2.3 Identification of potent probio

2.3 Identification of potent probionts
The biochemical characterization of the test cultures were
carried out for genus identification according to Bergey’s
Manual of Systematic Bacteriology. Further
identification of the potent probionts was achieved by 16S
rRNA sequencing and NCBI-BLAST search. The DNA was
isolated by HiPurA bacterial DNA isolation and purification
kit (Hi-media, Mumbai) and used as template. PCR
amplification of the 16S rRNA was done by using master mix
kit, MEDOX-MIX (Medox, India) as per user manual. The
primers and PCR conditions were adapted from previous
report [16]. The PCR product was subsequently sequenced and the sequence information of the isolate was compared with the
existing sequences available in the GenBank of NCBI using
BLAST search. The sequence was aligned using ClustalW
program within BioEdit version 7.0.5.3 and phylogenetic tree
was constructed by Neighbor-Joining method.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.3 ระบุของ probionts ที่มีศักยภาพคุณสมบัติชีวเคมีของวัฒนธรรมทดสอบได้ดำเนินการในพืชสกุลรหัสตามของ Bergeyคู่มือระบบ Bacteriology เพิ่มเติมรหัส probionts มีศักยภาพสำเร็จ โดย 16Sลำดับ rRNA และค้นหาระเบิด NCBI ดีเอ็นเอถูกแยกต่างหาก โดย HiPurA แยกดีเอ็นเอจากแบคทีเรียและทำให้บริสุทธิ์kit (Hi-สื่อ มุมไบ) และใช้เป็นแม่แบบ PCRทำโดยผสมผสานหลักขยายของ 16S rRNAชุด MEDOX-ผสม (Medox อินเดีย) ตามคู่มือการใช้งาน ที่ไพรเมอร์และเงื่อนไข PCR ถูกดัดแปลงจากก่อนหน้านี้รายงาน [16] ผลิตภัณฑ์ PCR ได้ในเวลาต่อมาเรียงลำดับ และข้อมูลลำดับแยกได้เมื่อเทียบกับการลำดับใน GenBank NCBI ใช้อยู่ค้นหาระเบิด มีจัดลำดับใช้ ClustalWโปรแกรม BioEdit รุ่น 7.0.5.3 และ phylogenetic treeถูกสร้างขึ้น โดยวิธีการรวมเพื่อนบ้าน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.3 บัตรประจำตัวของ probionts
ศักยภาพลักษณะที่ทางชีวเคมีของวัฒนธรรมการทดสอบได้รับการดำเนินการในการจำแนกประเภทตาม
Bergey
ของคู่มือการใช้งานของระบบแบคทีเรีย นอกจากบัตรประจำตัวของ probionts ที่มีศักยภาพได้สำเร็จโดย 16S ลำดับ rRNA และการค้นหา NCBI-ระเบิด ดีเอ็นเอถูกแยกโดยการแยกดีเอ็นเอของแบคทีเรีย HiPurA และการทำให้บริสุทธิ์ชุด(Hi-สื่อมุมไบ) และใช้เป็นแม่แบบ PCR ขยายของ 16S rRNA ที่ได้กระทำโดยใช้ต้นแบบผสมชุดMEDOX-MIX (Medox, อินเดีย) ตามคู่มือการใช้ ไพรเมอร์และเงื่อนไข PCR ถูกดัดแปลงมาจากก่อนหน้านี้รายงาน[16] ผลิตภัณฑ์ PCR ได้รับการจัดลำดับต่อมาและข้อมูลลำดับของแยกถูกเมื่อเทียบกับลำดับที่มีอยู่ที่มีอยู่ในGenBank ของ NCBI ใช้ค้นหาระเบิด ลำดับสอดคล้อง ClustalW ใช้โปรแกรมที่อยู่ในรุ่นBioEdit 7.0.5.3 และต้นไม้สายวิวัฒนาการที่ถูกสร้างขึ้นโดยวิธีการเพื่อนบ้านเข้า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.3 การระบุที่มีศักยภาพ probionts
ลักษณะสมบัติทางชีวเคมีของเชื้อทดสอบ
ดำเนินการชนิด สกุลตามวิธีของ
คู่มือของแบคทีเรียวิทยาอย่างเป็นระบบ การจำแนกต่อไป
ของ probionts ต้าทำได้โดยใช้ 16S rRNA ลำดับและการค้นหา ncbi-blast
. ดีเอ็นเอที่แยกได้ด้วย
hipura แยกดีเอ็นเอแบคทีเรียและชุดฟอก
( สวัสดี สื่อมุมไบ ) และใช้เป็นแม่แบบ การเพิ่มปริมาณของ 16S rRNA ยีน

ใช้ชุดผสมทำโดยอาจารย์ medox-mix ( medox , อินเดีย ) ตามคู่มือผู้ใช้
ไพรเมอร์และเงื่อนไขซึ่งดัดแปลงมาจากก่อนหน้านี้รายงาน [ 16 ] ผลิตภัณฑ์ PCR และลำดับเบสและลำดับข้อมูลจากถูกเปรียบเทียบกับลำดับ
ที่มีอยู่มีอยู่ในขนาดของ ncbi ใช้
ค้นหาระเบิดลำดับ คือ ชิด ใช้โปรแกรม clustalw
ภายใน bioedit และรุ่น 7.0.5.3 phylogenetic ต้นไม้
ถูกสร้างขึ้นโดยเพื่อนบ้านร่วมด้วย