We combined cDNA amplified fragment

We combined cDNA amplified fragment length polymorphism (cDNA-AFLP) with bulked segregant analysis (BSA) to detect genes that control rice blast (Magnaporthe grisea) resistance in a double-haploid (DH) population derived from a cross between a blast-resistant variety, Zhai Ye Qing8 (ZYQ8), and a blast-susceptible variety, Jin Xi17 (JX17). In cDNA-AFLP analysis between a blast resistance (R) pool and a blast susceptibility (S) pool from the DH population, 12 transcript-derived fragments (TDFs) that were present in only one of the two pools were detected, 8 of which were from the R pool and 4 from the S pool. Mapping analysis of these TDFs by using the DH mapping population showed that five of them, R1, R8, S9, S16 and S17, were located on chromosome 1. Sequence comparison and allelic analysis showed thatR1/S16 and R8/S9 were two pairs of allelic genes. The full-length cDNA sequences of R1/S16, S17 and R8/S were obtained through cDNA library screening, in which only the expression level of R8 cDNA was up-regulated by inoculation with the blast isolate zh10814 and not affected by mock treatment, suggesting that R8 was implicated in the signaling pathways of the rice blast resistance reaction. Protein function prediction showed that R8 cDNA encodes a protein with high identity to a putative calmodulin-binding protein in Arabidopsis thaliana which belongs to the P-loop-containing nucleotide triphosphate hydrolases superfamily that contains a number of various kinases

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เรารวม cDNA ที่ขยายส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (cDNA AFLP) กับ bulked segregant วิเคราะห์ (บีเอสเอ) เพื่อตรวจหายีนที่ควบคุมความต้านทานต่อการระเบิด (Magnaporthe grisea) ข้าวในประชากร double haploid (DH) มาข้ามระหว่างหลายระเบิดทน Zhai เย Qing8 (ZYQ8), และไวต่อระเบิด จิ Xi17 (JX17) ในการวิเคราะห์ cDNA AFLP ระหว่างการระเบิดความต้านทาน (R) สระว่ายน้ำและสระภูมิไวรับ (S) ระเบิดจากประชากร DH, 12 มาเสียงบรรยายการกระจายตัว (TDFs) ที่อยู่ในเดียวสระสอง พบ 8 ที่ขึ้นจากสระ R และ 4 สระ S วิเคราะห์การแม็ป TDFs เหล่านี้โดยใช้ประชากรแม็ป DH แสดงให้เห็นว่า ห้าของพวกเขา R1, R8, S9, S16 และ S17 ที่อยู่บนโครโมโซม 1 ลำดับเปรียบเทียบและวิเคราะห์ allelic พบ thatR1/S16 และ R8/S9 ได้สองคู่ของยีน allelic CDNA จัดลำดับของ R1/S16, S17 และ R8/S ได้รับผ่านการคัดกรองห้องสมุด cDNA ซึ่งเฉพาะระดับนิพจน์ของ R8 cDNA ถูกตั้งระเบียบ โดย inoculation กับระเบิดแยก zh10814 และไม่มีผลกระทบ โดยจำลองการรักษา การแนะนำว่า R8 เกี่ยวข้องในมนต์ signaling ของปฏิกิริยาต้านทานระเบิดข้าว คาดเดาฟังก์ชันของโปรตีนพบว่า R8 cDNA จแมปโปรตีนกับโปรตีน calmodulin ผูกเป็น putative Arabidopsis thaliana ซึ่งอยู่ที่ P-ห่วงประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์โนซีนไตรฟอสเฟต hydrolases superfamily ที่ประกอบด้วยจำนวน kinases ต่างๆ ฐานสูง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เรารวม cDNA ขยายความแตกต่างความยาวส่วน (cDNA-AFLP) ที่มีการวิเคราะห์ segregant มีเนื้อมีหนัง (BSA) เพื่อตรวจหายีนที่ไหม้ของข้าวควบคุม (Magnaporthe grisea) ความต้านทานในสองครั้งที่เดี่ยว (เอช) ประชากรที่ได้มาจากการผสมผสานกันระหว่างความหลากหลายระเบิดทน , Zhai เจ้า Qing8 (ZYQ8) และความหลากหลายระเบิดไวต่อจิน Xi17 (JX17) ในการวิเคราะห์ยีน-AFLP ระหว่างต้านทานระเบิด (R) สระว่ายน้ำและความไวต่อการระเบิด (S) สระว่ายน้ำจากประชากร DH 12 ชิ้นส่วนหลักฐานที่ได้มาจาก (TDFs) ที่มีอยู่ในเพียงหนึ่งในสองสระว่ายน้ำได้รับการตรวจพบ 8 ซึ่ง มาจากสระว่ายน้ำและ R 4 จากสระว่ายน้ำ S การวิเคราะห์การทำแผนที่ของ TDFs เหล่านี้โดยใช้การทำแผนที่ประชากร DH แสดงให้เห็นว่าห้าของพวกเขา, R1, R8, S9, S16 และ S17, ตั้งอยู่บนโครโมโซม 1. การเปรียบเทียบลำดับและการวิเคราะห์แสดงให้เห็น allelic thatR1 / S16 และ R8 / S9 สองคู่ ยีน allelic ยีนยาวเต็มรูปแบบลำดับของ R1 / S16, S17 และ R8 / S ที่ได้รับผ่านการคัดกรองห้องสมุด cDNA ซึ่งใน แต่ระดับการแสดงออกของยีน R8 ขึ้นการควบคุมโดยการฉีดวัคซีนที่มีการระเบิดแยก zh10814 และไม่ได้รับผลกระทบจากการรักษาจำลอง บอกว่า R8 มีส่วนเกี่ยวข้องในเส้นทางการส่งสัญญาณของการเกิดปฏิกิริยาต้านทานระเบิดข้าว โปรตีนทำนายฟังก์ชั่นแสดงให้เห็นว่า R8 ยีน encodes โปรตีนที่มีตัวตนสูงกับโปรตีนสมมุติผูกพัน calmodulin ใน Arabidopsis thaliana ซึ่งเป็น P-วงที่มี triphosphate เบื่อหน่าย hydrolases superfamily ที่มีจำนวนของไคเนสส์ต่างๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรารวมดีเอ็นเอ amplified fragment length polymorphism ( cDNA การวิเคราะห์ AFLP ) ยก segregant ( BSA ) เพื่อตรวจหายีนที่ควบคุมระเบิดข้าว ( magnaporthe นาน 2 ชั่วโมง ) ความต้านทานในดับเบิลแฮพลอยด์ ( DH ) ประชากรที่มาจากข้ามระหว่างระเบิดกันหลากหลาย ไจ๋ ท่าน qing8 ( zyq8 ) และระเบิด xi17 ( พันธุ์อ่อนแอ จิน jx17 )เทคนิคในการวิเคราะห์ดีเอ็นเอระหว่างระเบิดความต้านทาน ( R ) สระว่ายน้ำและระเบิดกลุ่ม ( s ) สระจาก DH จำนวน 12 ใบและเศษ ( tdfs ) ที่มีอยู่ในเพียงหนึ่งประเภทสองพบ 8 ซึ่งได้จาก R Pool และ 4 จาก S สระ การวิเคราะห์แผนที่ tdfs เหล่านี้โดยใช้ DH แผนที่ประชากร พบว่า ห้าของพวกเขา , R1 , R8 S9 s16 s17 , , และ ,ตั้งอยู่บนโครโมโซม 1 การเปรียบเทียบลำดับและการวิเคราะห์ยาฆ่าแมลง พบ thatr1 / R8 / S9 และ s16 เป็น allelic ยีน 2 คู่ การลำดับยีนแบบเต็มตัวของ R1 / s16 s17 R8 / s , และได้ผ่านการคัดกรองห้องสมุด cDNA ซึ่งในการแสดงออกของยีนในระดับเพียง R8 สามารถโดยการแยก zh10814 ระเบิด และไม่ได้รับผลกระทบจากการเยาะเย้ยแนะนำว่าเข้าถูกพาดพิงในการส่งสัญญาณทางข้าวต้านทานระเบิดปฏิกิริยา การทำนายฟังก์ชันโปรตีน พบว่า ยีน encodes R8 โปรตีนที่มีตัวตนสูงเพื่อการแสดงออกคาลโมดูลินโปรตีนใน Arabidopsis thaliana ซึ่งเป็นของ p-loop-containing นิวคลีโอไทด์ ไตรฟอสเฟตไฮโดรเลสซูเปอร์แฟมิลีว่ามีจำนวนของยาต่าง ๆ