2.4. Molecular approaches for guava

2.4. Molecular approaches for guava improvement
Guava breeding through conventional approaches is a long term and cumbersome process that relies on the arbitrary rearrangement of existing genes between two closely related parent plants. The combination of morpho-agronomic characters and DNA molecular markers constituted a novel tool of great utility to characterize guava germplasm, estimate diversity level and parentage relationship among accessions, and also to recom- mend genotypes with conservation and breeding potential. Clonal identifications are traditionally based on various morphological characters; however, morphological characters may not be reli- able attribute to discriminate between the closely related guava genotypes (Chandra et al., 2005b). Being a cross-pollinated species, substantial variability exists in seedling populations grown in dif- ferent regions (Srivastava, 2005). High heterozygosis could be a merit if stringent selection is made and selected plants could be used as parents for future breeding programs. Most of the cultivars grown on a commercial scale are seedling selections from the well- known parent cultivars (Jaiswal and Amin, 1992). A close genetic relationship among cultivars, somatic mutations, and changes due to environmental alterations can create problems in correct iden- tification of germplasm. Genetic engineering has now opened up new possibilities by allowing the transfer of individual genes within or across species and compliments the classical breeding approaches. Molecular markers are the main working tools for genomics surveys. With the development and availability of an array of molecular markers and dense molecular genetics maps in crop plants, marker assisted selection has become possible for traits both governed by major genes as well as quantitative trait loci (QTLs) (Babu et al., 2004). DNA markers are the predomi- nant types of genetic markers for marker assisted breeding (MAB). Each type of markers has advantages and disadvantages for spe- cific purposes. In recent years, different molecular markers (RAPD, RFLP, AFLP, SSRs, ISSR, and VNTRS) have been employed for the investigation of cultivar origin and taxonomic relationship of several plant species (Schlotterer, 2004; Schulman, 2007; Bernardo, 2008; Arif et al., 2011; Abdel-Mawgood, 2012). These molecular techniques have been widely used to monitor differences in DNA sequence in and among species. They also allow the creation of new sources of genetic variation by introducing new and desirable traits from wild varieties into elite lines. While restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers have been the basis for most genetic work in crop plants, amplified fragment length polymorphism (AFLPs) and simple sequence repeats (SSRs) are currently the most popular techniques used due to ease in detection and automation. The adoption of the new marker system, single-nucleotide polymorphisms (SNPs), is now highly preferred, with the increas- ing amount of sequence information, and the determination of gene function due to genomic research. Relatively speaking, SSRs have most of the desirable features and thus are the current marker of choice for many crops. SNPs require more detailed knowledge of the specific, single nucleotide DNA changes responsible for genetic variation among individuals. However, more and more SNPs have become available in many species, and thus they are also considered an important type for marker-assisted breeding (Ribaut et al., 2010; Correia et al., 2011; Faria