Example 14. Optimization of ฮิวเมไนซ์ antibodies
10 Optimization of ฮิวเมไนซ์ 20E5 antibodies.
HCDR2 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs (VH) 20E5_VH1,
20E5 VH2 and 20E5_VH3 contain an isomerization motif at VH residue positions 56-57 (DG, D56G57). To test the effect of substitutions at position 56, the aspartate
(D) residue คือ mutated to glycine (G), alanine (A), serine (S) หรือ glutamate (E),.
15 HCDR3 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 20E5_VH1, 20E5 VH2
and 20E5_VH3 contain a เมไธโอนีน (M) at position 106 (M106). The เมไธโอนีน คือ likely buried to a large extent, however, to reduce oxidation risk, the เมไธโอนีน at position 106 คือ mutated to leucine (L) หรือ isoleucine (I).
Position 11 in the ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 20E5_VH1,
20 20E5_VH2 and 20E5_VH3 contain a valine (V). Substitutions at this position may
have a structural impact on the antibody and hence its function (Klein et al mAbs 5:22-33, 2013). To test the effect of substitutions at position 11, the valine (V)
residue คือ mutated to leucine (L).
The mutations are incorporated to each บริเวณ แปรผัน สายหนัก
5 20E5_VH1, 20E5_VH2 and 20E5_VH3 using standard methods. The mutant
HCDR2 sequences are shown in Table 4 and the mutant HCDR3 sequences are
shown in Table 5. Optimized ฮิวเมไนซ์ 20E5 variable regions containing single
substitutions are shown in Table 6. Alignment of the parental and optimized VH
regions คือ shown in รูป 43A and รูป 43B. The names of the optimized VH 10 regions indicate the parental VH and the substitution made. Additional optimized
variable regions can be generated by making substitutions simultaneously at
positions 11, 56 and/or 106 using standard methods.
The resulting VH regions are paired with the บริเวณ แปรผัน สายเบาs
20E5_VL1 หรือ 20E5 VL2 and the resulting antibodies are expressed as IgG4/x using 15 standard methods. The antibodies are tested for their binding to CD134 using
ELISA according to protocol described in Example 11A. The antibodies are further
tested for their ability to induce การเพิ่มจำนวน of Teff cells and dampen the
inhibitory effect of Tregs on Teff การเพิ่มจำนวน using the protocols described in
Example 13. The antibodies having comparable properties than the parental
20 ฮิวเมไนซ์ 20E5 antibodies are selected for further studies.
Optimization of ฮิวเมไนซ์ 12H3 antibodies.
HCDR2 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs (VI-1) 12H3_VH1,
12H3_VH2 and 12H3 V113 contain a deamidation motif (NNG) at residues 54-56
(N54N55G56). To minimize deamidation risk, asparagine at position 55 (N55) คือ 5 mutated to glutamine (Q), alanine (A) หรือ glutamate (E).
HCDR3 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 12H3_VH1, 12H3_VH2 and 12H3_VH3 contain a เมไธโอนีน (M) at position 99 (M99). The เมไธโอนีน คือ likely buried to a large extent, however, to reduce oxidation risk, the เมไธโอนีน at position 99 คือ mutated to leucine (L) หรือ isoleucine (I).
10 Position 11 in the ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 12H3_VH1,
12H3_VH2 and 12H3_VH3 contain a valine (V). Substitutions at this position may have a structural impact on the antibody and hence its function (Klein et al mAbs 5:22-33, 2013). To test the effect of substitutions at position 11, the valine (V)
residue คือ mutated to leucine (L).
15 The mutations are incorporated to each บริเวณ แปรผัน สายหนัก
12H3 VH1, 12H3 V112 and 12H3_VH3 using standard methods. The mutant
HCDR2 sequences are shown in Table 7 and the mutant HCDR3 sequences are
shown in Table 8. Optimized ฮิวเมไนซ์ 12H3 variable regions containing single
substitutions are shown in Table 9. Alignment of the parental and optimized VH 20 regions are shown in รูป 44. The names of the optimized VH regions indicate
the parental VH and the substitution made. Additional optimized variable regions
can be generated by making substitutions simultaneously at positions 11, 55 and/or
99 using standard methods.
