Between 661,600,411 and 899,700,085

Between 661,600,411 and 899,700,085 genome sequence read pairs where generated for each of the four wheat cultivars (Table 1). Of these, between 4.70% and 3.10% mapped to the group 7/4AL reference as read pairs. As the reference is estimated to cover 14% of the complete genome, the number of mapped reads is less than predicted. This is likely due to many read pairs mapping to multiple locations in this highly repetitive genome and subsequently being ignored due to the SOAP -r 0 option. SGSautoSNP identified a total of 881,289 SNPs across the group 7 chromosomes. These consisted of 68% transitions and 32% transversions. This bias in transition/transversion ratio is commonly observed in SNP discovery and reflects the high degree of methlyl C to U mutation in genomes. It may be expected that the bread wheat genome is highly methylated due to the two rounds of polyploidy and high repeat content. The observed transition/transversion bias provides a level of confidence in SNP prediction accuracy since erroneously called SNPs caused by sequence read errors
or mismapping would be unlikely to display such a bias.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ระหว่าง 661,600,411 และ 899,700,085 จีโนม ลำดับอ่านจับคู่สร้างขึ้นสำหรับแต่ละพันธุ์ข้าวสาลี 4 (ตารางที่ 1) เหล่านี้ ระหว่าง 4.70% และ 3.10% แมปกับการอ้างอิงกลุ่ม 7/4AL เป็นคู่ที่อ่าน เป็นการอ้างอิงคือประมาณ 14% ของจีโนมสมบูรณ์ครอบคลุม จำนวนผู้อ่านแมปจะน้อยกว่าคาดการณ์ นี่คืออาจเนื่องจากหลายคู่อ่านแม็ปตำแหน่งในกลุ่มนี้ซ้ำสูงและต่อมาถูกละเว้นเนื่องจากสบู่ - r เลือก 0 SGSautoSNP ระบุจำนวน 881,289 SNPs ระหว่าง chromosomes กลุ่ม 7 เหล่านี้ประกอบด้วยช่วงการเปลี่ยนภาพและ 32% transversions 68% ความโน้มเอียงนี้เปลี่ยน แปลง/transversion อัตราส่วนโดยทั่วไปสังเกตในค้นพบ SNP และสะท้อนถึงระดับสูงของ methlyl C การกลายพันธุ์ของ U ใน genomes มันอาจจะคาดว่า จีโนมข้าวสาลีขนมปังสูง methylated เนื่องจากรอบสูง และ polyploidy เนื้อหาซ้ำสอง อคติ transversion สังเกตเปลี่ยนให้ระดับความเชื่อมั่นในความแม่นยำทำนาย SNP ตั้งแต่ตั้งใจเรียกว่า SNPs ที่เกิดจากลำดับอ่านข้อผิดพลาดหรือ mismapping จะไม่แสดงอคติดังกล่าว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระหว่าง 661600411 และลำดับจีโนม 899700085 อ่านคู่ที่สร้างขึ้นสำหรับแต่ละสี่สายพันธุ์ข้าวสาลี (ตารางที่ 1) เหล่านี้ระหว่าง 4.70% และ 3.10% แมปไปยังกลุ่ม 7 / อ้างอิง 4AL เป็นคู่อ่าน เป็นข้อมูลอ้างอิงที่คาดว่าจะครอบคลุม 14% ของจีโนมที่สมบูรณ์จำนวนแมปอ่านน้อยกว่าที่คาดการณ์ไว้ นี้น่าจะเกิดจากการอ่านหลายคู่ทำแผนที่ไปยังสถานที่หลายแห่งในจีโนมนี้ซ้ำ ๆ อย่างมากและต่อมาถูกละเลยเนื่องจากสบู่ -r 0 ตัวเลือก SGSautoSNP ระบุทั้งหมด 881,289 SNPs ข้ามกลุ่ม 7 โครโมโซม เหล่านี้ประกอบไปด้วย 68% การเปลี่ยนและ 32% transversions อคตินี้ในอัตราส่วนการเปลี่ยนแปลง / transversion เป็นที่สังเกตโดยทั่วไปในการค้นพบ SNP และสะท้อนให้เห็นถึงระดับสูงของ methlyl C ถึงการกลายพันธุ์ U ในจีโนม มันอาจจะเป็นที่คาดว่าจีโนมข้าวสาลีขนมปังเป็น methylated สูงเนื่องจากรอบสองของโพลีพลอยและเนื้อหาซ้ำสูง สังเกตการเปลี่ยนแปลง / transversion อคติมีระดับความเชื่อมั่นในความถูกต้องทำนาย SNP ตั้งแต่ SNPs ไม่สมควรเรียกว่าเกิดจากการอ่านลำดับข้อผิดพลาด
หรือ mismapping จะไม่น่าที่จะแสดงผลดังกล่าวทำให้มีความลำเอียง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระหว่าง 661600411 899700085 ลำดับจีโนมและอ่านคู่ที่สร้างขึ้นสำหรับแต่ละสี่ข้าวสาลีพันธุ์ ( ตารางที่ 1 ) ของเหล่านี้ระหว่าง 4.70 % และ 30 % ที่แมปไปยังกลุ่ม 7 / 4al อ้างอิงว่าอ่านคู่ เป็นอ้างอิงประมาณการครอบคลุม 14 % ของจีโนมที่สมบูรณ์ , จํานวนของแมปอ่านน้อยกว่าที่คาดการณ์ไว้นี้น่าจะเกิดจากหลายคู่หลายสถานที่ในการอ่านแผนที่จีโนมสูงซ้ำนี้และต่อมาถูกละเว้น เนื่องจากสบู่ - R 0 ตัวเลือก sgsautosnp ระบุทั้งหมดของ 881289 snps ข้ามกลุ่ม 7 โครโมโซม เหล่านี้ประกอบด้วยการเปลี่ยน 68% และ 32% transversions .อคติในอัตราส่วนการเปลี่ยน / transversion มักพบในการค้นพบ SNP และสะท้อนให้เห็นถึงระดับ methlyl C U การกลายพันธุ์ในจีโนม . มันอาจจะคาดหวังว่า ขนมปังโฮลวีท ( ขอ methylated เนื่องจากสองรอบของการทำซ้ำ และปริมาณสูงสังเกตการเปลี่ยนแปลง / transversion อคติให้ระดับของความมั่นใจในความถูกต้องของการทำนายผลเรียกว่า SNP ตั้งแต่ snps เกิดจากลำดับข้อผิดพลาดอ่าน
หรือ mismapping จะไม่น่าจะแสดงเช่นเส้นทแยง