Here we set out to explore the latt

Here we set out to explore the latter two questions using a
putative nonhost plant, Dianthus deltoides in the Caryophyllaceae
(Wang&Qui, 2006), which co-occurs with mycorrhizal plants in a
Danish coastal grassland. In June, 2007, we sampled 16 Dianthus
plants in a 50 m 9 100 m area for assessments of AM colonization
and fungal community composition. We also sampled 16
Hypochoeris radicata plants (a highly mycorrhizal species) to allow
for comparisons between Dianthus and a typical host plant. Plants
were sampled in a pairwise manner (Dianthus and Hypochoeris
plants were no more than 30 cm apart) to reduce confounding
effects of AMfungal spatial patterns, which have been documented
at this site previously (Rosendahl & Stukenbrock, 2004). We
assessed AM colonization on trypan blue stained roots using the
gridline intersect method on at least 50 intersects(McGonigle et al.,
1990), and extracted and amplifiedDNAfrom roots using the same
method as in Lekberg et al. (2012). Due to the visually lower AM
fungal abundance inDianthus roots, we extracted DNA from eight
2-cm root pieces per plant compared with eight 0.5-cm pieces per
Hypochoeris plant. Briefly, we targeted the large ribosomal subunit
(LSU) and amplifiedDNAusing a nested PCR with the eukaryotic
primers 0061 and NDL22 followed by FLR3-FLR4 (Van Tuinen
et al., 1998). Because we extractedDNAfromshort root fragments,
all positive PCR products were sequenced directly without cloning
(Macrogen, Seoul, Korea). High quality sequences were aligned
with published sequences obtained from the same grassland and
elsewhere (Rosendahl & Stukenbrock, 2004; Stukenbrock &
Rosendahl, 2005; Lekberg et al., 2012).We considered sequences a
match with previous operational taxonomic units (OTUs) if they
clustered within their monophyletic clades (see Supporting
Information Table S1 for original OTU names, updated nomenclature
and published accession numbers). We used a chi-square
test (with Yates correction; http://statpages.org/) and a 2 (plant
species) 9 10 (OTU) contingency table to test for differences in
AM fungal community composition between Dianthus and
Hypochoeris based on presence/absence of OTUs in each plant.
To verify that AM fungi were responsible for the observed root
colonization, and to assess if Dianthus allocates C to AM fungi, we
used neutral lipid fatty acid (NLFA) stable isotope probing (Olsson
et al., 2005) and conducted a 13CO2 pulse-chase labeling on seven
Dianthus individuals in July 2008. Given that this sampling
addressed a separate question from the sampling in 2007, the