The resulting VH regions are paired with the บริเวณ แปรผัน สายเบาs
25 12H3_VL1 หรือ 12H3 VL2 and the resulting antibodies are expressed as IgG4/ic using
standard methods. The antibodies are tested for their binding to CD134 using
ELISA according to protocol described in Example 11A. The antibodies are further
tested for their ability to induce การเพิ่มจำนวน of Teff cells and dampen the
inhibitory effect of Tregs on Teff การเพิ่มจำนวน using the protocols described in
30 Example 13. The antibodies having comparable properties than the parental
ฮิวเมไนซ์ 12H3 antibodies are selected for further studies
ตัวอย่างที่ 14 เพิ่มประสิทธิภาพของแอนตี้ฮิวเมไนซ์การเพิ่มประสิทธิภาพของแอนตี้ 20E5 ฮิวเมไนซ์ 10HCDR2 ฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผัน สายหนักs (VH) 20E5_VH120E5 VH2 และ 20E5_VH3 ประกอบด้วยการ isomerization แปลนที่ตำแหน่งตกค้าง VH 56-57 (กิจ D56G57) การทดสอบผลของการทดแทนที่ตำแหน่ง 56, aspartate(D) สารตกค้างคือกลายไป glycine (G), อะลานีน (A), glutamate แถ (S) หรือ (E),HCDR3 15 ของฮิวเมไนซ์ 20E5_VH1 สายหนักs บริเวณแปรผัน 20E5 VH2และ 20E5_VH3 ประกอบด้วยเมไธโอนีน (M) ที่ตำแหน่ง 106 (M106) คือเมไธโอนีนอาจจะฝังไปใหญ่ขอบเขต อย่างไรก็ตาม เพื่อลดความเสี่ยงของการเกิดออกซิเดชัน เมไธโอนีนที่ตำแหน่ง 106 คือกลายไป leucine (L) หรือ isoleucine (I)ตำแหน่ง 11 20E5_VH1 สายหนักs แปรผันของบริเวณฮิวเมไนซ์20 20E5_VH2 และ 20E5_VH3 ประกอบด้วยวาลีน (V) แทนที่ตำแหน่งนี้อาจมีผลกระทบต่อโครงสร้างแอนติบอดีที่ และดังนั้นฟังก์ชันของ (Klein et al mAbs 5:22-33, 2013) การทดสอบผลของการทดแทนที่ตำแหน่ง 11 วาลีน (V) สารตกค้างคือกลายไป leucine (L)การกลายพันธุ์อยู่รวมกับสายหนักแปรผันแต่ละบริเวณ5 20E5_VH1, 20E5_VH2 and 20E5_VH3 using standard methods. The mutantHCDR2 sequences are shown in Table 4 and the mutant HCDR3 sequences areshown in Table 5. Optimized ฮิวเมไนซ์ 20E5 variable regions containing single substitutions are shown in Table 6. Alignment of the parental and optimized VH regions คือ shown in รูป 43A and รูป 43B. The names of the optimized VH 10 regions indicate the parental VH and the substitution made. Additional optimized variable regions can be generated by making substitutions simultaneously at positions 11, 56 and/or 106 using standard methods.The resulting VH regions are paired with the บริเวณ แปรผัน สายเบาs20E5_VL1 หรือ 20E5 VL2 and the resulting antibodies are expressed as IgG4/x using 15 standard methods. The antibodies are tested for their binding to CD134 using ELISA according to protocol described in Example 11A. The antibodies are further tested for their ability to induce การเพิ่มจำนวน of Teff cells and dampen the inhibitory effect of Tregs on Teff การเพิ่มจำนวน using the protocols described in Example 13. The antibodies having comparable properties than the parental20 ฮิวเมไนซ์ 20E5 antibodies are selected for further studies.Optimization of ฮิวเมไนซ์ 12H3 antibodies.HCDR2 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs (VI-1) 