et al., 2011). Some of the impor- tant achievements made in guava through molecular approaches are presented in Table 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.4 แนวทางที่โมเลกุลปรับปรุงฝรั่งGuava breeding through conventional approaches is a long term and cumbersome process that relies on the arbitrary rearrangement of existing genes between two closely related parent plants. The combination of morpho-agronomic characters and DNA molecular markers constituted a novel tool of great utility to characterize guava germplasm, estimate diversity level and parentage relationship among accessions, and also to recom- mend genotypes with conservation and breeding potential. Clonal identifications are traditionally based on various morphological characters; however, morphological characters may not be reli- able attribute to discriminate between the closely related guava genotypes (Chandra et al., 2005b). Being a cross-pollinated species, substantial variability exists in seedling populations grown in dif- ferent regions (Srivastava, 2005). High heterozygosis could be a merit if stringent selection is made and selected plants could be used as parents for future breeding programs. Most of the cultivars grown on a commercial scale are seedling selections from the well- known parent cultivars (Jaiswal and Amin, 1992). A close genetic relationship among cultivars, somatic mutations, and changes due to environmental alterations can create problems in correct iden- tification of germplasm. Genetic engineering has now opened up new possibilities by allowing the transfer of individual genes within or across species and compliments the classical breeding approaches. Molecular markers are the main working tools for genomics surveys. With the development and availability of an array of molecular markers and dense molecular genetics maps in crop plants, marker assisted selection has become possible for traits both governed by major genes as well as quantitative trait loci (QTLs) (Babu et al., 2004). DNA markers are the predomi- nant types of genetic markers for marker assisted breeding (MAB). Each type of markers has advantages and disadvantages for spe- cific purposes. In recent years, different molecular markers (RAPD, RFLP, AFLP, SSRs, ISSR, and VNTRS) have been employed for the investigation of cultivar origin and taxonomic relationship of several plant species (Schlotterer, 2004; Schulman, 2007; Bernardo, 2008; Arif et al., 2011; Abdel-Mawgood, 2012). These molecular techniques have been widely used to monitor differences in DNA sequence in and among species. They also allow the creation of new sources of genetic variation by introducing new and desirable traits from wild varieties into elite lines. While restriction fragment length polymorphism (RFLP) markers have been the basis for most genetic work in crop plants, amplified fragment length polymorphism (AFLPs) and simple sequence repeats (SSRs) are currently the most popular techniques used due to ease in detection and automation. The adoption of the new marker system, single-nucleotide polymorphisms (SNPs), is now highly preferred, with the increas- ing amount of sequence information, and the determination of gene function due to genomic research. Relatively speaking, SSRs have most of the desirable features and thus are the current marker of choice for many crops. SNPs require more detailed knowledge of the specific, single nucleotide DNA changes responsible for genetic variation among individuals. However, more and more SNPs have become available in many species, and thus they are also considered an important type for marker-assisted breeding (Ribaut et al., 2010; Correia et al., 2011; Faria et al., 2011). Some of the impor- tant achievements made in guava through molecular approaches are presented in Table 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 วิธีโมเลกุลในการปรับปรุงฝรั่ง