different sampling times should present no problem. The labeling
and post-labeling processing was identical to that described in
Lekberg et al. (2012), and results from the Dianthus plants were
compared with seven Hypochoeris individuals from the study by
Lekberg et al. (2012). These Hypochoeris plants were from the same
50 m 9 100 m area, and had an identical labeling time (three
consecutive days starting 21 July for 2 h d

1) and chase period (3 d
after the last labeling). All plants were at least 5 m away from each
other to eliminate any risk of 13C cross-contamination. Carbon-13

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ที่นี่เราจะออกสำรวจคำถาม 2 หลังใช้เป็นโรงงาน putative nonhost, Dianthus deltoides ใน Caryophyllaceae(วัง & Qui, 2006), ซึ่งเกิดขึ้นกับพืช mycorrhizal ร่วมเป็นกราสแลนด์ฝั่งเดนมาร์ก ในเดือนมิถุนายน 2007 เราความ 16 Dianthusพืชใน 9 50 เมตร 100 เมตรสำหรับประเมินสนาม AMและองค์ประกอบชุมชนเชื้อรา นอกจากนี้เรายังความ 16Hypochoeris radicata พืช (ชนิด mycorrhizal สูง) ให้การเปรียบเทียบระหว่าง Dianthus และโรงงานที่โฮสต์โดยทั่วไป พืชมีตัวอย่างในรูปแพร์ไวส์ (Dianthus และ Hypochoerisพืชได้รับไม่เกิน 30 ซม.) เพื่อลด confoundingผลของ AMfungal ปริภูมิรูป ซึ่งมีการจัดทำเอกสารที่ก่อนหน้านี้ (Rosendahl & Stukenbrock, 2004) เราประเมินกำลังอาณานิคมบน trypan รากทิ้งคราบสีฟ้าที่ใช้ในเส้นตารางอินวิธีบนน้อย 50 ตัด (McGonigle et al.,1990), สกัด และ amplifiedDNAfrom รากใช้เหมือนกันวิธีใน Lekberg et al. (2012) จาก AM มองเห็นต่ำอุดมสมบูรณ์เชื้อรา inDianthus ราก เราสกัดดีเอ็นเอจากแปดชิ้น 2 ซม.รากต่อพืชเปรียบเทียบกับแปดชิ้น 0.5 ซม.ต่อโรงงาน Hypochoeris สั้น ๆ เรากำหนดเป้าหมายย่อย ribosomal ขนาดใหญ่(ชุดปั๊มหมึก) และ amplifiedDNAusing PCR ซ้อนกับแบบ eukaryoticไพรเมอร์ 0061 และตาม ด้วย FLR3-FLR4 (Van Tuinen NDL22และ al., 1998) เพราะเรา extractedDNAfromshort บางส่วนของรากผลิตภัณฑ์ PCR เป็นบวกทั้งหมดถูกเรียงลำดับโดยตรงไม่ มีโคลน(Macrogen โซล เกาหลี) มีจัดลำดับคุณภาพมีประกาศลำดับที่ได้รับจากกราสแลนด์เดียวกัน และอื่น ๆ (Rosendahl & Stukenbrock, 2004 Stukenbrock และRosendahl, 2005 Lekberg et al., 2012)เราถือว่าลำดับตรงกับหน่วยอนุกรมวิธานก่อนหน้างาน (OTUs) ถ้าพวกเขาคลัสเตอร์ภายในของ clades monophyletic (Supporting ดูS1 ตารางข้อมูลเดิมชื่อ OTU ปรับปรุงระบบการตั้งชื่อและหมายเลขทะเบียนที่เผยแพร่) เราใช้ chi-square เป็นทดสอบ (กับ Yates แก้ไข http://statpages.org/) และ 2 (โรงงานตารางฉุกเฉินชนิด) 10 9 (OTU) การทดสอบความแตกต่างในองค์ประกอบชุมชนเชื้อรา AM ระหว่าง Dianthus และHypochoeris ตามสถานะ/ขาดของ OTUs ในแต่ละโรงงานเพื่อตรวจสอบว่า เชื้อรา AM ที่ถูกสังเกตรากสนาม และ การประเมินถ้า Dianthus จัดสรร C กับ AM เชื้อรา เราใช้ไขมันเป็นกลางกรดไขมัน (NLFA) ไอโซโทปอาศัย (Olssonร้อยเอ็ด al., 