12H3_VH1,12H3_VH2 and 12H3 V113 contain a deamidation motif (NNG) at residues 54-56 (N54N55G56). To minimize deamidation risk, asparagine at position 55 (N55) คือ 5 mutated to glutamine (Q), alanine (A) หรือ glutamate (E).HCDR3 of ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 12H3_VH1, 12H3_VH2 and 12H3_VH3 contain a เมไธโอนีน (M) at position 99 (M99). The เมไธโอนีน คือ likely buried to a large extent, however, to reduce oxidation risk, the เมไธโอนีน at position 99 คือ mutated to leucine (L) หรือ isoleucine (I).10 Position 11 in the ฮิวเมไนซ์ บริเวณ แปรผัน สายหนักs 12H3_VH1,12H3_VH2 and 12H3_VH3 contain a valine (V). Substitutions at this position may have a structural impact on the antibody and hence its function (Klein et al mAbs 5:22-33, 2013). To test the effect of substitutions at position 11, the valine (V) residue คือ mutated to leucine (L).15 The mutations are incorporated to each บริเวณ แปรผัน สายหนัก12H3 VH1, 12H3 V112 and 12H3_VH3 using standard methods. The mutant HCDR2 sequences are shown in Table 7 and the mutant HCDR3 sequences are shown in Table 8. Optimized ฮิวเมไนซ์ 12H3 variable regions containing single substitutions are shown in Table 9. Alignment of the parental and optimized VH 20 regions are shown in รูป 44. The names of the optimized VH regions indicate the parental VH and the substitution made. Additional optimized variable regions can be generated by making substitutions simultaneously at positions 11, 55 and/or99 using standard methods.The resulting VH regions are paired with the บริเวณ แปรผัน สายเบาs25 12H3_VL1 หรือ 12H3 VL2 and the resulting antibodies are expressed as IgG4/ic usingstandard methods. The antibodies are tested for their binding to CD134 usingELISA according to protocol described in Example 11A. The antibodies are further tested for their ability to induce การเพิ่มจำนวน of Teff cells and dampen the inhibitory effect of Tregs on Teff การเพิ่มจำนวน using the protocols described in 30 Example 13. The antibodies having comparable properties than the parental ฮิวเมไนซ์ 12H3 antibodies are selected for further studies
การแปล กรุณารอสักครู่..
14.
ตัวอย่างการเพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์แอนติบอดี้ที่10 การเพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์แอนติบอดี้ 20E5.
HCDR2 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก s (VH) 20E5_VH1,
20E5 VH2 และ 20E5_VH3 ประกอบด้วยบรรทัดฐาน isomerization ที่ตกค้าง VH ตำแหน่ง 56-57 (DG, D56G57) เพื่อทดสอบผลกระทบของการแทนที่ 56 ตำแหน่งที่ aspartate
(D) ที่เหลือคือการกลายพันธุ์ Glycine (G), อะลานีน (A), ซีรีน (S) หรือกลูตาเมต (E) ,.
15 HCDR3 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผัน สายหนัก s 20E5_VH1, 20E5 VH2
และ 20E5_VH3 มีเมไธโอนีน (M) ที่ตำแหน่ง 106 (M106) เมไธโอนีนคือฝังแนวโน้มที่จะขอบเขตขนาดใหญ่ แต่เพื่อลดความเสี่ยงการเกิดออกซิเดชันที่เมไธโอนีนที่ตำแหน่ง 106 คือกลายพันธุ์เพื่อ leucine (L) หรือไอโซลิวซีน (I).
