Efficiency, limit of detection, and

Efficiency, limit of detection, and intra-assay and interassay precision
of the RT-PCR assays. Verifications of assay sensitivity, specificity,
and precision were performed as proposed previously (27). Standard
curves ofmHEVgenotypes 3 and 4 ranging from 101 to 108 copies of HEV
plasmid DNA were used to determine the efficiency, limit of detection,
and intra-assay and interassay precision of the real-time PCR assays. For
assays A and B, which do not differentiate HEV genotypes, standard
curves for genotypes 3 and 4 were tested separately. For assays C and D,
which differentiate between HEV genotypes 3 and 4, the standard curves
were tested as duplex assays or separately in singleplex assays. The amplification
efficiency (E) for each assay was calculated according to the following
formula to determine the performance of quantitative PCR
(qPCR): E  [101/S]  1, where S indicates the slope of the regression
line. The limit of detection of each assay and the intra-assay variation were
assessed with the standard curves tested in triplicate. The limit of detection
was specified as the smallest amount of DNA standard that could be
detected with 100% probability. The interassay variation was determined
by three independent runs of the standard curves in triplicate.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ประสิทธิภาพ ขีดจำกัดของการตรวจจับ และความแม่นยำในการวิเคราะห์ภายในและ interassayของ assays RT-PCR Verifications ทดสอบความไว specificityและความแม่นยำได้ดำเนินการเป็นนำเสนอก่อนหน้านี้ (27) มาตรฐานofmHEVgenotypes โค้ง 3 และ 4 ตั้งแต่ 101 ถึงสำเนา HEV 108plasmid DNA ถูกใช้เพื่อกำหนดประสิทธิภาพ ขีดจำกัดของการตรวจสอบและแม่นยำภายในวิเคราะห์และ interassay assays PCR แบบเรียลไทม์ สำหรับassays A และ B ซึ่งไม่แตกต่างการศึกษาจีโนไทป์ HEV มาตรฐานเส้นโค้งการศึกษาจีโนไทป์ 3 และ 4 ถูกทดสอบแยกกัน สำหรับ assays C และ Dซึ่งความแตกต่างระหว่าง HEV ศึกษาจีโนไทป์ 3 และ 4 เส้นโค้งมาตรฐานได้ทดสอบ assays สอง หรือแยกต่างหาก ใน singleplex assays ขยายการประสิทธิภาพ (E) สำหรับการวิเคราะห์แต่ละคำนวณตามต่อไปนี้สูตรการตรวจสอบประสิทธิภาพของ PCR เชิงปริมาณ(qPCR): E [10 1/S] 1 ที่ S ระบุความชันของการถดถอยบรรทัด ข้อจำกัดของการตรวจวิเคราะห์แต่ละและเปลี่ยนแปลงภายในวิเคราะห์ได้ประเมิน ด้วยเส้นโค้งมาตรฐานทดสอบใน triplicate ขีดจำกัดของการตรวจสอบระบุเป็นจำนวนดีเอ็นเอมาตรฐานที่อาจจะน้อยที่สุดพบกับความน่าเป็น 100% กำหนดรูปแบบ interassayโดยรันอิสระสามของเส้นโค้งมาตรฐานใน triplicate