2005) และดำเนินการ 13CO2 ชีพจรไล่ล่าติดฉลากในเจ็ดบุคคล dianthus ใน 2551 กรกฎาคม ระบุว่าสุ่มตัวอย่างนี้ส่งคำถามที่แยกต่างหากจากการสุ่มตัวอย่างในปี 2007 การสุ่มตัวอย่างหลายครั้งควรนำเสนอปัญหา การติดฉลากและการติดฉลากหลังประมวลผลเหมือนกับที่อธิบายไว้ในLekberg et al. (2012), และผลลัพธ์จากพืช Dianthusเมื่อเทียบกับเจ็ด Hypochoeris บุคคลจากการศึกษาโดยLekberg et al. (2012) พืชเหล่านี้ Hypochoeris ได้เหมือนกัน9 50 เมตร 100 เมตรพื้นที่ และเวลาการติดฉลากเหมือนกัน (สามโซนเวลาเริ่มต้น 21 กรกฎาคมสำหรับ d 2 h1) และระยะเวลาในการไล่ล่า (3 dหลังจากล่าสุดติดฉลาก) พืชทั้งหมดมีอย่างน้อย 5 เมตรจากแต่ละอื่น ๆ เพื่อขจัดความเสี่ยงใด ๆ การข้าม 13C ปนเปื้อน คาร์บอน-13

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่นี่เราได้ออกเดินทางไปสำรวจหลังสองคำถามโดยใช้
พืช nonhost สมมุติ Dianthus deltoides ใน Caryophyllaceae
(วังและใคร, 2006) ซึ่งร่วมเกิดขึ้นกับพืชไมคอไรซาใน
ทุ่งหญ้าชายฝั่งเดนมาร์ก ในเดือนมิถุนายนปี 2007 เราตัวอย่าง 16 Dianthus
พืชใน 50 เมตรพื้นที่ 9 100 เมตรสำหรับการประเมินผลของการล่าอาณานิคม AM
และองค์ประกอบชุมชนเชื้อรา นอกจากนี้เรายังเก็บตัวอย่าง 16
Hypochoeris พืช radicata (สายพันธุ์ mycorrhizal สูง) เพื่อให้
สำหรับการเปรียบเทียบระหว่างผีเสื้อและพืชทั่วไป พืช
เก็บตัวอย่างในลักษณะคู่ (ผีเสื้อและ Hypochoeris
พืชไม่เกิน 30 ซม. ออกจากกัน) เพื่อลดปัจจัยกวน
ผลกระทบของรูปแบบการกระจาย AMfungal ซึ่งได้รับการบันทึกไว้
ที่เว็บไซต์นี้ก่อนหน้านี้ (Rosendahl & Stukenbrock, 2004) เรา
ประเมินการล่าอาณานิคม AM บนรากสีทริแพนสีฟ้าโดยใช้
เส้นตารางตัดวิธีการอย่างน้อย 50 ปริภูมิ (McGonigle et al.,
1990) และสกัดและรากใช้ amplifiedDNAfrom เดียวกัน
วิธีการเช่นเดียวกับใน Lekberg และคณะ (2012) เนื่องจาก AM ต่ำกว่าสายตา
อุดมสมบูรณ์เชื้อราราก inDianthus เราสกัดดีเอ็นเอจากแปด
2 ซมชิ้นรากต่อต้นเมื่อเทียบกับแปดชิ้น 0.5 ซมต่อ
พืช Hypochoeris สั้น ๆ เรากำหนดเป้าหมาย subunit โซมอลขนาดใหญ่
(LSU) และ amplifiedDNAusing PCR ที่ซ้อนกันกับยูคาริโอ
ไพร 0061 และตามด้วย NDL22 FLR3-FLR4 (Van Tuinen
et al., 1998) เพราะเรา extractedDNAfromshort เศษราก
ทุกผลิตภัณฑ์ PCR บวกมีลำดับขั้นตอนโดยตรงโดยไม่ต้องโคลน
(Macrogen, Seoul, Korea) ลำดับที่มีคุณภาพสูงถูกจัดชิด
กับลำดับการตีพิมพ์ที่ได้จากทุ่งหญ้าเดียวกันและ
อื่น ๆ (Rosendahl & Stukenbrock 2004; Stukenbrock &
Rosendahl,. 2005; Lekberg, et al, 2012) เราพิจารณาลำดับ
การจับคู่กับหน่วยงานการจัดหมวดหมู่ก่อนหน้านี้ในการดำเนินงาน (Otus) ถ้า พวกเขา
ล้อมรอบด้วย clades ไฟย์เลติของพวกเขา (ดูสนับสนุน
ข้อมูลตาราง S1 สำหรับชื่อ OTU เดิมศัพท์ปรับปรุง
และตีพิมพ์หมายเลขภาคยานุวัติ) เราใช้ไคสแควร์
การทดสอบ (กับการแก้ไขเยตส์; http://statpages.org/) และ 2 (พืช
ชนิด) 9 10 (OTU) ตารางฉุกเฉินเพื่อทดสอบความแตกต่างใน
องค์ประกอบชุมชน AM เชื้อราระหว่างผีเสื้อและ
Hypochoeris ขึ้นอยู่กับ มี / ไม่มี Otus ในแต่ละโรงงาน.