ฝรั่งพันธุ์ผ่านวิธีการแบบเดิมเป็นระยะยาวและขั้นตอนที่ยุ่งยากที่อาศัยการปรับปรุงใหม่โดยพลการของยีนที่มีอยู่ระหว่างสองเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดพืชปกครอง การรวมกันของตัวละคร Morpho-ทางการเกษตรและเครื่องหมายโมเลกุลดีเอ็นเอประกอบด้วยเครื่องมือนวนิยายของสาธารณูปโภคที่ดีที่จะอธิบายลักษณะพันธุกรรมฝรั่งประเมินระดับความหลากหลายและความสัมพันธ์ในหมู่สายบิดามารดาและยังแนะซ่อมยีนกับการอนุรักษ์และศักยภาพในการเพาะพันธุ์ ระบุ Clonal จะขึ้นอยู่แบบดั้งเดิมในลักษณะทางสัณฐานวิทยาต่างๆ แต่ลักษณะทางสัณฐานวิทยาอาจจะไม่สามารถ reli- แอตทริบิวต์ที่จะแยกแยะระหว่างยีนฝรั่งเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด (จันทรา et al., 2005b) เป็นสายพันธุ์ข้ามเรณูแปรปรวนอย่างมีนัยสำคัญที่มีอยู่ในประชากรของต้นกล้าที่ปลูกในพื้นที่ที่แตกต่างกัน (Srivastava 2005) heterozygosis สูงอาจจะเป็นบุญที่เข้มงวดถ้าเลือกทำเลือกและพืชสามารถนำมาใช้เป็นพ่อแม่พันธุ์สำหรับโปรแกรมในอนาคต ส่วนใหญ่เป็นสายพันธุ์ที่ปลูกในเชิงพาณิชย์ได้รับการเลือกจากต้นกล้าพันธุ์ที่รู้จักกันดีของผู้ปกครอง (Jaiswal และอามิน, 1992) ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมใกล้หมู่พันธุ์กลายพันธุ์ร่างกายและการเปลี่ยนแปลงที่เกิดจากการเปลี่ยนแปลงสิ่งแวดล้อมสามารถสร้างปัญหาใน tification iden- ที่ถูกต้องของเชื้อพันธุกรรม พันธุวิศวกรรมได้เปิดตอนนี้ขึ้นเป็นไปได้ใหม่โดยให้การถ่ายโอนของยีนของแต่ละบุคคลภายในหรือข้ามสายพันธุ์และชมเชยวิธีการเพาะพันธุ์คลาสสิก เครื่องหมายโมเลกุลเป็นเครื่องมือหลักในการทำงานฟังก์ชั่นสำหรับการสำรวจ กับการพัฒนาและความพร้อมของอาร์เรย์ของโมเลกุลและพันธุศาสตร์ระดับโมเลกุลหนาแน่นแผนที่ในพืชเครื่องหมายเลือกความช่วยเหลือเป็นไปได้สำหรับลักษณะทั้งควบคุมโดยยีนที่สำคัญเช่นเดียวกับตำแหน่งลักษณะเชิงปริมาณ (QTLs) (นาย et al., 2004) . เครื่องหมายดีเอ็นเอเป็นชนิดที่ nant predomi- ของเครื่องหมายทางพันธุกรรมสำหรับเครื่องหมายช่วยการเพาะพันธุ์ (MAB) ชนิดของตัวบ่งชี้แต่ละคนมีข้อดีและข้อเสียเพื่อวัตถุประสงค์ cific เจาะจง ในปีที่ผ่านเครื่องหมายโมเลกุลที่แตกต่างกัน (RAPD, RFLP, AFLP, SSRs, ISSR และ VNTRS) ได้รับการว่าจ้างเพื่อการตรวจสอบแหล่งกำเนิดของพันธุ์และความสัมพันธ์ของการจัดหมวดหมู่ของพันธุ์พืชหลาย (Schlotterer 2004; Schulman 2007; Bernardo 2008; Arif et al, 2011;. อับเดล-Mawgood 2012) เทคนิคโมเลกุลเหล่านี้ได้ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการตรวจสอบความแตกต่างในลำดับดีเอ็นเอในและระหว่างสายพันธุ์ พวกเขายังช่วยให้การสร้างแหล่งใหม่ของการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมโดยการแนะนำลักษณะใหม่และเป็นที่น่าพอใจจากพันธุ์เข้าไปในป่าสายที่ยอดเยี่ยม ในขณะที่ความแตกต่างส่วนระยะเวลาในการ จำกัด (RFLP) ได้รับเครื่องหมายพื้นฐานสำหรับการทำงานทางพันธุกรรมมากที่สุดในพืช, ส่วนขยายระยะเวลาในหลายรูปแบบ (AFLPs) และลำดับที่เรียบง่ายซ้ำ (SSRs) ปัจจุบันมีเทคนิคที่นิยมใช้มากที่สุดเนื่องจากเพื่อความสะดวกในการตรวจสอบและระบบอัตโนมัติ การยอมรับของระบบเครื่องหมายใหม่หลากหลายเดียวเบื่อหน่าย (SNPs) คือตอนนี้ที่ต้องการอย่างมากกับจำนวนเงินที่ไอเอ็นจี increas- ข้อมูลลำดับและความมุ่งมั่นการทำงานของยีนที่เกิดจากการวิจัยจีโนม ค่อนข้างพูด SSRs มีมากที่สุดของคุณลักษณะที่พึงประสงค์และทำให้มีเครื่องหมายปัจจุบันของทางเลือกสำหรับการปลูกพืชจำนวนมาก SNPs ต้องใช้ความรู้รายละเอียดเพิ่มเติมของเฉพาะดีเอ็นเอเดี่ยวเบื่อหน่ายการเปลี่ยนแปลงผู้รับผิดชอบในการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมในหมู่ประชาชน อย่างไรก็ตาม SNPs มากขึ้นได้กลายเป็นที่มีอยู่ในหลายสายพันธุ์และทำให้พวกเขายังถือเป็นประเภทที่สำคัญสำหรับการเพาะพันธุ์เครื่องหมายช่วย (Ribaut et al, 2010;. Correia et al, 2011;.. Faria et al, 2011) บางส่วนของความสำเร็จที่สำาคัญที่เกิดขึ้นในฝรั่งผ่านวิธีโมเลกุลจะถูกนำเสนอในตารางที่ 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.4 . โมเลกุลแนวทางการปรับปรุงพันธุ์ฝรั่ง