ตำแหน่งที่ 11 ในฮิวเม ไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก s 20E5_VH1,
20 20E5_VH2 และ 20E5_VH3 มีวาลีน (ที่ V) แทนในตำแหน่งนี้อาจจะมีผลกระทบต่อโครงสร้างบนแอนติบอดีและด้วยเหตุนี้การทำงานของ (ไคลน์, et al โคลนที่ 5: 22-33, 2013)
เพื่อทดสอบผลกระทบของการแทนตำแหน่งที่ 11 ของวาลีน (V)
ที่เหลือคือการกลายพันธุ์ leucine (L).
การกลายพันธุ์ที่ได้รับการจัดตั้งขึ้นเพื่อแต่ละบริเวณแปรผันสายหนัก
5 20E5_VH1, 20E5_VH2 20E5_VH3 และใช้วิธีการมาตรฐาน กลายพันธุ์ลำดับ HCDR2 แสดงในตารางที่ 4 และลำดับ HCDR3 กลายพันธุ์จะแสดงในตารางที่5 เพิ่มประสิทธิภาพฮิวเมไนซ์ 20E5 ภูมิภาคตัวแปรเดียวที่มีการเปลี่ยนตัวแสดงในตารางที่6 การจัดตำแหน่งของผู้ปกครองและการเพิ่มประสิทธิภาพ VH ภูมิภาคคือที่แสดงในรูป 43A และ 43B รูป ชื่อของการเพิ่มประสิทธิภาพ VH 10 ภูมิภาคระบุผู้ปกครอง VH และทดแทนที่ทำ เพิ่มเติมที่ดีที่สุดในภูมิภาคตัวแปรที่สามารถสร้างขึ้นโดยการแทนพร้อมกันที่ตำแหน่ง11, 56 และ / หรือ 106 โดยใช้วิธีการมาตรฐาน. ภูมิภาค VH ส่งผลให้มีการจับคู่กับบริเวณแปรผันสายเบา s 20E5_VL1 หรือ 20E5 VL2 และแอนติบอดีที่เกิดขึ้นจะแสดงเป็น IgG4 / x 15 โดยใช้วิธีการมาตรฐาน แอนติบอดีจะมีการทดสอบสำหรับพวกเขาที่จะมีผลผูกพัน CD134 โดยใช้วิธีELISA ตามโปรโตคอลที่อธิบายไว้ในตัวอย่าง 11A แอนติบอดีต่อไปจะทดสอบความสามารถของพวกเขาที่จะทำให้เกิดการเพิ่มจำนวนของเซลล์ Teff และรองรับผลยับยั้งของTregs Teff ในการเพิ่มจำนวนการใช้โปรโตคอลที่อธิบายไว้ในตัวอย่าง13 แอนติบอดีที่มีคุณสมบัติเทียบเคียงผู้ปกครองกว่า20 ฮิวเมไนซ์ แอนติบอดี 20E5 จะถูกเลือกสำหรับการศึกษาต่อไป. การเพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์ 12H3 แอนติบอดี. HCDR2 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก s (VI-1) 12H3_VH1, 12H3_VH2 และ 12H3 V113 มีบรรทัดฐาน deamidation (NNG) ที่ตกค้าง 54-56 (N54N55G56) เพื่อลดความเสี่ยง deamidation, asparagine ที่ 55 ตำแหน่ง (N55) คือ 5 กลายพันธุ์ glutamine (Q), อะลานีน (A) หรือกลูตาเมต (E). HCDR3 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก s 12H3_VH1, 12H3_VH2 และ 12H3_VH3 มี เมไธโอนีน (M) ที่ 99 ตำแหน่ง (M99) เมไธโอนีนคือฝังแนวโน้มที่จะขอบเขตขนาดใหญ่ แต่เพื่อลดความเสี่ยงการเกิดออกซิเดชันที่เมไธโอนีนในตำแหน่งที่ 99 คือการกลายพันธุ์เพื่อ leucine (L) หรือไอโซลิวซีน (I). 