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประสิทธิภาพ, ขีด จำกัด ของการตรวจสอบและทดสอบภายในและความแม่นยำ interassay
ของการตรวจ RT-PCR การตรวจสอบการทดสอบความไวความจำเพาะ
และความแม่นยำได้ดำเนินการตามที่เสนอไปก่อนหน้านี้ (27) มาตรฐาน
โค้ง ofmHEVgenotypes 3 และ 4 ตั้งแต่ 101-108 สำเนาของ HEV
พลาสมิดดีเอ็นเอถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบที่มีประสิทธิภาพ, ขีด จำกัด ของการตรวจสอบ
และทดสอบภายในและความแม่นยำ interassay ของเรียลไทม์การตรวจ PCR สำหรับ
การตรวจ A และ B ซึ่งไม่แตกต่างยีน HEV มาตรฐาน
เส้นโค้งที่ 3 และ 4 สายพันธุ์ได้รับการทดสอบแยกต่างหาก สำหรับการตรวจ C และ D
ซึ่งความแตกต่างระหว่างยีน HEV 3 และ 4 เส้นโค้งมาตรฐาน
ได้รับการทดสอบเป็นชุดตรวจเพล็กซ์หรือแยกต่างหากในการตรวจ singleplex เครื่องขยายเสียง
ที่มีประสิทธิภาพ (E) สำหรับการทดสอบแต่ละที่คำนวณได้ตามต่อไปนี้
สูตรเพื่อตรวจสอบประสิทธิภาพการทำงานของ PCR เชิงปริมาณ
(qPCR): E? [10 1 / S] 1 ที่ S บ่งชี้ความลาดชันของการถดถอย
เส้น ขีด จำกัด ของการตรวจสอบของแต่ละการทดสอบและการเปลี่ยนแปลงภายในได้รับการทดสอบ
การประเมินที่มีเส้นโค้งมาตรฐานการทดสอบในเพิ่มขึ้นสามเท่า ขีด จำกัด ของการตรวจสอบ
ที่ถูกระบุเป็นจำนวนเงินที่น้อยที่สุดของมาตรฐานดีเอ็นเอที่สามารถ
ตรวจพบด้วยความน่าจะเป็น 100% รูปแบบ interassay ถูกกำหนด
โดยสามวิ่งอิสระของเส้นโค้งมาตรฐานในการเพิ่มขึ้นสามเท่า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประสิทธิภาพของการใช้วงเงิน และภายในและ interassay ความแม่นยำ
ของ RT-PCR ) . โทรศัพท์มือถือของการทดสอบความไว ความจำเพาะ และแน่นอน มีการปฏิบัติ
, เสนอก่อนหน้านี้ ( 27 ) เส้นโค้งมาตรฐาน
ofmhevgenotypes 3 และ 4 ตั้งแต่ 101 ของพลาสมิดดีเอ็นเอปลูก
108 เล่ม ถูกใช้เพื่อตรวจสอบประสิทธิภาพ ข้อจำกัดของการตรวจสอบ
และ การทดสอบภายในและ interassay ความแม่นยำของวิธี PCR แบบเรียลไทม์ สำหรับ
) A และ B ซึ่งไม่ได้แยกปลูกพันธุ์เส้นโค้งมาตรฐาน
สำหรับชนิดที่ 3 และ 4 ทดสอบแยก สำหรับวิธี C และ D ,
ซึ่งความแตกต่างระหว่างปลูกพันธุ์ที่ 3 กับ 4
เส้นโค้งมาตรฐานการทดสอบเป็นวิธีดูเพล็กซ์หรือแยก singleplex ) . การเพิ่มปริมาณ
ประสิทธิภาพ ( E ) สำหรับแต่ละวิธีคำนวณตามสูตรต่อไปนี้เพื่อตรวจสอบประสิทธิภาพของ

เทคนิคเชิงปริมาณ ( qpcr ) : e  [ 10  1 / S ]  1 , ที่ s แสดงความชันของเส้นถดถอย
. ข้อจำกัดของการตรวจสอบของแต่ละวิธีและอัฟกานิสถานการแปรเป็น
ประเมินด้วยมาตรฐานเส้นโค้งการทดสอบทั้งสามใบ ขีดจำกัดของการตรวจหา
ที่ระบุตามปริมาณที่น้อยที่สุดของดีเอ็นเอมาตรฐานที่สามารถตรวจสอบความน่าจะเป็น
100% การ interassay รูปแบบตั้งใจ
3 วิ่งอิสระของเส้นโค้งมาตรฐานทั้งสามใบ