ฝรั่งผ่านแนวทางปกติคือ ในระยะยาว และยุ่งยาก กระบวนการที่ต้องอาศัยการเรียงลำดับโดยพลการของยีนที่มีอยู่ระหว่างสองใกล้ชิดพ่อแม่ พืช การรวมกันของลักษณะ Morpho และเครื่องหมายโมเลกุลดีเอ็นเอจึงเป็นเครื่องมือใหม่ของสาธารณูปโภคที่ดีในลักษณะพันธุ์ฝรั่งการประเมินระดับความหลากหลายและบิดามารดาความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์และยังมี Recom - แก้ไขพันธุ์ กับการอนุรักษ์และปรับปรุงพันธุ์ที่มีศักยภาพ รูปแบบการแสดงตัวของแบบดั้งเดิมตามลักษณะทางสัณฐานวิทยาต่างๆ อย่างไรก็ตาม ลักษณะทางสัณฐานวิทยาอาจไม่สามารถบรรเทาอาการได้คุณลักษณะที่จะแยกแยะระหว่างความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดฝรั่งพันธุ์ ( จันทรา et al . , 2005b )การผสมข้ามชนิดระหว่างประชากรมากมายที่มีอยู่ในต้นกล้าปลูกในระดับภูมิภาค ( - ferent ศรีวัสทวา , 2005 ) heterozygosis สูงอาจเป็นบุญ ถ้าเลือกได้เลือกที่เข้มงวดและพืชที่สามารถใช้เป็นพ่อแม่พันธุ์ สำหรับโปรแกรมในอนาคตที่สุดของพันธุ์ที่ปลูกเพื่อการค้า จะกล้าเลือกจากดี - รู้จักพันธุ์แม่ ( jaiswal และอามิน , 1992 ) ใกล้ชิดความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมระหว่างสายพันธุ์โซมาการกลายพันธุ์ และการเปลี่ยนแปลงเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงสิ่งแวดล้อมสามารถสร้างปัญหาใน tification iden - ถูกต้องของเชื้อพันธุกรรมพันธุวิศวกรรมได้เปิดโอกาสใหม่ โดยให้โอนของยีนแต่ละบุคคลภายในหรือข้ามชนิดและชมเชยคลาสสิกพันธุ์มาแล้ว โมเลกุลเครื่องหมายเป็นหลักทำงานเครื่องมือในการสำรวจ กับการพัฒนาและความพร้อมของอาร์เรย์ของเครื่องหมายระดับโมเลกุลและพันธุศาสตร์โมเลกุลหนาแน่นแผนที่ในพืชพืชเครื่องหมายช่วยเลือกได้กลายเป็นไปได้สำหรับคุณลักษณะทั้งควบคุมโดยยีนหลักรวมทั้งปริมาณของลักษณะ ( ตำแหน่ง ) ( นาย et al . , 2004 ) เครื่องหมายดีเอ็นเอเป็น predomi - อีเมล์ประเภทของเครื่องหมายพันธุกรรมในดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยผสมพันธุ์ ( โมโน ) แต่ละประเภทของเครื่องหมายมีข้อดีและข้อเสียสำหรับเอสพี - cific วัตถุประสงค์ ในปีล่าสุด , เครื่องหมายโมเลกุล RAPD ( RFLP AFLP , ที่แตกต่างกัน , ssrs issr , , ,vntrs ) และมีการใช้สำหรับการตรวจสอบพันธุ์ต้นกำเนิดและความสัมพันธ์ทางอนุกรมวิธานของพืชชนิดต่าง ๆ ( schlotterer , 2004 ; Schulman , 2007 ; Bernardo , 2008 ; เรฟ et al . , 2011 ; เดล mawgood , 2012 ) เทคนิคโมเลกุลเหล่านี้ได้ถูกใช้กันอย่างแพร่หลายในการตรวจสอบความแตกต่างของดีเอ็นเอและลำดับในกลุ่มชนิดพวกเขายังอนุญาตให้สร้างแหล่งใหม่ของความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยการแนะนำคุณลักษณะใหม่และคุณลักษณะจากป่าพันธุ์สายท ในขณะที่การ fragment length polymorphism ( RFLP ) เครื่องหมายมีพื้นฐานทางพันธุกรรมส่วนใหญ่ทำงานในพืชพืชเทคนิค amplified fragment length polymorphism ( aflps ) และลำดับง่ายซ้ำ ( ssrs ) เป็นเทคนิคที่นิยมมากที่สุดใช้เนื่องจากความสะดวกในการตรวจสอบ และระบบอัตโนมัติ การยอมรับระบบพันธุ์เครื่องหมายใหม่ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ( snps ) คือตอนนี้ต้องการอย่างมากกับสินค้า - ing ปริมาณข้อมูลลําดับและการวิเคราะห์หน้าที่ของยีนเนื่องจากการวิจัยจีโนม .ค่อนข้างพูด ssrs มีคุณลักษณะที่พึงประสงค์ และดังนั้นจึง มีปัจจุบันเครื่องหมายของทางเลือกสำหรับหลายพืช snps ต้องการความรู้เพิ่มเติมรายละเอียดของเฉพาะซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ DNA การเปลี่ยนแปลงผู้รับผิดชอบความหลากหลายทางพันธุกรรมของแต่ละบุคคล อย่างไรก็ตาม เพิ่มเติม และเพิ่มเติม snps ได้กลายเป็นใช้ได้หลายชนิดและดังนั้นพวกเขาจะถือว่ายังเป็นประเภทที่สำคัญสำหรับเครื่องหมายช่วยผสมพันธุ์ ( ribaut et al . , 2010 ; Correia et al . , 2011 ; ฟาเรีย et al . , 2011 ) บางส่วนของผลงานที่ทำในฝรั่ง - impor tant โดยวิธีโมเลกุลจะถูกนำเสนอในตารางที่ 1