10 ตำแหน่ง 11 ในฮิว เมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก s 12H3_VH1, 12H3_VH2 และ 12H3_VH3 มีวาลีน (ที่ V) แทนในตำแหน่งนี้อาจจะมีผลกระทบต่อโครงสร้างบนแอนติบอดีและด้วยเหตุนี้การทำงานของ (ไคลน์, et al โคลนที่ 5: 22-33, 2013) เพื่อทดสอบผลกระทบของการแทนตำแหน่งที่ 11 ของวาลีน (V) ที่เหลือคือการกลายพันธุ์ leucine (L). 15 กลายพันธุ์ที่ได้รับการจัดตั้งขึ้นเพื่อแต่ละบริเวณแปรผันสายหนัก12H3 VH1, 12H3 V112 และ 12H3_VH3 โดยใช้วิธีการมาตรฐาน กลายพันธุ์ลำดับ HCDR2 แสดงในตารางที่ 7 และลำดับ HCDR3 กลายพันธุ์จะแสดงในตารางที่8 Optimized ฮิวเมไนซ์ 12H3 ภูมิภาคตัวแปรเดียวที่มีการเปลี่ยนตัวแสดงในตารางที่9 การจัดตำแหน่งของผู้ปกครองและการเพิ่มประสิทธิภาพ VH 20 ภูมิภาคจะแสดงใน รูป 44. ชื่อที่ดีที่สุดของภูมิภาค VH บ่งชี้ผู้ปกครองVH และทดแทนที่ทำ เพิ่มเติมที่ดีที่สุดในภูมิภาคตัวแปรที่สามารถสร้างขึ้นโดยการแทนพร้อมกันที่ตำแหน่ง 11, 55 และ / หรือ 99 โดยใช้วิธีการมาตรฐาน. ภูมิภาค VH ส่งผลให้มีการจับคู่กับบริเวณแปรผันสายเบา s 25 12H3_VL1 หรือ 12H3 VL2 และแอนติบอดีที่เกิดขึ้นจะแสดงเป็น IgG4 / ไอซีโดยใช้วิธีการมาตรฐาน แอนติบอดีจะมีการทดสอบสำหรับพวกเขาที่จะมีผลผูกพัน CD134 โดยใช้วิธีELISA ตามโปรโตคอลที่อธิบายไว้ในตัวอย่าง 11A แอนติบอดีต่อไปจะทดสอบความสามารถของพวกเขาที่จะทำให้เกิดการเพิ่มจำนวนของเซลล์ Teff และรองรับผลยับยั้งของTregs Teff ในการเพิ่มจำนวนการใช้โปรโตคอลที่อธิบายไว้ใน30 ตัวอย่าง 13 แอนติบอดีที่มีคุณสมบัติเทียบเคียงกว่าผู้ปกครองฮิวเมไนซ์แอนติบอดี 12H3 จะถูกเลือกสำหรับการศึกษาต่อไป
การแปล กรุณารอสักครู่..
ตัวอย่าง 14 การเพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์แอนติบอดี
10 เพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์ 20e5 antibodies .
hcdr2 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก S ( VH ) 20e5_vh1
20e5 vh2 , และมีการแยก 20e5_vh3 แม่ลายที่ VH กากตำแหน่ง 56-57 ( DG d56g57 , ) เพื่อทดสอบผลของการทดแทนที่ตำแหน่ง 56 , aspartate
( D ) กากความกลายพันธุ์เพื่อ Glycine ( G ) , alanine ( A ) , เอนไซม์ ( s ) ค็อค ผงชูรส ( E ) .
