Automated DNA sequencing electrophe

Automated DNA sequencing electropherograms were proofed
and edited using CodonCode Aligner v. 1.6.3. Sequences were truncated
to include only the ITS2 region. The DNA sequences from Gen-
Bank were annotated and trimmed using ITS2 annotation tools
based on Hidden Markov Model (HMM) (Keller et al., 2009). Sequences
of plant samples were aligned with those from GenBank
by ClustalX software and the genetic distances were calculated
using Kimura 2-Parameter (K2P) model. The distributions of intraversus
inter-specific variability were compared using DNA barcoding
gap with the software TAXON DNA (Slabbinck et al., 2008). Wilcoxon
signed-rank tests were performed as previously described
(Yao et al., 2010) (Table 1). Moreover, BLAST 1 and the nearest distance
method were used to test the power of species identification
as described previously (Yao et al., 2010).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Electropherograms ลำดับดีเอ็นเออัตโนมัติได้เตรียมและแก้ไขใช้ CodonCode Aligner v. 1.6.3 ลำดับถูกตัดรวมเฉพาะภูมิภาค ITS2 ลำดับดีเอ็นเอจาก Gen-ธนาคารมีการใส่คำอธิบายประกอบ และตัดโดยใช้เครื่องมือคำอธิบาย ITS2ใช้บนซ่อน Markov รุ่น (HMM) (เคลเลอร์ et al., 2009) ลำดับของโรงงาน ตัวอย่างสอดคล้องกับจาก GenBankโดย ClustalX ซอฟต์แวร์และระยะทางพันธุกรรมมีคำนวณโดยใช้แบบจำลอง (K2P) 2-พารามิเตอร์คิมุระโย การกระจายของ intraversusความแปรผันระหว่างการถูกเปรียบเทียบโดยใช้ซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอช่องว่างกับซอฟต์แวร์ TAXON DNA (Slabbinck et al., 2008) Wilcoxonทดสอบอันดับลงนามได้ดำเนินการอธิบายไว้ก่อนหน้านี้เป็น(ยาว et al., 2010) (ตาราง 1) นอกจากนี้ ระเบิด 1 และระยะที่ใกล้ที่สุดใช้วิธีการทดสอบอำนาจของรหัสชนิดตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (ยาว et al., 2010)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อัตโนมัติ electropherograms
ลำดับดีเอ็นเอถูกปลอดภัยและแก้ไขการใช้CodonCode Aligner v. 1.6.3 ลำดับที่ถูกตัดทอนรวมเฉพาะภูมิภาค ITS2
ลำดับดีเอ็นเอจาก Gen-
ธนาคารถูกข้อเขียนและตัดการใช้เครื่องมือบันทึกย่อ ITS2
ขึ้นอยู่กับรุ่นที่ซ่อนมาร์คอฟ (HMM) (เคลเลอร์ et al., 2009) ลำดับของตัวอย่างพืชที่ถูกจัดชิดกับผู้ที่มาจาก GenBank โดยซอฟต์แวร์ ClustalX และระยะทางพันธุกรรมจะถูกคำนวณโดยใช้คิมูระ2 พารามิเตอร์ (K2P) รูปแบบ การกระจายของ intraversus แปรปรวนระหว่างที่เฉพาะเจาะจงเปรียบเทียบดีเอ็นเอบาร์โค้ดโดยใช้ช่องว่างกับซอฟต์แวร์แท็กซอนดีเอ็นเอ (Slabbinck et al., 2008) Wilcoxon ทดสอบลงนามยศได้ดำเนินการตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้(ยาว et al., 2010) (ตารางที่ 1) นอกจากนี้ระเบิดที่ 1 และระยะที่ใกล้ที่สุดวิธีการที่ใช้ในการทดสอบพลังของประชาชนชนิดตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้(ยาว et al., 2010)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ดีเอ็นเอลำดับอัตโนมัติ electropherograms อยู่ในห้อง
และแก้ไขโดยใช้ codoncode อยู่ที่โวลต์คุณสมบัติ . ลำดับถูกตัดทอน
รวมเฉพาะ its2 ภูมิภาค ดีเอ็นเอลำดับจาก Gen -
ธนาคารได้บันทึกย่อและตัดการใช้เครื่องมือบันทึกย่อ its2
บนพื้นฐานของฮิดเดนมาร์คอฟโมเดล ( อืม ) ( เคลเลอร์ et al . , 2009 ) ลำดับ
ของตัวอย่างพืชชิดกับเหล่านั้นจาก 5%
โดยซอฟต์แวร์ clustalx และความแตกต่างทางพันธุกรรมได้
ใช้คิมูระสอง ( k2p ) นางแบบ การแจกแจงของ intraversus
อินเตอร์เฉพาะการเปรียบเทียบโดยใช้ดีเอ็นเอ barcoding
ช่องว่างกับซอฟต์แวร์ชนิดดีเอ็นเอ ( สเล็บบิ้ง et al . , 2008 ) การทดสอบ Wilcoxon
เซ็นอันดับมีการปฏิบัติตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
( เย้า et al . , 2010 ) ( ตารางที่ 1 ) นอกจากนี้ ระเบิด 1
ระยะทางที่ใกล้ที่สุดวิธีที่ใช้ในการทดสอบพลังของสปีชีส์การจำแนก
ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( เย้า et al . , 2010 )