ต้องการตรวจสอบว่า AM เชื้อรามีความรับผิดชอบสำหรับรากสังเกต
การล่าอาณานิคมและเพื่อประเมินว่า Dianthus จัดสรร C ถึง AM เชื้อราเรา
ใช้กรดไขมันไขมันที่เป็นกลาง (NLFA) ไอโซโทปละเอียด (โอลส์สัน
และคณะ 2005) และดำเนินการติดฉลาก 13CO2 ชีพจรไล่เจ็ด
บุคคล Dianthus ในเดือนกรกฎาคม 2008 ระบุว่าการสุ่มตัวอย่างนี้
ที่คำถามที่แยกต่างหากจากการสุ่มตัวอย่างในปี 2007,
การสุ่มตัวอย่างครั้งที่แตกต่างกันควรนำเสนอไม่มีปัญหา การติดฉลาก
และการประมวลผลหลังการติดฉลากเป็นเหมือนกับที่อธิบายไว้ใน
Lekberg และคณะ (2012) และผลที่ได้จากพืช Dianthus ถูก
เมื่อเทียบกับเจ็ดบุคคล Hypochoeris จากการศึกษาโดย
Lekberg และคณะ (2012) เหล่านี้พืช Hypochoeris ได้จากที่เดียวกัน
50 เมตรพื้นที่ 9 100 ม. ​​และมีเวลาการติดฉลากเหมือนกัน (สาม
วันติดต่อกันเริ่มต้นที่ 21 กรกฏาคมสำหรับ 2 HD
1?) และระยะเวลาการไล่ล่า (3 D
หลังจากการติดฉลากที่ผ่านมา) พืชทุกคนอย่างน้อย 5 เมตรห่างจากแต่ละ
อื่น ๆ เพื่อลดความเสี่ยงของ 13C การปนเปื้อนใด ๆ Carbon-13

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ที่นี่เราได้ออกเดินทางไปสำรวจหลัง 2 คำถามโดยใช้
ซึ่ง nonhost พืช ดอก deltoides ใน caryophyllaceae
( วัง& qui , 2006 ) ซึ่งร่วมเกิดกับพืชไมโคไรซาใน
เดนมาร์กชายฝั่งทุ่งเลี้ยงสัตว์ ในเดือนมิถุนายน 2007 เราเก็บตัว 16 ต้นดอก
ใน 50 เมตร 100 เมตร พื้นที่ 9 ข้อคือ การล่าอาณานิคม
และองค์ประกอบชุมชนรา เรายังมีตัวอย่าง 16
hypochoeris radicata พืช ( สูงไมโคไรซาชนิด ) เพื่อให้
สำหรับการเปรียบเทียบระหว่างพืชและพืชเป็นเจ้าภาพโดยทั่วไป พืช
จำนวนในลักษณะคู่ ( ดอกและพืช hypochoeris
ถูกไม่เกิน 30 ซม. ห่างกัน ) เพื่อลดผลกระทบของรูปแบบทางพื้นที่ amfungal confounding

ซึ่งได้รับเอกสารที่เว็บไซต์นี้ก่อนหน้านี้ ( Rosendahl & stukenbrock , 2004 ) เรา
ประเมินเป็นอาณานิคมในไตรแพนสีฟ้าเปื้อนรากใช้
gridline เซ็ควิธีอย่างน้อย 50 ตัด ( mcgonigle et al . ,
1990 ) และสกัด amplifieddnafrom รากโดยใช้วิธีเดียวกัน
ใน lekberg et al . ( 2012 ) เนื่องจากการมองเห็นต่ำเป็นเชื้อรา indianthus