15 hcdr3 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผัน 20e5_vh1 สายหนัก s , และ 20e5 vh2
20e5_vh3 ประกอบด้วยเมไธโอนีน ( M ) ที่ตำแหน่ง 106 ( m106 ) การเมไธโอนีนความอาจฝังอยู่ในขอบเขตขนาดใหญ่ อย่างไรก็ตาม เพื่อลดความเสี่ยงการออกซิเดชันการเมไธโอนีนที่ตำแหน่ง 106 ความกลายพันธุ์กับลูซีน ( L ) ค็อคไอโซลิวซีน ( I )
ตำแหน่ง 11 ในฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก 20e5_vh1
s , และ 20 20e5_vh2 20e5_vh3 ประกอบด้วยวาลีน ( V ) การแทนในตำแหน่งนี้อาจ
มีผลกระทบเชิงโครงสร้างต่อแอนติบอดีและด้วยเหตุนี้การทำงานของมัน ( ซึ่ง 5:22-33 ไคลน์ et al , 2013 )เพื่อทดสอบผลของการทดแทนที่ตำแหน่ง 11 , วาลีน ( V )
กากความกลายพันธุ์กับลูซีน ( L )
การกลายพันธุ์จะรวมกับแต่ละบริเวณแปรผันสายหนัก
5 20e5_vh1 20e5_vh2 20e5_vh3 , และใช้วิธีการมาตรฐาน ลำดับ hcdr2 กลายพันธุ์
แสดงในตารางที่ 4 และลำดับ hcdr3 กลายพันธุ์เป็น
แสดงดังตารางที่ 5เหมาะฮิวเมไนซ์ 20e5 ตัวแปรภูมิภาคที่มีการทดแทนเดียว
แสดงในตารางที่ 6 ตำแหน่งของผู้ปกครองและเหมาะสม VH
ภูมิภาคความรูปและแสดงใน 43a รูป 43b ชื่อของ VH VH ที่ดีที่สุด 10 ภูมิภาค พบผู้ปกครอง และการทำ เพิ่มเติมที่ดีที่สุด
ตัวแปรภูมิภาคสามารถสร้างขึ้นโดยการเปลี่ยนพร้อมกัน
ตำแหน่งที่ 11 , 56 และ / หรือ 106 โดยใช้วิธีมาตรฐาน
VH ภูมิภาคที่เกิดมาคู่กับบริเวณแปรผันสายเบา S
20e5_vl1 ค็อค 20e5 vl2 และผลของแอนติบอดีจะแสดงเป็นเล็กน้อย / X ใช้ 15 วิธีมาตรฐาน แอนติบอดีที่ถูกทดสอบสำหรับผูก cd134
) ใช้ตามขั้นตอนที่อธิบายไว้ในตัวอย่าง 11A antibodies ต่อ
.ทดสอบความสามารถในการก่อให้เกิดการเพิ่มจำนวนของ teff เซลล์และรองรับผลยับยั้งของทีเร็กส์บนการเพิ่มจำนวน teff โดยใช้โปรโตคอลอธิบาย
ตัวอย่าง 13 แอนติบอดีที่มีคุณสมบัติเทียบเคียงกว่าผู้ปกครอง
20 ฮิวเมไนซ์ 20e5 แอนติบอดีจะถูกเลือกสำหรับการศึกษาต่อ การเพิ่มประสิทธิภาพของฮิวเมไนซ์
12h3 แอนติบอดีhcdr2 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผันสายหนัก S ( vi-1 ) 12h3_vh1
12h3_vh2 12h3 , และ v113 ประกอบด้วยดีแอมมิ เดชันแม่ลาย ( ง ) ที่ตกค้าง 54-56
( n54n55g56 ) เพื่อลดความเสี่ยงดีแอมมิ เดชัน asparagine ที่ตำแหน่ง , 55 ( n55 ) ความกลายพันธุ์กับกลูตามีน 5 ( Q ) , alanine ( A ) ค็อค ผงชูรส ( E )
hcdr3 ของฮิวเมไนซ์บริเวณแปรผัน 12h3_vh1 สายหนัก s ,
การแปล กรุณารอสักครู่..