็บเซิร์ฟเวอร์ mfold (Zuker2003)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความแตกต่างในหมู่ ompa, csuE และ blaOXA-51 เหมือน allelic
ลำดับของ CC113 / 79, CC103 / 15, CC110 / 25, CC109 / 1 และ CC118 / 2 สายพันธุ์ที่ถูกประเมินด้วย Clustal V จัดตำแหน่งหลายกับ MegAlign
เครื่องมือของแพคเกจซอฟต์แวร์ Lasergene (DNAStar, Inc, Madison, WI).
ไพรเมอร์ที่ระบุไว้ในตารางที่ 2 ได้รับการออกแบบเพื่อให้แตกต่างกันของ PCR ขนาด amplicon และกำหนดสายพันธุ์ของแต่ละห้า CC เข้าไปใน
กลุ่มรายละเอียดที่แตกต่างกัน คาดว่าขนาด amplicon ได้รับการพิจารณาโดย
ในการวิเคราะห์ silico ด้วยเครื่องมือการจัดตำแหน่งหลายของ Lasergene ของ
ซอฟแวร์ SeqMan.
คุณสมบัติรองพื้นเช่น Tm เนื้อหา CG, dimer และการก่อตัวกิ๊บถูกวิเคราะห์ด้วย Oligocalc และ autodimer (Kibbe 2007; Vallone
และบัตเลอร์, 2004) . นอกจากนี้การมีเป้าหมายไพรเมอร์ที่อาจเกิดขึ้น
ภายใต้เงื่อนไขที่ได้รับการประเมิน PCR กับเว็บ mfold เซิร์ฟเวอร์ (Zuker,
2003)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีความแตกต่างระหว่างสูงสุดและ csue blaoxa-51-like ยาฆ่าแมลง ,ลำดับของ cc113 / 79 , cc103 / 15 , cc110 / 25 , cc109 / 1 และ cc118 / 2 ไอโซเลทถูกประเมินด้วย clustal V หลาย สอดคล้องกับ megalignเครื่องมือของ lasergene แพคเกจซอฟต์แวร์ ( dnastar , อิงค์ , Madison , WI )ไพรเมอร์ที่อธิบายไว้ในตารางที่ 2 ถูกออกแบบมาเพื่อให้ผลที่แตกต่างกันขนาดและสายพันธุ์ของเชื้อ และมอบหมายให้แต่ละของห้าซีซีเป็นกลุ่มข้อมูลที่แตกต่างกัน และถูกกำหนดโดยคาดว่าขนาดในการวิเคราะห์ด้วยเครื่องมือหลายนแนวของ lasergeneseqman ซอฟต์แวร์รองพื้น คุณสมบัติเช่น TM , CG เนื้อหาไดเมอร์และการวิเคราะห์ด้วย oligocalc ปิ่น และ autodimer ( kibbe , 2007 ; valloneและพ่อบ้าน , 2004 ) นอกจากนี้ ศักยภาพความพร้อมเช่นเป้าหมายภายใต้เงื่อนไขซึ่งประเมินด้วย mfold เว็บเซิร์ฟเวอร์ ซูเคอร์ ( ,2003 )