อุดมสมบูรณ์ราก เราสกัดดีเอ็นเอจากแปด
2-cm รากชิ้นต่อพืชเมื่อเทียบกับ 0.5-cm
8 ชิ้นต่อhypochoeris พืช สั้นเราเป้าหมายใหญ่
ซึ่งไรโบโซม ( LSU ) และ amplifieddnausing เป็นแบบซ้อนกันด้วยวิธี PCR และเข้ามา
0061 ndl22 ตาม flr3-flr4 ( รถตู้ tuinen
et al . , 1998 ) เพราะเรา extracteddnafromshort เศษราก
บวกทั้งหมดผลิตภัณฑ์ได้โดยตรงโดยไม่ต้องทำการตรวจยีน
( macrogen , โซล , เกาหลี ) ลำดับคุณภาพสูงชิด
กับลำดับหัวข้อเดียวกันได้จากทุ่งหญ้าและที่อื่น ๆ (
& Rosendahl stukenbrock , 2004 ; stukenbrock &
Rosendahl , 2005 ; lekberg et al . , 2012 ) เราถือว่าเป็นลำดับ
ตรงกับหน่วยอนุกรมวิธานก่อนหน้าปฏิบัติการ ( ใน ) ถ้าพวกเขา
จับกลุ่มภายใน monophyletic clades ( ดูสนับสนุน
ตารางข้อมูล S1 สำหรับชื่อ otu เดิมปรับปรุงระบบการตั้งชื่อ
,และเผยแพร่ตัวเลขเพิ่มขึ้น ) เราใช้ไคสแควร์
( กับ เยทส์แก้ไข ; http://statpages.org/ ) และ 2 ( พืช
) 9 10 ( otu ) สำรองตารางเพื่อทดสอบความแตกต่างในองค์ประกอบชุมชน
เป็นเชื้อราระหว่างพืชและ
hypochoeris ขึ้นอยู่กับการมี / ไม่มีในในแต่ละโรงงาน เพื่อยืนยันว่าเป็นเชื้อรา
รับผิดชอบและราก
การล่าอาณานิคมและเพื่อประเมิน ถ้าดอกจัดสรร C เป็นเชื้อรา เราใช้เป็นกลาง
ไขมันกรดไขมัน ( nlfa ) มั่นคงไอโซโทปละเอียด ( โอลส์สัน
et al . , 2005 ) และทำการ 13co2 ชีพจรตามการติดฉลากบนเจ็ด
ดอกบุคคลในเดือนกรกฎาคม 2008 ระบุว่าอาหารนี้
addressed คำถามแยกจากตัวอย่างใน 2007 ,
เวลาที่ต่างกัน ) ควรปัจจุบันไม่มีปัญหา การติดฉลาก
โพสต์ในการประมวลผลและการติดฉลากเหมือนกับที่อธิบายไว้ใน
lekberg et al . ( 2012 ) และผลลัพธ์ที่ได้จากพืชดอกถูก
เมื่อเทียบกับเจ็ด hypochoeris บุคคลจากการศึกษาด้วย
lekberg et al . ( 2012 ) พืชเหล่านี้ hypochoeris จากเดิม 50 M
9 100 เมตร พื้นที่ และการติดฉลากเหมือนกันเวลา 3 วันติดต่อกัน เริ่ม 21 กรกฎาคม
2 H D

1 ) และตามระยะเวลา ( 3 D
หลังจากครั้งสุดท้ายที่ติดฉลาก ) พืชทั้งหมดอย่างน้อย 5 เมตรห่างจากแต่ละอื่น ๆใด ๆ
เพื่อขจัดความเสี่ยงจากการปนเปื้อนของ 13C ข้าม carbon-13